More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_4867 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010725  Mpop_4867  ApbE family lipoprotein  100 
 
 		 324 aa  620  1e-176  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.307631  normal  0.1173 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1333  ApbE family lipoprotein  85.14 
 
 		 325 aa  470  1.0000000000000001e-131  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.254528 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1534  ApbE family lipoprotein  84.41 
 
 		 326 aa  462  1e-129  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2415  ApbE family lipoprotein  77.63 
 
 		 325 aa  398  9.999999999999999e-111  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.410887  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3618  ApbE family lipoprotein  60.7 
 
 		 320 aa  281  1e-74  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.128321  normal  0.0802479 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2638  ApbE family lipoprotein  39.49 
 
 		 344 aa  207  2e-52  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.489922  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0433  twin-arginine translocation pathway signal  43.26 
 
 		 333 aa  191  1e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2856  ApbE family lipoprotein  41.59 
 
 		 330 aa  188  1e-46  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3962  ApbE family lipoprotein  45.13 
 
 		 327 aa  186  4e-46  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.376919  normal  0.0354055 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2356  ApbE family lipoprotein  43.33 
 
 		 332 aa  177  2e-43  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3147  twin-arginine translocation pathway signal  40.21 
 
 		 344 aa  175  9.999999999999999e-43  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6245  ApbE family lipoprotein  46.96 
 
 		 264 aa  168  1e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6013  nitrous oxide reductase accessory protein NosX (required for nitrous oxide reduction), ApbE-like lipoprotein  37.86 
 
 		 332 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.279768  normal  0.154991 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4214  ApbE family lipoprotein  42.8 
 
 		 304 aa  160  2e-38  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0151609  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3168  ApbE family lipoprotein  38.08 
 
 		 313 aa  147  2.0000000000000003e-34  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0280  nosX protein  36.48 
 
 		 330 aa  139  6e-32  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1342  ApbE family lipoprotein  34.35 
 
 		 344 aa  139  6e-32  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  decreased coverage  0.00000274029  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1387  ApbE-like lipoprotein  31.51 
 
 		 350 aa  139  7.999999999999999e-32  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.184425  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1956  thiamine biosynthesis lipoprotein  32.31 
 
 		 363 aa  137  2e-31  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14840  ApbE family lipoprotein  30.82 
 
 		 360 aa  137  3.0000000000000003e-31  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.173743  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3326  hypothetical protein  39.64 
 
 		 300 aa  137  3.0000000000000003e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.128315 
 
 
-
 
NC_002936  DET1595  ApbE/NosX family protein  32.99 
 
 		 344 aa  136  5e-31  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.0000126725  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1244  ApbE family lipoprotein  35.14 
 
 		 347 aa  134  1.9999999999999998e-30  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.75152  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1478  thiamine biosynthesis lipoprotein  33.92 
 
 		 357 aa  134  1.9999999999999998e-30  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000175227  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1667  ApbE family lipoprotein  35.68 
 
 		 332 aa  133  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.569601 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3592  ApbE family lipoprotein  32.1 
 
 		 332 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.481358 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4070  ApbE family lipoprotein  30.1 
 
 		 335 aa  130  3e-29  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.785623  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1691  ApbE family lipoprotein  33.21 
 
 		 338 aa  129  5.0000000000000004e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.258239 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4341  ApbE family lipoprotein  33.8 
 
 		 336 aa  129  5.0000000000000004e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2150  ApbE family lipoprotein  34.44 
 
 		 332 aa  129  8.000000000000001e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.344488  normal  0.0417056 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1954  ApbE family lipoprotein  33.1 
 
 		 337 aa  128  1.0000000000000001e-28  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.355281  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0516  ApbE family lipoprotein  34.83 
 
 		 336 aa  127  3e-28  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.0154508 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0536  ApbE family lipoprotein  31.65 
 
 		 345 aa  126  5e-28  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14280  ApbE family lipoprotein  33.21 
 
 		 336 aa  125  7e-28  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  3.71424e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1825  ApbE family lipoprotein  35.36 
 
 		 336 aa  125  9e-28  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3863  ApbE-like lipoprotein  35.02 
 
 		 349 aa  125  1e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0587  hypotehtical protein  30.91 
 
 		 342 aa  123  5e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3727  thiamine biosynthesis protein  39.83 
 
 		 345 aa  121  9.999999999999999e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.351343 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3199  putative nitrous-oxide reductase protein NosX  39.66 
 
 		 302 aa  122  9.999999999999999e-27  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0685  ApbE family lipoprotein  38.24 
 
 		 298 aa  121  9.999999999999999e-27  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0743531  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1097  ApbE family lipoprotein  26.62 
 
 		 339 aa  120  3e-26  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000910901  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1216  thiamine biosynthesis lipoprotein  32.97 
 
 		 336 aa  120  3.9999999999999996e-26  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25360  putative thiamine biosynthesis lipoprotein  35.5 
 
 		 342 aa  120  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2363  putative thiamin biosynthesis lipoprotein ApbE  25.08 
 
 		 343 aa  119  7e-26  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2693  ApbE family lipoprotein  29.47 
 
 		 352 aa  119  7e-26  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00390804 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2727  ApbE-like lipoprotein  33.94 
 
 		 355 aa  117  1.9999999999999998e-25  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.619342  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3036  ApbE family lipoprotein  27.15 
 
 		 381 aa  118  1.9999999999999998e-25  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000431252  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0552  ApbE family lipoprotein  33.45 
 
 		 351 aa  115  1.0000000000000001e-24  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0673  ApbE family lipoprotein  29.28 
 
