More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_0139 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_0139  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  100 
 
 		 233 aa  454  1e-127  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0817814 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2153  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  76.75 
 
 		 242 aa  345  5e-94  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10890  short-chain dehydrogenase of unknown substrate specificity  62.23 
 
 		 235 aa  282  3.0000000000000004e-75  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4544  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  58.44 
 
 		 258 aa  235  5.0000000000000005e-61  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4495  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  53.39 
 
 		 237 aa  229  2e-59  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4582  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  53.39 
 
 		 237 aa  229  2e-59  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.138824 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0234  short chain dehydrogenase  53.12 
 
 		 227 aa  227  1e-58  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.100339 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1044  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  54.75 
 
 		 232 aa  222  3e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.132567  normal  0.124295 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4878  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  51.69 
 
 		 237 aa  221  7e-57  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0560826 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1493  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  49.58 
 
 		 243 aa  214  8e-55  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.666378 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0488  short chain dehydrogenase  49.34 
 
 		 228 aa  207  1e-52  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.249212  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0510  short chain dehydrogenase  48.9 
 
 		 228 aa  204  9e-52  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0499  short chain dehydrogenase  48.9 
 
 		 228 aa  204  9e-52  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6375  putative short chain dehydrogenase  51.11 
 
 		 231 aa  195  4.0000000000000005e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.930619 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5248  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.24 
 
 		 276 aa  195  5.000000000000001e-49  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.225539 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2285  short chain dehydrogenase  48.89 
 
 		 233 aa  191  9e-48  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0036  putative short chain dehydrogenase  49.35 
 
 		 232 aa  189  4e-47  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.00856815  normal  0.0949052 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2001  short chain dehydrogenase  50.66 
 
 		 237 aa  186  2e-46  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0088  short chain dehydrogenase  50.66 
 
 		 237 aa  186  2e-46  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0587  short chain dehydrogenase  50.66 
 
 		 237 aa  186  2e-46  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3095  short chain dehydrogenase  50.66 
 
 		 237 aa  186  2e-46  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0406  short chain dehydrogenase  51.1 
 
 		 237 aa  187  2e-46  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.603523  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0426  short chain dehydrogenase  50.66 
 
 		 237 aa  186  2e-46  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0351  short chain dehydrogenase  52.86 
 
 		 332 aa  183  2.0000000000000003e-45  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.853624  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2287  short chain dehydrogenase  50.22 
 
 		 234 aa  181  1e-44  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1361  short chain dehydrogenase  51.34 
 
 		 234 aa  178  7e-44  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.338763  normal  0.94608 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6083  short chain dehydrogenase  49.57 
 
 		 234 aa  178  8e-44  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5406  short chain dehydrogenase  50.22 
 
 		 234 aa  176  3e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4814  short chain dehydrogenase  50.22 
 
 		 234 aa  176  3e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.910102 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5455  short chain dehydrogenase  50.22 
 
 		 234 aa  176  3e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.319749 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4383  short chain dehydrogenase  52.05 
 
 		 234 aa  174  7e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4798  short chain dehydrogenase  48.43 
 
 		 234 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.58679 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13195  short chain dehydrogenase  45.96 
 
 		 235 aa  174  9.999999999999999e-43  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.433482 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1290  short chain dehydrogenase  48.86 
 
 		 234 aa  172  2.9999999999999996e-42  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0196  short chain dehydrogenase  49.78 
 
 		 234 aa  172  2.9999999999999996e-42  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.641579  normal  0.448139 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0305  short chain dehydrogenase  50.43 
 
 		 234 aa  171  6.999999999999999e-42  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.123589  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0101  short chain dehydrogenase  50.68 
 
 		 234 aa  171  7.999999999999999e-42  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.451177  normal  0.857442 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2181  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  46.19 
 
 		 241 aa  171  1e-41  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5340  short chain dehydrogenase  48.43 
 
 		 234 aa  170  2e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.980591  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2696  putative short-chain oxidoreductase  45.75 
 
 		 256 aa  170  2e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0368477  normal  0.782631 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0014  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.92 
 
 		 245 aa  167  1e-40  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4944  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.29 
 
 		 235 aa  166  2e-40  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3216  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  48.29 
 
 		 235 aa  166  2e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0361  short chain dehydrogenase  45.19 
 
 		 244 aa  164  9e-40  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000319132  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0688  short chain dehydrogenase  42.31 
 
 		 237 aa  164  1.0000000000000001e-39  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.437388  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37000  short-chain dehydrogenase of unknown substrate specificity  46.29 
 
 		 239 aa  156  2e-37  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.559047 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1857  short chain dehydrogenase  41.18 
 
