More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A0944 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007355  Mbar_A0944  hypothetical protein  100 
 
 
213 aa  436  1e-121  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1777  beta-lactamase-like protein  51.94 
 
 
211 aa  218  7e-56  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0314  beta-lactamase domain-containing protein  44.39 
 
 
214 aa  175  4e-43  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0052  beta-lactamase domain-containing protein  45.24 
 
 
200 aa  159  2e-38  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0043  beta-lactamase domain-containing protein  42.31 
 
 
200 aa  159  4e-38  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2460  beta-lactamase-like  41.84 
 
 
191 aa  150  2e-35  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0415  beta-lactamase domain protein  41.35 
 
 
199 aa  137  1e-31  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.354703  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0199  diphthine synthase  33.67 
 
 
200 aa  115  6e-25  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.000243979  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2512  beta-lactamase domain protein  32.29 
 
 
214 aa  101  7e-21  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.738891  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21890  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  40.22 
 
 
229 aa  98.6  7e-20  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.0120239 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12170  beta-lactamase domain protein  36.21 
 
 
210 aa  97.4  2e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000265397  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0387  beta-lactamase domain-containing protein  37.95 
 
 
231 aa  97.4  2e-19  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.084331  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1263  beta-lactamase domain protein  37.19 
 
 
231 aa  97.1  2e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.795749 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1678  Beta-lactamase-like  38.82 
 
 
207 aa  96.7  3e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00806685 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0903  beta-lactamase domain-containing protein  36.26 
 
 
213 aa  95.9  4e-19  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0808  beta-lactamase-like protein  37.79 
 
 
207 aa  95.9  4e-19  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000000286838  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2012  hypothetical protein  36 
 
 
213 aa  94  1e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0010295  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3471  beta-lactamase domain protein  31.79 
 
 
206 aa  94  1e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0443  beta-lactamase domain protein  34.8 
 
 
208 aa  93.6  2e-18  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3590  beta-lactamase domain-containing protein  38.71 
 
 
217 aa  93.6  2e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00212811 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0549  beta-lactamase domain-containing protein  36.21 
 
 
216 aa  92.4  4e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0141512  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0735  beta-lactamase domain-containing protein  37.37 
 
 
205 aa  92.4  4e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.204457  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3066  beta-lactamase-like  31.5 
 
 
363 aa  92  6e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.193945  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3171  beta-lactamase domain protein  33.5 
 
 
211 aa  91.7  7e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.343145 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1290  beta-lactamase domain protein  36.99 
 
 
206 aa  90.9  1e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00903792  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1949  beta-lactamase domain protein  36.55 
 
 
208 aa  90.9  1e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1342  beta-lactamase-like protein  35.98 
 
 
201 aa  90.9  1e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.224258  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1211  beta-lactamase domain protein  35.33 
 
 
211 aa  90.5  2e-17  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.000331215  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3607  beta-lactamase domain protein  38.02 
 
 
205 aa  90.5  2e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000181659  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0028  beta-lactamase domain-containing protein  34.69 
 
 
220 aa  90.1  2e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0137537  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0479  beta-lactamase domain protein  32.9 
 
 
212 aa  90.5  2e-17  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3342  beta-lactamase domain protein  34.29 
 
 
208 aa  89.7  3e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00014349  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0469  beta-lactamase domain-containing protein  35.26 
 
 
215 aa  89.7  3e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0169041  hitchhiker  0.000497753 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0418  beta-lactamase domain protein  33.02 
 
 
212 aa  89  5e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1123  beta-lactamase domain-containing protein  36.79 
 
 
204 aa  88.6  7e-17  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2547  beta-lactamase domain protein  34.86 
 
 
209 aa  87.8  1e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.92485e-17 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0381  Hydroxyacylglutathione hydrolase  40.14 
 
 
211 aa  87.8  1e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.883291  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0720  beta-lactamase domain-containing protein  36.63 
 
 
210 aa  87.8  1e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.199097  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1171  beta-lactamase domain protein  31.87 
 
 
303 aa  87  2e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.361402  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3722  beta-lactamase domain-containing protein  31.28 
 
 
206 aa  86.7  2e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2640  beta-lactamase domain protein  38.07 
 
 
206 aa  86.3  3e-16  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1666  beta-lactamase domain protein  34.29 
 
 
209 aa  85.9  4e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2884  beta-lactamase domain protein  31.58 
 
 
191 aa  85.9  4e-16  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2928  beta-lactamase domain-containing protein  34.43 
 
 
251 aa  85.5  5e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.391468  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_3004  beta-lactamase domain-containing protein  34.88 
 
 
204 aa  85.5  5e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.985459  normal  0.107301 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0656  beta-lactamase domain protein  33.86 
 
 
208 aa  85.5  5e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1117  beta-lactamase domain-containing protein  35.29 
 
 
205 aa  85.5  5e-16  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0282  beta-lactamase domain-containing protein  32.63 
 
 
240 aa  85.5  6e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1123  metallo-beta-lactamase family protein  35.59 
 
 
209 aa  85.1  7e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.692582  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0780  beta-lactamase domain-containing protein  33.68 
 
 
287 aa  85.1  7e-16  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.63 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0786  metallo-beta-lactamase family protein  34.64 
 
 
208 aa  84.3  0.000000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0221878  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1739  beta-lactamase domain protein  30.73 
 
 
212 aa  84.7  0.000000000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000226138  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1026  metallo-beta-lactamase family protein  35.32 
 
