231 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MADE_01993 on replicon NC_011138
Organism: Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011138  MADE_01993  predicted aminoglycoside phosphotransferase  100 
 
 
380 aa  802    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.0000191703  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2216  aminoglycoside phosphotransferase  64.55 
 
 
355 aa  525  1e-148  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0634  aminoglycoside phosphotransferase  63.1 
 
 
370 aa  500  1e-140  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1186  aminoglycoside phosphotransferase  56.3 
 
 
429 aa  441  9.999999999999999e-123  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.161649  normal  0.0723481 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0471  aminoglycoside phosphotransferase  54.28 
 
 
403 aa  425  1e-118  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2202  aminoglycoside phosphotransferase  51.08 
 
 
354 aa  394  1e-108  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0249474  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4576  aminoglycoside phosphotransferase  49.46 
 
 
357 aa  392  1e-108  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.822662 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0116  aminoglycoside phosphotransferase  46.8 
 
 
379 aa  380  1e-104  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2457  aminoglycoside phosphotransferase  49.86 
 
 
355 aa  362  7.0000000000000005e-99  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00764802 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2724  hypothetical protein  49.44 
 
 
355 aa  357  9.999999999999999e-98  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3418  aminoglycoside phosphotransferase  50.14 
 
 
355 aa  356  2.9999999999999997e-97  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.949755  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3559  aminoglycoside phosphotransferase  48.48 
 
 
355 aa  353  2e-96  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.595969  normal  0.25426 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40880  hypothetical protein  47.73 
 
 
356 aa  353  2e-96  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2075  aminoglycoside phosphotransferase  48.75 
 
 
355 aa  352  5e-96  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0283964  normal  0.0813065 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3467  hypothetical protein  47.47 
 
 
356 aa  351  1e-95  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.962273  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3214  aminoglycoside phosphotransferase  46.54 
 
 
355 aa  345  7e-94  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.457678 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3925  aminoglycoside phosphotransferase  48.2 
 
 
355 aa  345  8e-94  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.138496  normal  0.0994806 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1248  aminoglycoside phosphotransferase  45.82 
 
 
354 aa  345  1e-93  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.437649  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1910  aminoglycoside phosphotransferase  47.65 
 
 
355 aa  343  4e-93  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.107516  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0521  phosphotransferase enzyme family protein  47.06 
 
 
358 aa  331  1e-89  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.828343  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0946  phosphotransferase enzyme family protein  46.26 
 
 
876 aa  329  6e-89  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2515  phosphotransferase enzyme family protein  46.26 
 
 
358 aa  329  6e-89  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.538126  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2653  phosphotransferase enzyme family protein  46.26 
 
 
358 aa  327  2.0000000000000001e-88  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.95808  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0243  phosphotransferase enzyme family protein  45.99 
 
 
358 aa  325  9e-88  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0279  phosphotransferase enzyme family protein  45.99 
 
 
358 aa  325  9e-88  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.438432  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1426  phosphotransferase enzyme family protein  45.99 
 
 
358 aa  325  9e-88  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1623  phosphotransferase enzyme family protein  45.99 
 
 
358 aa  325  9e-88  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1459  aminoglycoside phosphotransferase  43.82 
 
 
354 aa  307  2.0000000000000002e-82  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.049097  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1097  aminoglycoside phosphotransferase  41.55 
 
 
348 aa  301  9e-81  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.627512  normal  0.0663578 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2291  aminoglycoside phosphotransferase  41.62 
 
 
348 aa  299  7e-80  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2064  aminoglycoside phosphotransferase  39.89 
 
 
361 aa  298  1e-79  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.449993  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2337  aminoglycoside phosphotransferase  37.4 
 
 
353 aa  261  2e-68  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1393  aminoglycoside phosphotransferase  38.24 
 
 
363 aa  259  4e-68  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.330539 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1559  aminoglycoside phosphotransferase  36.49 
 
 
344 aa  242  7e-63  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1805  aminoglycoside phosphotransferase  33.24 
 
 
352 aa  236  7e-61  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0927  aminoglycoside phosphotransferase  34.26 
 
 
351 aa  233  3e-60  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.993496  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2397  aminoglycoside phosphotransferase  35.59 
 
 
362 aa  233  5e-60  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0626006  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2209  aminoglycoside phosphotransferase  34.08 
 
 
350 aa  227  2e-58  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.375246  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0164  aminoglycoside phosphotransferase  33.33 
 
 
357 aa  225  9e-58  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4129  aminoglycoside phosphotransferase  34.49 
 
 
358 aa  200  3e-50  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.682336  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1868  aminoglycoside phosphotransferase  35.35 
 
 
344 aa  196  7e-49  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1259  aminoglycoside phosphotransferase  30.43 
 
 
359 aa  192  1e-47  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0160608  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1859  aminoglycoside phosphotransferase  32 
 
 
338 aa  191  2e-47  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3460  aminoglycoside phosphotransferase  34.91 
 
 
344 aa  191  2e-47  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.142226  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0649  aminoglycoside phosphotransferase  31.25 
 
 
356 aa  189  7e-47  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0418435  normal  0.791945 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1035  aminoglycoside phosphotransferase  29.04 
 
 
353 aa  179  4.999999999999999e-44  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.261257  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4497  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  30.68 
 
 
815 aa  179  5.999999999999999e-44  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7669  phosphotransferase family protein  32.23 
 
 
349 aa  177  4e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.799733  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0994  aminoglycoside phosphotransferase  33.03 
 
 
358 aa  172  7.999999999999999e-42  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.739164  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1844  hypothetical protein  30.55 
 
