276 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_4616 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011757  Mchl_4502  polysaccharide export protein  88.56 
 
 
455 aa  748  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.317742 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4616  polysaccharide export protein  100 
 
 
439 aa  856  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.139503  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4134  polysaccharide export protein  88.33 
 
 
455 aa  746  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.285347  normal  0.57622 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5609  polysaccharide export protein  37.17 
 
 
419 aa  199  8e-50  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4555  polysaccharide export protein  28.5 
 
 
452 aa  111  2e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0860  polysaccharide export protein  30.48 
 
 
437 aa  110  7e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0360  exopolysaccharide biosynthesis protein Bme11  28.41 
 
 
415 aa  102  2e-20  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.459343  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0417  exopolysaccharide biosynthesis protein Bme11  28.41 
 
 
415 aa  102  2e-20  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.125789  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6217  polysaccharide export protein  27.19 
 
 
436 aa  101  3e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.453567  normal  0.166454 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2548  Outer membrane polysaccharide export protein, exoF  28.29 
 
 
410 aa  98.2  3e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1903  polysaccharide export protein  42.62 
 
 
221 aa  97.8  3e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1207  polysaccharide export protein  28.29 
 
 
410 aa  98.2  3e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.150349 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6413  polysaccharide export protein  26.82 
 
 
438 aa  97.8  4e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0105958  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3370  polysaccharide export protein  27.4 
 
 
415 aa  96.3  1e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4819  polysaccharide export protein  45.19 
 
 
200 aa  93.6  6e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3534  polysaccharide export protein  29.62 
 
 
435 aa  93.6  6e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4708  polysaccharide export protein  37.07 
 
 
219 aa  93.2  7e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.655126  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6499  polysaccharide export protein  46.23 
 
 
205 aa  92.8  1e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0776  putative capsule polysaccharide export protein  35.14 
 
 
196 aa  91.3  3e-17  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0783  capsule polysaccharide export protein, putative  35.14 
 
 
195 aa  91.3  3e-17  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.886397  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1974  polysaccharide export protein  28.17 
 
 
411 aa  91.3  3e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.154701 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4531  polysaccharide export protein  40.19 
 
 
208 aa  91.3  3e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1414  polysaccharide export protein  37.61 
 
 
234 aa  90.5  5e-17  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.639365 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2696  polysaccharide export protein  35.97 
 
 
196 aa  89.7  8e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.975578 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2464  polysaccharide export protein  39.13 
 
 
235 aa  89  1e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.719315  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7871  hypothetical protein  36.44 
 
 
238 aa  88.6  2e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_4037  polysaccharide export protein  39.13 
 
 
235 aa  89  2e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2593  polysaccharide export protein  28.24 
 
 
442 aa  89  2e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2506  polysaccharide export protein  35.66 
 
 
196 aa  88.2  2e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1809  polysaccharide export protein  41.35 
 
 
192 aa  87.8  3e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6739  polysaccharide export protein  27.85 
 
 
370 aa  87.8  3e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.474516  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0309  polysaccharide export protein  40.38 
 
 
195 aa  88.2  3e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.313034  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1858  polysaccharide export protein  41.35 
 
 
192 aa  87.8  4e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.210486  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2193  polysaccharide export protein  41.35 
 
 
192 aa  87.8  4e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.136002  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1487  polysaccharide export protein  37.74 
 
 
193 aa  87  6e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0270462  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02478  polysaccharide export periplasmic protein  42.31 
 
 
153 aa  86.7  7e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4815  polysaccharide export protein  27.91 
 
 
434 aa  86.7  7e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1665  polysaccharide export protein  39.42 
 
 
189 aa  86.7  8e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2957  polysaccharide export protein  40.38 
 
 
190 aa  85.9  1e-15  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.836808  normal  0.0520803 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3174  polysaccharide export protein  33.33 
 
 
185 aa  86.3  1e-15  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1312  polysaccharide export protein  35.21 
 
 
191 aa  85.9  1e-15  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4940  polysaccharide export protein  37.5 
 
 
247 aa  85.5  2e-15  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.89418 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0586  polysaccharide export protein  37.5 
 
 
185 aa  85.5  2e-15  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1156  polysaccharide export protein  35.66 
 
 
187 aa  85.1  2e-15  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.508119  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0791  polysaccharide export protein  36.43 
 
 
216 aa  84.3  4e-15  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.22146  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0460  hypothetical protein  40.38 
 
 
175 aa  84.3  4e-15  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4418  polysaccharide export protein  35.71 
 
 
220 aa  83.6  6e-15  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3135  polysaccharide export protein  25.76 
 
 
459 aa  83.6  7e-15  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.248104  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5320  polysaccharide export protein  37.27 
 
 
213 aa  83.2  8e-15  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.884665  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5213  polysaccharide export protein  39.42 
 
 
190 aa  82.8  1e-14  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.118373  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3000  polysaccharide export protein  35.04 
 
 
186 aa  83.2  1e-14  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.912736  normal  0.44921 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3022  polysaccharide export protein  33.05 
 
