More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_3845 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_3845  dihydrodipicolinate synthetase  100 
 
 		 299 aa  605  9.999999999999999e-173  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3957  dihydrodipicolinate synthetase  92.28 
 
 		 299 aa  567  1e-161  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5022  dihydrodipicolinate synthetase  80.87 
 
 		 299 aa  481  1e-135  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3930  dihydrodipicolinate synthetase  81.21 
 
 		 299 aa  481  1e-135  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4039  dihydrodipicolinate synthetase  80.87 
 
 		 299 aa  481  1e-135  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3972  dihydrodipicolinate synthetase  80.54 
 
 		 299 aa  479  1e-134  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4989  dihydrodipicolinate synthetase  80.2 
 
 		 299 aa  474  1e-133  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1939  dihydrodipicolinate synthase  31.86 
 
 		 296 aa  171  1e-41  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1874  dihydrodipicolinate synthase  31.19 
 
 		 292 aa  157  3e-37  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.013061 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1450  dihydrodipicolinate synthase  30.38 
 
 		 296 aa  154  1e-36  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3568  dihydrodipicolinate synthase  30.66 
 
 		 292 aa  153  2.9999999999999998e-36  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000801902  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2362  dihydrodipicolinate synthase  31.4 
 
 		 304 aa  153  2.9999999999999998e-36  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000117821  normal  0.484255 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1402  dihydrodipicolinate synthase  30.66 
 
 		 292 aa  152  5e-36  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000702013  hitchhiker  4.69848e-20 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0351  dihydrodipicolinate synthase  29.69 
 
 		 295 aa  152  5e-36  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3897  dihydrodipicolinate synthase  30.66 
 
 		 292 aa  152  5e-36  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0082714  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1170  dihydrodipicolinate synthase  29.86 
 
 		 290 aa  152  5e-36  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000026647  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3650  dihydrodipicolinate synthase  30.66 
 
 		 292 aa  152  5.9999999999999996e-36  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.109215  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3540  dihydrodipicolinate synthase  30.66 
 
 		 292 aa  152  5.9999999999999996e-36  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00322291  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3558  dihydrodipicolinate synthase  30.66 
 
 		 292 aa  152  5.9999999999999996e-36  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.238358  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3846  dihydrodipicolinate synthase  30.66 
 
 		 292 aa  152  5.9999999999999996e-36  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000642983  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3935  dihydrodipicolinate synthase  30.66 
 
 		 292 aa  152  5.9999999999999996e-36  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000721965  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3810  dihydrodipicolinate synthase  30.66 
 
 		 292 aa  152  5.9999999999999996e-36  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.27976e-50 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1531  dihydrodipicolinate synthetase family protein  30.72 
 
 		 304 aa  150  3e-35  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00114549  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2062  dihydrodipicolinate synthase  27.62 
 
 		 291 aa  146  4.0000000000000006e-34  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1762  dihydrodipicolinate synthase  31.06 
 
 		 304 aa  145  6e-34  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000163874  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2822  dihydrodipicolinate synthetase  30.38 
 
 		 304 aa  145  6e-34  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0197523  normal  0.589984 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0946  dihydrodipicolinate synthase  29.11 
 
 		 294 aa  145  6e-34  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3164  dihydrodipicolinate synthase  28.87 
 
 		 297 aa  145  8.000000000000001e-34  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2861  dihydrodipicolinate synthase  31.08 
 
 		 298 aa  145  1e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.224352  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2883  dihydrodipicolinate synthase  30.72 
 
 		 298 aa  144  2e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.399498  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2844  dihydrodipicolinate synthase  30.28 
 
 		 298 aa  144  2e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0557185  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1685  dihydrodipicolinate synthetase  29.66 
 
 		 295 aa  143  3e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.805786  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2449  dihydrodipicolinate synthase  30.28 
 
 		 298 aa  143  3e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2635  dihydrodipicolinate synthase  30.42 
 
 		 298 aa  143  4e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1269  dihydrodipicolinate synthase  29.18 
 
