More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LACR_1849 on replicon NC_008527
Organism: Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008527  LACR_1849  alpha-amylase  100 
 
 		 524 aa  1076    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2344  alpha amylase catalytic region  37.56 
 
 		 575 aa  349  5e-95  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.520603  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1675  alpha amylase catalytic region  37.5 
 
 		 499 aa  286  5e-76  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14740  alpha amylase  36.2 
 
 		 515 aa  284  3.0000000000000004e-75  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0597647  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4280  alpha amylase catalytic region  35.87 
 
 		 541 aa  270  4e-71  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4258  alpha amylase catalytic region  33.73 
 
 		 541 aa  268  2e-70  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.256991  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4127  Alpha amylase, catalytic region  35.53 
 
 		 545 aa  266  5e-70  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4246  alpha amylase catalytic region  34.51 
 
 		 593 aa  252  1e-65  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.286976  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0014  alpha amylase, catalytic region  34.29 
 
 		 595 aa  251  3e-65  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.328102 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3205  alpha amylase catalytic region  33.4 
 
 		 583 aa  249  7e-65  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00323479  normal  0.589076 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4288  alpha amylase catalytic region  33.54 
 
 		 588 aa  244  3e-63  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.240212  normal  0.162413 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0347  alpha amylase catalytic region  33.66 
 
 		 522 aa  241  2e-62  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.242051  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2425  alpha amylase catalytic region  33.26 
 
 		 509 aa  240  5e-62  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.144227  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23200  alpha amylase  30.14 
 
 		 654 aa  236  1.0000000000000001e-60  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000149088  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1342  alpha amylase catalytic region  31.54 
 
 		 493 aa  233  6e-60  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0736  alpha amylase, catalytic region  32.08 
 
 		 815 aa  221  3e-56  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0867  alpha amylase catalytic region  31.31 
 
 		 558 aa  219  1e-55  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0584  trehalose synthase  30.84 
 
 		 606 aa  203  6e-51  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0835  alpha amylase catalytic region  29.38 
 
 		 549 aa  201  1.9999999999999998e-50  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2014  trehalose synthase  30.77 
 
 		 551 aa  201  1.9999999999999998e-50  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0356  alpha amylase, catalytic region  29.93 
 
 		 564 aa  200  6e-50  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.171609  normal  0.628947 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1336  alpha amylase catalytic region  31.32 
 
 		 565 aa  199  1.0000000000000001e-49  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00360472 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0983  alpha amylase catalytic region  31.14 
 
 		 555 aa  196  1e-48  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.0000965574  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0965  alpha amylase, catalytic region  30.96 
 
 		 555 aa  195  2e-48  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.00000000585421  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1727  alpha amylase catalytic region  31.48 
 
 		 454 aa  191  2.9999999999999997e-47  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000000518329  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0330  trehalose synthase  30.29 
 
 		 551 aa  191  2.9999999999999997e-47  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0078  alpha,alpha-phosphotrehalase  29.26 
 
 		 556 aa  188  2e-46  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.220549  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3114  alpha amylase catalytic region  28.6 
 
 		 579 aa  187  3e-46  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3584  trehalose synthase  29.35 
 
 		 601 aa  187  6e-46  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0248  trehalose synthase  30.22 
 
 		 682 aa  186  9e-46  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2342  alpha amylase catalytic region  29.07 
 
 		 538 aa  186  9e-46  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0542  alpha,alpha-phosphotrehalase  28.44 
 
 		 555 aa  185  1.0000000000000001e-45  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.764323  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0678  trehalose synthase  27.98 
 
 		 556 aa  186  1.0000000000000001e-45  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.026654  normal  0.804097 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0770  alpha amylase, catalytic region  29.52 
 
 		 455 aa  185  2.0000000000000003e-45  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4089  alpha amylase catalytic region  28.22 
 
 		 540 aa  185  2.0000000000000003e-45  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8808  alpha amylase, catalytic region  27.17 
 
 		 552 aa  185  2.0000000000000003e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0549  alpha amylase catalytic region  31.19 
 
 		 537 aa  184  3e-45  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0433  trehalose-6-phosphate hydrolase  28.68 
 
 		 562 aa  184  4.0000000000000006e-45  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000180763  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0537  trehalose synthase-like protein  29.12 
 
 		 556 aa  184  5.0000000000000004e-45  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4705  trehalose-6-phosphate hydrolase  30.52 
 
 		 550 aa  183  6e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0221451  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2736  alpha amylase, catalytic region  27.87 
 
 		 543 aa  183  6e-45  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.70509  normal  0.436177 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2115  alpha amylase catalytic region  28.44 
 
 		 553 aa  182  1e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.232775  normal  0.0296214 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0553  alpha amylase catalytic region  29.66 
 
 		 537 aa  182  1e-44  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6073  trehalose synthase  29.47 
 
 		 604 aa  181  2e-44  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.887339  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0672  alpha amylase, catalytic region  28.57 
 
 		 533 aa  180  4e-44  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.227468 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0523  trehalose-6-phosphate hydrolase  28.27 
 
 		 560 aa  180  4e-44  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2383  dextran glucosidase  26.32 
 
 		 566 aa  181  4e-44  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0624  alpha amylase catalytic region  29.89 
 
 		 570 aa  181  4e-44  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00268544  normal  0.845236 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4855  trehalose-6-phosphate hydrolase  30.13 
 
 		 550 aa  180  4.999999999999999e-44  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0911834  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01206  hypothetical protein  28.62 
 
 		 561 aa  180  5.999999999999999e-44  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4392  trehalose synthase  29.45 
 
