154 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_8318 on replicon NC_011892
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011892  Mnod_8318  amidohydrolase 2  100 
 
 
312 aa  627  1e-179  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.778214  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5617  amidohydrolase 2  81.09 
 
 
312 aa  498  1e-140  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4135  amidohydrolase 2  75 
 
 
309 aa  459  9.999999999999999e-129  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3820  amidohydrolase 2  53.17 
 
 
304 aa  317  2e-85  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5473  amidohydrolase 2  49.02 
 
 
310 aa  305  5.0000000000000004e-82  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5389  amidohydrolase 2  49.02 
 
 
310 aa  305  5.0000000000000004e-82  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0731638 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4881  amidohydrolase 2  48.37 
 
 
310 aa  303  2.0000000000000002e-81  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4697  amidohydrolase 2  49.82 
 
 
310 aa  299  3e-80  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2724  amidohydrolase 2  49.83 
 
 
308 aa  280  2e-74  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0290847 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4132  amidohydrolase 2  51.56 
 
 
315 aa  271  1e-71  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.665287  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4612  amidohydrolase 2  49.44 
 
 
282 aa  269  5e-71  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.219345  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6262  amidohydrolase 2  50.52 
 
 
290 aa  268  1e-70  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3895  amidohydrolase 2  47.16 
 
 
297 aa  262  6e-69  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  decreased coverage  0.00259115  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5616  amidohydrolase 2  44.95 
 
 
321 aa  248  7e-65  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4134  amidohydrolase 2  48.44 
 
 
320 aa  246  3e-64  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4279  amidohydrolase 2  45.8 
 
 
311 aa  244  9.999999999999999e-64  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4273  amidohydrolase 2  47.24 
 
 
296 aa  238  1e-61  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0246696  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1313  amidohydrolase 2  47.39 
 
 
274 aa  234  1.0000000000000001e-60  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.885703 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3836  amidohydrolase 2  47.55 
 
 
293 aa  230  2e-59  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0308229  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4532  amidohydrolase 2  47.55 
 
 
293 aa  230  2e-59  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.289209  normal  0.958952 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5772  amidohydrolase 2  47.17 
 
 
293 aa  229  4e-59  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0604  amidohydrolase family protein  43.98 
 
 
286 aa  228  1e-58  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.99939 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4571  amidohydrolase 2  42.05 
 
 
272 aa  226  4e-58  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.192753 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3514  amidohydrolase 2  44.2 
 
 
273 aa  216  5e-55  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0429106  normal  0.234252 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001537  putative dicarboxylic acid hydrolase  40.29 
 
 
289 aa  212  7e-54  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2475  amidohydrolase 2  41.61 
 
 
287 aa  209  4e-53  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2123  amidohydrolase family protein  39.86 
 
 
275 aa  209  4e-53  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.668761  normal  0.0985236 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2151  amidohydrolase family protein  39.86 
 
 
289 aa  209  5e-53  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.253711  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2260  amidohydrolase 2  39.49 
 
 
289 aa  207  1e-52  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1073  amidohydrolase 2  41.85 
 
 
289 aa  205  1e-51  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6996  amidohydrolase 2  41.73 
 
 
271 aa  204  1e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1693  amidohydrolase 2  39.05 
 
 
300 aa  204  1e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.852729 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0981  hydrolase, putative  41.73 
 
 
271 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1031  amidohydrolase 2  41.54 
 
 
295 aa  197  2.0000000000000003e-49  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0960801  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0589  putative hydrolase  37.23 
 
 
306 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0213615  normal  0.523207 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2147  amidohydrolase 2  38.97 
 
 
290 aa  196  4.0000000000000005e-49  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0660  putative hydrolase  43.07 
 
 
294 aa  195  9e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.436551 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0193  amidohydrolase 2  40.94 
 
 
286 aa  194  2e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000000547733  decreased coverage  0.0000789992 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0977  putative hydrolase  39.34 
 
 
286 aa  193  3e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.001407  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3359  amidohydrolase 2  38.41 
 
 
307 aa  193  3e-48  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4447  amidohydrolase 2  38.62 
 
 
305 aa  193  3e-48  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0655397  normal  0.0912133 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8626  amidohydrolase 2  41.13 
 
 
280 aa  192  5e-48  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.232295  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1280  amidohydrolase 2  39.56 
 
 
291 aa  191  1e-47  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.678089  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3887  amidohydrolase 2  38.75 
 
 
302 aa  191  2e-47  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.542754  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1940  putative amidohydrolase  40.07 
 
 
289 aa  190  2.9999999999999997e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000181471  normal  0.171226 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5181  amidohydrolase 2  38.62 
 
 
304 aa  189  4e-47  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3726  amidohydrolase 2  37.32 
 
 
283 aa  189  7e-47  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0502  amidohydrolase 2  39.82 
 
 
325 aa  189  7e-47  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0984  amidohydrolase 2  37.93 
 
 
327 aa  187  2e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0569292  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0874  amidohydrolase 2  37.24 
 
