More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A3446 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007355  Mbar_A3446  ABC transporter, ATP-binding protein  100 
 
 		 227 aa  464  9.999999999999999e-131  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00000000207745  normal  0.0995359 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2847  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  86.78 
 
 		 227 aa  409  1e-113  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0355331  normal  0.014272 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1456  ABC transporter related  67.42 
 
 		 256 aa  313  9e-85  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  hitchhiker  0.00934987  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2269  ABC transporter, ATP-binding protein  54.26 
 
 		 224 aa  242  3e-63  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1473  ABC transporter, ATP-binding protein  51.15 
 
 		 249 aa  239  2e-62  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3118  ABC transporter, ATP-binding protein  51.15 
 
 		 240 aa  240  2e-62  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.793068  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1695  ABC transporter, ATP-binding protein  51.15 
 
 		 227 aa  239  2e-62  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2200  ABC transporter, ATP-binding protein  51.15 
 
 		 240 aa  240  2e-62  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3238  ABC transporter related  50.9 
 
 		 223 aa  239  2e-62  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0758948  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2638  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  51.15 
 
 		 249 aa  239  2e-62  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2583  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  51.15 
 
 		 249 aa  239  2e-62  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.484423  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0425  ABC transporter related  57.65 
 
 		 234 aa  239  2.9999999999999997e-62  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2358  ABC transporter-related protein  51.58 
 
 		 225 aa  238  6.999999999999999e-62  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.816057 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1888  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  50.69 
 
 		 249 aa  238  8e-62  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1250  putative ATP-binding component of a transport system  50 
 
 		 227 aa  237  1e-61  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  3.40949e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0693  lipoprotein-releasing system ATP-binding protein  50.45 
 
 		 238 aa  236  2e-61  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.359  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0838  ABC transporter related protein  50 
 
 		 224 aa  236  3e-61  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2361  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  50.9 
 
 		 227 aa  236  3e-61  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0014315  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2508  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  51.58 
 
 		 225 aa  234  9e-61  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.711904  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0461  ABC transporter-related protein  53.57 
 
 		 227 aa  234  9e-61  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.880159  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0759  ABC transporter related  51.13 
 
 		 230 aa  233  1.0000000000000001e-60  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0004925  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01531  hypothetical protein  52.07 
 
 		 235 aa  233  2.0000000000000002e-60  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6488  ABC transporter related protein  47.75 
 
 		 246 aa  233  2.0000000000000002e-60  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1118  lipoprotein releasing system ATP-binding ABC transporter  49.55 
 
 		 244 aa  232  3e-60  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.107348  normal  0.208318 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0835  ABC transporter related  51.61 
 
 		 235 aa  232  3e-60  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1701  ATPase  51.13 
 
 		 240 aa  232  3e-60  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.620814 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1542  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  49.77 
 
 		 237 aa  232  3e-60  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.523279  normal  0.32706 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1633  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  47.6 
 
 		 233 aa  232  3e-60  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00322127  normal  0.820935 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2002  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  50 
 
 		 234 aa  232  4.0000000000000004e-60  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.286552  normal  0.0212812 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5419  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  49.31 
 
 		 252 aa  231  5e-60  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.912303  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2131  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  49.31 
 
 		 253 aa  231  5e-60  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.099841  normal  0.052889 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5964  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  49.31 
 
 		 253 aa  231  5e-60  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.115719  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3422  ABC transporter related  49.55 
 
 		 224 aa  231  5e-60  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2113  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  49.31 
 
 		 253 aa  231  5e-60  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0436359  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1601  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  50.45 
 
 		 234 aa  231  6e-60  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000492682  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2862  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  50.45 
 
 		 234 aa  231  6e-60  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.228509  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1366  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  48.87 
 
 		 230 aa  231  8.000000000000001e-60  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3478  lipoprotein releasing system ATP-binding protein LolD  47.96 
 
 		 258 aa  230  1e-59  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.741929  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1151  ABC transporter related  51.82 
 
 		 228 aa  230  1e-59  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.023193  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1987  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  51.14 
 
 		 233 aa  229  2e-59  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.43138  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1814  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  48.4 
 
 		 236 aa  230  2e-59  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0451036  normal  0.0825777 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1763  ABC transporter related protein  52.65 
 
 		 246 aa  230  2e-59  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.261961  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00596  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  48.88 
 
 		 236 aa  229  3e-59  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.820221  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1810  putative ATP-binding component of ABC transporter  49.55 
 
 		 228 aa  229  3e-59  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.512088  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1708  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  50 
 
 		 234 aa  229  3e-59  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000319183  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1497  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  49.55 
 
 		 233 aa  229  3e-59  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000137035  normal  0.884927 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01113  outer membrane-specific lipoprotein transporter subunit  49.55 
 
 		 233 aa  229  4e-59  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2023  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  48.39 
 
 		 231 aa  229  4e-59  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.488055  normal  0.290833 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01121  hypothetical protein  49.55 
 
