More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mesil_0786 on replicon NC_014212
Organism: Meiothermus silvanus DSM 9946



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014212  Mesil_0786  NmrA family protein  100 
 
 
209 aa  416  9.999999999999999e-116  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1230  hypothetical protein  40.48 
 
 
211 aa  142  4e-33  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.629008  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3281  NAD-dependent epimerase/dehydratase  38.14 
 
 
212 aa  135  4e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.015604 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0168  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.74 
 
 
231 aa  125  6e-28  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3327  hypothetical protein  34.58 
 
 
211 aa  124  7e-28  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.953225  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2191  NmrA family protein  36.79 
 
 
210 aa  124  1e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2568  hypothetical protein  28.99 
 
 
211 aa  122  5e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000183423  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2182  NmrA family protein  35.85 
 
 
213 aa  121  9e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1353  putative secreted protein  39.09 
 
 
202 aa  120  9.999999999999999e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4516  putative secreted protein  39.02 
 
 
231 aa  119  3e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.465433 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6534  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.68 
 
 
231 aa  116  3e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0286873  normal  0.116207 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2621  hypothetical protein  28.5 
 
 
211 aa  116  3e-25  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000178057  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2306  hypothetical protein  28.5 
 
 
211 aa  115  3.9999999999999997e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000574802  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2345  hypothetical protein  28.5 
 
 
211 aa  115  5e-25  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000121894  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2872  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.95 
 
 
231 aa  114  8.999999999999998e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.477413 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2389  hypothetical protein  28.02 
 
 
211 aa  114  1.0000000000000001e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.232115  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2578  hypothetical protein  28.02 
 
 
211 aa  114  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000117808 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2565  hypothetical protein  28.02 
 
 
211 aa  114  1.0000000000000001e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3230  putative secreted protein  37.56 
 
 
212 aa  112  4.0000000000000004e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.627075  normal  0.32449 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2120  NmrA family protein  37.5 
 
 
209 aa  111  7.000000000000001e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1628  NmrA family protein  34.78 
 
 
231 aa  109  3e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.927129  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5238  putative secreted protein  36.41 
 
 
212 aa  109  3e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.110421 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0393  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.95 
 
 
211 aa  108  8.000000000000001e-23  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.682232 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2519  hypothetical protein  28.57 
 
 
223 aa  106  3e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.717536  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1908  TrkA domain-containing protein  33.49 
 
 
206 aa  105  6e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.276103  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1873  oxidoreductase  30.95 
 
 
206 aa  103  2e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0129367  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1864  oxidoreductase  30.95 
 
 
206 aa  103  2e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.119654  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1911  oxidoreductase  30.48 
 
 
206 aa  102  5e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.924054  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2057  oxidoreductase  30.48 
 
 
206 aa  102  5e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4085  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.75 
 
 
211 aa  102  5e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0412177  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2090  putative oxidoreductase  30.48 
 
 
206 aa  101  6e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2158  putative oxidoreductase  30.48 
 
 
206 aa  101  6e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.00024659  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2126  oxidoreductase, putative  30.48 
 
 
206 aa  100  1e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1895  putative NADH-flavin reductase-like protein  32.35 
 
 
214 aa  96.3  3e-19  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3261  putative oxidoreductase  31.25 
 
 
207 aa  95.5  6e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.795398 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2048  putative oxidoreductase  31.25 
 
 
207 aa  94  1e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.812468  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0026  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.8 
 
 
213 aa  90.9  1e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.208681  normal  0.101774 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23810  putative NADH-flavin reductase  31.25 
 
 
211 aa  90.9  1e-17  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0815  putative NADH-flavin reductase-like protein  27.62 
 
 
212 aa  89.4  3e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4571  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.99 
 
 
209 aa  89  4e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.520797 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0968  saccharopine dehydrogenase related protein  29.91 
 
 
215 aa  89  5e-17  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4581  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.47 
 
 
214 aa  88.6  6e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.497066 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42659  predicted protein  33.19 
 
 
282 aa  87.8  1e-16  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1434  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.04 
 
 
223 aa  87.4  1e-16  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.235405  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0923  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  29.81 
 
 
205 aa  84.7  9e-16  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2440  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.91 
 
 
223 aa  83.6  0.000000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000202565 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2018  NAD-binding protein, putative  33.5 
 
 
206 aa  82.8  0.000000000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54690  hypothetical protein  35.1 
 
 
213 aa  82  0.000000000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.347798  hitchhiker  0.00000151278 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0543  NAD-dependent glycerol-3-phosphate dehydrogenase domain protein  30.41 
 