 		 1152 aa  180  5.999999999999999e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.21351 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0862  trehalose synthase  26.09 
 
 		 598 aa  180  7e-44  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0438  trehalose-6-phosphate hydrolase  29.58 
 
 		 551 aa  180  7e-44  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.683069  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3755  alpha,alpha-phosphotrehalase  31.99 
 
 		 551 aa  179  1e-43  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5490  trehalose synthase  29.36 
 
 		 1136 aa  179  1e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.984156  hitchhiker  0.000243022 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2210  alpha amylase catalytic region  28.18 
 
 		 586 aa  179  1e-43  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.408019  hitchhiker  0.00161183 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0528  trehalose-6-phosphate hydrolase  27.94 
 
 		 554 aa  179  1e-43  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.664084  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0738  trehalose synthase  27.09 
 
 		 598 aa  179  1e-43  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.197847  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0775  alpha amylase, catalytic region  28.29 
 
 		 534 aa  179  1e-43  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4736  trehalose-6-phosphate hydrolase  29.94 
 
 		 550 aa  179  1e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7033  glycoside hydrolase family protein  30.42 
 
 		 1138 aa  179  2e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.160404  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0107  alpha amylase catalytic region  27.09 
 
 		 543 aa  179  2e-43  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0636933  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0303  alpha amylase catalytic region  28.24 
 
 		 557 aa  178  3e-43  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5761  trehalose-6-phosphate hydrolase  31.75 
 
 		 551 aa  177  3e-43  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.748972  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004234  trehalose-6-phosphate hydrolase  28.11 
 
 		 561 aa  177  3e-43  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0161937  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3310  alpha amylase, catalytic region  28.86 
 
 		 575 aa  177  3e-43  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3687  alpha amylase, catalytic region  28.09 
 
 		 540 aa  177  3e-43  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4800  trehalose-6-phosphate hydrolase  29.94 
 
 		 550 aa  178  3e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.235757  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1851  trehalose-6-phosphate hydrolase  28.32 
 
 		 531 aa  178  3e-43  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1176  alpha amylase catalytic region  29.49 
 
 		 647 aa  177  4e-43  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4834  trehalose-6-phosphate hydrolase  29.75 
 
 		 550 aa  177  4e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1340  alpha, alpha-phosphotrehalase  28.77 
 
 		 553 aa  177  6e-43  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2859  trehalose synthase  29.19 
 
 		 577 aa  176  7e-43  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2418  trehalose synthase  28.6 
 
 		 591 aa  176  7e-43  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.482185  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2828  trehalose synthase  28.83 
 
 		 548 aa  176  9e-43  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1051  trehalose synthase  27.22 
 
 		 572 aa  176  9e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.828904  normal  0.512672 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11590  glycosidase  28.49 
 
 		 522 aa  176  9.999999999999999e-43  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2978  alpha amylase, catalytic region  28.79 
 
 		 548 aa  176  9.999999999999999e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.533119  normal  0.0820165 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3679  trehalose synthase-like  27.67 
 
 		 574 aa  176  9.999999999999999e-43  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2678  trehalose synthase  28.11 
 
 		 1115 aa  175  9.999999999999999e-43  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8141  trehalose synthase  28.54 
 
 		 567 aa  175  9.999999999999999e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.351371 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0509  alpha, alpha-phosphotrehalase  27.96 
 
 		 549 aa  176  9.999999999999999e-43  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.170608  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04107  trehalose-6-P hydrolase  33.42 
 
 		 551 aa  174  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6822  trehalose synthase  30.2 
 
 		 1154 aa  175  1.9999999999999998e-42  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.615207 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2593  alpha amylase catalytic region  44.05 
 
 		 258 aa  175  1.9999999999999998e-42  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000191559  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4493  trehalose-6-phosphate hydrolase  31.75 
 
 		 551 aa  175  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6087  trehalose synthase  30.42 
 
 		 1137 aa  175  1.9999999999999998e-42  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0830562  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4811  trehalose-6-phosphate hydrolase  31.75 
 
 		 551 aa  175  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1331  trehalose synthase-like  30.42 
 
 		 1137 aa  175  1.9999999999999998e-42  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6498  trehalose synthase  30.42 
 
 		 1137 aa  175  1.9999999999999998e-42  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.388171  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04071  hypothetical protein  33.42 
 
 		 551 aa  174  1.9999999999999998e-42  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1968  alpha amylase catalytic region  27.31 
 
 		 554 aa  174  2.9999999999999996e-42  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5591  trehalose synthase  30.2 
 
 		 1137 aa  174  2.9999999999999996e-42  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.00664495  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3091  trehalose synthase  29.34 
 
 		 582 aa  174  3.9999999999999995e-42  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000061423  hitchhiker  0.00000215015 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1728  trehalose synthase  28.37 
 
 		 585 aa  174  3.9999999999999995e-42  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0520  Alpha amylase  30.37 
 
 		 537 aa  174  3.9999999999999995e-42  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1908  alpha amylase catalytic region  28.65 
 
 		 553 aa  173  5.999999999999999e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.834785  normal  0.122197 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3863  alpha amylase catalytic region  29.68 
 
 		 541 aa  173  5.999999999999999e-42  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.00249861  normal  0.684332 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3772  trehalose-6-phosphate hydrolase  31.52 
 
 		 551 aa  173  6.999999999999999e-42  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4844  trehalose-6-phosphate hydrolase  31.52 
 
 		 551 aa  173  7.999999999999999e-42  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.257097  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>