More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jden_0043 on replicon NC_013174
Organism: Jonesia denitrificans DSM 20603



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013174  Jden_0043  ABC transporter related  100 
 
 		 213 aa  432  1e-120  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.61103  normal  0.243763 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2300  ABC transporter related  54.29 
 
 		 222 aa  217  8.999999999999998e-56  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1571  ABC transporter related protein  51.43 
 
 		 220 aa  204  5e-52  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2628  ABC transporter related protein  38.24 
 
 		 215 aa  139  4.999999999999999e-32  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0076105 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2375  ABC transporter related  33.87 
 
 		 225 aa  134  9e-31  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0812  peptide ABC transporter ATPase  41.41 
 
 		 209 aa  133  1.9999999999999998e-30  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.3924  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1360  ABC transporter related  33.87 
 
 		 225 aa  132  3e-30  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0276671  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0277  peptide ABC transporter ATPase  33 
 
 		 211 aa  124  1e-27  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1717  ABC transporter related  40.96 
 
 		 248 aa  123  2e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4175  ABC transporter related  33.5 
 
 		 237 aa  122  3e-27  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2386  ABC transporter related  36.17 
 
 		 229 aa  120  9.999999999999999e-27  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0955  ABC transporter related protein  40 
 
 		 240 aa  119  3e-26  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0487401  normal  0.0166931 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2973  ABC transporter related  35.16 
 
 		 222 aa  119  3.9999999999999996e-26  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1388  ABC transporter-related protein  34.59 
 
 		 205 aa  118  6e-26  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1392  ABC transporter related  35.79 
 
 		 654 aa  118  7.999999999999999e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.760197  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0390  ABC transporter related  35.5 
 
 		 232 aa  117  9.999999999999999e-26  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2165  ABC transporter-related protein  36.42 
 
 		 205 aa  116  1.9999999999999998e-25  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.213816  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0970  ABC transporter related  36.22 
 
 		 241 aa  116  3e-25  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.195625  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1516  ABC transporter, ATP-binding protein, putative  32.16 
 
 		 230 aa  115  3.9999999999999997e-25  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00103839  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1311  ABC transporter related  34.52 
 
 		 221 aa  115  3.9999999999999997e-25  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0791  ABC transporter, ATP-binding protein  33.52 
 
 		 220 aa  115  5e-25  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.271834 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0254  ABC transporter related  35.87 
 
 		 241 aa  115  6e-25  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1689  peptide ABC transporter ATPase  33.33 
 
 		 233 aa  114  8.999999999999998e-25  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4701  ABC transporter, ATP-binding protein  33.33 
 
 		 230 aa  114  1.0000000000000001e-24  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.91334  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1601  ABC transporter, ATP-binding protein  32.11 
 
 		 224 aa  114  1.0000000000000001e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000190075  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1995  ABC transporter related protein  37.89 
 
 		 229 aa  113  2.0000000000000002e-24  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.691117  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0329  putative ABC transport system, ATP-binding protein  33.33 
 
 		 226 aa  113  2.0000000000000002e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.292409 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1657  ABC transporter related  35.47 
 
 		 258 aa  113  2.0000000000000002e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0060  ABC transporter related  36.55 
 
 		 235 aa  113  2.0000000000000002e-24  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.235651  normal  0.22489 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1515  SalX-type ABC antimicrobial peptide transport system ATPase  35.75 
 
 		 233 aa  113  2.0000000000000002e-24  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2350  ABC transporter related protein  34.43 
 
 		 220 aa  113  2.0000000000000002e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.575927  normal  0.731614 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4887  ABC transporter related  37.7 
 
 		 455 aa  113  2.0000000000000002e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.98231  normal  0.130468 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1576  ABC transporter related  36.61 
 
 		 223 aa  112  3e-24  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2196  cell division ATP-binding protein FtsE  36.67 
 
 		 228 aa  112  3e-24  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.000000000000206385  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0986  ABC transporter, ATPase subunit  36.36 
 
 		 232 aa  112  3e-24  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4589  ABC transporter related protein  35.03 
 
 		 225 aa  112  4.0000000000000004e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00504379  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0572  macrolide ABC transporter ATPase/inner membrane protein  35.11 
 
 		 665 aa  112  4.0000000000000004e-24  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.412698  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1692  ABC transporter related  36.36 
 
 		 229 aa  112  4.0000000000000004e-24  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.00000461278  normal  0.0121253 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0904  macrolide export ATP-binding/permease protein MacB  33.88 
 
 		 216 aa  112  5e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3908  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  34.45 
 
 		 267 aa  112  5e-24  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.480865 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3859  phosphonate ABC transporter, ATPase subunit  34.45 
 
 		 267 aa  112  5e-24  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0109  ABC transporter related  36.84 
 
 		 243 aa  111  6e-24  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.112558  normal  0.0826339 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2281  ABC transporter related  42.07 
 
 		 235 aa  112  6e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.341913  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1095  Sigma 54 interacting domain protein  36.23 
 
 		 232 aa  112  6e-24  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1900  ABC transporter related  38.95 
 
 		 234 aa  111  7.000000000000001e-24  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.938738 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1396  macrolide transporter ATP-binding /permease protein  36.96 
 
 		 646 aa  111  8.000000000000001e-24  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0900334 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3745  cell division ATP-binding protein FtsE  35 
 
 		 224 aa  111  8.000000000000001e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4838  ABC transporter related  36.26 
 
 		 225 aa  111  9e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0743  ABC transporter related  33.16 
 
