More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mevan_0795 on replicon NC_009634
Organism: Methanococcus vannielii SB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009634  Mevan_0795  MscS mechanosensitive ion channel  100 
 
 
269 aa  534  1e-151  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0091  MscS mechanosensitive ion channel  74.72 
 
 
267 aa  418  1e-116  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0730  MscS mechanosensitive ion channel  73.58 
 
 
267 aa  412  1e-114  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.506108  normal  0.245277 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1188  MscS mechanosensitive ion channel  72.83 
 
 
267 aa  408  1e-113  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.765639  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1202  MscS Mechanosensitive ion channel  53.49 
 
 
270 aa  305  7e-82  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.49703  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2273  MscS mechanosensitive ion channel  56 
 
 
258 aa  289  4e-77  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2284  MscS mechanosensitive ion channel  50.81 
 
 
273 aa  261  1e-68  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2090  hypothetical protein  52.42 
 
 
301 aa  256  3e-67  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3719  MscS mechanosensitive ion channel  36.86 
 
 
538 aa  192  6e-48  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00173633  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3145  mechanosensitive ion channel  37.35 
 
 
544 aa  189  4e-47  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.187903  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2546  small-conductance mechanosensitive channel  38.49 
 
 
286 aa  188  9e-47  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.748104  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1797  mechanosensitive ion channel  36.47 
 
 
561 aa  186  3e-46  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.433096  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3521  MscS mechanosensitive ion channel  35.88 
 
 
547 aa  186  4e-46  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03562  hypothetical protein  38.1 
 
 
288 aa  185  8e-46  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03290  MscS Mechanosensitive ion channel  35.66 
 
 
280 aa  183  2.0000000000000003e-45  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0613  MscS mechanosensitive ion channel  37.65 
 
 
547 aa  183  2.0000000000000003e-45  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000873032  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4338  MscS mechanosensitive ion channel  36.47 
 
 
533 aa  182  4.0000000000000006e-45  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002474  small-conductance mechanosensitive channel  37.3 
 
 
288 aa  181  9.000000000000001e-45  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3747  MscS Mechanosensitive ion channel  36.08 
 
 
549 aa  179  2.9999999999999997e-44  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3929  MscS mechanosensitive ion channel  36.08 
 
 
549 aa  180  2.9999999999999997e-44  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3803  MscS mechanosensitive ion channel  36.08 
 
 
549 aa  180  2.9999999999999997e-44  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.717222  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1709  small conductance mechanosensitive channel  37.25 
 
 
494 aa  178  8e-44  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.0466336 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0444  MscS mechanosensitive ion channel  35.54 
 
 
540 aa  177  2e-43  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1036  putative mechanosensitive ion channel protein  34.8 
 
 
534 aa  177  2e-43  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002898  small-conductance mechanosensitive channel  35.04 
 
 
532 aa  174  9.999999999999999e-43  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.341732  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0032  hypothetical protein  34.92 
 
 
287 aa  174  9.999999999999999e-43  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.20954  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3468  MscS mechanosensitive ion channel  34.51 
 
 
550 aa  174  9.999999999999999e-43  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3333  MscS mechanosensitive ion channel  34.13 
 
 
275 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1350  hypothetical protein  34.75 
 
 
292 aa  173  2.9999999999999996e-42  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.136839  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0562  MscS mechanosensitive ion channel  34.12 
 
 
551 aa  172  5e-42  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0561  MscS mechanosensitive ion channel  34.12 
 
 
551 aa  172  5.999999999999999e-42  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03062  hypothetical protein  33.73 
 
 
563 aa  171  1e-41  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3627  MscS mechanosensitive ion channel  35.04 
 
 
268 aa  170  2e-41  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.143912 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1205  MscS mechanosensitive ion channel  34.73 
 
 
275 aa  171  2e-41  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00184527  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1276  MscS mechanosensitive ion channel  34.73 
 
 
275 aa  171  2e-41  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.0000188457  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1746  mechanosensitive ion channel family protein  32.59 
 
 
531 aa  169  5e-41  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3778  MscS mechanosensitive ion channel  33.46 
 
 
276 aa  169  6e-41  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.981923 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0797  MscS Mechanosensitive ion channel  35.8 
 
 
268 aa  168  8e-41  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3028  MscS mechanosensitive ion channel  33.97 
 
 
275 aa  168  9e-41  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000445897  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3171  MscS mechanosensitive ion channel  34.68 
 
 
275 aa  167  2e-40  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000563606  hitchhiker  0.0000513684 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1350  MscS Mechanosensitive ion channel  34.68 
 
 
275 aa  167  2e-40  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000676183  hitchhiker  0.0000000000523866 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2465  putative small-conductance mechanosensitive channel  34.27 
 
 
275 aa  167  2e-40  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.404234  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1206  MscS mechanosensitive ion channel  33.59 
 
 
275 aa  166  2.9999999999999998e-40  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0281  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3013  MscS mechanosensitive ion channel  34.68 
 
 
275 aa  166  4e-40  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000253066  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2675  MscS mechanosensitive ion channel  32.82 
 
 
275 aa  164  1.0000000000000001e-39  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00133263  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1140  MscS mechanosensitive ion channel  34.14 
 
 
274 aa  163  3e-39  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.15609  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1345  MscS mechanosensitive ion channel  37.18 
 
 
274 aa  162  4.0000000000000004e-39  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000767633  hitchhiker  0.0000248019 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1359  MscS mechanosensitive ion channel  34.13 
 
 
275 aa  162  5.0000000000000005e-39  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.000000000124466  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1245  MscS mechanosensitive ion channel  35.48 
 
