More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_1089 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_1089  HflK protein  100 
 
 		 386 aa  763    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0604271 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0701  HflK protein  91.76 
 
 		 389 aa  615  1e-175  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.704502  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2780  HflK protein  70.47 
 
 		 379 aa  468  1.0000000000000001e-131  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.224376 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4527  HflK protein  69.23 
 
 		 394 aa  466  9.999999999999999e-131  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2658  HflK protein  70.73 
 
 		 382 aa  458  9.999999999999999e-129  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.832603 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2885  HflK protein  70.47 
 
 		 382 aa  456  1e-127  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2728  HflK protein  53.23 
 
 		 385 aa  397  1e-109  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4005  HflK protein  54.88 
 
 		 383 aa  394  1e-108  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.906349  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3352  HflK protein  53.4 
 
 		 389 aa  377  1e-103  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.154635 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1664  HflK protein  52.49 
 
 		 385 aa  374  1e-102  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0743516 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0604  HflK protein  52.39 
 
 		 368 aa  369  1e-101  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0450848 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3262  HflK protein  51.69 
 
 		 383 aa  370  1e-101  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.264682  normal  0.260183 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2038  HflK protein  52.85 
 
 		 390 aa  367  1e-100  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.989603  normal  0.793303 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2349  HflK  51.69 
 
 		 382 aa  363  2e-99  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.384267  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6097  protease activity modulator HflK  53.85 
 
 		 379 aa  357  1.9999999999999998e-97  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1730  HflK protein  50.13 
 
 		 389 aa  347  3e-94  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000348315 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2458  HflK protein  48.58 
 
 		 398 aa  310  4e-83  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0761893 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2203  HflK  46.69 
 
 		 407 aa  305  7e-82  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1090  HflK protein  38.46 
 
 		 405 aa  262  8.999999999999999e-69  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1981  hflK protein  40.05 
 
 		 403 aa  254  2.0000000000000002e-66  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.245892  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1749  HflK protein  41.19 
 
 		 376 aa  253  3e-66  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.254466  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1573  HflK protein  40.17 
 
 		 367 aa  248  1e-64  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000427817  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1353  band 7 protein:stomatin  40.82 
 
 		 384 aa  246  6e-64  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.792313  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3670  HflK protein  39.69 
 
 		 399 aa  244  1.9999999999999999e-63  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.119308  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2024  HflK protein  45.22 
 
 		 379 aa  244  1.9999999999999999e-63  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0603  HflK  38.27 
 
 		 395 aa  243  3.9999999999999997e-63  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.425074 
 
 
-
 
NC_004310  BR1397  hflK protein  40.35 
 
 		 382 aa  242  7e-63  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1794  HflK protein  40.83 
 
 		 383 aa  240  4e-62  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.301305  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0831  hflK protein  36 
 
 		 344 aa  239  8e-62  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.604081  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0445  HflK protein  37 
 
 		 399 aa  238  1e-61  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.713082  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2818  HFLK protein  41.12 
 
 		 383 aa  237  2e-61  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.44638  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2736  Protein HflK  38.4 
 
 		 382 aa  237  3e-61  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.12799  normal  0.0330194 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0357  HflK protein  39.3 
 
 		 393 aa  234  2.0000000000000002e-60  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.24266  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2018  HflK protein  40.59 
 
 		 362 aa  234  2.0000000000000002e-60  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2001  HflK protein  39.57 
 
 		 393 aa  234  2.0000000000000002e-60  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.610891  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2588  HflK-like protein  37.85 
 
 		 413 aa  231  2e-59  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0268051  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0885  HflK protein  38.15 
 
 		 394 aa  230  3e-59  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.240559 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0263  HflK protein  36.29 
 
 		 360 aa  229  4e-59  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3173  HflK protein  36.94 
 
 		 394 aa  229  7e-59  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3383  HflK protein  35.46 
 
 		 433 aa  227  3e-58  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1989  hypothetical protein  36.94 
 
 		 435 aa  226  4e-58  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.757808  normal  0.0447269 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0899  HflK protein  35.17 
 
 		 393 aa  226  5.0000000000000005e-58  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0975444  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2946  HflK protein  40.66 
 
 		 359 aa  225  1e-57  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0486  HflK protein  37.23 
 
 		 361 aa  225  1e-57  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.333714 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0664  HflK protein  36.89 
 
 		 395 aa  224  2e-57  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.119349  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1587  HflK protein  37.09 
 
 		 391 aa  224  2e-57  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000287062 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1956  HflK protein  36.44 
 
 		 387 aa  222  7e-57  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.733622  normal  0.100531 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0866  HflK protein  36.46 
 
 		 387 aa  220  3.9999999999999997e-56  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0134837  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2674  HflK protein  37.39 
 
 		 388 aa  219  3.9999999999999997e-56  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0162976 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1107  HflK protein  40.64 
 
