More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_4267 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_03756  GTP-binding protein  55.98 
 
 		 607 aa  677    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4115  GTP-binding protein TypA  55.98 
 
 		 607 aa  677    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4138  GTP-binding protein TypA  53.74 
 
 		 606 aa  658    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.781613  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0500  GTP-binding protein TypA  56.3 
 
 		 598 aa  678    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5044  GTP-binding protein TypA  52.74 
 
 		 606 aa  646    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0948  GTP-binding protein  54.33 
 
 		 602 aa  657    Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1224  GTP-binding protein TypA  53.91 
 
 		 605 aa  645    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2852  GTP-binding protein TypA  54.98 
 
 		 606 aa  665    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.011881  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1771  GTP-binding protein TypA  54.3 
 
 		 608 aa  655    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.374634  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1296  GTP-binding elongation factor protein  55.5 
 
 		 606 aa  655    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.609673  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4918  GTP-binding protein TypA  52.74 
 
 		 606 aa  646    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0606  GTP-binding protein TypA  54.03 
 
 		 605 aa  647    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.226291  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0038  GTP-binding protein TypA  52.75 
 
 		 602 aa  670    Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.368844  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07981  tyrosine binding protein  57.19 
 
 		 598 aa  669    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.633904 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5850  GTP-binding protein TypA/BipA  53.58 
 
 		 605 aa  654    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0948932  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4408  virulence regulator BipA  55.33 
 
 		 603 aa  662    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0361  GTP-binding protein TypA  52.66 
 
 		 606 aa  639    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00590  GTPase  54.93 
 
 		 609 aa  670    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1757  GTP-binding protein TypA/BipA  52.82 
 
 		 602 aa  661    Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0999  GTP-binding protein TypA  54.3 
 
 		 608 aa  655    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.191284  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0053  GTP-binding protein TypA  52.58 
 
 		 602 aa  667    Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1053  GTP-binding protein TypA  54.3 
 
 		 608 aa  655    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2875  hypothetical protein  55.72 
 
 		 608 aa  676    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2737  hypothetical protein  55.91 
 
 		 608 aa  676    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4815  GTP-binding protein TypA  52.99 
 
 		 606 aa  637    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0339  putative regulatory protein TypA or elongation factor Tu  52.11 
 
 		 615 aa  647    Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.597633  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1998  GTP-binding protein TypA  54.3 
 
 		 613 aa  650    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.472185  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0166  GTP-binding protein TypA  57.36 
 
 		 598 aa  672    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0168881  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2021  GTP-binding protein TypA  55.83 
 
 		 606 aa  660    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.487667  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0308  GTP-binding protein TypA  55.41 
 
 		 609 aa  660    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.196053  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0772  GTP-binding protein TypA  54.75 
 
 		 610 aa  671    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.260784 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0554  small GTP-binding protein  53.56 
 
 		 614 aa  637    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.478934  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0763  small GTP-binding protein domain-containing protein  56.58 
 
 		 596 aa  651    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.202624 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1923  GTP-binding protein TypA  54.3 
 
 		 608 aa  655    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.289402  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0720  GTP-binding protein TypA  56.86 
 
 		 609 aa  680    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000568805  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0347  GTP-binding protein TypA  53.31 
 
 		 606 aa  654    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4008  GTP-binding protein TypA  55.54 
 
 		 599 aa  673    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000475691  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1211  GTP-binding protein TypA  56.83 
 
 		 602 aa  699    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000229587  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4648  GTP-binding protein TypA  53.5 
 
 		 608 aa  646    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0457537  normal  0.313247 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0028  GTP-binding protein TypA/BipA  55.61 
 
 		 607 aa  662    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1236  GTP-binding protein TypA  56.08 
 
 		 600 aa  667    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.292914  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0413  GTP-binding protein TypA  55.61 
 
 		 603 aa  660    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1243  GTP-binding protein TypA  56.42 
 
 		 602 aa  668    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.590892 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3013  GTP-binding protein TypA  55.29 
 
 		 598 aa  672    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00684443  normal  0.862296 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4025  GTP-binding protein TypA  53.81 
 
 		 606 aa  641    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.759535 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0169  GTP-binding protein TypA  53.23 
 
 		 607 aa  649    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0380  GTP-binding protein TypA  54.52 
 
 		 615 aa  662    Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000238787  hitchhiker  0.00000136232 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4098  GTP-binding protein  55.98 
 
 		 607 aa  677    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0770  tyrosine binding protein  55.57 
 
 		 598 aa  665    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1525  GTP-binding protein TypA  56.58 
 
 		 597 aa  649    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00490404 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1770  GTP-binding protein TypA  53.41 
 
