More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_5086 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013440  Hoch_5086  OmpA/MotB domain protein  100 
 
 
533 aa  1091    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04698  OmpA family domain protein  48.48 
 
 
268 aa  91.3  4e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0684754  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0753  OmpA domain-containing protein  50.49 
 
 
464 aa  91.3  5e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.767935 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3770  OmpA/MotB domain-containing protein  46.23 
 
 
440 aa  88.6  3e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3747  OmpA/MotB family outer membrane protein  45.87 
 
 
542 aa  87.4  7e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.598443  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0631  OmpA/MotB  45.63 
 
 
463 aa  87  7e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6933  OmpA/MotB domain protein  47.17 
 
 
630 aa  86.3  0.000000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.453004 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2561  NLPA lipoprotein  27.03 
 
 
339 aa  86.3  0.000000000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.79068 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3487  OmpA/MotB domain-containing protein  25.98 
 
 
522 aa  86.3  0.000000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.662497  normal  0.283139 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3804  OmpA/MotB domain protein  44.95 
 
 
543 aa  86.3  0.000000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1284  OmpA/MotB domain protein  40.44 
 
 
456 aa  86.3  0.000000000000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2185  outer membrane protein  47.12 
 
 
694 aa  86.7  0.000000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.138653 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1570  OmpA/MotB domain-containing protein  44.95 
 
 
498 aa  85.9  0.000000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00583575 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3888  OmpA/MotB domain protein  44.95 
 
 
544 aa  85.5  0.000000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.457406  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0305  OmpA/MotB domain protein  43.69 
 
 
169 aa  85.5  0.000000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.270512  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2067  OmpA/MotB domain protein  44.14 
 
 
216 aa  85.1  0.000000000000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.697357  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3652  OmpA/MotB domain-containing protein  42.98 
 
 
166 aa  85.1  0.000000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.549445  normal  0.986121 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3949  OmpA/MotB family outer membrane protein  43.1 
 
 
407 aa  85.1  0.000000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.243665  normal  0.26275 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4033  OmpA/MotB domain protein  42.99 
 
 
374 aa  84.7  0.000000000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.659004  normal  0.277798 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3635  OmpA family domain-containing protein  45.87 
 
 
310 aa  84.7  0.000000000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.837065  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0019  OmpA/MotB domain-containing protein  46.08 
 
 
510 aa  84.7  0.000000000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0746655  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2321  OmpA/MotB domain-containing protein  55.71 
 
 
727 aa  84.7  0.000000000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3627  ompA family protein  45.87 
 
 
310 aa  84.3  0.000000000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.574456  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3652  ompA family protein  45.87 
 
 
310 aa  84.3  0.000000000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0672699  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2828  OmpA domain-containing protein  45.87 
 
 
310 aa  84.3  0.000000000000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1715  ompA family protein  45.87 
 
 
310 aa  84.3  0.000000000000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.706939  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3149  ompA family protein  45.87 
 
 
310 aa  84.3  0.000000000000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2956  OmpA domain-containing protein  44.35 
 
 
311 aa  84.3  0.000000000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0285  hypothetical protein  45.79 
 
 
364 aa  84.3  0.000000000000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000131916  decreased coverage  0.000000274042 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0052  ompA family protein  45.87 
 
 
310 aa  84.3  0.000000000000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.757478  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2738  OmpA/MotB domain protein  42.45 
 
 
241 aa  84  0.000000000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00260572  hitchhiker  0.0000108242 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1647  putative sulfonate/nitrate transport system substrate-binding protein  23.65 
 
 
324 aa  84  0.000000000000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4921  OmpA/MotB domain protein  46.08 
 
 
320 aa  84  0.000000000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.730269  normal  0.0282337 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2441  OmpA/MotB domain-containing protein  38.41 
 
 
215 aa  83.6  0.000000000000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000000422184  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1825  OmpA/MotB  38.41 
 
 
215 aa  83.6  0.000000000000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.000764276  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2436  OmpA/MotB domain-containing protein  38.41 
 
 
215 aa  83.6  0.000000000000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0140056  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1255  Outer membrane protein and related peptidoglycan-associated (lipo)proteins-like  38.1 
 
 
422 aa  82.8  0.00000000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.201684  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4257  OmpA/MotB  36.96 
 
 
215 aa  82.8  0.00000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3060  putative outer membrane protein and related peptidoglycan-associated (lipo)proteins  42.72 
 
 
707 aa  82.4  0.00000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0502  OmpA/MotB  35.66 
 
 
463 aa  82  0.00000000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.605644 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5767  OmpA/MotB family protein  37.96 
 
 
214 aa  82  0.00000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00312455  normal  0.42403 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0884  OmpA/MotB  33.33 
 
 
464 aa  82.4  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.138624  normal  0.799439 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2702  OmpA/MotB domain-containing protein  42.74 
 
 
270 aa  82  0.00000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.248823  normal  0.0593962 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1209  OmpA/MotB domain-containing protein  42.72 
 
 
369 aa  81.6  0.00000000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.469659  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1143  OmpA/MotB domain-containing protein  37.31 
 
 
237 aa  81.3  0.00000000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.667913 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3081  OmpA/MotB  36.92 
 
 
653 aa  80.9  0.00000000000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2066  OmpA/MotB domain protein  38.98 
 
 
631 aa  80.5  0.00000000000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0885806  normal  0.200128 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2909  OmpA/MotB domain-containing protein  44.04 
 
 
316 aa  80.5  0.00000000000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5600  OmpA/MotB domain protein  40.95 
 