 
223 aa  82  0.000000000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0880  hypothetical protein  31.53 
 
 
223 aa  80.1  0.00000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.533635  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0762  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.17 
 
 
203 aa  80.5  0.00000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.117349  normal  0.30102 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5343  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.58 
 
 
227 aa  80.1  0.00000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1882  putative NADH-flavin reductase-like protein  33.66 
 
 
207 aa  79.3  0.00000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.608011 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1725  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.18 
 
 
214 aa  78.2  0.00000000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4779  hypothetical protein  33.17 
 
 
213 aa  78.2  0.00000000000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.421738  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2199  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.96 
 
 
217 aa  77.8  0.0000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.866991  normal  0.263782 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3221  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.1 
 
 
210 aa  77  0.0000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.112317  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0809  3-beta hydroxysteroid dehydrogenase/isomerase  31.11 
 
 
213 aa  77  0.0000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0392  hypothetical protein  33 
 
 
213 aa  74.7  0.000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.383752  normal  0.0799866 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0612  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.36 
 
 
210 aa  74.3  0.000000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0780  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.7 
 
 
212 aa  73.9  0.000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2205  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.24 
 
 
213 aa  73.2  0.000000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000013553  hitchhiker  0.000125224 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2401  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.32 
 
 
213 aa  72.8  0.000000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3341  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.78 
 
 
210 aa  72.4  0.000000000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3511  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.52 
 
 
210 aa  72  0.000000000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2358  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.26 
 
 
231 aa  71.6  0.000000000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.503864  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0482  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.42 
 
 
216 aa  70.9  0.00000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.220556 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0607  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.62 
 
 
210 aa  70.9  0.00000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.692938  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3811  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.62 
 
 
210 aa  70.9  0.00000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2674  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.88 
 
 
211 aa  70.1  0.00000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.172224  normal  0.0331815 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2799  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.56 
 
 
215 aa  69.7  0.00000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.470573  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6107  NmrA family protein  28.85 
 
 
216 aa  68.9  0.00000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3754  hypothetical protein  27.54 
 
 
207 aa  69.3  0.00000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.248863  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4018  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.58 
 
 
213 aa  68.9  0.00000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.163335  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1392  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.61 
 
 
204 aa  68.2  0.00000000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4332  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.61 
 
 
204 aa  68.2  0.00000000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.182614 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5649  hypothetical protein  30.95 
 
 
216 aa  68.2  0.00000000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.054314  normal  0.986235 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0501  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase-like  32.76 
 
 
216 aa  67.8  0.0000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.82125 
 
 
-
 
NC_006680  CNK00190  hypothetical protein  25.6 
 
 
255 aa  66.6  0.0000000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1882  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.38 
 
 
213 aa  67  0.0000000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2272  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.57 
 
 
239 aa  66.6  0.0000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.692086 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2728  hypothetical protein  26 
 
 
213 aa  66.6  0.0000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.763149  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4473  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.44 
 
 
204 aa  66.2  0.0000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.350599 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2535  hypothetical protein  33.33 
 
 
217 aa  66.2  0.0000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS00404  hypothetical protein  32.96 
 
 
203 aa  65.9  0.0000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.000519632  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3687  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.67 
 
 
210 aa  65.9  0.0000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1826  NmrA family protein  30.69 
 
 
207 aa  66.2  0.0000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2414  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.9 
 
 
223 aa  66.2  0.0000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.596261  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6521  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.11 
 
 
210 aa  65.9  0.0000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.02448  normal  0.211637 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2094  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.54 
 
 
203 aa  65.5  0.0000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0891152  normal  0.33329 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0839  NAD-dependent epimerase/dehydratase  25.98 
 
 
212 aa  64.7  0.0000000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4051  hypothetical protein  27.85 
 
 
241 aa  64.7  0.0000000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.018698 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1033  NmrA family protein  28.16 
 
 
204 aa  64.3  0.000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1607  NAD-dependent epimerase/dehydratase  26.46 
 
 
215 aa  63.9  0.000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3304  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.18 
 
 
210 aa  63.5  0.000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1689  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.6 
 
 
243 aa  63.5  0.000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0189126  hitchhiker  0.0000000628331 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0457  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.86 
 
 
212 aa  62.4  0.000000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.721526  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4420  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.29 
 
 
204 aa  62.4  0.000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.952073  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0470  TrkA-N  30.54 
 
 
202 aa  62  0.000000006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1875  NAD-dependent epimerase/dehydratase  28.65 
 
 
211 aa  62  0.000000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.146647  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>