149 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_5139 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_5139  phytanoyl-CoA dioxygenase  100 
 
 		 320 aa  644    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0463387  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6945  phytanoyl-CoA dioxygenase  38.55 
 
 		 303 aa  156  5.0000000000000005e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.979271  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1544  phytanoyl-CoA dioxygenase  38.15 
 
 		 303 aa  154  1e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.149771  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6285  phytanoyl-CoA dioxygenase  38.15 
 
 		 303 aa  154  1e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.142673  normal  0.594182 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3118  Phytanoyl-CoA dioxygenase  32.37 
 
 		 257 aa  125  9e-28  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  hitchhiker  0.00211764  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0782  phytanoyl-CoA dioxygenase  33.05 
 
 		 274 aa  107  3e-22  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.242238  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2355  Phytanoyl-CoA dioxygenase  28.83 
 
 		 260 aa  100  3e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6368  putative dioxygenase  28.76 
 
 		 296 aa  96.7  5e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.365984  normal  0.570767 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4113  Phytanoyl-CoA dioxygenase  29.39 
 
 		 300 aa  94.7  2e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0567  Phytanoyl-CoA dioxygenase  29.69 
 
 		 261 aa  93.2  5e-18  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.584768 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2295  Phytanoyl-CoA dioxygenase  25.55 
 
 		 270 aa  91.7  2e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.858979  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1224  Phytanoyl-CoA dioxygenase  29.46 
 
 		 253 aa  90.1  4e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.335805  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5544  phytanoyl-CoA dioxygenase family protein  29.41 
 
 		 298 aa  83.2  0.000000000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.209005  normal  0.209987 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1576  Phytanoyl-CoA dioxygenase  25.54 
 
 		 273 aa  82.4  0.00000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.158036  normal  0.083991 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6979  biosynthesis of mitomycin antibiotics/polyketide fumonisin protein  27.35 
 
 		 263 aa  81.3  0.00000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.222506 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1403  Phytanoyl-CoA dioxygenase  25.66 
 
 		 293 aa  79.7  0.00000000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.144927  normal  0.75907 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1903  Phytanoyl-CoA dioxygenase  29.03 
 
 		 254 aa  78.2  0.0000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.825715  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4055  Phytanoyl-CoA dioxygenase  30.29 
 
 		 265 aa  77.8  0.0000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.14003  normal  0.288742 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0673  Phytanoyl-CoA dioxygenase  25.61 
 
 		 280 aa  75.5  0.000000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4437  Phytanoyl-CoA dioxygenase  26.84 
 
 		 285 aa  73.6  0.000000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0472  phytanoyl-CoA dioxygenase  28.74 
 
 		 266 aa  72  0.00000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0402269  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0790  mitomycin antibiotics/polyketide fumonisin biosynthesis protein  27.48 
 
 		 300 aa  72  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1961  phytanoyl-CoA dioxygenase  27.51 
 
 		 260 aa  71.2  0.00000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.00281638  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23361  hypothetical protein  27.54 
 
 		 302 aa  71.6  0.00000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3257  Phytanoyl-CoA dioxygenase  26.38 
 
 		 305 aa  70.9  0.00000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.867901  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0950  phytanoyl-CoA dioxygenase  30.67 
 
 		 230 aa  70.1  0.00000000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.977141  normal  0.257278 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3392  Phytanoyl-CoA dioxygenase  30.82 
 
 		 260 aa  70.1  0.00000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.325628 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0392  phytanoyl-CoA dioxygenase  24.46 
 
 		 302 aa  68.6  0.0000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.773744 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1704  Phytanoyl-CoA dioxygenase  24.35 
 
 		 259 aa  68.2  0.0000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.235452  hitchhiker  0.00714566 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1060  hypothetical protein  26.87 
 
 		 276 aa  67.8  0.0000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.247283  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2811  Phytanoyl-CoA dioxygenase  28.57 
 
 		 394 aa  67  0.0000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.124113  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4554  phytanoyl-CoA dioxygenase  26.43 
 