 
215 aa  83.2  0.000000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.043416  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1034  metallo-beta-lactamase family protein  35.32 
 
 
215 aa  83.2  0.000000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1088  metallo-beta-lactamase family protein  35.32 
 
 
215 aa  83.6  0.000000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00153658  normal  0.346644 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0089  beta-lactamase domain-containing protein  36 
 
 
207 aa  83.6  0.000000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2072  beta-lactamase domain-containing protein  37.06 
 
 
210 aa  84  0.000000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.760558  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2669  beta-lactamase domain-containing protein  35.32 
 
 
215 aa  83.2  0.000000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00771642  normal  0.138863 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04020  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  33.68 
 
 
222 aa  83.2  0.000000000000003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.626574 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2193  metallo-beta-lactamase family protein  34.83 
 
 
215 aa  82.8  0.000000000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.700248  normal  0.270656 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0834  beta-lactamase domain-containing protein  34.47 
 
 
205 aa  82.4  0.000000000000005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0372  beta-lactamase domain-containing protein  31.28 
 
 
203 aa  82.4  0.000000000000005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00504714  hitchhiker  0.000000000307388 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2391  metallo-beta-lactamase family protein  35.32 
 
 
215 aa  82  0.000000000000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.178829  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00931  predicted metal-binding enzyme  34.83 
 
 
215 aa  82  0.000000000000006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00844744  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2716  beta-lactamase domain protein  34.83 
 
 
215 aa  82  0.000000000000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.187181  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25370  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase  34.2 
 
 
207 aa  82  0.000000000000006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.555955 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00938  hypothetical protein  34.83 
 
 
215 aa  82  0.000000000000006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0114501  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1411  beta-lactamase domain-containing protein  33.92 
 
 
214 aa  81.6  0.000000000000007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.557584  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2513  beta-lactamase domain protein  28.78 
 
 
192 aa  81.6  0.000000000000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02708  hypothetical protein  39.16 
 
 
218 aa  80.1  0.00000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2453  beta-lactamase domain protein  34.64 
 
 
207 aa  80.5  0.00000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000197435  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4155  beta-lactamase domain protein  32.2 
 
 
212 aa  80.5  0.00000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000681201 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2397  putative hydrolase  33.16 
 
 
210 aa  80.1  0.00000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.322158 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1975  metallo-beta-lactamase superfamily protein  34.33 
 
 
215 aa  79.7  0.00000000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0642346  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2544  beta-lactamase domain protein  28.5 
 
 
191 aa  79.3  0.00000000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.143017  normal  0.22049 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00776  probable metallo-beta-lactamase  32.63 
 
 
213 aa  79.7  0.00000000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2285  beta-lactamase domain protein  34.1 
 
 
205 aa  79.7  0.00000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00100141  hitchhiker  0.0000000549236 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2403  metallo-beta-lactamase family protein  35.11 
 
 
213 aa  79.3  0.00000000000004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1453  Beta-lactamase-like  30.61 
 
 
241 aa  79.3  0.00000000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.581113  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2652  beta-lactamase domain-containing protein  33.83 
 
 
215 aa  79.3  0.00000000000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0560187  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1782  Metallo-beta-lactamase  33.83 
 
 
217 aa  79.3  0.00000000000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.111003  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1901  beta-lactamase-like  36.11 
 
 
209 aa  79.3  0.00000000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.647994  hitchhiker  0.00267047 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1958  beta-lactamase domain-containing protein  33.16 
 
 
209 aa  79.3  0.00000000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2561  metallo-beta-lactamase family protein  33.83 
 
 
215 aa  79.3  0.00000000000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000219407  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1306  metallo-beta-lactamase family protein  32.37 
 
 
214 aa  79  0.00000000000005  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3479  Beta-lactamase-like  36.26 
 
 
218 aa  79  0.00000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_691  metallo-beta-lactamase  33.91 
 
 
217 aa  79  0.00000000000005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.664332  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1522  Beta-lactamase-like  36.72 
 
 
214 aa  78.6  0.00000000000007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3707  beta-lactamase domain-containing protein  33.51 
 
 
209 aa  78.6  0.00000000000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000107683  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5067  beta-lactamase domain-containing protein  34.03 
 
 
215 aa  78.2  0.00000000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.512117  normal  0.0696013 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2954  beta-lactamase domain-containing protein  34.78 
 
 
214 aa  78.2  0.00000000000008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003129  hydroxyacylglutathione hydrolase  37.43 
 
 
216 aa  78.2  0.00000000000009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000730462  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0220  beta-lactamase domain protein  33.14 
 
 
212 aa  78.2  0.00000000000009  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2674  Beta-lactamase-like  33.33 
 
 
209 aa  78.2  0.00000000000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.627601 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2888  beta-lactamase domain-containing protein  28.91 
 
 
368 aa  78.2  0.00000000000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0785  metallo-beta-lactamase family protein  35.76 
 
 
205 aa  77.8  0.0000000000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.721139  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1793  beta-lactamase domain-containing protein  31.68 
 
 
243 aa  77.4  0.0000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1635  beta-lactamase domain-containing protein  33.69 
 
 
214 aa  77.8  0.0000000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.702342  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0711  beta-lactamase domain-containing protein  34.48 
 
 
217 aa  77.8  0.0000000000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2524  beta-lactamase domain-containing protein  37.21 
 
 
215 aa  77.8  0.0000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>