 		 226 aa  110  1.0000000000000001e-23  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0657  ABC transporter ATP-binding protein  33.88 
 
 		 216 aa  110  1.0000000000000001e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0271807  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0512  ABC transporter, ATP-binding protein  34.08 
 
 		 215 aa  110  1.0000000000000001e-23  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5546  ABC transporter related  31.94 
 
 		 224 aa  110  1.0000000000000001e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.361355  hitchhiker  0.00000572537 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2719  ABC transporter related protein  34.85 
 
 		 255 aa  111  1.0000000000000001e-23  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1340  ABC transporter related  36.16 
 
 		 644 aa  110  1.0000000000000001e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5611  ABC transporter related  34.57 
 
 		 220 aa  110  1.0000000000000001e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.650337  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2271  ABC transporter related  36.41 
 
 		 258 aa  110  1.0000000000000001e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000137949 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1938  ABC transporter related  33 
 
 		 275 aa  110  2.0000000000000002e-23  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.305639  normal  0.108587 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1841  ABC transporter related  34.21 
 
 		 224 aa  109  2.0000000000000002e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0297689  normal  0.0173978 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1653  ABC transporter related  34.08 
 
 		 228 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.200996  normal  0.926793 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0562  ABC transporter related  34.57 
 
 		 665 aa  110  2.0000000000000002e-23  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0367  ABC transporter, ATPase subunit  36.02 
 
 		 240 aa  110  2.0000000000000002e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.810917 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1757  peptide ABC transporter ATPase  32.54 
 
 		 225 aa  110  2.0000000000000002e-23  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000421952  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1036  ABC transporter related  36.27 
 
 		 328 aa  109  3e-23  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0519  molybdenum-pterin binding domain-containing protein  37.56 
 
 		 364 aa  109  3e-23  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.629407  normal  0.744926 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1659  ABC transporter related  34.76 
 
 		 241 aa  109  3e-23  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2239  ABC transporter related  35.11 
 
 		 233 aa  109  3e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0270  peptide ABC transporter ATPase  34.98 
 
 		 232 aa  109  3e-23  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0080  ABC transporter related  36.52 
 
 		 235 aa  109  3e-23  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.348241  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3339  ABC transporter related  38.89 
 
 		 249 aa  109  3e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0563  ABC transporter related protein  30.05 
 
 		 233 aa  109  3e-23  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3710  ABC transporter related  32.81 
 
 		 255 aa  109  3e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3596  cell division ATP-binding protein FtsE  35.59 
 
 		 230 aa  108  4.0000000000000004e-23  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0240123  normal  0.0833457 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0692  ABC transporter related  36.41 
 
 		 252 aa  109  4.0000000000000004e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3844  ABC transporter related protein  34.74 
 
 		 225 aa  108  4.0000000000000004e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0956  ABC transporter related  33.33 
 
 		 229 aa  109  4.0000000000000004e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0799  ABC transporter related  35.56 
 
 		 266 aa  108  5e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11004  adhesion ABC transporter ATP-binding protein  34.38 
 
 		 237 aa  108  5e-23  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  6.7798e-57  normal  0.515996 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0456  ABC transporter related  35.33 
 
 		 229 aa  108  5e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1552  ABC transporter-related protein  35.75 
 
 		 221 aa  108  5e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2567  ABC transporter related  36.23 
 
 		 249 aa  108  5e-23  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2658  ABC transporter-related protein  35.16 
 
 		 227 aa  108  5e-23  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1335  ABC transporter related  35.56 
 
 		 238 aa  108  5e-23  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.43014  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1518  ABC transporter-related protein  34.64 
 
 		 228 aa  108  6e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1563  ABC transporter related  33.68 
 
 		 249 aa  108  6e-23  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0841  ABC transporter, ATP-binding protein  34.78 
 
 		 255 aa  108  6e-23  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.598404  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2590  ABC transporter related  32.39 
 
 		 234 aa  108  6e-23  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0374  ABC transporter related  36.51 
 
 		 232 aa  108  6e-23  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.13034  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2356  ABC transporter related  35.14 
 
 		 233 aa  108  7.000000000000001e-23  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0836286  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3482  ABC transporter related protein  34.04 
 
 		 230 aa  108  7.000000000000001e-23  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.407816  normal  0.326208 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1060  ABC transporter related  38.25 
 
 		 230 aa  108  7.000000000000001e-23  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.724138  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2178  ABC transporter related  33.15 
 
 		 233 aa  108  7.000000000000001e-23  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0270  ABC transporter related protein  35.94 
 
 		 243 aa  108  7.000000000000001e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1867  ABC transporter, ATPase subunit  36.26 
 
 		 408 aa  108  8.000000000000001e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1763  ABC transporter related protein  32.96 
 
 		 246 aa  108  8.000000000000001e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.261961  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32340  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  33.85 
 
 		 264 aa  107  9.000000000000001e-23  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.442827 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3506  ABC transporter, ATP-binding protein  33.15 
 
 		 238 aa  108  9.000000000000001e-23  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.172031  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2739  ABC transporter related  34.11 
 
 		 217 aa  107  9.000000000000001e-23  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.569673  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0773  ABC transporter related  33.88 
 
 		 233 aa  108  9.000000000000001e-23  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.805493  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2354  ABC transporter related  34.59 
 
 		 247 aa  107  1e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.266266  normal  0.0591431 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3978  cell division protein FtsE  36.13 
 
 		 222 aa  107  1e-22  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.590462  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>