 
537 aa  80.1  0.00000000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.372086  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3825  OmpA/MotB domain-containing protein  44.66 
 
 
729 aa  80.1  0.00000000000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.263673  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2601  OmpA/MotB domain protein  42.72 
 
 
403 aa  80.1  0.00000000000009  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.278208  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0391  OmpA/MotB domain-containing protein  44.04 
 
 
316 aa  80.1  0.00000000000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.908149  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0482  OmpA family outer membrane protein  42.86 
 
 
620 aa  79.3  0.0000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.83961  normal  0.790259 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1196  OmpA/MotB domain-containing protein  43.69 
 
 
459 aa  79  0.0000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0858  OmpA/MotB domain-containing protein  37.68 
 
 
214 aa  79.3  0.0000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00000645517  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0457  OmpA/MotB domain-containing protein  44.04 
 
 
316 aa  78.6  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.518918  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0418  OmpA/MotB domain-containing protein  43.12 
 
 
316 aa  78.6  0.0000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.661169 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1798  OmpA/MotB  36.64 
 
 
294 aa  79  0.0000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.797204  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2141  outer membrane protein  34.04 
 
 
510 aa  79.3  0.0000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.496848  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1059  ompA family protein  40.54 
 
 
215 aa  78.2  0.0000000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0697  OmpA/MotB domain-containing protein  38.57 
 
 
487 aa  78.2  0.0000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0711  ompA family protein  40.54 
 
 
215 aa  78.2  0.0000000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0433789  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2454  outer membrane protein  41.75 
 
 
402 aa  78.6  0.0000000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1212  ompA family protein  40.54 
 
 
316 aa  78.2  0.0000000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3573  OmpA/MotB family outer membrane protein  44.04 
 
 
320 aa  78.2  0.0000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1615  ompA family protein  40.54 
 
 
215 aa  78.2  0.0000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.180495  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2302  ompA family protein  40.54 
 
 
215 aa  78.2  0.0000000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2984  ompA family protein  40.54 
 
 
215 aa  78.2  0.0000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.00790258  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1054  ompA family protein  40.54 
 
 
215 aa  78.2  0.0000000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5270  OmpA/MotB domain protein  40.38 
 
 
464 aa  78.2  0.0000000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0857  ompA family protein  40.54 
 
 
261 aa  78.2  0.0000000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0772  OmpA/MotB  32.67 
 
 
464 aa  77.8  0.0000000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.226683 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3730  OmpA/MotB domain protein  35.94 
 
 
440 aa  77.8  0.0000000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.331233  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000499  outer membrane protein A precursor  37.5 
 
 
330 aa  77.8  0.0000000000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.0000000410155  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6364  OmpA/MotB domain-containing protein  45.28 
 
 
231 aa  77.4  0.0000000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.1144  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1805  outer membrane protein OmpA  38.66 
 
 
321 aa  77.8  0.0000000000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0441  OmpA/MotB domain-containing protein  43.24 
 
 
417 aa  77.8  0.0000000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.00000000726931  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1376  OmpA/MotB domain protein  35.71 
 
 
468 aa  77.8  0.0000000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000480584  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2107  OmpA/MotB domain-containing protein  45 
 
 
417 aa  77.8  0.0000000000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.425223  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0689  OmpA/MotB domain protein  42.99 
 
 
443 aa  77.8  0.0000000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000828786  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4576  OmpA/MotB domain-containing protein  44.12 
 
 
224 aa  77.4  0.0000000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4927  OmpA/MotB  39.81 
 
 
464 aa  77  0.0000000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.989181  normal  0.828832 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0492  OmpA/MotB domain-containing protein  43.69 
 
 
187 aa  77.4  0.0000000000007  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000142767  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6789  OmpA/MotB domain-containing protein  44.66 
 
 
228 aa  77  0.0000000000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.356042  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2146  OmpA/MotB domain-containing protein  36.23 
 
 
218 aa  77  0.0000000000008  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.47635  normal  0.386424 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1221  OmpA/MotB  35.46 
 
 
240 aa  77  0.0000000000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3482  OmpA/MotB family outer membrane protein  39.25 
 
 
217 aa  76.6  0.0000000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000000110424  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4113  OmpA/MotB  32.93 
 
 
270 aa  76.6  0.000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.264738 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4073  OmpA/MotB domain-containing protein  39.53 
 
 
319 aa  76.3  0.000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.68736  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0127  OmpA/MotB domain protein  41.75 
 
 
364 aa  76.3  0.000000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2622  OmpA/MotB  43.12 
 
 
247 aa  76.6  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1016  OmpA/MotB domain protein  39.25 
 
 
217 aa  76.3  0.000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0000464743  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0673  OmpA/MotB domain-containing protein  43.24 
 
 
227 aa  76.6  0.000000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.534007  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2050  outer membrane protein  42.06 
 
 
235 aa  76.6  0.000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2606  outer membrane peptidoglycan-associated protein  36.7 
 
 
710 aa  76.6  0.000000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2483  OmpA/MotB domain-containing protein  36.23 
 
 
232 aa  76.3  0.000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.421874  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0483  OmpA/MotB domain-containing protein  43.12 
 
 
316 aa  76.6  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1167  OmpA family protein  36.84 
 
 
243 aa  75.5  0.000000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.146962  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01947  lipoprotein  42.72 
 
 
277 aa  75.5  0.000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.331066 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04793  OmpA family protein  38.24 
 
 
241 aa  75.9  0.000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.188001  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>