103 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_4104 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_4104  cyclic nucleotide-binding protein  100 
 
 		 163 aa  305  2.0000000000000002e-82  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.374225 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1854  cyclic nucleotide-binding protein  61.9 
 
 		 155 aa  164  4e-40  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.795804 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1575  cyclic nucleotide-binding  61.9 
 
 		 155 aa  164  5e-40  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.6817  normal  0.0500798 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1664  cyclic nucleotide-binding protein  57.62 
 
 		 159 aa  155  2e-37  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.617914 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1016  cyclic nucleotide-binding protein  63.19 
 
 		 149 aa  152  2e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1398  cyclic nucleotide-binding protein  63.83 
 
 		 168 aa  151  4e-36  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.144588  normal  0.108065 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0086  cyclic nucleotide-binding protein  40 
 
 		 160 aa  93.6  1e-18  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.929528  normal  0.0740226 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1928  cyclic nucleotide-binding protein  39.86 
 
 		 153 aa  91.7  4e-18  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2005  cyclic nucleotide-binding protein  39.86 
 
 		 153 aa  91.3  6e-18  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3764  cyclic nucleotide-binding protein  37.41 
 
 		 151 aa  90.5  8e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0964  cyclic nucleotide-binding protein  39.86 
 
 		 152 aa  90.5  9e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0331  cyclic nucleotide-binding protein  42.5 
 
 		 150 aa  89.7  2e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0211845 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4089  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  37.41 
 
 		 151 aa  89.7  2e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.998394  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0380  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  38.46 
 
 		 148 aa  84  9e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0279  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  40 
 
 		 149 aa  82.8  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.294504 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0093  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  40.46 
 
 		 149 aa  82.8  0.000000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.132878  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3055  cyclic nucleotide-binding protein  36.3 
 
 		 151 aa  82.8  0.000000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.517471  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0441  cyclic nucleotide-binding  36.92 
 
 		 148 aa  81.3  0.000000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.309044  normal  0.811617 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0285  cyclic nucleotide-binding protein  36.36 
 
 		 149 aa  80.5  0.000000000000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.512507  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3425  cyclic nucleotide-binding protein  34.48 
 
 		 151 aa  77.4  0.00000000000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0230  cyclic nucleotide-binding protein  33.33 
 
 		 150 aa  76.3  0.0000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.253117  normal  0.331569 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0178  cyclic nucleotide-binding protein  38.58 
 
 		 138 aa  73.6  0.000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.220978  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1772  cyclic nucleotide-binding protein  36.13 
 
 		 161 aa  73.6  0.000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0691544 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3942  cAMP-dependent protein kinase regulatory subunit  32.21 
 
 		 154 aa  73.6  0.000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.644852  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1892  cyclic nucleotide-binding protein  33.56 
 
 		 147 aa  70.9  0.000000000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.326195  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4229  hypothetical protein  33.1 
 
 		 151 aa  68.9  0.00000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  unclonable  0.000114025  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5607  cAMP-dependent protein kinase regulatory subunit  26.03 
 
 		 154 aa  63.5  0.000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5013  cyclic nucleotide-binding protein  32.84 
 
 		 147 aa  62.8  0.000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.32822  normal  0.191008 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7131  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  27.81 
 
 		 155 aa  62  0.000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.331754 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1291  cyclic nucleotide-binding protein  34.75 
 
 		 164 aa  61.6  0.000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.234039  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5981  cyclic nucleotide-binding protein  27.15 
 
 		 155 aa  59.7  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2750  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  29.05 
 
 		 222 aa  59.7  0.00000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0000000354449  normal  0.602467 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4405  cyclic nucleotide-binding protein  30.41 
 
 		 148 aa  56.2  0.0000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4167  cyclic nucleotide-binding protein  31.71 
 
 		 570 aa  54.7  0.0000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04890  cAMP-binding protein  33.79 
 
 		 226 aa  54.3  0.0000007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.84759 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2719  cyclic nucleotide-binding protein  30.2 
 
 		 151 aa  53.1  0.000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.460468  normal  0.384505 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3019  cyclic nucleotide-binding protein  28.03 
 
 		 149 aa  52.8  0.000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.852704  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3122  cyclic nucleotide-binding protein  27.27 
 
 		 149 aa  52.4  0.000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.196103 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4601  cyclic nucleotide-binding protein  23.97 
 
 		 154 aa  51.6  0.000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.930738 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2896  cyclic nucleotide-binding  29.85 
 
 		 194 aa  52  0.000004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.633977  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0460  Crp/FNR family transcriptional regulator  29.93 
 
 		 232 aa  50.1  0.00001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.884408 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3443  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  30.5 
 
 		 229 aa  50.4  0.00001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.12986  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3395  Crp/FNR family transcriptional regulator  30.71 
 
 		 225 aa  49.3  0.00002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1167  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  28.47 
 
 		 239 aa  49.3  0.00002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000625437  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3176  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  30.71 
 
 		 225 aa  49.3  0.00002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.231761 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3511  Crp/FNR family transcriptional regulator  31.71 
 
 		 233 aa  48.9  0.00003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0424  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  35.16 
 
 		 242 aa  48.9  0.00003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.24952 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04560  glutaminase  32.46 
 
 		 615 aa  49.3  0.00003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.393943  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02297  transcription regulator protein  30.22 
 