 
451 aa  82.4  2e-14  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1524  polysaccharide export protein  41.9 
 
 
196 aa  82  2e-14  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1224  polysaccharide export protein  36.44 
 
 
191 aa  81.6  2e-14  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6863  polysaccharide export protein  29.13 
 
 
529 aa  81.6  3e-14  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4309  polysaccharide export protein  34.5 
 
 
495 aa  81.3  3e-14  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3558  polysaccharide export protein  35.58 
 
 
185 aa  80.5  6e-14  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0652  polysaccharide export protein  25.21 
 
 
427 aa  77.8  3e-13  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2814  polysaccharide export protein  39.05 
 
 
177 aa  76.6  7e-13  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0853  polysaccharide export protein  35.58 
 
 
191 aa  77  7e-13  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.317786 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3405  hypothetical protein  35.96 
 
 
410 aa  75.9  1e-12  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1072  polysaccharide export protein  28.69 
 
 
423 aa  75.5  2e-12  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.660733  normal  0.636279 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3695  polysaccharide export protein  27.75 
 
 
441 aa  75.5  2e-12  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.597234  normal  0.443587 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001324  Capsular polysaccharide synthesis enzyme CpsC polysaccharide export  37.27 
 
 
177 aa  75.1  2e-12  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.414025  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1072  polysaccharide export protein  39.42 
 
 
178 aa  75.5  2e-12  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.875269  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1384  polysaccharide export protein  36.54 
 
 
178 aa  74.3  4e-12  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.121569  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0458  polysaccharide biosynthesis/export protein  32.76 
 
 
193 aa  73.9  5e-12  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4578  polysaccharide export protein  26.41 
 
 
417 aa  73.9  5e-12  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.653885  normal  0.998934 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0810  polysaccharide export protein  41.35 
 
 
184 aa  73.9  5e-12  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05205  hypothetical protein  35.45 
 
 
177 aa  73.6  8e-12  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1455  polysaccharide export protein  26.33 
 
 
816 aa  73.2  9e-12  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3407  polysaccharide export protein  24.94 
 
 
461 aa  71.2  3e-11  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.531923 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4945  polysaccharide export protein  25.75 
 
 
422 aa  70.5  6e-11  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.330229 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3287  polysaccharide export protein  31.5 
 
 
492 aa  70.1  7e-11  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4001  polysaccharide export protein  25.69 
 
 
192 aa  70.1  8e-11  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3013  polysaccharide export protein  34.53 
 
 
270 aa  68.9  1e-10  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1061  polysaccharide export protein  32.98 
 
 
478 aa  68.6  2e-10  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0167243  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5877  polysaccharide export protein  27.19 
 
 
425 aa  68.6  2e-10  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0694613  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1175  polysaccharide biosynthesis/export protein  34.45 
 
 
152 aa  67.8  3e-10  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.265571  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1588  polysaccharide export protein  35.67 
 
 
257 aa  68.2  3e-10  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.101952  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3561  polysaccharide export protein  24.58 
 
 
441 aa  67.4  4e-10  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4601  polysaccharide export protein  34.23 
 
 
473 aa  67.4  5e-10  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.930879 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1669  polysaccharide export protein  30.52 
 
 
347 aa  67.4  5e-10  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  1.78188e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4816  polysaccharide export protein  32.89 
 
 
253 aa  67  7e-10  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.769943 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2236  polysaccharide export protein  29.82 
 
 
948 aa  67  7e-10  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.987184  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5937  exopolysaccharide production protein  23.28 
 
 
426 aa  65.5  2e-09  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3311  polysaccharide export protein  36.57 
 
 
324 aa  64.7  3e-09  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.328062 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1444  polysaccharide export protein  33.33 
 
 
252 aa  63.2  9e-09  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3803  polysaccharide export protein  32.86 
 
 
344 aa  62.4  1e-08  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02766  hypothetical protein  34.58 
 
 
558 aa  62  2e-08  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  3.32683e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1515  polysaccharide export protein  31.86 
 
 
869 aa  62.4  2e-08  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000317972  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02816  KpsD protein  34.58 
 
 
558 aa  62  2e-08  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  4.3482e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0734  polysaccharide export protein  33.33 
 
 
192 aa  61.6  2e-08  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0580696  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4021  polysaccharide export protein  29.61 
 
 
451 aa  62  2e-08  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4611  polysaccharide export protein  25.19 
 
 
429 aa  60.8  4e-08  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.831894  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1795  polysaccharide export outer membrane protein  32.21 
 
 
264 aa  60.8  4e-08  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2184  polysaccharide export protein  28.8 
 
 
833 aa  60.8  5e-08  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.243697  hitchhiker  0.000313767 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1508  polysaccharide export protein  28.26 
 
 
495 aa  60.5  5e-08  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3223  polysaccharide export protein  30.99 
 
 
237 aa  60.8  5e-08  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0801201  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1013  hypothetical protein  27.82 
 
 
191 aa  60.5  6e-08  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.528873  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>