More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_7396 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_7396  Peptidase M23  100 
 
 		 537 aa  1022    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.128641  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6574  peptidase M23B  66.12 
 
 		 501 aa  531  1e-149  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.189098  normal  0.018456 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2699  peptidase M23  40.14 
 
 		 500 aa  289  9e-77  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.349979  normal  0.95229 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2270  peptidase M23  88.8 
 
 		 494 aa  242  1e-62  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0701101  normal  0.561142 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4750  Peptidase M23  88.03 
 
 		 446 aa  227  5.0000000000000005e-58  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.282212 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4601  Peptidase M23  87.18 
 
 		 455 aa  224  2e-57  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0813649  normal  0.686442 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4231  peptidase M23B  87.18 
 
 		 451 aa  225  2e-57  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4409  putative peptidoglycan-binding LysM  61.45 
 
 		 484 aa  191  2.9999999999999997e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.35842 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3178  Peptidase M23  70.25 
 
 		 471 aa  187  3e-46  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0130239  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1341  Peptidase M23  71.79 
 
 		 417 aa  187  5e-46  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.734958 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1772  peptidase M23B  64.93 
 
 		 453 aa  179  9e-44  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.306427  decreased coverage  0.00457712 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1795  peptidase M23B  68.33 
 
 		 449 aa  178  2e-43  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.792228  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2781  peptidase M23B  66.12 
 
 		 478 aa  178  3e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.705886 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2522  peptidase M23B  65.12 
 
 		 464 aa  177  4e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.158439  normal  0.260963 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4412  peptidase M23B  57.14 
 
 		 447 aa  177  5e-43  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.276526  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2736  peptidase M23B  65.29 
 
 		 474 aa  177  5e-43  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.446493 
 
 
-
 
NC_004310  BR0888  M24/M37 family peptidase  46.41 
 
 		 427 aa  153  7e-36  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0884  M24/M37 family peptidase  46.41 
 
 		 427 aa  153  7e-36  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2339  peptidase M23B  49.02 
 
 		 438 aa  150  6e-35  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3033  peptidase M23B  49.61 
 
 		 328 aa  143  6e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1901  peptidase M23B  53.38 
 
 		 323 aa  142  9.999999999999999e-33  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.312919 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1171  peptidase M23B  42.71 
 
 		 509 aa  141  3e-32  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.816034  normal  0.264871 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1493  Peptidase M23  39.63 
 
 		 530 aa  140  3.9999999999999997e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.323244 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1691  Peptidase M23  42.77 
 
 		 534 aa  138  3.0000000000000003e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2662  lipoprotein  52.5 
 
 		 538 aa  135  9.999999999999999e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0792091  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002515  membrane protein  41.9 
 
 		 307 aa  128  3e-28  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1176  peptidase M23B  44.3 
 
 		 285 aa  125  2e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.534318  normal  0.430733 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1297  peptidase M23B  43.95 
 
 		 270 aa  124  3e-27  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0650361  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0639  peptidase M23B  47.62 
 
 		 394 aa  125  3e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  hitchhiker  0.00338923  normal  0.454095 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38690  lipoprotein NlpD  45.75 
 
 		 284 aa  123  7e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0521  LysM/M23 peptidase  35.64 
 
 		 397 aa  123  7e-27  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.939953  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3021  peptidase M23B  44 
 
 		 293 aa  123  9e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000191073 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4155  peptidase M23B  46.21 
 
 		 262 aa  123  9e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.647334  normal  0.0748574 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1622  peptidase M23B  46.21 
 
 		 262 aa  122  9.999999999999999e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.752531  normal  0.248121 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03518  hypothetical protein  40 
 
 		 307 aa  120  4.9999999999999996e-26  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0330  peptidoglycan-specific endopeptidase, M23 family  45.74 
 
 		 230 aa  120  6e-26  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10980  peptidase M23B  34.9 
 
 		 274 aa  120  6e-26  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000310987  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1862  putative lipoprotein NlpD  44.96 
 
 		 230 aa  119  9.999999999999999e-26  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0237  peptidase M23B  46.32 
 
 		 824 aa  119  9.999999999999999e-26  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.130715 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2345  peptidase M23B  40.76 
 
 		 452 aa  119  1.9999999999999998e-25  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000378681  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3112  peptidase M23B  44.37 
 
 		 633 aa  119  1.9999999999999998e-25  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.233689 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0657  Peptidase M23  42.21 
 
 		 252 aa  118  3e-25  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1131  peptidase M23B  50 
 
 		 293 aa  117  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0929  peptidase M23B  49.65 
 
 		 261 aa  117  3.9999999999999997e-25  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1564  lipoprotein NlpD, putative  46.67 
 
 		 288 aa  117  6e-25  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1373  peptidoglycan-binding LysM:peptidase M23B  46.67 
 
 		 288 aa  117  6.9999999999999995e-25  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.142196  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3075  lipoprotein NlpD  39.13 
 
 		 377 aa  116  8.999999999999998e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.567477  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3050  lipoprotein NlpD  39.13 
 
 		 377 aa  116  8.999999999999998e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3131  lipoprotein NlpD  39.13 
 
