More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Maqu_1862 on replicon NC_008740
Organism: Marinobacter aquaeolei VT8



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008740  Maqu_1862  dTMP kinase  100 
 
 		 214 aa  431  1e-120  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0221751  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1829  dTMP kinase  62.25 
 
 		 218 aa  251  6e-66  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1530  thymidylate kinase  60.5 
 
 		 207 aa  243  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.609014 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1495  thymidylate kinase  59.31 
 
 		 210 aa  240  1e-62  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.845785  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3795  thymidylate kinase  58.91 
 
 		 210 aa  239  2e-62  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.398765  normal  0.441646 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3827  thymidylate kinase  59.02 
 
 		 210 aa  236  2e-61  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.058171  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1633  thymidylate kinase  58.42 
 
 		 210 aa  236  2e-61  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1652  thymidylate kinase  58.05 
 
 		 210 aa  234  7e-61  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.401857  normal  0.314195 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2199  thymidylate kinase  57.92 
 
 		 210 aa  233  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.833111  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25740  thymidylate kinase  58.42 
 
 		 210 aa  233  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.602436 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4152  thymidylate kinase  56.1 
 
 		 210 aa  228  4e-59  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.898638  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1606  thymidylate kinase  60.4 
 
 		 212 aa  228  6e-59  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0524778  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14970  thymidylate kinase  57.07 
 
 		 211 aa  226  3e-58  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1634  thymidylate kinase  54 
 
 		 208 aa  222  4e-57  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.60217  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1416  thymidylate kinase  55.77 
 
 		 217 aa  217  1e-55  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.845977 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0718  thymidylate kinase  51.21 
 
 		 219 aa  212  2.9999999999999995e-54  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.881728  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0608  thymidylate kinase  50.48 
 
 		 223 aa  211  7e-54  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00959948  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1577  thymidylate kinase  50.48 
 
 		 223 aa  211  7e-54  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0174932  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1387  thymidylate kinase  50.25 
 
 		 205 aa  204  1e-51  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0198768  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1660  thymidylate kinase  51.01 
 
 		 206 aa  202  4e-51  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0638751  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1996  thymidylate kinase  49.5 
 
 		 208 aa  197  1.0000000000000001e-49  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2267  dTMP kinase  46.19 
 
 		 212 aa  194  6e-49  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.799684  normal  0.27429 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1253  thymidylate kinase  55.67 
 
 		 219 aa  193  2e-48  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1828  thymidylate kinase  48.28 
 
 		 200 aa  191  7e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.179808  normal  0.0308742 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1500  thymidylate kinase  48.98 
 
 		 203 aa  190  1e-47  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.243976  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2318  thymidylate kinase  49.53 
 
 		 217 aa  188  7e-47  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0629646  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1434  thymidylate kinase  47.8 
 
 		 203 aa  184  8e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2263  thymidylate kinase  46.89 
 
 		 206 aa  182  2.0000000000000003e-45  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0386042  normal  0.293028 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1946  dTMP kinase  47.64 
 
 		 212 aa  183  2.0000000000000003e-45  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.30449  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0155  thymidylate kinase  48.26 
 
 		 225 aa  183  2.0000000000000003e-45  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1665  dTMP kinase  46.8 
 
 		 219 aa  183  2.0000000000000003e-45  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1043  thymidylate kinase  45.93 
 
 		 206 aa  182  3e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.625825  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2229  thymidylate kinase  47.17 
 
 		 213 aa  182  4.0000000000000006e-45  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.558567  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2154  thymidylate kinase  47.85 
 
 		 206 aa  181  5.0000000000000004e-45  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.511195  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1939  thymidylate kinase  46.89 
 
 		 206 aa  181  8.000000000000001e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.622457  normal  0.256999 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0126  dTMP kinase  47.26 
 
 		 208 aa  179  2e-44  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000990938  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0145  thymidylate kinase  47.76 
 
 		 225 aa  179  2e-44  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00289209 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2197  thymidylate kinase  46.04 
 
 		 204 aa  179  2e-44  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.677728 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1543  thymidylate kinase  49.01 
 
 		 204 aa  178  5.999999999999999e-44  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.145095  normal  0.0739271 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1784  thymidylate kinase  48.54 
 
 		 205 aa  176  3e-43  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.378428  normal  0.509643 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2281  thymidylate kinase  46.89 
 
 		 206 aa  175  4e-43  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.617741  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1425  thymidylate kinase  46.89 
 
 		 206 aa  175  4e-43  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.248175  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3388  thymidylate kinase  46.89 
 
 		 206 aa  175  4e-43  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.830309  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1916  thymidylate kinase  46.89 
 
 		 206 aa  175  4e-43  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1189  thymidylate kinase  46.89 
 
 		 206 aa  175  4e-43  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3227  thymidylate kinase  47.72 
 
 		 217 aa  175  4e-43  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.000111751  normal  0.0445017 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2443  thymidylate kinase  46.89 
 
 		 206 aa  175  6e-43  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.770966  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2320  thymidylate kinase  46.89 
 
 		 206 aa  175  6e-43  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1425  thymidylate kinase  47.57 
 
 		 205 aa  174  9e-43  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.578696  normal  0.216838 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02330  thymidylate kinase  47 
 
 		 222 aa  172  3.9999999999999995e-42  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1916  thymidylate kinase  45.93 
 
