91 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlab_0574 on replicon NC_008942
Organism: Methanocorpusculum labreanum Z



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008942  Mlab_0574  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit A  100 
 
 		 566 aa  1184    Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.509676  decreased coverage  0.000667669 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1188  amidohydrolase 3  69.38 
 
 		 566 aa  860    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2109  amidohydrolase 3  62.34 
 
 		 565 aa  746    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1097  amidohydrolase 3  49.36 
 
 		 566 aa  563  1.0000000000000001e-159  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1425  formylmethanofuran dehydrogenase subunit A  43.65 
 
 		 567 aa  475  1e-133  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.197367  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0343  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit A  43.83 
 
 		 567 aa  474  1e-132  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.44984  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0494  amidohydrolase 3  44.01 
 
 		 567 aa  475  1e-132  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.654333  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0562  amidohydrolase 3  44.01 
 
 		 567 aa  471  1.0000000000000001e-131  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1989  amidohydrolase 3  42.68 
 
 		 571 aa  471  1.0000000000000001e-131  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.314934  normal  0.216249 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0619  amidohydrolase 3  43.77 
 
 		 568 aa  468  9.999999999999999e-131  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.438541  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1662  amidohydrolase 3  41.29 
 
 		 583 aa  462  1e-129  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.197857  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1530  amidohydrolase 3  41.74 
 
 		 583 aa  465  1e-129  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000517509 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1443  amidohydrolase 3  43.23 
 
 		 582 aa  461  9.999999999999999e-129  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.252368  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0382  formylmethanofuran dehydrogenase subunit A  41.22 
 
 		 583 aa  461  9.999999999999999e-129  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2234  formylmethanofuran dehydrogenase subunit A  42.49 
 
 		 570 aa  460  9.999999999999999e-129  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.459579  normal  0.0518322 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1451  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit A  41.22 
 
 		 583 aa  458  1e-127  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0876  amidohydrolase 3  43.14 
 
 		 568 aa  456  1e-127  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.518844  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0371  amidohydrolase 3  41.54 
 
 		 570 aa  458  1e-127  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0083  amidohydrolase 3  40.81 
 
 		 597 aa  455  1.0000000000000001e-126  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1982  amidohydrolase 3  41.79 
 
 		 566 aa  453  1.0000000000000001e-126  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.24205 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0245  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit A  43.13 
 
 		 570 aa  454  1.0000000000000001e-126  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.571542  normal  0.357982 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0202  formylmethanofuran dehydrogenase subunit A  42.41 
 
 		 569 aa  450  1e-125  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.58786  normal  0.082487 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1472  amidohydrolase 3  41.9 
 
 		 578 aa  449  1e-125  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.883375  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0284  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit A  39.38 
 
 		 584 aa  451  1e-125  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00233084  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1289  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit A  39.3 
 
 		 584 aa  441  9.999999999999999e-123  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2859  formylmethanofurane dehydrogenase, A subunit, putative  37.66 
 
 		 555 aa  358  9.999999999999999e-98  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.482874  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1663  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit A  36.93 
 
 		 558 aa  357  1.9999999999999998e-97  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0362929  normal  0.346748 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0024  DNA/RNA non-specific endonuclease  36.61 
 
 		 556 aa  358  1.9999999999999998e-97  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5934  formylmethanofuran dehydrogenase subunit A  37.52 
 
 		 562 aa  347  3e-94  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.765653  normal  0.0594888 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2462  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit A  38.23 
 
 		 566 aa  347  4e-94  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.193668 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1687  formylmethanofuran dehydrogenase subunit A  35 
 
 		 552 aa  340  2.9999999999999998e-92  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3135  formylmethanofuran dehydrogenase subunit A  36.69 
 
 		 561 aa  340  4e-92  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1795  amidohydrolase 3  37.32 
 
 		 549 aa  339  9e-92  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  hitchhiker  0.00999447  normal  0.727979 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3066  formylmethanofuran dehydrogenase subunit A  36.4 
 
 		 561 aa  338  1.9999999999999998e-91  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2624  formylmethanofuran dehydrogenase, subunit A  35.88 
 
 		 561 aa  337  3.9999999999999995e-91  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.117622  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6505  formylmethanofuran dehydrogenase subunit A  36.82 
 
 		 566 aa  335  2e-90  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.148601  normal  0.0276597 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2319  formylmethanofurane dehydrogenase, subunit, putative  33.51 
 
 		 572 aa  296  9e-79  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.281312  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0525  formylmethanofuran dehydrogenase subunit A  34.55 
 
 		 548 aa  273  8.000000000000001e-72  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.571355 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2401  formylmethanofuran dehydrogenase subunit A  32.91 
 
 		 542 aa  267  4e-70  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5999  formylmethanofuran dehydrogenase subunit A  33.52 
 
 		 543 aa  254  3e-66  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.074465  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1777  formylmethanofuran dehydrogenase subunit A  34.74 
 
 		 548 aa  253  8.000000000000001e-66  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.227375  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2161  formylmethanofuran dehydrogenase subunit A  34.56 
 