 		 292 aa  143  4e-33  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000240328  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2592  dihydrodipicolinate synthase  30.07 
 
 		 298 aa  142  8e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08690  dihydrodipicolinate synthase  28.33 
 
 		 294 aa  142  8e-33  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0207042  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1296  dihydrodipicolinate synthase  29.01 
 
 		 292 aa  141  9.999999999999999e-33  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.000060181  normal  0.083937 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2641  dihydrodipicolinate synthase  29.72 
 
 		 298 aa  141  9.999999999999999e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.267093  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2451  dihydrodipicolinate synthase  30.66 
 
 		 292 aa  141  9.999999999999999e-33  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00159687  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2832  dihydrodipicolinate synthase  29.72 
 
 		 298 aa  141  9.999999999999999e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.152609  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1847  dihydrodipicolinate synthase  29.9 
 
 		 299 aa  141  9.999999999999999e-33  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.284862 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2838  dihydrodipicolinate synthase  29.72 
 
 		 298 aa  141  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000864796 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2557  dihydrodipicolinate synthase  29.72 
 
 		 298 aa  140  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.191613  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1068  dihydrodipicolinate synthase  28.57 
 
 		 292 aa  140  1.9999999999999998e-32  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.126267  normal  0.042063 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4271  dihydrodipicolinate synthetase  29.87 
 
 		 310 aa  140  1.9999999999999998e-32  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.443076 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0562  dihydrodipicolinate synthase  27.46 
 
 		 292 aa  139  3.9999999999999997e-32  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00078537 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0647  dihydrodipicolinate synthase  30 
 
 		 292 aa  139  4.999999999999999e-32  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.443428  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2184  dihydrodipicolinate synthase  29.17 
 
 		 297 aa  138  8.999999999999999e-32  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2714  dihydrodipicolinate synthetase  30.27 
 
 		 304 aa  137  1e-31  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3043  dihydrodipicolinate synthase  28.72 
 
 		 290 aa  137  2e-31  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.366614  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2987  dihydrodipicolinate synthase  26.91 
 
 		 294 aa  136  4e-31  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00573153  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0588  dihydrodipicolinate synthase  27.84 
 
 		 296 aa  136  4e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.144122  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0056  dihydrodipicolinate synthase  29.24 
 
 		 291 aa  135  7.000000000000001e-31  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.821032  normal  0.798921 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2198  dihydrodipicolinate synthase  28.87 
 
 		 300 aa  134  9.999999999999999e-31  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0796408  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0234  dihydrodipicolinate synthase  28.03 
 
 		 290 aa  134  1.9999999999999998e-30  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0873  putative dihydrodipicolinate synthase  32.25 
 
 		 301 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.414654 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1370  dihydrodipicolinate synthase  29.11 
 
 		 296 aa  133  3e-30  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.702797  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0566  dihydrodipicolinate synthase  28.37 
 
 		 298 aa  133  3e-30  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.427592 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3999  dihydrodipicolinate synthetase  77.38 
 
 		 96 aa  133  3e-30  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1149  dihydrodipicolinate synthase  26.96 
 
 		 298 aa  133  3.9999999999999996e-30  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4559  dihydrodipicolinate synthetase  31.17 
 
 		 301 aa  132  5e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1134  dihydrodipicolinate synthase  28.27 
 
 		 295 aa  132  6e-30  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1417  putative dihydrodipicolinate synthetase  32.21 
 
 		 300 aa  132  7.999999999999999e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000330737  normal  0.0220995 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1797  dihydrodipicolinate synthase  27.99 
 
 		 292 aa  132  9e-30  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0000131213  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4666  dihydrodipicolinate synthetase  30.87 
 
 		 301 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0656669  normal  0.616699 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6523  dihydrodipicolinate synthetase  26.95 
 
 		 303 aa  131  1.0000000000000001e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.107378 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5604  dihydrodipicolinate synthase  28.77 
 
