More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jden_0432 on replicon NC_013174
Organism: Jonesia denitrificans DSM 20603



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013521  Sked_04860  membrane carboxypeptidase (penicillin-binding protein)  54.36 
 
 
763 aa  700  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.820236 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0604  glycosyl transferase family 51  47.84 
 
 
833 aa  647  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0810058  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1399  glycosyl transferase family 51  47.06 
 
 
807 aa  650  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.248953  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0432  glycosyl transferase family 51  100 
 
 
784 aa  1618  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.440855 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3041  glycosyl transferase family 51  48.41 
 
 
765 aa  607  1e-172  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26280  membrane carboxypeptidase (penicillin-binding protein)  43.75 
 
 
821 aa  573  1e-162  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.419693  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3099  glycosyl transferase family 51  47.51 
 
 
838 aa  553  1e-156  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.113974  hitchhiker  0.000163958 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0109  PASTA  43.21 
 
 
801 aa  499  1e-139  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.820003  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0978  membrane carboxypeptidase  40.96 
 
 
768 aa  496  1e-139  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0304  transglycosylase  40.31 
 
 
773 aa  496  1e-139  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.201618 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3399  glycosyl transferase family protein  38.37 
 
 
766 aa  476  1e-133  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.809051  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0429  glycosyl transferase family 51  44 
 
 
821 aa  474  1e-132  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.195502 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3246  glycosyl transferase family 51  38.49 
 
 
727 aa  466  1e-129  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3180  glycosyl transferase family 51  39.72 
 
 
772 aa  465  1e-129  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5307  glycosyl transferase family 51  40.39 
 
 
789 aa  454  1e-126  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.93625 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1026  glycosyl transferase family 51  40.18 
 
 
773 aa  447  1e-124  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3526  glycosyl transferase family protein  38.57 
 
 
723 aa  438  1e-121  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.121527  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18460  membrane carboxypeptidase (penicillin-binding protein)  39.11 
 
 
727 aa  429  1e-118  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8912  glycosyl transferase family 51  37.13 
 
 
740 aa  428  1e-118  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.882154 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2004  glycosyl transferase family protein  38.55 
 
 
820 aa  422  1e-117  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0250  glycosyl transferase family 51  39.44 
 
 
892 aa  422  1e-116  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0340145 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0195  family 51 glycosyl transferase  39.83 
 
 
739 aa  414  1e-114  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.89929 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5853  glycosyl transferase family protein  36.2 
 
 
819 aa  412  1e-113  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.698953  normal  0.762762 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25450  membrane carboxypeptidase (penicillin-binding protein)  38.05 
 
 
817 aa  405  1e-111  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0460  multimodular transpeptidase-transglycosylase  37.11 
 
 
744 aa  402  1e-110  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.361167  normal  0.657816 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0326  glycosyl transferase family protein  37.39 
 
 
807 aa  398  1e-109  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.563186  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3010  Peptidoglycan glycosyltransferase  38.44 
 
 
737 aa  392  1e-107  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.993006  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0754  twin-arginine translocation pathway signal  35.8 
 
 
880 aa  386  1e-106  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4664  glycosyl transferase family 51  36.36 
 
 
721 aa  387  1e-106  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.748672  hitchhiker  0.00235934 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1426  peptidoglycan glycosyltransferase  36.99 
 
 
1057 aa  377  1e-103  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.591884 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8177  Peptidoglycan glycosyltransferase  36.78 
 
 
736 aa  366  1e-100  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2308  penicillin-binding protein 1A  37.13 
 
 
761 aa  365  1e-99  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0308818  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4921  Peptidoglycan glycosyltransferase  37.81 
 
 
747 aa  356  9e-97  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2902  Peptidoglycan glycosyltransferase  37.29 
 
 
759 aa  354  4e-96  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.786765  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3015  glycosyl transferase family protein  37.54 
 
 
758 aa  346  1e-93  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.166966  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3548  glycosyl transferase family protein  35.09 
 
 
710 aa  342  1e-92  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3923  glycosyl transferase family protein  35.67 
 
 
710 aa  342  2e-92  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.304998  normal  0.0998899 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3240  glycosyl transferase family protein  36.52 
 
 
758 aa  341  3e-92  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5713  Peptidoglycan glycosyltransferase  36.01 
 
 
766 aa  341  3e-92  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0235  glycosyl transferase family 51  33.71 
 
 
830 aa  333  6e-90  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0337  glycosyl transferase family protein  35.04 
 
 
871 aa  333  1e-89  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0174987 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4277  glycosyl transferase family protein  35.12 
 
 
877 aa  328  2e-88  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.113216  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08350  penicillin-binding protein, 1A family  35.39 
 
 
723 aa  327  8e-88  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.207948 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1056  Peptidoglycan glycosyltransferase  32.87 
 
 
705 aa  326  1e-87  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4382  glycosyl transferase family 51  34.16 
 
 
771 aa  321  3e-86  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.099328 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0511  glycosyl transferase family 51  34.76 
 
 
726 aa  320  6e-86  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0481562  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4354  glycosyl transferase family protein  34.19 
 
 
801 aa  317  6e-85  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36250  membrane carboxypeptidase (penicillin-binding protein)  33.93 
 
 
720 aa  316  1e-84  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.808415 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4796  glycosyl transferase family protein  34.05 
 
 
808 aa  312  1e-83  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.686979  normal  0.170085 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4870  glycosyl transferase family 51  33.24 
 
 
814 aa  311  4e-83  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0586  glycosyl transferase family 51  34.4 
 
