More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_3261 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010172  Mext_3261  protoheme IX farnesyltransferase  100 
 
 		 317 aa  618  1e-176  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.116788 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3585  protoheme IX farnesyltransferase  99.68 
 
 		 317 aa  615  1e-175  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3457  protoheme IX farnesyltransferase  96.85 
 
 		 317 aa  554  1e-157  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0031  protoheme IX farnesyltransferase  75.56 
 
 		 316 aa  444  1.0000000000000001e-124  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.823652  normal  0.697538 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2347  protoheme IX farnesyltransferase  79.11 
 
 		 317 aa  435  1e-121  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.8404  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0262  protoheme IX farnesyltransferase  76.51 
 
 		 317 aa  422  1e-117  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.284022  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0671  protoheme IX farnesyltransferase  58.96 
 
 		 318 aa  341  1e-92  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.613215 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1042  protoheme IX farnesyltransferase  60.07 
 
 		 325 aa  337  9.999999999999999e-92  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4646  protoheme IX farnesyltransferase  59.81 
 
 		 315 aa  335  7.999999999999999e-91  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.372407  normal  0.111817 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0728  protoheme IX farnesyltransferase  62.77 
 
 		 321 aa  330  2e-89  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.147557 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0520  protoheme IX farnesyltransferase  58.3 
 
 		 316 aa  328  6e-89  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0743  protoheme IX farnesyltransferase  59.47 
 
 		 310 aa  327  1.0000000000000001e-88  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.120936  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0604  protoheme IX farnesyltransferase  57.38 
 
 		 316 aa  327  2.0000000000000001e-88  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0644  protoheme IX farnesyltransferase  57.68 
 
 		 316 aa  325  9e-88  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.211966 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0830  protoheme IX farnesyltransferase  60.85 
 
 		 312 aa  320  3e-86  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0147164  normal  0.292197 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0763  protoheme IX farnesyltransferase  61.62 
 
 		 353 aa  318  9e-86  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.467386  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0816  protoheme IX farnesyltransferase  61.35 
 
 		 313 aa  318  9e-86  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.566736  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0225  protoheme IX farnesyltransferase  61.62 
 
 		 312 aa  318  1e-85  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0469  protoheme IX farnesyltransferase  56.62 
 
 		 315 aa  317  2e-85  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.362812  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0475  protoheme IX farnesyltransferase  56.62 
 
 		 312 aa  317  2e-85  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.100765  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1239  protoheme IX farnesyltransferase  58.6 
 
 		 316 aa  316  3e-85  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.377478 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0257  protoheme IX farnesyltransferase  61.4 
 
 		 328 aa  316  4e-85  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.430018  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3461  protoheme IX farnesyltransferase  61.4 
 
 		 328 aa  316  4e-85  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0319  protoheme IX farnesyltransferase  53.16 
 
 		 315 aa  315  6e-85  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0628217  normal  0.314061 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0583  protoheme IX farnesyltransferase  56 
 
 		 315 aa  315  9e-85  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.0000491835  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4586  protoheme IX farnesyltransferase  60.64 
 
 		 313 aa  310  2e-83  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4789  protoheme IX farnesyltransferase  59.34 
 
 		 313 aa  309  4e-83  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0475  protoheme IX farnesyltransferase  55.59 
 
 		 310 aa  300  2e-80  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1827  protoheme IX farnesyltransferase  55.59 
 
 		 310 aa  300  2e-80  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0766556  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4504  protoheme IX farnesyltransferase  53.24 
 
 		 345 aa  299  4e-80  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.569688 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4320  protoheme IX farnesyltransferase  54.7 
 
 		 305 aa  297  2e-79  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0343069  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3154  protoheme IX farnesyltransferase  52.96 
 
 		 309 aa  293  2e-78  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0615  protoheme IX farnesyltransferase  57.34 
 
