More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jden_0063 on replicon NC_013174
Organism: Jonesia denitrificans DSM 20603



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013174  Jden_0063  transcriptional regulator, DeoR family  100 
 
 		 253 aa  496  1e-139  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.366513  normal  0.178311 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1535  transcriptional regulator, DeoR family  63.24 
 
 		 253 aa  308  5.9999999999999995e-83  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.556819  hitchhiker  0.00734434 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2177  transcriptional regulator, DeoR family  60.47 
 
 		 253 aa  303  1.0000000000000001e-81  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0975605  hitchhiker  0.00125188 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5273  transcriptional regulator, DeoR family  56.92 
 
 		 253 aa  273  2.0000000000000002e-72  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.408646  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4225  transcriptional regulator, DeoR family  57.09 
 
 		 253 aa  271  8.000000000000001e-72  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.320526  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1059  transcriptional regulator, DeoR family  53.75 
 
 		 253 aa  268  7e-71  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2500  transcriptional regulator, DeoR family  55.16 
 
 		 253 aa  266  2e-70  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.134213  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7075  DeoR family transcriptional regulator  54.55 
 
 		 253 aa  263  2e-69  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2141  transcriptional regulator, DeoR family  57.31 
 
 		 253 aa  262  4.999999999999999e-69  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.386533  normal  0.871763 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28620  transcriptional regulator, DeoR family  58.5 
 
 		 253 aa  257  1e-67  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0973174  normal  0.0755211 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4851  DeoR family transcriptional regulator  56.13 
 
 		 253 aa  250  2e-65  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00849976 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0720  DeoR family transcriptional regulator  55.41 
 
 		 253 aa  245  6e-64  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.528248  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0082  DeoR family transcriptional regulator  55.98 
 
 		 255 aa  244  6.999999999999999e-64  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0376166  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0091  DeoR family transcriptional regulator  55.98 
 
 		 255 aa  244  6.999999999999999e-64  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.316718  normal  0.0391482 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0072  DeoR family transcriptional regulator  55.98 
 
 		 255 aa  244  6.999999999999999e-64  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.314417  normal  0.278782 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0750  DeoR family transcriptional regulator  51.84 
 
 		 259 aa  232  3e-60  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.6006 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0096  DeoR family transcriptional regulator  52.23 
 
 		 259 aa  227  1e-58  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.12978 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3182  DeoR family transcriptional regulator  49.15 
 
 		 255 aa  219  1.9999999999999999e-56  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.457235  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4850  transcriptional regulator, DeoR family  47.84 
 
 		 255 aa  216  4e-55  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.786631  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2219  regulatory protein DeoR  45.45 
 
 		 256 aa  204  2e-51  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  hitchhiker  0.0075585  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0184  transcriptional regulator, DeoR family  49.15 
 
 		 256 aa  190  2e-47  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0301  DeoR family transcriptional regulator  45.35 
 
 		 269 aa  189  2.9999999999999997e-47  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.596764  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0527  transcriptional regulator, DeoR family  44.49 
 
 		 268 aa  188  9e-47  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0011  DeoR family transcriptional regulator  42.35 
 
 		 258 aa  186  4e-46  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000425621  unclonable  0.00000000668451 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5310  transcriptional regulator, DeoR family  44.21 
 
 		 253 aa  184  2.0000000000000003e-45  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0608  GntR family transcriptional regulator  40.39 
 
 		 254 aa  176  3e-43  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1220  DeoR family transcriptional regulator  44.59 
 
 		 252 aa  174  9.999999999999999e-43  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5588  DeoR family transcriptional regulator  45.02 
 
 		 252 aa  171  7.999999999999999e-42  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.677206  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0146  transcriptional regulator, DeoR family  38 
 
 		 250 aa  168  6e-41  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000230525  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0575  DeoR family transcriptional regulator  38.25 
 