 
722 aa  310  9e-83  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.690048  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5121  glycosyl transferase family 51  32.68 
 
 
693 aa  304  3e-81  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2135  glycosyl transferase family protein  33.66 
 
 
695 aa  301  3e-80  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.194507  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1010  penicillin-binding protein, 1A family  32.54 
 
 
710 aa  301  4e-80  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0570  membrane carboxypeptidase (penicillin-binding protein)  33.43 
 
 
1129 aa  300  1e-79  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_02290  penicillin-binding protein, 1A family  34.78 
 
 
710 aa  297  5e-79  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1710  penicillin-binding protein 1A  33.13 
 
 
905 aa  297  6e-79  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000352248  normal  0.214747 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0697  Peptidoglycan glycosyltransferase  35.6 
 
 
695 aa  293  1e-77  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2337  glycosyl transferase family 51  33.95 
 
 
750 aa  291  3e-77  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.360484  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4746  glycosyl transferase family 51  34.98 
 
 
680 aa  290  5e-77  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.842414  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4182  glycosyl transferase family 51  32.88 
 
 
836 aa  288  2e-76  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3106  family 51 glycosyl transferase  33.76 
 
 
719 aa  288  3e-76  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.265076  hitchhiker  0.000700529 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5899  glycosyl transferase family 51  34.83 
 
 
726 aa  285  2e-75  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.118947  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4021  glycosyl transferase family protein  35.85 
 
 
700 aa  284  4e-75  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  9.48759e-05 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1310  penicillin-binding protein 1A  34.57 
 
 
704 aa  284  5e-75  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.028236  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1128  penicillin-binding protein, 1A family  30.99 
 
 
648 aa  283  1e-74  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3357  glycosyl transferase family 51  33.65 
 
 
825 aa  282  2e-74  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3639  glycosyl transferase family protein  35.11 
 
 
703 aa  278  3e-73  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1068  glycosyl transferase family protein  32.56 
 
 
828 aa  278  4e-73  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05690  penicillin-binding protein, 1A family  30.66 
 
 
806 aa  277  4e-73  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5209  glycosyl transferase family protein  32.17 
 
 
824 aa  277  7e-73  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.567607  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2526  Peptidoglycan glycosyltransferase  32.11 
 
 
764 aa  276  8e-73  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3939  Peptidoglycan glycosyltransferase  30.39 
 
 
840 aa  276  1e-72  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1365  glycosyl transferase family protein  31.98 
 
 
818 aa  275  2e-72  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.488414 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0444  1A family penicillin-binding protein  31.28 
 
 
654 aa  275  3e-72  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1480  glycosyl transferase family protein  32.14 
 
 
830 aa  275  3e-72  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1505  glycosyl transferase family protein  32.59 
 
 
831 aa  275  4e-72  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1483  glycosyl transferase family protein  32.59 
 
 
831 aa  275  4e-72  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.344549  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13713  bifunctional membrane-associated penicillin-binding protein 1A/1B ponA2: penicillin-insensitive transglycosylase + penicillin-sensitive transpeptidase  32.52 
 
 
810 aa  274  5e-72  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.625883  normal  0.056984 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0858  penicillin-binding protein, 1A family  32.03 
 
 
618 aa  274  6e-72  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00486988  hitchhiker  0.00041503 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1369  1A family penicillin-binding protein  30.32 
 
 
765 aa  273  6e-72  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7315  glycosyl transferase family protein  32.44 
 
 
1245 aa  273  1e-71  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.508122  normal  0.0712916 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2100  1A family penicillin-binding protein  31.93 
 
 
661 aa  272  2e-71  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0220  penicillin-binding protein, 1A family  31.52 
 
 
643 aa  270  5e-71  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0217  penicillin-binding protein, 1A family  31.52 
 
 
643 aa  270  5e-71  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.380595  hitchhiker  0.00649941 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5442  glycosyl transferase family protein  30.78 
 
 
817 aa  270  6e-71  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.248132 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0739  penicillin-binding protein, 1A family  29.97 
 
 
668 aa  270  9e-71  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1056  penicillin-binding protein, 1A family  31.87 
 
 
751 aa  270  9e-71  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3356  glycosyl transferase family 51  32.56 
 
 
808 aa  268  2e-70  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37820  membrane carboxypeptidase (penicillin-binding protein)  30.51 
 
 
890 aa  268  4e-70  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.603691  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0921  penicillin-binding protein  31.25 
 
 
649 aa  267  6e-70  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2820  penicillin-binding protein, 1A family  30.24 
 
 
727 aa  266  1e-69  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.727063  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4911  glycosyl transferase family protein  31.8 
 
 
816 aa  265  2e-69  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.192929  normal  0.575861 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5212  glycosyl transferase family protein  31.95 
 
 
816 aa  265  2e-69  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.233659  hitchhiker  0.00132257 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4825  glycosyl transferase family protein  31.8 
 
 
816 aa  265  2e-69  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.329879  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0316  penicillin-binding protein, 1A family  32.11 
 
 
750 aa  265  3e-69  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.223118 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2535  penicillin-binding protein, 1A family  30.42 
 
 
643 aa  263  7e-69  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0388  glycosyl transferase family 51  31.34 
 
 
1117 aa  262  2e-68  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.62292  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1696  penicillin-binding protein, 1A family  31.31 
 
 
761 aa  261  3e-68  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.235679  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5748  glycosyl transferase family protein  31.58 
 
 
806 aa  261  3e-68  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.409444 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>