 		 276 aa  66.2  0.0000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.762546  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1483  phytanoyl-CoA dioxygenase  31.25 
 
 		 269 aa  66.2  0.0000000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05540  ectoine hydroxylase  27.23 
 
 		 298 aa  66.2  0.0000000007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2489  phytanoyl-CoA dioxygenase  24.8 
 
 		 309 aa  65.9  0.0000000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0914  Phytanoyl-CoA dioxygenase  28.12 
 
 		 394 aa  65.9  0.000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1638  Phytanoyl-CoA dioxygenase  25.2 
 
 		 273 aa  64.7  0.000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0080  phytanoyl-CoA dioxygenase  26.03 
 
 		 253 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5543  Phytanoyl-CoA dioxygenase  28.09 
 
 		 282 aa  64.3  0.000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.401437  normal  0.0790883 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0247  phytanoyl-CoA dioxygenase  27.87 
 
 		 280 aa  63.9  0.000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.439609  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3892  ectoine hydroxylase  28.35 
 
 		 311 aa  63.5  0.000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5271  ectoine hydroxylase  28.42 
 
 		 304 aa  63.2  0.000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.442083 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0542  ectoine hydroxylase  27.24 
 
 		 314 aa  62.8  0.000000009  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0384417  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2672  phytanoyl-CoA dioxygenase  24.62 
 
 		 309 aa  62  0.00000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000176999 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1259  Type I secretion membrane fusion protein, HlyD  25.31 
 
 		 253 aa  61.2  0.00000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000199096 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0138  ectoine hydroxylase  24.07 
 
 		 302 aa  60.8  0.00000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.192134  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1372  Phytanoyl-CoA dioxygenase  25.75 
 
 		 275 aa  60.8  0.00000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3627  putative deoxygenase  30.52 
 
 		 281 aa  60.1  0.00000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4972  Phytanoyl-CoA dioxygenase  22.87 
 
 		 277 aa  59.7  0.00000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.170605  hitchhiker  0.00000000026195 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4369  hypothetical protein  26.03 
 
 		 253 aa  59.7  0.00000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2245  hypothetical protein  27.27 
 
 		 266 aa  59.3  0.00000008  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2051  phytanoyl-CoA dioxygenase  26.05 
 
 		 278 aa  59.3  0.00000008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.110515  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5814  ectoine hydroxylase  25.29 
 
 		 296 aa  59.3  0.00000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5568  phytanoyl-CoA dioxygenase  28.57 
 
 		 270 aa  57.8  0.0000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.172876  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2103  Phytanoyl-CoA dioxygenase  25.53 
 
 		 283 aa  58.2  0.0000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.549141 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1037  phytanoyl-CoA dioxygenase  24.71 
 
 		 279 aa  58.2  0.0000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.0855304 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2952  ectoine hydroxylase  26.05 
 
 		 306 aa  57.8  0.0000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.340405 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4835  ectoine hydroxylase  29.44 
 
 		 303 aa  57.8  0.0000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.284573  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0353  Phytanoyl-CoA dioxygenase  23.98 
 
 		 253 aa  57  0.0000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.693124 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5446  phytanoyl-CoA dioxygenase  27.38 
 
 		 282 aa  56.6  0.0000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.235602  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2862  phytanoyl-CoA dioxygenase  29.53 
 
 		 268 aa  56.6  0.0000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2963  phytanoyl-CoA dioxygenase  24.81 
 
 		 284 aa  56.2  0.0000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.12584  normal  0.762779 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2273  hypothetical protein  26.52 
 
 		 278 aa  56.2  0.0000007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41990  Phytanoyl-CoA dioxygenase  26.53 
 
 		 248 aa  56.2  0.0000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3127  phytanoyl-CoA dioxygenase  28.67 
 
 		 257 aa  56.2  0.0000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5242  phytanoyl-CoA dioxygenase  27.27 
 
 		 282 aa  55.8  0.0000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.425206  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5617  phytanoyl-CoA dioxygenase  27.27 
 