 
274 aa  161  9e-39  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.016266  normal  0.622604 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3340  small-conductance mechanosensitive channel  33.21 
 
 
275 aa  160  2e-38  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0521  MscS mechanosensitive ion channel  38.38 
 
 
200 aa  160  2e-38  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.108923  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1533  MscS Mechanosensitive ion channel  30.89 
 
 
276 aa  160  2e-38  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0047  MscS mechanosensitive ion channel  32.24 
 
 
270 aa  159  4e-38  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0955  MscS mechanosensitive ion channel  32.71 
 
 
298 aa  159  4e-38  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1152  MscS mechanosensitive ion channel  34.05 
 
 
274 aa  159  5e-38  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0163398  normal  0.0148083 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2296  MscS mechanosensitive ion channel  30.42 
 
 
270 aa  157  2e-37  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1856  hypothetical protein  34.03 
 
 
281 aa  157  2e-37  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.130527  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0585  putative small-conductance mechanosensitive channel  35.66 
 
 
277 aa  157  2e-37  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000000591532  normal  0.0145572 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0390  MscS mechanosensitive ion channel  32.84 
 
 
274 aa  157  2e-37  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.855015  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2740  MscS mechanosensitive ion channel  30.68 
 
 
288 aa  154  1e-36  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2803  MscS mechanosensitive ion channel  30.89 
 
 
277 aa  154  2e-36  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2423  MscS Mechanosensitive ion channel  31.47 
 
 
297 aa  152  5.9999999999999996e-36  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.591216  normal  0.0692547 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2469  putative transport protein  32.4 
 
 
269 aa  151  1e-35  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0452  MscS mechanosensitive ion channel  34.07 
 
 
283 aa  150  2e-35  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  decreased coverage  0.00426986  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4603  mechanosensitive ion channel family protein  32.96 
 
 
275 aa  150  3e-35  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3200  MscS Mechanosensitive ion channel  34.41 
 
 
275 aa  149  6e-35  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.126037  normal  0.165541 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1967  MscS Mechanosensitive ion channel  34.58 
 
 
279 aa  148  1.0000000000000001e-34  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.340778 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2137  MscS mechanosensitive ion channel  35 
 
 
288 aa  145  5e-34  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.857102  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0812  small-conductance mechanosensitive channel  36.8 
 
 
274 aa  145  9e-34  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0625  small-conductance mechanosensitive ion channel  33.03 
 
 
291 aa  144  1e-33  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.286405  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1584  MscS mechanosensitive ion channel  29.72 
 
 
279 aa  144  1e-33  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00518641  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0940  MscS mechanosensitive ion channel  32.92 
 
 
275 aa  144  2e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.546965 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3620  MscS mechanosensitive ion channel  35.29 
 
 
277 aa  144  2e-33  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.812148  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1689  MscS mechanosensitive ion channel  33.33 
 
 
356 aa  142  5e-33  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0786  mechanosensitive channel MscS  31.03 
 
 
286 aa  140  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02755  mechanosensitive channel  31.03 
 
 
286 aa  140  3e-32  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0769  MscS Mechanosensitive ion channel  31.03 
 
 
286 aa  140  3e-32  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02718  hypothetical protein  31.03 
 
 
286 aa  140  3e-32  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3349  mechanosensitive channel MscS  31.03 
 
 
286 aa  140  3e-32  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3251  mechanosensitive channel MscS  31.03 
 
 
286 aa  140  3e-32  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3061  mechanosensitive channel MscS  31.03 
 
 
291 aa  139  3e-32  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.397816  normal  0.219365 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4221  mechanosensitive channel MscS  31.03 
 
 
286 aa  140  3e-32  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3082  mechanosensitive channel MscS  31.03 
 
 
286 aa  140  3e-32  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1342  MscS Mechanosensitive ion channel  27.78 
 
 
266 aa  139  6e-32  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00293598  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2402  hypothetical protein  33.61 
 
 
279 aa  139  6e-32  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.267781  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4503  MscS Mechanosensitive ion channel  33.47 
 
 
285 aa  137  1e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2565  hypothetical protein  34.68 
 
 
283 aa  137  2e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2641  MscS Mechanosensitive ion channel  30.9 
 
 
280 aa  137  2e-31  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3671  MscS mechanosensitive ion channel  31.28 
 
 
277 aa  137  2e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0359  MscS mechanosensitive ion channel  33.05 
 
 
360 aa  137  2e-31  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.821631  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1552  MscS mechanosensitive ion channel  32.42 
 
 
359 aa  137  2e-31  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.101944 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1074  MscS mechanosensitive ion channel  31.7 
 
 
360 aa  137  3.0000000000000003e-31  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.287098  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0541  MscS mechanosensitive ion channel  29.6 
 
 
273 aa  136  4e-31  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4436  MscS Mechanosensitive ion channel  33.05 
 
 
285 aa  136  4e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.312478 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4433  MscS Mechanosensitive ion channel  33.05 
 
 
285 aa  135  5e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4349  MscS Mechanosensitive ion channel  33.05 
 
 
285 aa  136  5e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0589  MscS mechanosensitive ion channel  33.48 
 
 
291 aa  135  7.000000000000001e-31  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.516163  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01095  mechanosensitive ion channel family protein  31.15 
 
 
280 aa  134  9.999999999999999e-31  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3304  mechanosensitive channel MscS  31.38 
 
 
286 aa  134  1.9999999999999998e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3307  mechanosensitive channel MscS  30.96 
 
 
286 aa  134  1.9999999999999998e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>