 		 548 aa  252  1e-65  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.194626  normal  0.104385 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1826  formylmethanofuran dehydrogenase subunit A  34.56 
 
 		 548 aa  252  1e-65  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.885029  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5775  formylmethanofuran dehydrogenase subunit A  32.52 
 
 		 543 aa  252  1e-65  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.179855  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0726  dihydroorotase, multifunctional complex type  45.31 
 
 		 432 aa  58.5  0.0000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0680932  hitchhiker  0.000000153921 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1857  dihydroorotase, multifunctional complex type  46.15 
 
 		 425 aa  54.7  0.000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0880  dihydroorotase  41.54 
 
 		 431 aa  51.2  0.00005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1497  phenylhydantoinase  36.36 
 
 		 484 aa  49.7  0.0002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.204674  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3886  phenylhydantoinase  42.86 
 
 		 472 aa  48.5  0.0003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2105  amidohydrolase  33.33 
 
 		 461 aa  48.1  0.0004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2354  dihydroorotase, multifunctional complex type  40.62 
 
 		 429 aa  48.1  0.0004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0187405  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3349  dihydroorotase  36.9 
 
 		 412 aa  48.5  0.0004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000206965  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2214  phenylhydantoinase  36.14 
 
 		 472 aa  48.1  0.0004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2756  amidohydrolase  30.43 
 
 		 403 aa  47.8  0.0005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0215724  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1055  dihydroorotase  41.94 
 
 		 431 aa  47.4  0.0007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4058  amidohydrolase 3  41.27 
 
 		 413 aa  47.4  0.0008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.419842  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7926  phenylhydantoinase  37.04 
 
 		 474 aa  46.6  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.245265  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3360  dihydroorotase, multifunctional complex type  37.5 
 
 		 488 aa  46.6  0.001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.321157  hitchhiker  0.000187525 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4135  phenylhydantoinase  39.68 
 
 		 471 aa  46.6  0.001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1660  amidohydrolase 3  41.94 
 
 		 435 aa  46.6  0.001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4022  phenylhydantoinase  39.68 
 
 		 471 aa  46.6  0.001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17490  cytosine deaminase-like metal-dependent hydrolase  42.42 
 
 		 440 aa  46.6  0.001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0541623  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1635  dihydropyrimidinase  32.94 
 
 		 467 aa  46.6  0.001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1462  phenylhydantoinase  34.34 
 
 		 483 aa  46.2  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3038  phenylhydantoinase  33.33 
 
 		 484 aa  45.8  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4021  phenylhydantoinase  44.23 
 
 		 481 aa  45.8  0.002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2528  dihydroorotase, multifunctional complex type  33.85 
 
 		 424 aa  45.8  0.002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6635  hydantoinase  49.21 
 
 		 470 aa  46.2  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.34089  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2067  dihydropyrimidinase  42.19 
 
 		 485 aa  45.4  0.003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.265667 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3107  dihydropyrimidinase  42.19 
 
 		 485 aa  45.4  0.003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0154348  normal  0.387617 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1614  dihydrooratase  36.46 
 
 		 425 aa  45.4  0.003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.296588  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3462  dihydropyrimidinase  42.19 
 
 		 485 aa  45.4  0.003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1272  dihydroorotase, multifunctional complex type  38.46 
 
 		 425 aa  45.1  0.003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0255922  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2584  dihydroorotase, multifunctional complex type  48.94 
 
 		 437 aa  44.7  0.004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4992  phenylhydantoinase  45.16 
 
 		 471 aa  44.7  0.004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.543154  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3941  phenylhydantoinase  42.19 
 
 		 475 aa  44.7  0.005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.309638  normal  0.168213 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0686  dihydropyrimidinase  36.59 
 
 		 469 aa  44.3  0.005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.000587372  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6029  phenylhydantoinase  33.33 
 
 		 485 aa  44.7  0.005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0881  dihydroorotase, multifunctional complex type  40 
 
 		 426 aa  44.7  0.005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.123105  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3293  phenylhydantoinase  33.33 
 
 		 484 aa  44.3  0.006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.349462  normal  0.101645 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2402  dihydroorotase  41.94 
 
 		 430 aa  44.3  0.006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0460345  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0045  phenylhydantoinase  39.68 
 
 		 473 aa  44.3  0.006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09380  dihydroorotase, multifunctional complex type  35.94 
 
 		 434 aa  44.3  0.007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0821252  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0077  AsmA  36.99 
 
 		 506 aa  43.9  0.007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0723  amidohydrolase  41.94 
 
 		 485 aa  43.9  0.007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.43512  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1370  phenylhydantoinase  34 
 
 		 483 aa  43.5  0.009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.596955 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1816  phenylhydantoinase  33 
 
 		 483 aa  43.5  0.009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.168058  normal  0.23209 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01823  conserved hypothetical protein  34.52 
 
 		 489 aa  43.5  0.009  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0650  dihydroorotase  40.62 
 
 		 425 aa  43.5  0.01  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.775356  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2367  phenylhydantoinase  35 
 
 		 484 aa  43.5  0.01  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.040332  normal  0.334928 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3137  amidohydrolase  28.74 
 
 		 411 aa  43.5  0.01  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>