 		 274 aa  165  5.9999999999999996e-40  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000140104  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3673  DeoR family transcriptional regulator  39.45 
 
 		 267 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.373167 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0997  transcriptional regulator, DeoR family  39.43 
 
 		 267 aa  162  7e-39  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.566799 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0890  transcriptional regulator, DeoR family  40.95 
 
 		 260 aa  161  8.000000000000001e-39  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.390832  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2392  transcriptional regulator, DeoR family  33.6 
 
 		 253 aa  160  2e-38  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4698  transcriptional regulator, DeoR family  43.03 
 
 		 258 aa  160  2e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00604276  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0408  transcriptional regulator, DeoR family  35.18 
 
 		 257 aa  159  3e-38  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.237553  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2807  DeoR family transcriptional regulator  38.96 
 
 		 260 aa  158  7e-38  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.807975  normal  0.355136 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1701  DeoR family transcriptional regulator  38.62 
 
 		 264 aa  158  9e-38  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.596529  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1644  DeoR family transcriptional regulator  36.9 
 
 		 251 aa  157  2e-37  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000364234 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1079  DeoR family transcriptional regulator  36.12 
 
 		 251 aa  155  5.0000000000000005e-37  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2660  transcriptional regulator, DeoR family  41.1 
 
 		 254 aa  153  2e-36  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.360297  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3908  DeoR family transcriptional regulator  36.69 
 
 		 267 aa  153  2e-36  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00814425  normal  0.0123745 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2390  transcriptional regulator, DeoR family  37.7 
 
 		 258 aa  154  2e-36  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.248992  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3258  DeoR family transcriptional regulator  34.92 
 
 		 251 aa  151  1e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  0.0000943791  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0903  DeoR family transcriptional regulator  36.72 
 
 		 251 aa  150  2e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.910889 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22300  transcriptional regulator of sugar metabolism  40.86 
 
 		 253 aa  150  2e-35  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1714  transcriptional regulator, DeoR family  40.25 
 
 		 256 aa  149  3e-35  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.0085463  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2577  DeoR family transcriptional regulator  36.05 
 
 		 256 aa  149  4e-35  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0801  DeoR family transcriptional regulator  37.89 
 
 		 251 aa  149  5e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4043  DeoR family transcriptional regulator  37.11 
 
 		 251 aa  148  7e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0462  DeoR family transcriptional regulator  36.72 
 
 		 251 aa  148  8e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2761  transcriptional regulator, DeoR family  39.62 
 
 		 257 aa  148  8e-35  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0941  DeoR family transcriptional regulator  36.72 
 
 		 251 aa  148  8e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0642  DeoR family transcriptional regulator  36.44 
 
 		 256 aa  147  1.0000000000000001e-34  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.000291189  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2071  DeoR family transcriptional regulator  35.77 
 
 		 254 aa  147  1.0000000000000001e-34  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.128442  normal  0.332572 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2460  transcriptional regulator, DeoR family  40.29 
 
 		 264 aa  147  1.0000000000000001e-34  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.18963  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1880  transcriptional regulator, DeoR family  36.03 
 
 		 254 aa  147  2.0000000000000003e-34  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0922  transcriptional regulator, DeoR family  39.08 
 
 		 248 aa  147  2.0000000000000003e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.44653  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3377  transcriptional regulator, DeoR family  35.47 
 
 		 257 aa  145  6e-34  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1031  lactose transport regulator  38.46 
 
 		 233 aa  145  7.0000000000000006e-34  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.227139  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0568  regulatory protein DeoR  32.39 
 
 		 254 aa  145  8.000000000000001e-34  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.250668  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14330  transcriptional regulator, DeoR family  38.4 
 
 		 282 aa  144  9e-34  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5087  transcriptional regulator, DeoR family  37.2 
 
 		 254 aa  144  1e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5399  DeoR family transcriptional regulator  39.83 
 
 		 242 aa  144  1e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.054992  normal  0.41602 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1854  regulatory protein, DeoR  37.2 
 