 		 233 aa  229  4e-59  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2150  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  48.39 
 
 		 252 aa  229  4e-59  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0659015  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2297  ABC transporter related  52.51 
 
 		 225 aa  229  4e-59  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2206  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  49.55 
 
 		 233 aa  229  4e-59  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.165489  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0068  ABC transporter related protein  52.27 
 
 		 248 aa  229  4e-59  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2396  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  46.43 
 
 		 239 aa  228  5e-59  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.261186  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2530  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  49.1 
 
 		 233 aa  227  1e-58  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000457106  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2238  hypothetical protein  48.86 
 
 		 227 aa  227  1e-58  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1239  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  49.1 
 
 		 233 aa  227  1e-58  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000767258  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2670  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  47.56 
 
 		 233 aa  227  1e-58  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1239  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  49.1 
 
 		 233 aa  227  1e-58  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000867827  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2484  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  49.1 
 
 		 233 aa  227  1e-58  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000399068  normal  0.0488273 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2155  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  48.42 
 
 		 231 aa  227  1e-58  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.263413  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12888  ABC transporter, ATP-binding protein  52.49 
 
 		 228 aa  227  1e-58  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.567138  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1333  lipoprotein releasing system ATP-binding protein LolD  48.18 
 
 		 229 aa  227  1e-58  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0369942  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1692  ABC transporter, ATP-binding protein  49.54 
 
 		 219 aa  226  2e-58  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.623229 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1445  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  48.85 
 
 		 247 aa  226  2e-58  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.303456  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1295  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  49.55 
 
 		 233 aa  226  2e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0289168  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2210  hypothetical protein  48.86 
 
 		 227 aa  226  2e-58  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1318  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  49.55 
 
 		 233 aa  226  2e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.113611  hitchhiker  0.00161216 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1546  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  47.03 
 
 		 238 aa  226  2e-58  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0365689  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2150  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  49.55 
 
 		 233 aa  226  2e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.166466  hitchhiker  0.000506788 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1333  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  49.55 
 
 		 233 aa  226  2e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00479967 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2009  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  49.1 
 
 		 233 aa  226  2e-58  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.56693  normal  0.0495903 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1966  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  49.55 
 
 		 233 aa  226  2e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00198197  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1439  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  47.77 
 
 		 236 aa  226  2e-58  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.383265  normal  0.239297 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003991  lipoprotein releasing system ATP-binding protein LolD  50.69 
 
 		 235 aa  226  2e-58  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3016  ABC transporter related  50.23 
 
 		 227 aa  226  2e-58  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1760  ABC transporter related  51.82 
 
 		 250 aa  226  3e-58  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1632  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  49.1 
 
 		 233 aa  225  4e-58  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.961804  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1157  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  47.47 
 
 		 252 aa  225  4e-58  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.572225  normal  0.0166271 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0175  ABC transporter related  52.04 
 
 		 226 aa  225  4e-58  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0570775  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0568  ABC transporter related  51.14 
 
 		 234 aa  225  5.0000000000000005e-58  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3858  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  50.22 
 
 		 232 aa  225  5.0000000000000005e-58  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.802026  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0961  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  48.86 
 
 		 242 aa  225  5.0000000000000005e-58  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.00749478  normal  0.0189235 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3826  ABC transporter related  46.88 
 
 		 225 aa  225  5.0000000000000005e-58  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0583  ABC transporter related  51.14 
 
 		 234 aa  225  5.0000000000000005e-58  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.540435  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1057  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  48.86 
 
 		 242 aa  225  5.0000000000000005e-58  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.441915 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0349  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  47.27 
 
 		 240 aa  224  6e-58  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02834  hypothetical protein  51.35 
 
 		 239 aa  224  6e-58  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2258  lipoprotein releasing system ATP-binding protein LolD  47.96 
 
 		 230 aa  224  8e-58  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1608  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  49.34 
 
 		 237 aa  224  8e-58  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.109115  normal  0.0760989 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1567  ABC lipoprotein efflux pump, ATPase subunit  48.39 
 
 		 247 aa  224  8e-58  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.37654 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2625  lipoprotein ABC transporter, ATP-binding protein LolD  48.42 
 
 		 224 aa  224  9e-58  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1649  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  49.32 
 
 		 235 aa  224  9e-58  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.473335  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0267  ABC transporter related  49.77 
 
 		 277 aa  224  1e-57  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.481305  normal  0.0672685 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2577  ABC transporter related  52.25 
 
 		 260 aa  223  1e-57  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.993808  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6890  ABC transporter related  48.6 
 
 		 226 aa  224  1e-57  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.430612 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5400  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  46.36 
 
 		 238 aa  224  1e-57  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.122098  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1084  ABC transporter related  50.68 
 
 		 234 aa  223  1e-57  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003050  ABC-type antimicrobial peptide transport system ATPase component  51.82 
 
 		 232 aa  224  1e-57  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14700  lipoprotein-releasing ABC transporter  50.9 
 
 		 232 aa  223  2e-57  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.072484  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>