 		 377 aa  116  8.999999999999998e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.143103 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3234  lipoprotein NlpD  39.13 
 
 		 377 aa  116  8.999999999999998e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3114  lipoprotein NlpD  39.13 
 
 		 377 aa  116  8.999999999999998e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.378129  normal  0.89385 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3213  lipoprotein NlpD  38.67 
 
 		 374 aa  115  1.0000000000000001e-24  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.160012 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0598  peptidoglycan-binding LysM  44.27 
 
 		 590 aa  115  1.0000000000000001e-24  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  unclonable  0.0000000000165223  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02592  predicted outer membrane lipoprotein  39.13 
 
 		 379 aa  115  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3132  lipoprotein NlpD  39.13 
 
 		 363 aa  115  2.0000000000000002e-24  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02557  hypothetical protein  39.13 
 
 		 379 aa  115  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4053  peptidase M23B  47.9 
 
 		 285 aa  115  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000777294 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2880  lipoprotein NlpD  39.13 
 
 		 379 aa  115  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.704845  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3043  lipoprotein NlpD  39.13 
 
 		 379 aa  115  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1502  lipoprotein B  41.29 
 
 		 290 aa  115  2.0000000000000002e-24  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.176009  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0970  lipoprotein NlpD  39.13 
 
 		 379 aa  115  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.957286  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17470  hypothetical protein  50 
 
 		 297 aa  115  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3190  M23B family peptidase  44.54 
 
 		 251 aa  114  3e-24  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1836  Peptidase M23  41.67 
 
 		 315 aa  115  3e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.117063  normal  0.29408 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1452  peptidase M23B  45.3 
 
 		 292 aa  114  4.0000000000000004e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.3197  normal  0.212696 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3294  lipoprotein NlpD  36.31 
 
 		 327 aa  114  6e-24  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1416  peptidase M23B  46.15 
 
 		 299 aa  114  6e-24  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0961  peptidase M23B  44.44 
 
 		 312 aa  114  6e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0959  lipoprotein NlpD  36.31 
 
 		 327 aa  114  6e-24  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3426  lipoprotein NlpD  36.31 
 
 		 327 aa  114  6e-24  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0796777  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1732  peptidase M23  43.97 
 
 		 295 aa  114  6e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0850817  normal  0.0853785 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0299  peptidase M23B  43.08 
 
 		 249 aa  113  8.000000000000001e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000319427 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1845  peptidase M23B  44.83 
 
 		 296 aa  113  9e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.736133  normal  0.104174 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6258  peptidase M23B  44.83 
 
 		 296 aa  113  9e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0271245  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2998  M23B family peptidase  43.7 
 
 		 250 aa  113  9e-24  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.310031 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1759  peptidase M23B  43.97 
 
 		 295 aa  113  9e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.125432  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1821  peptidase M23B  44.83 
 
 		 296 aa  113  9e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.361225  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02698  Tetratricopeptide repeat transcriptional regulator  43.7 
 
 		 251 aa  113  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.686613  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0827  Peptidase M23  43.7 
 
 		 251 aa  113  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1254  peptidase  44.96 
 
 		 317 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.174583 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1355  lipoprotein NlpD, putative  45.3 
 
 		 298 aa  113  1.0000000000000001e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.209854  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2522  peptidoglycan-binding LysM:peptidase M23B  49.14 
 
 		 304 aa  112  1.0000000000000001e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000138444  normal  0.0361265 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2199  M23 family peptidase  45.3 
 
 		 296 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.577669  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2366  peptidase  45.3 
 
 		 292 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.417341  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0052  putative lipoprotein NlpD  45.3 
 
 		 296 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.367666  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3025  M23B family peptidase  43.7 
 
 		 251 aa  113  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00328229  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02660  hypothetical protein  43.7 
 
 		 251 aa  113  1.0000000000000001e-23  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.649815  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2237  M23 family peptidase  45.3 
 
 		 296 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.772749  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0799  Peptidase M23  47.11 
 
 		 294 aa  112  1.0000000000000001e-23  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  hitchhiker  0.00788388  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1845  putative lipoprotein NlpD  45.3 
 
 		 296 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.362158  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1117  putative lipoprotein NlpD  45.3 
 
 		 296 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0803  Peptidase M23  46.28 
 
 		 292 aa  112  2.0000000000000002e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0843  peptidase M23B  43.7 
 
 		 251 aa  112  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.325004  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5122  peptidase M23B  44.83 
 
 		 294 aa  112  2.0000000000000002e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00948111  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3015  Peptidase M23  48.28 
 
 		 274 aa  112  2.0000000000000002e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.508636  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0752  peptidoglycan-binding peptidase M23B  44.68 
 
 		 291 aa  112  2.0000000000000002e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.897589  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2351  putative lipoprotein/metalloendopeptidase  42.74 
 
 		 311 aa  112  2.0000000000000002e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0718469  normal  0.0896324 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3304  peptidase, M23B family  43.7 
 
 		 251 aa  112  2.0000000000000002e-23  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4155  peptidase, M23B family  43.7 
 
 		 251 aa  112  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0947828 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0831  lipoprotein NlpD  44.17 
 
 		 328 aa  112  2.0000000000000002e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0680895 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>