More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_3523 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_3523  GntR family transcriptional regulator  100 
 
 		 239 aa  462  1e-129  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0140617  normal  0.356265 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4931  GntR family transcriptional regulator  68.75 
 
 		 231 aa  290  2e-77  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.558054  hitchhiker  0.000443766 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5099  GntR family transcriptional regulator  53.85 
 
 		 240 aa  209  4e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.408259  normal  0.367137 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2513  GntR family transcriptional regulator  51.35 
 
 		 268 aa  201  6e-51  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.761478  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5881  GntR family transcriptional regulator  53.49 
 
 		 226 aa  197  9e-50  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.453374  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5984  GntR family transcriptional regulator  53.95 
 
 		 226 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0745493  normal  0.107513 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6120  GntR family transcriptional regulator  53.02 
 
 		 226 aa  196  2.0000000000000003e-49  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.105627  normal  0.0219652 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1970  GntR family transcriptional regulator  53.55 
 
 		 225 aa  192  3e-48  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.968442  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3814  GntR family transcriptional regulator  51.49 
 
 		 229 aa  186  2e-46  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5100  GntR family transcriptional regulator  54.5 
 
 		 226 aa  185  6e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.2531  normal  0.563225 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1551  transcriptional regulator, GntR family protein  44.5 
 
 		 224 aa  179  2.9999999999999997e-44  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000349617  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2825  GntR family transcriptional regulator  45.07 
 
 		 223 aa  179  2.9999999999999997e-44  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.687306  normal  0.544458 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1759  GntR family transcriptional regulator  44.6 
 
 		 223 aa  174  1.9999999999999998e-42  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000431204  normal  1 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9244  transcriptional regulator GntR family  44.55 
 
 		 226 aa  170  2e-41  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.173978  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1528  GntR family transcriptional regulator  44.17 
 
 		 223 aa  169  3e-41  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1701  GntR family transcriptional regulator  43.19 
 
 		 223 aa  169  4e-41  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0631333  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2852  GntR family transcriptional regulator  44.13 
 
 		 223 aa  168  6e-41  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2365  GntR family transcriptional regulator  43.66 
 
 		 223 aa  168  7e-41  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.0000000273195  normal  0.0972309 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1521  GntR family transcriptional regulator  44.13 
 
 		 223 aa  168  8e-41  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000831441  normal  0.527855 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2354  GntR family transcriptional regulator  43.66 
 
 		 233 aa  167  1e-40  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000394326  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1588  GntR family transcriptional regulator  43.66 
 
 		 223 aa  167  1e-40  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0421437  normal  0.157754 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2747  GntR family transcriptional regulator  44.13 
 
 		 223 aa  166  2e-40  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00299596  normal  0.0681091 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2633  GntR family transcriptional regulator  44.13 
 
 		 223 aa  166  2e-40  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0189782  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1716  transcriptional regulator, GntR family  44.13 
 
 		 223 aa  166  2e-40  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000127588  hitchhiker  0.0000108879 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2668  GntR family transcriptional regulator  44.13 
 
 		 223 aa  166  2e-40  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000195924  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1582  GntR family transcriptional regulator  43.66 
 
 		 223 aa  166  2e-40  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00672922  normal  0.129388 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003675  predicted regulator PutR for proline utilization GntR family  38.94 
 
 		 224 aa  162  6e-39  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2707  GntR family transcriptional regulator  44.02 
 
 		 223 aa  160  2e-38  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.755904  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4142  GntR family transcriptional regulator  42.71 
 
 		 222 aa  156  3e-37  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.209682  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1382  regulatory protein GntR, HTH  41.21 
 
 		 227 aa  151  1e-35  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000764152  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2063  GntR family transcriptional regulator  45.07 
 
 		 222 aa  149  6e-35  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  hitchhiker  0.00486577  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2260  GntR family transcriptional regulator  40.91 
 
 		 232 aa  133  3e-30  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0845736  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2118  transcriptional regulator  33.01 
 
 		 226 aa  131  7.999999999999999e-30  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.206974 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3324  GntR family transcriptional regulator  36.65 
 
 		 229 aa  131  1.0000000000000001e-29  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.106017 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0300  GntR family transcriptional regulator  41.15 
 
 		 245 aa  129  4.0000000000000003e-29  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.211588 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0942  GntR family transcriptional regulator  42.79 
 
 		 214 aa  128  6e-29  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1421  GntR family transcriptional regulator  36.67 
 
 		 217 aa  125  6e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00674258  normal  0.128717 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2125  GntR family transcriptional regulator  42.64 
 
 		 230 aa  123  2e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4345  GntR family transcriptional regulator  33.02 
 
 		 230 aa  120  9.999999999999999e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.49969 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1522  GntR family transcriptional regulator  32.08 
 
 		 267 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.383522 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4086  transcriptional regulator, GntR family  36.8 
 
 		 231 aa  120  1.9999999999999998e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.129918 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3671  GntR family transcriptional regulator  34.16 
 
 		 247 aa  119  3e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.483393  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4857  transcriptional regulator, GntR family  36.27 
 
 		 225 aa  119  3e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.205094  normal  0.100646 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3968  GntR family transcriptional regulator  34.65 
 
 		 206 aa  117  9.999999999999999e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2552  GntR family transcriptional regulator  37.26 
 
 		 245 aa  117  9.999999999999999e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  unclonable  0.00000205206  normal  0.288206 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47820  putative transcriptional regulator  33.99 
 
 		 222 aa  117  9.999999999999999e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000218363  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4121  putative transcriptional regulator  34.48 
 
