More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_0892 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_0892  glycosyl transferase group 1  100 
 
 		 379 aa  716    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.71794  decreased coverage  0.00056914 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3070  glycosyl transferase group 1  45.4 
 
 		 403 aa  231  2e-59  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.606356  normal  0.0594638 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0370  glycosyl transferase group 1  38.84 
 
 		 401 aa  159  5e-38  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0778  glycosyl transferase, group 1  33.62 
 
 		 393 aa  123  7e-27  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.272091  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2820  glycosyl transferase, group 1  42.86 
 
 		 370 aa  122  9.999999999999999e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.662627  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1526  glycosyltransferase  39.72 
 
 		 369 aa  117  3e-25  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1716  glycosyl transferase, group 1  34.45 
 
 		 390 aa  114  2.0000000000000002e-24  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.740017  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1089  glycosyl transferase, group 1  33.73 
 
 		 363 aa  114  4.0000000000000004e-24  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.250695  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0631  glycosyl transferase group 1  51.52 
 
 		 394 aa  112  1.0000000000000001e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2654  glycosyl transferase, group 1  50.35 
 
 		 388 aa  112  1.0000000000000001e-23  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0179694  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2721  glycosyl transferase, group 1  44.64 
 
 		 364 aa  111  2.0000000000000002e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.134421  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1090  glycosyl transferase, group 1  30.23 
 
 		 375 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.638047  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1376  glycosyl transferase, group 1  39.76 
 
 		 368 aa  111  2.0000000000000002e-23  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0541  glycosyl transferase family protein  40.38 
 
 		 348 aa  109  9.000000000000001e-23  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9234  putative glycosyl transferase, group 1  41.71 
 
 		 388 aa  108  1e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1815  glycosyl transferase, group 1  35.4 
 
 		 381 aa  107  3e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1124  glycosyl transferase group 1  42.55 
 
 		 371 aa  107  4e-22  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2762  glycosyl transferase, group 1  33.72 
 
 		 309 aa  107  4e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.873929  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4240  glycosyl transferase group 1  45.33 
 
 		 418 aa  106  7e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4583  glycosyl transferase group 1  43.11 
 
 		 396 aa  105  1e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1715  glycosyl transferase, group 1  35.25 
 
 		 375 aa  105  2e-21  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.546177  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9217  putative glycosyl transferase, group 1  43.79 
 
 		 383 aa  104  3e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0826  glycosyl transferase group 1  40.78 
 
 		 350 aa  104  3e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2547  glycosyl transferase, group 1 family protein  35.93 
 
 		 396 aa  103  5e-21  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.930254  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3097  glycosyl transferase group 1  30.34 
 
 		 365 aa  103  5e-21  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0171  glycosyl transferase, group 1  44.16 
 
 		 419 aa  103  5e-21  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.7931  normal  0.13729 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1377  glycosyl transferase, group 1  35.75 
 
 		 368 aa  102  1e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0740  glycosyl transferase, group 1  45 
 
 		 368 aa  101  2e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1266  glycosyl transferase group 1  35.89 
 
 		 396 aa  101  2e-20  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.583933  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4707  glycosyl transferase group 1  43.06 
 
 		 386 aa  101  2e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.817147  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3069  glycosyl transferase, group 1  31.45 
 
 		 399 aa  100  6e-20  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.687268  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2180  glycosyl transferase group 1  28.21 
 
 		 376 aa  100  6e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2480  glycosyl transferase, group 1  36.6 
 
 		 346 aa  99.4  9e-20  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.197524  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2415  glycosyl transferase family protein  34.94 
 
 		 374 aa  98.2  2e-19  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2460  glycosyl transferase group 1  47.29 
 
 		 443 aa  98.2  2e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00000528788  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4547  glycosyl transferase group 1  36 
 
 		 370 aa  98.6  2e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0387  glycosyl transferase group 1  40.14 
 
 		 364 aa  98.2  2e-19  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4708  glycosyl transferase group 1  29.63 
 
 		 374 aa  96.7  6e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.392081  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1724  group 1 glycosyl transferase  38.22 
 
 		 440 aa  96.3  8e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0814072  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2819  glycosyl transferase, group 1  30.24 
 
 		 359 aa  95.9  1e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.170608  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2757  glycosyl transferase group 1  44.87 
 
 		 392 aa  95.1  2e-18  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.110907  normal  0.856034 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2409  glycosyl transferase group 1  35.71 
 
 		 660 aa  95.1  2e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.360311  normal  0.103606 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3096  glycosyl transferase group 1  32.52 
 
 		 361 aa  94.4  3e-18  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5157  group 1 glycosyl transferase  36.11 
 
 		 399 aa  94.4  3e-18  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3097  glycosyl transferase group 1  39.62 
 
 		 390 aa  94  4e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.367624  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0201  glycosyl transferase, group 1  43.45 
 
 		 398 aa  93.2  7e-18  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2457  glycosyl transferase, group 1  30.69 
 
 		 386 aa  92.8  8e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1259  glycosyl transferase group 1  40.62 
 
 		 419 aa  92.8  1e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0977722  normal  0.300588 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1592  glycosyl transferase group 1  29.11 
 
 		 346 aa  92.4  1e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.512714  normal  0.0921992 
 
 
-
 
NC_002950  PG1149  glycosyl transferase, group 1 family protein  33.97 
 
 		 375 aa  91.7  2e-17  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2261  glycosyl transferase, group 1  31.84 
 