 
339 aa  172  1e-41  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.00606035  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5523  aminoglycoside phosphotransferase  33.55 
 
 
354 aa  172  1e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0625  aminoglycoside phosphotransferase  34.21 
 
 
354 aa  171  3e-41  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.149436 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0222  aminoglycoside phosphotransferase  28.57 
 
 
355 aa  167  2e-40  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.193801  normal  0.0244768 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5104  putative tyrosine protein kinase  30.32 
 
 
352 aa  167  2.9999999999999998e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16770  predicted aminoglycoside phosphotransferase  30.63 
 
 
338 aa  166  5.9999999999999996e-40  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2920  aminoglycoside phosphotransferase  32.31 
 
 
341 aa  166  5.9999999999999996e-40  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.252097 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2476  aminoglycoside phosphotransferase  29.92 
 
 
338 aa  166  6.9999999999999995e-40  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000012289  decreased coverage  0.00166754 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1813  aminoglycoside phosphotransferase  32.63 
 
 
344 aa  165  1.0000000000000001e-39  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0618  aminoglycoside phosphotransferase  34.33 
 
 
364 aa  164  2.0000000000000002e-39  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.176832  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2903  aminoglycoside phosphotransferase  27.14 
 
 
353 aa  164  3e-39  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1563  aminoglycoside phosphotransferase  31.56 
 
 
354 aa  164  3e-39  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.364356  normal  0.663698 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1512  aminoglycoside phosphotransferase  31.66 
 
 
356 aa  163  5.0000000000000005e-39  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000564346 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1820  aminoglycoside phosphotransferase  33.33 
 
 
352 aa  163  5.0000000000000005e-39  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0105242 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2658  aminoglycoside phosphotransferase  31.96 
 
 
348 aa  163  5.0000000000000005e-39  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2519  aminoglycoside phosphotransferase  28.92 
 
 
349 aa  162  8.000000000000001e-39  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0177703  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1368  aminoglycoside phosphotransferase  31.66 
 
 
368 aa  162  9e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.544786  hitchhiker  0.00183478 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2112  aminoglycoside phosphotransferase  31.31 
 
 
353 aa  162  1e-38  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2261  aminoglycoside phosphotransferase  30.36 
 
 
352 aa  161  2e-38  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2810  aminoglycoside phosphotransferase  31.09 
 
 
336 aa  160  3e-38  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0541387  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3481  aminoglycoside phosphotransferase  30.99 
 
 
353 aa  160  3e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0724682  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3286  aminoglycoside phosphotransferase  32.47 
 
 
361 aa  158  1e-37  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.597573 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01062  aminoglycoside phosphotransferase  29.95 
 
 
352 aa  157  2e-37  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.533136  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3187  putative tyrosine protein kinase/aminoglycoside phosphotransferase  31.07 
 
 
368 aa  157  3e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5980  aminoglycoside phosphotransferase  32.61 
 
 
353 aa  157  4e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.913808  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3209  aminoglycoside phosphotransferase  29.46 
 
 
391 aa  157  4e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.79954  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0011  aminoglycoside phosphotransferase  33.66 
 
 
337 aa  156  6e-37  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.477677  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6920  aminoglycoside phosphotransferase  27.43 
 
 
348 aa  156  7e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1108  aminoglycoside phosphotransferase  29.97 
 
 
362 aa  156  7e-37  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0793428  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5287  aminoglycoside phosphotransferase  30.56 
 
 
353 aa  155  8e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.599023  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1944  aminoglycoside phosphotransferase  30.92 
 
 
361 aa  155  9e-37  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6367  aminoglycoside phosphotransferase  30.86 
 
 
353 aa  155  1e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.708018  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0972  aminoglycoside phosphotransferase  31.09 
 
 
358 aa  155  1e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0454764 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3072  aminoglycoside phosphotransferase  31.12 
 
 
388 aa  155  1e-36  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.267154  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1653  aminoglycoside phosphotransferase  28.53 
 
 
377 aa  154  2e-36  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.793508  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0835  aminoglycoside phosphotransferase  30.65 
 
 
360 aa  154  2e-36  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.407131  normal  0.960092 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1778  aminoglycoside phosphotransferase  30.64 
 
 
361 aa  154  2.9999999999999998e-36  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.221845  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5046  aminoglycoside phosphotransferase  31.77 
 
 
342 aa  153  4e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.895104 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1018  aminoglycoside phosphotransferase  32.55 
 
 
358 aa  153  4e-36  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2861  aminoglycoside phosphotransferase  31.55 
 
 
345 aa  153  4e-36  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1885  aminoglycoside phosphotransferase  31.6 
 
 
347 aa  152  8e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.969674 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1084  phosphotransferase enzyme family protein  30.88 
 
 
368 aa  151  2e-35  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3709  aminoglycoside phosphotransferase  30.65 
 
 
352 aa  150  3e-35  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3327  aminoglycoside phosphotransferase  30.43 
 
 
361 aa  150  3e-35  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.163531  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2700  aminoglycoside phosphotransferase  30.16 
 
 
315 aa  150  3e-35  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4078  aminoglycoside phosphotransferase  30.74 
 
 
358 aa  150  3e-35  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.694545  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1478  aminoglycoside phosphotransferase  29.38 
 
 
353 aa  150  3e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2068  aminoglycoside phosphotransferase  28.93 
 
 
344 aa  150  4e-35  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1831  aminoglycoside phosphotransferase  28.49 
 
 
451 aa  149  8e-35  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5274  aminoglycoside phosphotransferase  30.52 
 
 
343 aa  149  8e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1007  aminoglycoside phosphotransferase  29.88 
 
 
358 aa  149  9e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>