 		 225 aa  47.8  0.00006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.419231 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1660  Crp/FNR family transcriptional regulator  30.3 
 
 		 261 aa  47.8  0.00006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.74426  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5025  cyclic nucleotide-binding  30.84 
 
 		 749 aa  47.8  0.00006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0554599  normal  0.33022 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3367  Crp/FNR family transcriptional regulator  29.27 
 
 		 230 aa  47.8  0.00007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8903  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  36.28 
 
 		 224 aa  47.4  0.00008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS01902  putative transcription regulator protein  30.99 
 
 		 239 aa  46.6  0.0001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.980965  normal  0.145891 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4483  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  37.04 
 
 		 243 aa  46.6  0.0001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.183908 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4617  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  37.04 
 
 		 243 aa  46.6  0.0001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.652735  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1066  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  30.43 
 
 		 225 aa  47  0.0001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0339  cyclic nucleotide-binding  31.94 
 
 		 225 aa  45.8  0.0002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1521  cyclic nucleotide-binding protein  31.11 
 
 		 153 aa  45.8  0.0002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  hitchhiker  0.000183504  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1010  CRP/FNR family transcriptional regulator  43.86 
 
 		 257 aa  46.2  0.0002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3831  cyclic nucleotide-binding protein  28.21 
 
 		 435 aa  45.8  0.0002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0387698 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3095  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  33.33 
 
 		 220 aa  45.4  0.0003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000148221 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4030  cyclic nucleotide-binding protein  26.61 
 
 		 173 aa  44.7  0.0006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.900362 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25400  cAMP-binding protein  29.58 
 
 		 225 aa  44.7  0.0006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3368  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  31.06 
 
 		 503 aa  44.7  0.0006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.00879958  normal  0.135189 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1803  Crp/FNR family transcriptional regulator  26.47 
 
 		 249 aa  44.3  0.0007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0808632  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0619  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  27.94 
 
 		 229 aa  43.5  0.001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2817  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  27.94 
 
 		 229 aa  43.5  0.001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0426  Na+/H+ antiporter  35.71 
 
 		 832 aa  43.9  0.001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1801  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  27.94 
 
 		 229 aa  43.9  0.001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3249  cyclic nucleotide-binding protein  23.29 
 
 		 171 aa  43.5  0.001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2392  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  27.94 
 
 		 230 aa  43.9  0.001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2895  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  27.94 
 
 		 230 aa  43.9  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.869141  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2082  cyclic nucleotide-binding protein  35.71 
 
 		 832 aa  43.9  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.584605  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2695  cyclic nucleotide-binding protein  27.94 
 
 		 229 aa  43.5  0.001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2752  cyclic nucleotide-binding protein  27.94 
 
 		 230 aa  43.9  0.001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.339389  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1706  cyclic nucleotide-binding protein  27.94 
 
 		 230 aa  43.9  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.450772  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18280  cAMP-binding protein  31.94 
 
 		 225 aa  43.5  0.001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.186071  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1036  cyclic nucleotide-binding  26.43 
 
 		 245 aa  42.7  0.002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3025  cyclic nucleotide-binding domain-containing protein  25.56 
 
 		 179 aa  42.7  0.002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0339332  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2350  cyclic nucleotide-binding protein  29.91 
 
 		 832 aa  43.1  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5745  transcriptional regulator  25 
 
 		 243 aa  43.1  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.810963  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2102  Crp/FNR family transcriptional regulator  28.45 
 
 		 226 aa  42.7  0.002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000889631  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3038  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  30.07 
 
 		 225 aa  42.7  0.002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0258  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  34.4 
 
 		 222 aa  42.4  0.003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4322  cyclic nucleotide-binding  28.78 
 
 		 225 aa  41.6  0.004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0230513 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0559  Crp/FNR family transcriptional regulator  38.18 
 
 		 225 aa  41.6  0.004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.338488  normal  0.42035 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3062  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  25.98 
 
 		 232 aa  42  0.004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26230  cAMP-binding protein  26.06 
 
 		 225 aa  42  0.004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.466611  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0328  Crp/FNR family transcriptional regulator  33.06 
 
 		 246 aa  41.6  0.005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0277272  normal  0.0570772 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4762  Crp/FNR family transcriptional regulator  28.78 
 
 		 225 aa  41.6  0.005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.900483  hitchhiker  0.0000929699 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3408  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  27.19 
 
 		 243 aa  41.6  0.005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.258046 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2266  transcriptional regulator, putative  32.2 
 
 		 251 aa  41.2  0.006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.578468  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0117  cyclic nucleotide-binding: regulatory protein, Crp  30.25 
 
 		 228 aa  41.2  0.006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0894  cyclic nucleotide-binding  35.9 
 
 		 226 aa  41.2  0.006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1089  cyclic nucleotide-binding protein  32.2 
 
 		 251 aa  41.2  0.006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.30583  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0934  cyclic nucleotide-binding  32.2 
 
 		 251 aa  41.2  0.006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.059861  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0938  cyclic nucleotide-binding protein  32.2 
 
 		 251 aa  41.2  0.006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.914927  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2143  putative transcriptional regulator  32.2 
 
 		 251 aa  41.2  0.006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2606  transcriptional regulator, Crp/Fnr family  30.34 
 
 		 253 aa  41.2  0.006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.193309  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>