 		 252 aa  144  2e-33  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.0000517285  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3128  transcriptional regulator, DeoR family  32 
 
 		 255 aa  144  2e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3705  transcriptional regulator, DeoR family  31.43 
 
 		 258 aa  142  4e-33  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1493  DeoR family transcriptional regulator  36.05 
 
 		 254 aa  142  5e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2323  transcriptional regulator, DeoR family  38.79 
 
 		 266 aa  141  9e-33  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0738  regulatory protein DeoR  40.3 
 
 		 253 aa  141  9.999999999999999e-33  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0722  DeoR family transcriptional regulator  40.3 
 
 		 253 aa  141  9.999999999999999e-33  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02947  hypothetical protein  32.53 
 
 		 269 aa  140  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02996  DNA-binding transcriptional dual regulator  32.53 
 
 		 269 aa  140  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0574  transcriptional regulator, DeoR family  32.53 
 
 		 269 aa  140  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3611  DNA-binding transcriptional regulator AgaR  32.66 
 
 		 269 aa  140  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4445  DNA-binding transcriptional regulator AgaR  32.53 
 
 		 269 aa  140  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3428  DNA-binding transcriptional regulator AgaR  32.53 
 
 		 269 aa  140  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0569  DNA-binding transcriptional regulator AgaR  32.53 
 
 		 269 aa  140  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3321  DNA-binding transcriptional regulator AgaR  32.53 
 
 		 269 aa  140  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1716  transcriptional regulator, DeoR family  30.54 
 
 		 252 aa  139  3e-32  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.467325  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4905  transcriptional regulator, DeoR family  38.52 
 
 		 289 aa  139  3e-32  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.23552  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0995  transcriptional regulator, DeoR family  38.68 
 
 		 264 aa  140  3e-32  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.103879  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0907  transcriptional regulator of DeoR family protein  34.26 
 
 		 253 aa  139  4.999999999999999e-32  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.238467 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0729  transcriptional regulator, DeoR family  36.44 
 
 		 256 aa  139  4.999999999999999e-32  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000103564 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0457  glycerol-3-phosphate regulon repressor  37.23 
 
 		 259 aa  139  6e-32  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2613  transcriptional regulator, DeoR family  33.73 
 
 		 257 aa  139  6e-32  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000000333133  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2109  DeoR family transcriptional regulator  37.23 
 
 		 259 aa  139  6e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0344  transcriptional regulator, DeoR family  33.99 
 
 		 252 aa  138  7e-32  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.273291  hitchhiker  0.00282371 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0631  glycerol-3-phosphate regulon repressor  37.89 
 
 		 257 aa  138  7e-32  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.405946  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2691  DeoR family transcriptional regulator  34.06 
 
 		 254 aa  138  7e-32  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.134445  hitchhiker  0.00149692 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1861  transcriptional regulator, DeoR family  35.46 
 
 		 261 aa  138  1e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3861  regulatory protein DeoR  32.62 
 
 		 249 aa  137  1e-31  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2702  transcriptional regulator, DeoR family  38.34 
 
 		 250 aa  137  2e-31  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2651  transcriptional regulator, DeoR family  39.55 
 
 		 250 aa  137  2e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0609  DeoR family transcriptional regulator  33.61 
 
 		 252 aa  136  3.0000000000000003e-31  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000143813 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1348  lactose phosphotransferase system repressor  37.2 
 
 		 247 aa  136  4e-31  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5798  transcriptional regulator, DeoR family  38.4 
 
 		 252 aa  136  4e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.159529 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2797  regulatory protein DeoR  34.75 
 
 		 254 aa  135  4e-31  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0478  DeoR family transcriptional regulator  33.6 
 
 		 254 aa  135  5e-31  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3571  DNA-binding transcriptional regulator AgaR  31.33 
 
 		 269 aa  135  5e-31  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.557659 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>