 		 345 aa  115  1.0000000000000001e-24  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.38992  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14650  thiamine biosynthesis lipoprotein  36.32 
 
 		 337 aa  114  3e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1569  ApbE family protein  36.12 
 
 		 306 aa  114  3e-24  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.339212  normal  0.0160978 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1713  thiamine biosynthesis lipoprotein ApbE precursor  35.03 
 
 		 326 aa  114  3e-24  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.732965  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0693  ApbE family lipoprotein  37.5 
 
 		 379 aa  114  3e-24  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1601  ApbE family lipoprotein  31.25 
 
 		 341 aa  113  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0279572  normal  0.0160847 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2166  putative lipoprotein  35.54 
 
 		 342 aa  113  5e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1642  ApbE family lipoprotein  35.12 
 
 		 326 aa  112  6e-24  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1664  ApbE family lipoprotein  29.13 
 
 		 328 aa  112  7.000000000000001e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.517464 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0427  ApbE family lipoprotein  37.84 
 
 		 287 aa  111  2.0000000000000002e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.127952  normal  0.810308 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2411  thiamine biosynthesis lipoprotein ApbE, putative  35.54 
 
 		 310 aa  110  3e-23  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.39462  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4038  ApbE family lipoprotein  33.68 
 
 		 386 aa  108  9.000000000000001e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.618341  normal  0.564525 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1239  ApbE family lipoprotein  30.39 
 
 		 349 aa  108  1e-22  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1717  ApbE family lipoprotein  30 
 
 		 337 aa  108  2e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.117102  normal  0.0292335 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1073  ApbE family lipoprotein  35.77 
 
 		 331 aa  107  2e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.651926  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5212  ApbE-like lipoprotein  35.29 
 
 		 335 aa  107  4e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1611  ApbE family lipoprotein  35.48 
 
 		 331 aa  107  4e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.288201 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0982  ApbE family lipoprotein  29.52 
 
 		 353 aa  106  5e-22  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1216  ApbE family lipoprotein  29.86 
 
 		 349 aa  105  8e-22  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0350  ApbE family lipoprotein  32.86 
 
 		 339 aa  105  9e-22  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5054  ApbE family lipoprotein  35.44 
 
 		 362 aa  105  9e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.288464  normal  0.124828 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0752  ApbE family lipoprotein  30.39 
 
 		 344 aa  105  9e-22  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1874  ApbE family lipoprotein  29.96 
 
 		 317 aa  105  1e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0211225  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1523  ApbE family lipoprotein  25 
 
 		 350 aa  104  2e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2813  ApbE family lipoprotein  32.73 
 
 		 308 aa  104  2e-21  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0000198345  hitchhiker  0.00117663 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5637  ApbE-like lipoprotein, membrane-associated lipoprotein involved in thiamine biosynthesis  36.04 
 
 		 337 aa  103  3e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.85012 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1803  thiamine biosynthesis lipoprotein  32.93 
 
 		 349 aa  103  4e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1597  ApbE family lipoprotein  29.93 
 
 		 308 aa  103  5e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1461  ApbE family lipoprotein  32.31 
 
 		 345 aa  102  9e-21  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1484  ApbE family lipoprotein  31.4 
 
 		 369 aa  102  1e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0759035 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0035  hypothetical protein  31.54 
 
 		 331 aa  100  2e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0561  ApbE-like lipoprotein  30.18 
 
 		 348 aa  100  3e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1144  ApbE family lipoprotein  31.23 
 
 		 338 aa  100  3e-20  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.301499  normal  0.219283 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1499  ApbE family lipoprotein  27.27 
 
 		 380 aa  100  3e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000152679  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2606  ApbE family lipoprotein  30.51 
 
 		 323 aa  100  4e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.636226  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3611  ApbE family lipoprotein  30.74 
 
 		 338 aa  100  4e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.698198  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1571  ApbE-like lipoprotein  35.02 
 
 		 331 aa  99.8  6e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1925  ApbE family lipoprotein  32 
 
 		 349 aa  99.4  8e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3991  ApbE family lipoprotein  35.94 
 
 		 341 aa  98.6  1e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.604582 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1878  thiamin biosynthesis lipoprotein ApbE  32.51 
 
 		 367 aa  99  1e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2875  ApbE family lipoprotein  30.69 
 
 		 338 aa  98.6  1e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2614  ApbE family protein  30.43 
 
 		 371 aa  98.2  2e-19  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3233  ApbE family lipoprotein  33.86 
 
 		 344 aa  97.8  2e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000188784  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1504  ApbE family lipoprotein  31.08 
 
 		 366 aa  98.2  2e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00453066  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2455  thiamine biosynthesis lipoprotein ApbE  33.33 
 
 		 348 aa  97.8  2e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.489519  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0427  ApbE-like lipoprotein  32.37 
 
 		 332 aa  97.4  3e-19  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.846061  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2380  ApbE family lipoprotein  33.94 
 
 		 368 aa  97.1  4e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3311  thiamine biosynthesis lipoprotein  33.06 
 
 		 331 aa  96.7  4e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.465607  hitchhiker  0.00000384441 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3160  putative thiamine biosynthesis lipoprotein apbE  33.06 
 
 		 345 aa  97.1  4e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2292  ApbE family lipoprotein  33.94 
 
 		 365 aa  97.1  4e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.715586  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3299  ApbE family lipoprotein  33.06 
 
 		 359 aa  96.7  5e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.753835  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3569  membrane protein  28.37 
 
 		 336 aa  96.7  5e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.325217 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>