 		 310 aa  291  7e-78  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0901  protoheme IX farnesyltransferase  58.74 
 
 		 312 aa  286  2.9999999999999996e-76  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.110093  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0623  protoheme IX farnesyltransferase  51.55 
 
 		 302 aa  278  6e-74  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.0491007  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2232  protoheme IX farnesyltransferase  50.93 
 
 		 330 aa  275  8e-73  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0835279  hitchhiker  0.00671366 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2335  protoheme IX farnesyltransferase  51.02 
 
 		 313 aa  270  2e-71  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.377934  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0302  protoheme IX farnesyltransferase  49.28 
 
 		 295 aa  268  8.999999999999999e-71  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  decreased coverage  0.00437405  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0915  protoheme IX farnesyltransferase  51.56 
 
 		 304 aa  266  5e-70  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.010873  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1141  protoheme IX farnesyltransferase  52.09 
 
 		 328 aa  261  8.999999999999999e-69  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1403  protoheme IX farnesyltransferase  50.82 
 
 		 308 aa  261  1e-68  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0811  protoheme IX farnesyltransferase  44.22 
 
 		 295 aa  260  2e-68  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.791489  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2165  protoheme IX farnesyltransferase  53.26 
 
 		 317 aa  256  5e-67  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0405  protoheme IX farnesyltransferase  50.87 
 
 		 311 aa  255  7e-67  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.789326  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3877  protoheme IX farnesyltransferase  50 
 
 		 302 aa  251  1e-65  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.153481  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1004  protoheme IX farnesyltransferase  44.56 
 
 		 295 aa  248  9e-65  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.458622  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4064  protoheme IX farnesyltransferase  43.34 
 
 		 301 aa  218  8.999999999999998e-56  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.298465  normal  0.322583 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1908  protoheme IX farnesyltransferase  44.56 
 
 		 302 aa  216  4e-55  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1209  protoheme IX farnesyltransferase  44.22 
 
 		 324 aa  211  9e-54  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.444038  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0255  protoheme IX farnesyltransferase  42.36 
 
 		 323 aa  210  2e-53  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0253  protoheme IX farnesyltransferase  42.36 
 
 		 323 aa  210  3e-53  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0548443  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3688  protoheme IX farnesyltransferase  42.66 
 
 		 323 aa  209  4e-53  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0301  protoheme IX farnesyltransferase  45.25 
 
 		 309 aa  209  7e-53  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.305576  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3039  Protoheme IX farnesyltransferase  42.01 
 
 		 299 aa  207  3e-52  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000858907  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3003  protoheme IX farnesyltransferase  41.98 
 
 		 302 aa  205  7e-52  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.523448  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0224  protoheme IX farnesyltransferase  43.21 
 
 		 534 aa  204  2e-51  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.478514  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3899  protoheme IX farnesyltransferase  40.07 
 
 		 302 aa  204  2e-51  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.295694  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1254  protoheme IX farnesyltransferase  42.86 
 
 		 304 aa  202  6e-51  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2710  protoheme IX farnesyltransferase  38.96 
 
 		 311 aa  202  8e-51  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.242296  normal  0.192859 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4382  protoheme IX farnesyltransferase  43.15 
 
 		 301 aa  201  9.999999999999999e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0071  protoheme IX farnesyltransferase  44.91 
 
 		 296 aa  201  9.999999999999999e-51  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3571  protoheme IX farnesyltransferase  41.58 
 
 		 317 aa  201  1.9999999999999998e-50  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.882357  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4304  protoheme IX farnesyltransferase  43.75 
 
 		 535 aa  200  3e-50  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1505  protoheme IX farnesyltransferase  39.73 
 
 		 622 aa  198  1.0000000000000001e-49  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1781  protoheme IX farnesyltransferase  42.03 
 
 		 328 aa  198  1.0000000000000001e-49  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.641415  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0554  protoheme IX farnesyltransferase  42.37 
 