 		 603 aa  658    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0712941  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3553  GTP-binding protein TypA  56.03 
 
 		 607 aa  678    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.718809  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4378  GTP-binding protein TypA  56.58 
 
 		 596 aa  652    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2557  GTP-binding protein TypA  53.72 
 
 		 608 aa  650    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1007  GTP-binding protein TypA  52.99 
 
 		 614 aa  672    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000478233  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0077  GTP-binding protein TypA  52.58 
 
 		 602 aa  669    Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2542  GTP-binding protein TypA  53.44 
 
 		 614 aa  652    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0446151  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3415  virulence regulator BipA  55.33 
 
 		 604 aa  667    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.349187 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0738  GTP-binding protein TypA  55.72 
 
 		 606 aa  660    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_08221  tyrosine binding protein  55.57 
 
 		 598 aa  665    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.848748  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4094  GTP-binding protein TypA  55.63 
 
 		 607 aa  670    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0511  regulatory protein TypA  54.49 
 
 		 608 aa  655    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2316  GTP-binding protein TypA  54.11 
 
 		 609 aa  671    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1259  GTP-binding protein TypA  53.85 
 
 		 602 aa  645    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.273411 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08241  tyrosine binding protein  55.15 
 
 		 598 aa  666    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2813  GTP-binding protein TypA  54.41 
 
 		 608 aa  650    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.472576 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3455  GTP-binding protein TypA  55.07 
 
 		 603 aa  657    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000132117  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2046  GTP-binding protein TypA/BipA  51.67 
 
 		 600 aa  639    Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0433299  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0239  GTP-binding protein TypA  52.48 
 
 		 608 aa  640    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0307  GTP-binding protein TypA  55.41 
 
 		 609 aa  660    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0237117  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0373  GTP-binding protein TypA  52.6 
 
 		 615 aa  652    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0554499  normal  0.0314222 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2024  GTP-binding protein TypA  56.13 
 
 		 607 aa  663    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.213403 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1307  GTP-binding protein TypA  53.45 
 
 		 610 aa  642    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.992713  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0864  GTP-binding protein TypA  53.96 
 
 		 593 aa  642    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.490555 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1748  GTP-binding protein TypA  54.3 
 
 		 608 aa  655    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.623717  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2303  GTP-binding protein TypA  53.53 
 
 		 610 aa  645    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0308778  normal  0.797114 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1027  GTP-binding protein TypA  53.67 
 
 		 608 aa  649    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1024  GTP-binding protein TypA  53.91 
 
 		 623 aa  657    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16761  tyrosine binding protein  55.91 
 
 		 600 aa  657    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.262859 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2027  GTP-binding protein TypA  52.07 
 
 		 610 aa  644    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1744  GTP-binding protein TypA  51.74 
 
 		 610 aa  640    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0417  GTP-binding protein  54.61 
 
 		 616 aa  637    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0525699  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4442  GTP-binding protein TypA  56.92 
 
 		 596 aa  671    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0306  GTP-binding protein TypA  56 
 
 		 603 aa  671    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.562357  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3718  GTP-binding protein TypA  56 
 
 		 603 aa  671    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0253074 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0941  GTP-binding protein TypA  57.1 
 
 		 602 aa  683    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0324  GTP-binding protein TypA  55.61 
 
 		 603 aa  667    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.000010951  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0339  GTP-binding protein TypA  53.29 
 
 		 608 aa  657    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.0649933 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1389  GTP-binding protein TypA  53.33 
 
 		 608 aa  644    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67560  GTP-binding protein TypA/BipA  53.91 
 
 		 605 aa  665    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.24734  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0153  GTP-binding protein TypA  54.49 
 
 		 605 aa  659    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.143377  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1499  GTP-binding protein TypA  54.3 
 
 		 608 aa  655    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.584386  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1918  putative GTP-binding elongation factor protein  54.08 
 
 		 610 aa  649    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.23891  normal  0.145014 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0167  GTP-binding protein TypA  54.3 
 
 		 608 aa  655    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.139003  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_08211  tyrosine binding protein  55.67 
 
 		 600 aa  662    Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.96814  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1507  GTP-binding protein TypA  53.67 
 
 		 608 aa  649    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0770  GTP-binding protein TypA  53.17 
 
 		 603 aa  650    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.872449  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1545  GTP-binding protein TypA  54.89 
 
 		 611 aa  647    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0301  GTP-binding protein TypA  55.5 
 
 		 603 aa  666    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00567265 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0013  GTP-binding protein TypA/BipA  51.91 
 
 		 602 aa  643    Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>