 		 206 aa  171  6.999999999999999e-42  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0727621 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6186  thymidylate kinase  45.93 
 
 		 206 aa  171  6.999999999999999e-42  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1893  thymidylate kinase  45.93 
 
 		 206 aa  171  6.999999999999999e-42  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.430132  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1691  thymidylate kinase  47 
 
 		 212 aa  170  1e-41  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0210927  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5193  thymidylate kinase  44.98 
 
 		 206 aa  170  1e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.207302 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1381  thymidylate kinase  44.98 
 
 		 206 aa  171  1e-41  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1583  thymidylate kinase  47 
 
 		 212 aa  170  1e-41  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000489849  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3493  thymidylate kinase  47 
 
 		 212 aa  170  1e-41  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000071243  normal  0.0320777 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1466  thymidylate kinase  46.6 
 
 		 205 aa  170  2e-41  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.110191  normal  0.0122014 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1830  thymidylate kinase  44.98 
 
 		 206 aa  170  2e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1802  thymidylate kinase  44.98 
 
 		 206 aa  170  2e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0698629  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0042  thymidylate kinase  45.59 
 
 		 207 aa  168  6e-41  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000722791 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2029  thymidylate kinase  43.54 
 
 		 213 aa  168  6e-41  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000357383  hitchhiker  0.00000127305 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01094  thymidylate kinase  43.54 
 
 		 213 aa  167  1e-40  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00390554  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2549  dTMP kinase  43.54 
 
 		 213 aa  167  1e-40  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000242114  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2503  thymidylate kinase  43.54 
 
 		 213 aa  167  1e-40  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00403809  unclonable  0.0000000113108 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1220  thymidylate kinase  43.54 
 
 		 213 aa  167  1e-40  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000082141  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0059  dTMP kinase  45 
 
 		 207 aa  167  1e-40  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.804352  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01102  hypothetical protein  43.54 
 
 		 213 aa  167  1e-40  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00374424  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3153  dTMP kinase  43.96 
 
 		 213 aa  167  1e-40  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000133636  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2226  thymidylate kinase  43.54 
 
 		 213 aa  167  1e-40  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000221684  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0006  dTMP kinase  48.34 
 
 		 215 aa  167  1e-40  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  hitchhiker  0.00242626  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1219  thymidylate kinase  43.54 
 
 		 213 aa  167  1e-40  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.000000000000291901  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1691  thymidylate kinase  43.81 
 
 		 216 aa  166  2e-40  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.38478e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3024  thymidylate kinase  42.57 
 
 		 209 aa  167  2e-40  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1477  thymidylate kinase  43.54 
 
 		 213 aa  166  2e-40  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000124035  hitchhiker  0.000000000959374 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0966  dTMP kinase  45.19 
 
 		 214 aa  165  5e-40  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2010  thymidylate kinase  46.83 
 
 		 230 aa  164  6.9999999999999995e-40  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.154294  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0279  thymidylate kinase  40.89 
 
 		 213 aa  164  6.9999999999999995e-40  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0883  dTMP kinase  47.67 
 
 		 211 aa  164  9e-40  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1860  thymidylate kinase / thymidylate synthase  44.33 
 
 		 215 aa  164  1.0000000000000001e-39  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.913356  normal  0.157314 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1962  thymidylate kinase  44.12 
 
 		 211 aa  163  2.0000000000000002e-39  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0101939  normal  0.909912 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2503  thymidylate kinase  49.75 
 
 		 233 aa  163  2.0000000000000002e-39  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.33464  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2169  thymidylate kinase  44.55 
 
 		 213 aa  162  3e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000154462 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1276  thymidylate kinase  44.55 
 
 		 213 aa  162  3e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.823229  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1987  thymidylate kinase  42.73 
 
 		 217 aa  162  3e-39  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1299  thymidylate kinase  44.55 
 
 		 213 aa  162  4.0000000000000004e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.160764  hitchhiker  0.0000000000000573213 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1986  thymidylate kinase  44.55 
 
 		 213 aa  162  4.0000000000000004e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000464686  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1717  thymidylate kinase  42.73 
 
 		 217 aa  162  4.0000000000000004e-39  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.351649  normal  0.313232 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1487  thymidylate kinase  43.72 
 
 		 210 aa  162  4.0000000000000004e-39  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.396843  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1314  thymidylate kinase  44.55 
 
 		 213 aa  162  4.0000000000000004e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000000054513 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2302  thymidylate kinase  43.72 
 
 		 212 aa  161  6e-39  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.792305  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0100  thymidylate kinase  43.23 
 
 		 233 aa  161  7e-39  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000072842 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1703  thymidylate kinase  45 
 
 		 214 aa  160  1e-38  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.225544  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0398  dTMP kinase  42.23 
 
 		 222 aa  160  1e-38  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.559161 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0240  thymidylate kinase  42.65 
 
 		 224 aa  159  2e-38  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.644878  normal  0.218016 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2703  thymidylate kinase  45.05 
 
 		 230 aa  159  3e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.833829  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2802  thymidylate kinase  44.5 
 
 		 219 aa  159  4e-38  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.100646  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1983  thymidylate kinase  46.49 
 
 		 210 aa  158  7e-38  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3114  thymidylate kinase  46.5 
 
 		 230 aa  157  1e-37  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0311212  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>