More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Memar_0506 on replicon NC_009051
Organism: Methanoculleus marisnigri JR1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009051  Memar_0506  geranylgeranyl reductase  100 
 
 		 398 aa  800    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0962  geranylgeranyl reductase  68.84 
 
 		 399 aa  556  1e-157  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.493163  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1945  geranylgeranyl reductase  67.43 
 
 		 398 aa  525  1e-148  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1123  geranylgeranyl reductase  60.7 
 
 		 402 aa  489  1e-137  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0431  PUA domain-containing protein  59.19 
 
 		 397 aa  461  1e-129  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1308  geranylgeranyl reductase  49.37 
 
 		 406 aa  384  1e-105  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0369  geranylgeranyl reductase  48.22 
 
 		 408 aa  379  1e-104  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0683691  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3422  geranylgeranyl reductase  48.61 
 
 		 407 aa  360  2e-98  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.351163 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0044  geranylgeranyl reductase  47.48 
 
 		 391 aa  360  3e-98  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.345503  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0578  geranylgeranyl reductase  43 
 
 		 395 aa  315  6e-85  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1250  geranylgeranyl reductase  39 
 
 		 390 aa  256  4e-67  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.375977  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0522  geranylgeranyl reductase  38.5 
 
 		 390 aa  243  3.9999999999999997e-63  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1386  geranylgeranyl reductase  38 
 
 		 390 aa  241  2e-62  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1307  geranylgeranyl reductase  36.88 
 
 		 391 aa  240  2.9999999999999997e-62  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.398981  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1375  geranylgeranyl reductase  37.66 
 
 		 390 aa  239  4e-62  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.545102  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0718  geranylgeranyl reductase  33.06 
 
 		 387 aa  182  1e-44  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0172  bacteriochlorophyll synthase  32.56 
 
 		 396 aa  179  5.999999999999999e-44  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.935683 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1077  geranylgeranyl reductase  29.57 
 
 		 399 aa  174  1.9999999999999998e-42  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0240225  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1347  geranylgeranyl reductase  33.23 
 
 		 453 aa  158  2e-37  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0129504  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1073  geranylgeranyl reductase  32.06 
 
 		 452 aa  154  2e-36  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0714  geranylgeranyl reductase  30.73 
 
 		 386 aa  154  2e-36  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0303  geranylgeranyl reductase  33.24 
 
 		 396 aa  146  6e-34  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.411579  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1711  geranylgeranyl reductase  33.82 
 
 		 365 aa  144  2e-33  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0938  geranylgeranyl reductase  33.14 
 
 		 453 aa  142  9e-33  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.129052 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2942  hypothetical protein  29.82 
 
 		 416 aa  138  2e-31  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.33678  normal  0.0128685 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1696  geranylgeranyl reductase  33.04 
 
 		 459 aa  138  2e-31  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0811  geranylgeranyl reductase  33.96 
 
 		 453 aa  131  2.0000000000000002e-29  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1392  excinuclease ABC subunit C  29.97 
 
 		 382 aa  130  3e-29  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0201698  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0365  geranylgeranyl reductase  24 
 
 		 386 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.230405  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2507  FAD dependent oxidoreductase  30.05 
 
 		 414 aa  126  6e-28  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.206191  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0864  geranylgeranyl reductase  25.77 
 
 		 396 aa  126  8.000000000000001e-28  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000799674  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0681  geranylgeranyl reductase  28.32 
 
 		 453 aa  125  1e-27  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00166018  hitchhiker  0.00000684168 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0631  geranylgeranyl reductase  28.75 
 
 		 402 aa  124  3e-27  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1447  geranylgeranyl reductase  24.33 
 
 		 392 aa  122  9e-27  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.134641  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3081  FAD dependent oxidoreductase  30.29 
 
 		 413 aa  122  9.999999999999999e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0671  geranylgeranyl reductase  32.33 
 
 		 381 aa  121  1.9999999999999998e-26  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.421353  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0810  geranylgeranyl reductase  27.32 
 
 		 384 aa  120  3.9999999999999996e-26  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0236364  normal  0.332437 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1349  geranylgeranyl reductase  24.87 
 
 		 392 aa  120  3.9999999999999996e-26  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0539  geranylgeranyl reductase  23.82 
 
 		 391 aa  118  9.999999999999999e-26  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3091  FAD dependent oxidoreductase  27.42 
 
 		 410 aa  118  9.999999999999999e-26  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.275239  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0472  geranylgeranyl reductase  23.54 
 
 		 385 aa  118  1.9999999999999998e-25  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.730289  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0668  geranylgeranyl reductase  31.04 
 
 		 458 aa  117  3e-25  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.159483  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1090  bacteriochlorophyll synthase 43 kDa subunit  26.57 
 
 		 385 aa  115  2.0000000000000002e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2206  FAD dependent oxidoreductase  28.57 
 
 		 410 aa  113  6e-24  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.685598 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1087  electron transfer flavoprotein  26.95 
 
 		 384 aa  110  4.0000000000000004e-23  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.384904  normal  0.110599 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0807  geranylgeranyl reductase  31.07 
 
 		 348 aa  109  9.000000000000001e-23  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00458422  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0444  geranylgeranyl reductase  30.27 
 
 		 341 aa  108  2e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1220  dehydrogenase (flavoprotein)-like protein  26.56 
 
 		 378 aa  106  9e-22  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1007  FAD dependent oxidoreductase  29.71 
 