 		 222 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0739685  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4297  transcriptional regulator, GntR family  40.28 
 
 		 232 aa  117  1.9999999999999998e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.535178  normal  0.743699 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1183  GntR family transcriptional regulator  36.1 
 
 		 226 aa  115  6.9999999999999995e-25  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2816  GntR family transcriptional regulator  37.04 
 
 		 235 aa  114  1.0000000000000001e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00368325  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0050  GntR family transcriptional regulator  36.27 
 
 		 222 aa  114  1.0000000000000001e-24  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.731616  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4822  transcriptional regulator, GntR family  36.82 
 
 		 257 aa  109  4.0000000000000004e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00147753  normal  0.0149979 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1843  GntR family transcriptional regulator  36.82 
 
 		 257 aa  109  5e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0747919 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2970  GntR family transcriptional regulator  30.95 
 
 		 229 aa  108  1e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0065  GntR family transcriptional regulator  31.5 
 
 		 235 aa  105  6e-22  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0261299  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5088  GntR family transcriptional regulator  34.69 
 
 		 260 aa  105  7e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.104666  normal  0.0604229 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1081  transcriptional regulator GntR family  36.41 
 
 		 222 aa  104  1e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4088  transcriptional regulator, GntR family  33.04 
 
 		 236 aa  104  1e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.127832 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3493  GntR family transcriptional regulator  36.49 
 
 		 215 aa  103  2e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.552869 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4029  GntR family transcriptional regulator  36.49 
 
 		 215 aa  103  2e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7582  GntR family transcriptional regulator  37.91 
 
 		 234 aa  103  3e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0644  GntR family transcriptional regulator  36.92 
 
 		 244 aa  103  3e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.412108  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0037  GntR family transcriptional regulator  37.13 
 
 		 213 aa  103  3e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2096  transcriptional regulator, GntR family  35.27 
 
 		 237 aa  102  6e-21  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3370  GntR family transcriptional regulator  28.5 
 
 		 235 aa  101  8e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0062  GntR family transcriptional regulator  28.02 
 
 		 234 aa  100  1e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5212  GntR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 219 aa  101  1e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0902392  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5647  GntR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 219 aa  101  1e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0508113  normal  0.188641 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1651  transcriptional regulator, GntR family  35.44 
 
 		 242 aa  100  2e-20  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2404  GntR family transcriptional regulator  29.82 
 
 		 230 aa  100  2e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0202  transcriptional regulator, GntR family  33.64 
 
 		 233 aa  100  3e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0023081  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0335  transcriptional regulator, GntR family  33.82 
 
 		 232 aa  99.8  4e-20  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5008  transcriptional regulator GntR  36.11 
 
 		 245 aa  99  6e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.374928 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4582  GntR family transcriptional regulator  35.89 
 
 		 213 aa  99  6e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.971723  hitchhiker  0.000691576 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1149  GntR family transcriptional regulator  29.11 
 
 		 223 aa  98.6  8e-20  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0675802  normal  0.772542 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5454  transcriptional regulator, GntR family  36.28 
 
 		 245 aa  97.8  1e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2304  GntR family transcriptional regulator  33.67 
 
 		 224 aa  97.8  1e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.39728 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5066  GntR family transcriptional regulator  34.76 
 
 		 232 aa  97.8  1e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.219495  normal  0.372207 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2320  GntR family transcriptional regulator  34.6 
 
 		 207 aa  97.4  2e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1710  transcription regulator AsnC  29.49 
 
 		 217 aa  96.7  3e-19  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4139  transcriptional regulator, GntR family  35.89 
 
 		 238 aa  96.7  3e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.773243 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11670  transcriptional regulator  36.68 
 
 		 210 aa  96.7  3e-19  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.615947  normal  0.208843 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5914  transcriptional regulator, GntR family  32.88 
 
 		 243 aa  96.3  4e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.961809  normal  0.157742 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1661  GntR family transcriptional regulator  33.03 
 
 		 230 aa  95.9  5e-19  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2798  GntR family transcriptional regulator  34.8 
 
 		 233 aa  95.9  5e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.297778 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_3010  GntR family transcriptional regulator  34.57 
 
 		 209 aa  95.9  5e-19  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.276593 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2350  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 242 aa  95.5  7e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3795  transcriptional regulator, GntR family  28.71 
 
 		 229 aa  95.1  8e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.326665  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0163  GntR family transcriptional regulator  35.24 
 
 		 229 aa  94.4  1e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000281276 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4024  GntR family transcriptional regulator  33.51 
 
 		 239 aa  94.7  1e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.466546  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0181  GntR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 229 aa  94.4  1e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.454577  normal  0.894817 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0526  transcriptional regulator, GntR family  27.91 
 
 		 231 aa  94.7  1e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000481506  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0095  GntR family transcriptional regulator  34 
 
 		 230 aa  94.4  1e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0023  transcriptional regulator, GntR family  28.5 
 
 		 228 aa  94.4  1e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2466  GntR family transcriptional regulator  36.88 
 
 		 213 aa  93.6  2e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0280  GntR family transcriptional regulator  32.83 
 
 		 233 aa  94  2e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0095071 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3878  transcriptional regulator, GntR family  28.23 
 
 		 229 aa  94  2e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.709818 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0182  GntR family transcriptional regulator  35.24 
 
 		 229 aa  94.4  2e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.167799 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3487  transcriptional regulator, GntR family  35.08 
 
 		 223 aa  94.4  2e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1887  GntR family transcriptional regulator  34.18 
 
 		 219 aa  93.2  3e-18  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.000514659  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>