 
304 aa  186  3e-46  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.706401  normal  0.426868 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0169  amidohydrolase 2  39.31 
 
 
305 aa  186  3e-46  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.644601  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2700  2-pyrone-4,6-dicarboxylic acid hydrolase  37.59 
 
 
304 aa  186  5e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.613072 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2744  hypothetical protein  34.69 
 
 
323 aa  186  5e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.303494 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0332  amidohydrolase 2  37.24 
 
 
313 aa  186  6e-46  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4374  amidohydrolase 2  36.54 
 
 
312 aa  185  1.0000000000000001e-45  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.592913  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2029  amidohydrolase 2  37.24 
 
 
312 aa  184  2.0000000000000003e-45  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.523659  normal  0.974074 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3003  hypothetical protein  34.66 
 
 
320 aa  184  2.0000000000000003e-45  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3635  amidohydrolase 2  36.73 
 
 
314 aa  184  2.0000000000000003e-45  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3261  amidohydrolase 2  38.99 
 
 
290 aa  183  3e-45  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.71996 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3988  amidohydrolase 2  50 
 
 
198 aa  183  4.0000000000000006e-45  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3940  amidohydrolase 2  36.96 
 
 
290 aa  182  4.0000000000000006e-45  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.916411  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4101  amidohydrolase 2  50 
 
 
198 aa  183  4.0000000000000006e-45  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.254374 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3206  amidohydrolase 2  37.59 
 
 
302 aa  180  2e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6113  amidohydrolase 2  39.35 
 
 
295 aa  180  2.9999999999999997e-44  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1458  amidohydrolase 2  35.51 
 
 
287 aa  179  4.999999999999999e-44  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1365  amidohydrolase 2  35.51 
 
 
287 aa  178  1e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.306085 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1270  amidohydrolase 2  38.41 
 
 
300 aa  176  3e-43  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3066  amidohydrolase 2  38.13 
 
 
302 aa  176  4e-43  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.190851  normal  0.0386103 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4322  amidohydrolase 2  36.21 
 
 
302 aa  176  5e-43  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.981758  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2819  amidohydrolase 2  35.99 
 
 
296 aa  168  1e-40  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.146112  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1945  amidohydrolase 2  34.8 
 
 
287 aa  162  9e-39  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3956  amidohydrolase 2  33.33 
 
 
290 aa  160  2e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3756  amidohydrolase 2  36.03 
 
 
296 aa  157  2e-37  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5930  amidohydrolase 2  36.04 
 
 
295 aa  156  4e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3369  amidohydrolase 2  34.57 
 
 
301 aa  155  9e-37  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.351724  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4566  amidohydrolase 2  36.3 
 
 
296 aa  155  1e-36  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0738992  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2408  amidohydrolase 2  35.36 
 
 
295 aa  152  8e-36  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0387251  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4267  amidohydrolase 2  36.59 
 
 
296 aa  148  1.0000000000000001e-34  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.73633  normal  0.33562 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6154  amidohydrolase 2  38.43 
 
 
274 aa  143  3e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.960542  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0867  amidohydrolase 2  35.14 
 
 
290 aa  134  1.9999999999999998e-30  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.898872  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4835  amidohydrolase 2  34.19 
 
 
303 aa  129  9.000000000000001e-29  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2846  amidohydrolase 2  32.71 
 
 
275 aa  126  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.648145  normal  0.556731 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7150  amidohydrolase 2  32.49 
 
 
295 aa  126  4.0000000000000003e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.292844 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2685  hydrolase  33.82 
 
 
308 aa  124  2e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5880  amidohydrolase 2  32.98 
 
 
285 aa  124  2e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1548  amidohydrolase 2  33.21 
 
 
276 aa  123  4e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.623186  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1603  hydrolase  34.19 
 
 
324 aa  123  5e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.454229  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0866  hydrolase  34.19 
 
 
330 aa  122  6e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1387  hydrolase  34.19 
 
 
330 aa  122  6e-27  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0488  hydrolase  34.19 
 
 
330 aa  122  6e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1624  amidohydrolase family protein  34.19 
 
 
327 aa  122  6e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0669  amidohydrolase family protein  34.19 
 
 
330 aa  122  6e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.450151  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1785  hydrolase  34.19 
 
 
368 aa  122  7e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3372  amidohydrolase 2  33.62 
 
 
271 aa  117  1.9999999999999998e-25  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.735405 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1615  amidohydrolase 2  34.04 
 
 
296 aa  117  3e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.144238  normal  0.232419 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5578  amidohydrolase 2  32.84 
 
 
277 aa  117  3e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006692  CNG01560  conserved hypothetical protein  27.1 
 
 
318 aa  115  1.0000000000000001e-24  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00939  TIM barrel metal-dependent hydrolase, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G16240)  31.14 
 
 
318 aa  113  4.0000000000000004e-24  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1699  amidohydrolase 2  29.09 
 
 
280 aa  112  8.000000000000001e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.138527 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3133  amidohydrolase 2  31.16 
 
 
281 aa  111  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.118734  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>