 		 409 aa  106  9e-22  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0661  geranylgeranyl reductase  23.94 
 
 		 375 aa  105  1e-21  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0166  geranylgeranyl reductase  27.49 
 
 		 453 aa  103  6e-21  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3043  geranylgeranyl reductase  26.11 
 
 		 376 aa  103  7e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.483009 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0023  geranylgeranyl reductase  28.95 
 
 		 379 aa  102  1e-20  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0136897  hitchhiker  0.00371909 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2205  geranylgeranyl reductase  29.89 
 
 		 363 aa  101  2e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1523  geranylgeranyl reductase  27.08 
 
 		 495 aa  101  2e-20  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.545892  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0279  geranylgeranyl reductase  30.33 
 
 		 424 aa  101  3e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.615542  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1407  geranylgeranyl reductase  27.59 
 
 		 398 aa  101  3e-20  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.426262  normal  0.248213 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1920  geranylgeranyl reductase  31.65 
 
 		 394 aa  100  6e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.571775 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0277  geranylgeranyl hydrogenase  31.65 
 
 		 394 aa  100  6e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1343  geranylgeranyl reductase  33.13 
 
 		 411 aa  100  6e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.263408 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0939  FAD dependent oxidoreductase  25.55 
 
 		 385 aa  99  1e-19  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0379493  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2269  geranylgeranyl reductase  30.46 
 
 		 398 aa  99  1e-19  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0643  geranylgeranyl reductase  29.41 
 
 		 360 aa  97.8  3e-19  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.770726  normal  0.124546 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1514  geranylgeranyl reductase  24.21 
 
 		 485 aa  97.1  5e-19  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00785047 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2696  geranylgeranyl reductase, plantal and  29.47 
 
 		 435 aa  96.7  6e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1955  hypothetical protein  26.9 
 
 		 405 aa  96.3  8e-19  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0035  geranylgeranyl reductase  28.69 
 
 		 380 aa  96.3  9e-19  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.916237  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0583  geranylgeranyl reductase  27.41 
 
 		 425 aa  96.3  9e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1018  geranylgeranyl reductase  31.7 
 
 		 394 aa  94.4  3e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.175097  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0830  geranylgeranyl reductase  24.85 
 
 		 415 aa  93.6  5e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2633  geranylgeranyl reductase  29.48 
 
 		 421 aa  93.6  6e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4066  geranylgeranyl reductase  28.91 
 
 		 423 aa  93.2  7e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.449431  normal  0.299227 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0266  geranylgeranyl reductase  29.13 
 
 		 445 aa  93.2  7e-18  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.224418  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1042  geranylgeranyl reductase  29.26 
 
 		 388 aa  93.2  8e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0648  geranylgeranyl reductase  28.27 
 
 		 430 aa  92.8  9e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0626765  normal  0.0232794 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0023  geranylgeranyl reductase  28.53 
 
 		 398 aa  92.8  1e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0468  geranylgeranyl reductase  28.27 
 
 		 431 aa  92  2e-17  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3751  geranylgeranyl reductase  26.46 
 
 		 406 aa  91.3  3e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0101048  hitchhiker  0.000524672 
 
 
-
 
NC_002936  DET0771  hypothetical protein  26.4 
 
 		 379 aa  90.9  3e-17  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0697  FAD dependent oxidoreductase  25.82 
 
 		 393 aa  90.9  3e-17  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0016  geranylgeranyl reductase  28.42 
 
 		 380 aa  90.9  3e-17  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.828893  normal  0.344079 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0537  geranylgeranyl reductase  28.39 
 
 		 434 aa  90.9  3e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.118976 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0029  geranylgeranyl reductase  28.76 
 
 		 380 aa  91.3  3e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3745  geranylgeranyl reductase  28.26 
 
 		 400 aa  89.7  9e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000410516 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3528  geranylgeranyl reductase  29.56 
 
 		 394 aa  89  1e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.673829 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4464  geranylgeranyl reductase  28.5 
 
 		 423 aa  89.4  1e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.152921  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0926  FAD dependent oxidoreductase  27.04 
 
 		 411 aa  88.2  2e-16  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.609885  hitchhiker  0.00113671 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3265  geranylgeranyl reductase  26.2 
 
 		 406 aa  87.8  3e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0200135 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1066  geranylgeranyl reductase  27.58 
 
 		 382 aa  87.8  3e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000111291  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2055  geranylgeranyl reductase  26.39 
 
 		 393 aa  87.8  3e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4420  geranylgeranyl reductase  27.24 
 
 		 418 aa  87.8  3e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3712  geranylgeranyl reductase  27.81 
 
 		 402 aa  87.4  4e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.407055  hitchhiker  0.000489008 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0385  geranylgeranyl reductase  27.25 
 
 		 457 aa  87  5e-16  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1062  geranylgeranyl reductase  28.78 
 
 		 385 aa  86.7  8e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5052  geranylgeranyl reductase  29.09 
 
 		 434 aa  86.3  9e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8053  geranylgeranyl reductase  27.76 
 
 		 423 aa  85.5  0.000000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.661392 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2774  Electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  26.25 
 
 		 430 aa  85.5  0.000000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.372841  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0044  geranylgeranyl reductase  28.49 
 
 		 380 aa  85.9  0.000000000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0173  geranylgeranyl reductase  25.91 
 
 		 405 aa  85.9  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.0000608264  normal  0.261316 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0022  geranylgeranyl reductase  27.69 
 
 		 380 aa  85.5  0.000000000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>