 		 298 aa  131  1.0000000000000001e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002793  dihydrodipicolinate synthase  27.93 
 
 		 292 aa  131  1.0000000000000001e-29  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2927  dihydrodipicolinate synthase  26.35 
 
 		 296 aa  130  2.0000000000000002e-29  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0846  dihydrodipicolinate synthase  28.37 
 
 		 292 aa  130  2.0000000000000002e-29  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00144357 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3169  dihydrodipicolinate synthase  26.35 
 
 		 296 aa  130  2.0000000000000002e-29  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0826  dihydrodipicolinate synthase  27.37 
 
 		 295 aa  130  2.0000000000000002e-29  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.545696  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2262  dihydrodipicolinate synthase  27.11 
 
 		 290 aa  130  3e-29  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1895  dihydrodipicolinate synthetase  28.85 
 
 		 306 aa  130  3e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.305178 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1443  dihydrodipicolinate synthase  29.1 
 
 		 296 aa  130  3e-29  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4227  dihydrodipicolinate synthetase  28.85 
 
 		 306 aa  130  3e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0531975  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0341  2,4-dihydroxyhept-2-ene-1,7-dioic acid aldolase  33.04 
 
 		 301 aa  130  3e-29  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09730  putative dihydrodipicolinate synthase  32.41 
 
 		 303 aa  130  3e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000547803  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4139  dihydrodipicolinate synthetase  28.85 
 
 		 306 aa  130  3e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.405813  normal  0.104892 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3836  dihydrodipicolinate synthase, putative  35.15 
 
 		 206 aa  129  4.0000000000000003e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000159944  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3380  dihydrodipicolinate synthetase  28.85 
 
 		 306 aa  130  4.0000000000000003e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.434141  normal  0.344387 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3086  dihydrodipicolinate synthase  28.91 
 
 		 326 aa  129  4.0000000000000003e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.167482  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03187  dihydrodipicolinate synthase  27.24 
 
 		 297 aa  129  5.0000000000000004e-29  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0159  dihydrodipicolinate synthase  26.99 
 
 		 290 aa  129  6e-29  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.865785  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4144  dihydrodipicolinate synthase  29.01 
 
 		 290 aa  129  6e-29  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4054  dihydrodipicolinate synthase  29.01 
 
 		 290 aa  129  6e-29  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0476  dihydrodipicolinate synthase  28.23 
 
 		 291 aa  128  9.000000000000001e-29  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1145  dihydrodipicolinate synthase  27.53 
 
 		 294 aa  128  1.0000000000000001e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0950083  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0827  dihydrodipicolinate synthase  27.24 
 
 		 294 aa  128  1.0000000000000001e-28  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.579615  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1335  2,4-dihydroxyhept-2-ene-1,7-dioic acid aldolase  36.76 
 
 		 313 aa  128  1.0000000000000001e-28  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.941139  normal  0.106036 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2234  dihydrodipicolinate synthase  26.41 
 
 		 290 aa  128  1.0000000000000001e-28  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0756  dihydrodipicolinate synthase  26.35 
 
 		 296 aa  128  1.0000000000000001e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.706325 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0258  dihydrodipicolinate synthase  29.69 
 
 		 293 aa  128  1.0000000000000001e-28  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2143  dihydrodipicolinate synthase  27.87 
 
 		 293 aa  128  1.0000000000000001e-28  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.168982  normal  0.25781 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1906  dihydrodipicolinate synthase  26.48 
 
 		 300 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2258  dihydrodipicolinate synthase  30.24 
 
 		 294 aa  128  1.0000000000000001e-28  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.269277  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1449  dihydrodipicolinate synthetase family protein  27.46 
 
 		 304 aa  127  2.0000000000000002e-28  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.365355  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2918  dihydrodipicolinate synthase  27.68 
 
 		 294 aa  127  2.0000000000000002e-28  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1432  dihydrodipicolinate synthase  30.41 
 
 		 294 aa  127  2.0000000000000002e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.230305  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>