 		 282 aa  55.8  0.0000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.752397  normal  0.0823186 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3373  phytanoyl-CoA dioxygenase  25.13 
 
 		 274 aa  55.8  0.0000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.442816  normal  0.162414 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4611  phytanoyl-CoA dioxygenase  27.27 
 
 		 282 aa  55.8  0.0000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.361058  hitchhiker  0.00169766 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1391  phytanoyl-CoA dioxygenase  24.71 
 
 		 251 aa  55.5  0.000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.633515  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4896  phytanoyl-CoA dioxygenase  26.32 
 
 		 282 aa  55.1  0.000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.819022  normal  0.342162 
 
 
-
 
NC_003296  RS05217  hydroxylase protein  28.69 
 
 		 263 aa  54.7  0.000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34780  ectoine hydroxylase  26.26 
 
 		 300 aa  54.7  0.000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.965609  normal  0.242617 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1714  phytanoyl-CoA dioxygenase  27.24 
 
 		 293 aa  54.3  0.000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.635994  normal  0.315835 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3003  ectoine hydroxylase  26.59 
 
 		 332 aa  55.1  0.000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3060  hypothetical protein  27.12 
 
 		 268 aa  53.9  0.000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000784438  hitchhiker  0.000216713 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2128  Phytanoyl-CoA dioxygenase  37.74 
 
 		 296 aa  54.3  0.000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3076  phytanoyl-CoA dioxygenase  26.55 
 
 		 257 aa  53.9  0.000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.183167 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0397  phytanoyl-CoA dioxygenase  26.7 
 
 		 306 aa  53.9  0.000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0074  phytanoyl-CoA dioxygenase  26.7 
 
 		 282 aa  53.9  0.000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1849  ectoine hydroxylase  27.43 
 
 		 302 aa  53.9  0.000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2162  hypothetical protein  26.7 
 
 		 253 aa  53.5  0.000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3421  hypothetical protein  26.7 
 
 		 253 aa  53.5  0.000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.757627  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2748  hypothetical protein  29.63 
 
 		 276 aa  53.5  0.000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0176  phytanoyl-CoA dioxygenase  27.03 
 
 		 306 aa  53.5  0.000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2927  hypothetical protein  26.7 
 
 		 256 aa  53.5  0.000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4030  Phytanoyl-CoA dioxygenase  28.03 
 
 		 263 aa  53.1  0.000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0676207  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0213  phytanoyl-CoA dioxygenase (PhyH) family protein  26.7 
 
 		 297 aa  53.1  0.000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3916  Phytanoyl-CoA dioxygenase  28.03 
 
 		 263 aa  53.1  0.000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2990  phytanoyl-CoA dioxygenase  29.77 
 
 		 257 aa  53.1  0.000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.281214  normal  0.032087 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3264  hypothetical protein  26.7 
 
 		 306 aa  53.1  0.000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006694  CNI03700  conserved hypothetical protein  24.37 
 
 		 299 aa  52.8  0.000007  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.183271  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6323  phytanoyl-CoA dioxygenase  24.43 
 
 		 239 aa  53.1  0.000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19670  ectoine hydroxylase  23.73 
 
 		 315 aa  52.8  0.000008  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00431425 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4710  coronamic acid synthetase CmaB  24.23 
 
 		 309 aa  52.4  0.000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.25566  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1994  phytanoyl-CoA dioxygenase  27.87 
 
 		 259 aa  52  0.00001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.73105 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3047  phytanoyl-CoA dioxygenase  28.93 
 
 		 278 aa  52  0.00001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.158689  unclonable  0.000000648427 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3014  phytanoyl-CoA dioxygenase  30.94 
 
 		 275 aa  52  0.00001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.347351  normal  0.0815501 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28650  protein involved in biosynthesis of mitomycin antibiotics/polyketide fumonisin  25.75 
 
 		 258 aa  52  0.00001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3228  phytanoyl-CoA dioxygenase  23.53 
 
 		 283 aa  52  0.00001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.348283 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>