 		 308 aa  219  5e-56  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0999  HflK protein  40.64 
 
 		 308 aa  219  7.999999999999999e-56  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0073  HflK protein  35.98 
 
 		 452 aa  217  2.9999999999999998e-55  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.715541  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0843  HflK  33.61 
 
 		 355 aa  217  2.9999999999999998e-55  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2011  HflK protein  37.74 
 
 		 378 aa  216  5e-55  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.166821  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0630  HflK protein  38.78 
 
 		 309 aa  216  5e-55  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0575  HflK protein  34.5 
 
 		 459 aa  216  5e-55  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.289879  hitchhiker  0.000000000363385 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1942  HflK protein  35.04 
 
 		 406 aa  216  7e-55  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2978  HflK  36.06 
 
 		 436 aa  216  7e-55  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.750881  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5012  HflK protein  37.35 
 
 		 464 aa  215  9.999999999999999e-55  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.967957  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3344  HflK protein  41.98 
 
 		 370 aa  214  2.9999999999999995e-54  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.405881  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2300  HflK protein  39.74 
 
 		 464 aa  211  1e-53  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.194929  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1879  HflK protein  35.9 
 
 		 471 aa  211  2e-53  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.239775  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1097  HflK protein  37.82 
 
 		 451 aa  210  4e-53  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1177  HflK protein  37.82 
 
 		 451 aa  210  4e-53  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.621922 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3430  HflK protein  32.68 
 
 		 381 aa  209  5e-53  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0909026  normal  0.0445873 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0600  HflK protein  32.68 
 
 		 381 aa  209  6e-53  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0138092  hitchhiker  0.00143389 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1284  HflK protein  32.91 
 
 		 503 aa  209  8e-53  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0673  HflK protein  29.49 
 
 		 498 aa  209  9e-53  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0560  HflK protein  32.78 
 
 		 379 aa  208  1e-52  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000508673  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1050  hflK protein  37.15 
 
 		 357 aa  208  1e-52  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2279  HflK protein  37.79 
 
 		 378 aa  207  2e-52  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2541  HflK protein  36.73 
 
 		 362 aa  208  2e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4940  hflK protein  32.31 
 
 		 395 aa  207  3e-52  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3708  HflK protein  32.15 
 
 		 379 aa  206  4e-52  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000788714  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0605  hflK protein  32.23 
 
 		 381 aa  206  4e-52  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3891  HflK protein  32.15 
 
 		 379 aa  206  4e-52  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000465537  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2601  HflK protein  36.21 
 
 		 474 aa  206  4e-52  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.373557  normal  0.662751 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3765  HflK protein  32.15 
 
 		 379 aa  206  4e-52  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000022736  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2194  HflK protein  38.24 
 
 		 456 aa  206  5e-52  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3384  HflK protein  38.39 
 
 		 359 aa  206  6e-52  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.16512  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2665  heat shock protein HslU  32.63 
 
 		 386 aa  206  6e-52  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.288159  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2099  HflK protein  32.01 
 
 		 447 aa  206  7e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.080069 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0574  HflK  32.04 
 
 		 400 aa  206  8e-52  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.872643 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2630  HflK protein  35.66 
 
 		 414 aa  204  2e-51  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.587706  unclonable  0.00000000000633953 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0327  HflK protein  32.18 
 
 		 382 aa  204  2e-51  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2347  ftsH protease activity modulator HflK  34.42 
 
 		 442 aa  204  2e-51  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2220  HflK protein  34.42 
 
 		 454 aa  204  2e-51  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1413  HflK protein  34.22 
 
 		 465 aa  204  3e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.843638  hitchhiker  0.0000076277 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0525  HflK  33.69 
 
 		 389 aa  204  3e-51  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.325556  normal  0.48129 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0164  HflK protein  35.71 
 
 		 347 aa  204  3e-51  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  hitchhiker  0.00000564548  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0599  HflK protein  31.42 
 
 		 381 aa  203  3e-51  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0263631  hitchhiker  0.00000131875 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1099  HflK protein  34.42 
 
 		 437 aa  203  4e-51  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1827  HflK protein  34.42 
 
 		 437 aa  203  4e-51  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1338  ftsH protease activity modulator HflK  34.42 
 
 		 437 aa  203  4e-51  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.123813  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0069  ftsH protease activity modulator HflK  34.42 
 
 		 449 aa  203  4e-51  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.255254  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1431  HflK protein  39.24 
 
 		 471 aa  203  5e-51  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.936066 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2182  HflK protein  34.15 
 
 		 454 aa  203  5e-51  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1066  HflK protein  35.5 
 
 		 477 aa  202  6e-51  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.544735  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2861  HflK protein  35.18 
 
 		 393 aa  202  9e-51  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2241  ftsH protease activity modulator HflK  33.88 
 
 		 445 aa  202  9.999999999999999e-51  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.753349  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>