 		 245 aa  154  2e-36  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.960393 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2361  short chain dehydrogenase  39.92 
 
 		 243 aa  154  2e-36  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37030  short-chain alcohol dehydrogenase  46.12 
 
 		 241 aa  152  2.9999999999999998e-36  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.731779 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2067  short chain dehydrogenase  39.92 
 
 		 265 aa  150  1e-35  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0338341  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2205  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.49 
 
 		 237 aa  142  4e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.998256 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1856  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.68 
 
 		 235 aa  138  6e-32  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.21396  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1569  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.74 
 
 		 247 aa  126  2.0000000000000002e-28  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.169085  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0292  short chain dehydrogenase  40.45 
 
 		 243 aa  125  5e-28  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.640514  hitchhiker  0.000719162 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7169  short chain dehydrogenase  39.48 
 
 		 238 aa  122  7e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2182  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.19 
 
 		 239 aa  117  9.999999999999999e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0874  short chain dehydrogenase  39.38 
 
 		 254 aa  112  6e-24  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3502  putative oxidoreductase  32.76 
 
 		 244 aa  110  2.0000000000000002e-23  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.398353 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2629  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.7 
 
 		 317 aa  107  2e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0044  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.84 
 
 		 264 aa  106  3e-22  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0007  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.29 
 
 		 300 aa  105  5e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  0.67964 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1039  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.25 
 
 		 242 aa  103  2e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.967418  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1001  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.11 
 
 		 285 aa  103  2e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03276  oxidoreductase, short-chain dehydrogenase/reductase family (AFU_orthologue; AFUA_2G14460)  38.74 
 
 		 279 aa  103  3e-21  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0176594 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2175  short chain dehydrogenase  33.33 
 
 		 272 aa  102  4e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.328635  hitchhiker  0.00607004 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0498  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.65 
 
 		 273 aa  102  6e-21  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.000000406118  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2060  short chain dehydrogenase  35.34 
 
 		 270 aa  101  8e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3117  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.2 
 
 		 256 aa  100  1e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3521  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.38 
 
 		 268 aa  100  2e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2235  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.05 
 
 		 266 aa  99.8  3e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.30257  normal  0.665507 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3993  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.2 
 
 		 268 aa  99.4  4e-20  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.468783  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3849  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.54 
 
 		 314 aa  99.8  4e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0687851  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4574  short chain dehydrogenase  41.14 
 
 		 270 aa  99  5e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.582259 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10768  putative oxidoreductase  33.94 
 
 		 304 aa  99.4  5e-20  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.465871  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4451  short chain dehydrogenase  41.76 
 
 		 270 aa  99  6e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.358799  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2495  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.88 
 
 		 251 aa  98.6  7e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0209  short chain dehydrogenase  34.8 
 
 		 244 aa  98.6  7e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.665383  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3010  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.08 
 
 		 276 aa  98.6  8e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000215509 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1274  short chain dehydrogenase  41.76 
 
 		 270 aa  97.8  1e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.145274  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1655  hypothetical protein  34.41 
 
 		 283 aa  98.2  1e-19  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3548  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.42 
 
 		 278 aa  97.8  1e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1732  putative short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.89 
 
 		 257 aa  97.8  1e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5243  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.13 
 
 		 245 aa  97.8  1e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4065  oxidoreductase, short-chain dehydrogenase/reductase family  36.53 
 
 		 252 aa  97.1  2e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.372477  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0101  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.92 
 
 		 272 aa  97.1  2e-19  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0037  short chain dehydrogenase  40.53 
 
 		 283 aa  97.1  2e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.40951  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3745  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.11 
 
 		 279 aa  97.1  2e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3989  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.27 
 
 		 276 aa  97.1  2e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.171067  normal  0.181158 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3259  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.17 
 
 		 284 aa  97.4  2e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3206  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.17 
 
 		 284 aa  97.4  2e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3197  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.17 
 
 		 284 aa  97.4  2e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3975  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.27 
 
 		 276 aa  97.1  2e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2458  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.26 
 
 		 251 aa  97.1  2e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.315729  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4049  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.27 
 
 		 276 aa  97.1  2e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1648  hypothetical protein  34.41 
 
 		 283 aa  96.7  3e-19  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1126  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.26 
 
 		 338 aa  96.3  3e-19  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11271  short-chain type dehydrogenase/reductase  37.02 
 
 		 276 aa  96.3  4e-19  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000317139  hitchhiker  0.0033897 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3599  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.45 
 
 		 296 aa  95.9  4e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2049  short chain dehydrogenase  33.33 
 
 		 286 aa  96.3  4e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000200632 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3013  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.95 
 
 		 296 aa  95.9  5e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>