 		 410 aa  91.7  2e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3398  cell wall biosynthesis glycosyltransferase-like protein  40.43 
 
 		 386 aa  90.9  4e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1306  glycosyl transferase group 1  36.84 
 
 		 355 aa  89.7  7e-17  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2492  glycosyl transferase, group 1  45.14 
 
 		 371 aa  89.7  7e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.637644  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2962  glycosyl transferase, group 1  36.44 
 
 		 409 aa  89.7  7e-17  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.355294  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7048  putative O-antigen export system permease protein  35.43 
 
 		 638 aa  89.7  7e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2889  glycosyl transferase group 1  39.73 
 
 		 353 aa  89.7  7e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5674  glycosyl transferase group 1  33.33 
 
 		 762 aa  89.4  9e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.176919 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1357  glycosyl transferase, group 1  25.97 
 
 		 364 aa  89  1e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_25641  glycosyl transferase, group 1  42.14 
 
 		 425 aa  89  1e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1206  glycosyl transferase group 1  40.71 
 
 		 357 aa  88.2  2e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1604  glycosyl transferase group 1  39.1 
 
 		 362 aa  88.6  2e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000498756  normal  0.0753767 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0282  glycosyl transferase group 1  36.55 
 
 		 364 aa  87.4  3e-16  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13028  Glycosyl transferase group 1  22.1 
 
 		 365 aa  87  4e-16  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0903  lipopolysaccharide N-acetylglucosaminyltransferase  35.95 
 
 		 366 aa  87  4e-16  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4196  glycosyl transferase group 1  32.24 
 
 		 366 aa  87.4  4e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3961  Glycosyltransferase-like protein  39.72 
 
 		 416 aa  87  5e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.606556  normal  0.103628 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1252  phosphatidylserine decarboxylase  31.08 
 
 		 340 aa  87  5e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.277456  normal  0.603033 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1007  glycosyl transferase group 1  26.5 
 
 		 669 aa  86.7  6e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.192205  normal  0.137378 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0989  glycosyl transferase, group 1 family protein  42.46 
 
 		 415 aa  86.7  7e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.447878  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0824  glycosyl transferase group 1  38.46 
 
 		 384 aa  86.3  7e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.31396  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0904  glycosyl transferase, group 1  38.25 
 
 		 890 aa  86.7  7e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.145803  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1839  glycosyl transferase group 1  38.33 
 
 		 362 aa  86.3  8e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1112  glycosyl transferase, group 1 family protein  35.95 
 
 		 366 aa  86.3  9e-16  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0819  glycosyl transferase, group 1 family protein  42.31 
 
 		 420 aa  85.5  0.000000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0664  glycosyl transferase, group 1  34.17 
 
 		 361 aa  85.9  0.000000000000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.591322  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2938  glycosyl transferase, group 1  36.59 
 
 		 351 aa  85.5  0.000000000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0332  glycosyl transferase, group 1 family protein  42.31 
 
 		 420 aa  85.5  0.000000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0265354  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1049  glycosyl transferase, group 1 family protein  42.31 
 
 		 420 aa  85.5  0.000000000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1908  glycosyl transferase, group 1 family protein  42.31 
 
 		 392 aa  85.1  0.000000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2548  glycosyl transferase, group 1  35.29 
 
 		 367 aa  85.1  0.000000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.742963  normal  0.196776 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0355  glycosyl transferase group 1  28.4 
 
 		 364 aa  85.1  0.000000000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.984651 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3883  glycosyl transferase group 1  30.51 
 
 		 395 aa  85.1  0.000000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2583  glycosyl transferase group 1  43.66 
 
 		 361 aa  85.1  0.000000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.491975 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1202  glycosyl transferase, group 1 family protein  42.31 
 
 		 420 aa  84.7  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1211  glycosyl transferase, group 1 family protein  42.31 
 
 		 420 aa  84.7  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.417832  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0432  glycosyl transferase group 1  24.93 
 
 		 350 aa  84.7  0.000000000000003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4593  glycosyl transferase family 2  34.63 
 
 		 1032 aa  84.3  0.000000000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1476  glycosyl transferase  35.51 
 
 		 346 aa  84.3  0.000000000000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.621422  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0101  glycosyl transferase, group 1 family protein  19.88 
 
 		 501 aa  84  0.000000000000004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1362  glycosyl transferase, group 1 family protein  42.31 
 
 		 392 aa  84  0.000000000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.881597  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1480  glycosyl transferase, group 1:PHP-like  29.96 
 
 		 803 aa  84  0.000000000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.117248 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2679  glycosyl transferase group 1  30.53 
 
 		 678 aa  84  0.000000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.341256 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0359  glycosyl transferase, group 1  36.24 
 
 		 364 aa  84  0.000000000000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.123481  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3477  glycosyl transferase group 1  38.26 
 
 		 418 aa  83.2  0.000000000000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1204  glycosyl transferase group 1  25.56 
 
 		 409 aa  83.2  0.000000000000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4016  glycosyl transferase, group 1  33.64 
 
 		 378 aa  83.2  0.000000000000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.54123 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0399  glycosyl transferase group 1  34.6 
 
 		 388 aa  82  0.00000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3286  putative lipopolysaccharide biosynthesis glycosyltransferase protein  41.91 
 
 		 419 aa  82.4  0.00000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2518  glycosyl transferase group 1  32.48 
 
 		 411 aa  82.4  0.00000000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.377974  normal  0.0256247 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>