 		 301 aa  198  1.0000000000000001e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.175384  normal  0.802361 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4614  protoheme IX farnesyltransferase  42.96 
 
 		 300 aa  197  2.0000000000000003e-49  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1128  protoheme IX farnesyltransferase  45.58 
 
 		 307 aa  197  2.0000000000000003e-49  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0340852 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0044  protoheme IX farnesyltransferase  41.9 
 
 		 303 aa  197  3e-49  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3789  protoheme IX farnesyltransferase  42.25 
 
 		 301 aa  194  1e-48  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3708  protoheme IX farnesyltransferase  41.12 
 
 		 443 aa  194  2e-48  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00051278  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3998  protoheme IX farnesyltransferase  43.33 
 
 		 300 aa  194  2e-48  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0062  protoheme IX farnesyltransferase  40.6 
 
 		 298 aa  193  3e-48  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.291941  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0070  protoheme IX farnesyltransferase  42.42 
 
 		 306 aa  193  3e-48  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.915118  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0887  protoheme IX farnesyltransferase  42.03 
 
 		 306 aa  193  3e-48  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3828  protoheme IX farnesyltransferase  41.81 
 
 		 305 aa  193  4e-48  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.47985 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2415  protoheme IX farnesyltransferase  42.66 
 
 		 333 aa  192  5e-48  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3799  protoheme IX farnesyltransferase  43.33 
 
 		 300 aa  192  5e-48  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2461  protoheme IX farnesyltransferase  42.66 
 
 		 333 aa  192  5e-48  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.751171  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0630  protoheme IX farnesyltransferase  42.14 
 
 		 301 aa  192  6e-48  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.781454  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3872  protoheme IX farnesyltransferase  43.33 
 
 		 300 aa  192  7e-48  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2455  protoheme IX farnesyltransferase  42.66 
 
 		 310 aa  192  8e-48  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0713  protoheme IX farnesyltransferase  42.14 
 
 		 301 aa  192  8e-48  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0319  protoheme IX farnesyltransferase  44.22 
 
 		 297 aa  191  1e-47  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.102064 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0130  protoheme IX farnesyltransferase  45.26 
 
 		 297 aa  191  1e-47  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.914448 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4238  protoheme IX farnesyltransferase  42.24 
 
 		 305 aa  191  1e-47  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2850  protoheme IX farnesyltransferase  40.75 
 
 		 306 aa  191  2e-47  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.859751  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4162  protoheme IX farnesyltransferase  42.37 
 
 		 301 aa  190  2e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3527  protoheme IX farnesyltransferase  40.75 
 
 		 306 aa  191  2e-47  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.153236  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001453  heme O synthase protoheme IX farnesyltransferase COX10-CtaB  41.11 
 
 		 299 aa  190  2.9999999999999997e-47  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4006  protoheme IX farnesyltransferase  41.34 
 
 		 301 aa  189  5e-47  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3662  protoheme IX farnesyltransferase  41.23 
 
 		 586 aa  189  5e-47  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2247  protoheme IX farnesyltransferase  41.9 
 
 		 328 aa  189  5.999999999999999e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000151822 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2754  protoheme IX farnesyltransferase  41.16 
 
 		 300 aa  188  8e-47  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.628153  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01380  protoheme IX farnesyltransferase  41.38 
 
 		 304 aa  189  8e-47  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0191  protoheme IX farnesyltransferase  40.33 
 
 		 298 aa  188  9e-47  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0286  protoheme IX farnesyltransferase  40.2 
 
 		 301 aa  187  1e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0188  protoheme IX farnesyltransferase  41.38 
 
 		 304 aa  188  1e-46  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0150  protoheme IX farnesyltransferase  44.81 
 
 		 299 aa  187  2e-46  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3173  protoheme IX farnesyltransferase  42.27 
 
 		 311 aa  187  2e-46  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0955942  normal  0.36361 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>