More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hmuk_3127 on replicon NC_013202
Organism: Halomicrobium mukohataei DSM 12286



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012029  Hlac_1413  geranylgeranyl reductase  73.14 
 
 		 456 aa  659    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.145276  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3127  geranylgeranyl reductase  100 
 
 		 458 aa  936    Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.541663  normal  0.393865 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1377  geranylgeranyl reductase  73.25 
 
 		 467 aa  660    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2778  geranylgeranyl reductase  72.43 
 
 		 471 aa  637    Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0881  geranylgeranyl reductase  71.83 
 
 		 455 aa  628  1e-179  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.170951  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0668  geranylgeranyl reductase  57.42 
 
 		 458 aa  543  1e-153  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.159483  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2954  geranylgeranyl reductase  58.26 
 
 		 457 aa  508  1e-143  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1523  geranylgeranyl reductase  39.92 
 
 		 495 aa  317  4e-85  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.545892  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1347  geranylgeranyl reductase  32.98 
 
 		 453 aa  191  2e-47  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0129504  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1073  geranylgeranyl reductase  31.58 
 
 		 452 aa  176  6e-43  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0938  geranylgeranyl reductase  30.47 
 
 		 453 aa  164  2.0000000000000002e-39  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.129052 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1696  geranylgeranyl reductase  31.22 
 
 		 459 aa  152  1e-35  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0811  geranylgeranyl reductase  30 
 
 		 453 aa  151  2e-35  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0681  geranylgeranyl reductase  25.66 
 
 		 453 aa  132  1.0000000000000001e-29  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00166018  hitchhiker  0.00000684168 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0166  geranylgeranyl reductase  25 
 
 		 453 aa  124  3e-27  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1514  geranylgeranyl reductase  23.89 
 
 		 485 aa  120  6e-26  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00785047 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0369  geranylgeranyl reductase  28.84 
 
 		 408 aa  117  3e-25  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0683691  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1308  geranylgeranyl reductase  29.17 
 
 		 406 aa  107  6e-22  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0578  geranylgeranyl reductase  27.32 
 
 		 395 aa  99.8  8e-20  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0044  geranylgeranyl reductase  28.84 
 
 		 391 aa  99.4  1e-19  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.345503  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1250  geranylgeranyl reductase  27.47 
 
 		 390 aa  98.6  2e-19  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.375977  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0522  geranylgeranyl reductase  27.39 
 
 		 390 aa  97.8  3e-19  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1386  geranylgeranyl reductase  26.79 
 
 		 390 aa  94.7  3e-18  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1087  electron transfer flavoprotein  27.65 
 
 		 384 aa  94  5e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.384904  normal  0.110599 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1375  geranylgeranyl reductase  28.12 
 
 		 390 aa  91.7  2e-17  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.545102  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4559  geranylgeranyl reductase  30.08 
 
 		 419 aa  89.4  1e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2696  geranylgeranyl reductase, plantal and  29.95 
 
 		 435 aa  87.4  5e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1307  geranylgeranyl reductase  26.02 
 
 		 391 aa  86.3  0.000000000000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.398981  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3422  geranylgeranyl reductase  28.61 
 
 		 407 aa  85.5  0.000000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.351163 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0718  geranylgeranyl reductase  28.41 
 
 		 387 aa  84.7  0.000000000000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0537  geranylgeranyl reductase  29.97 
 
 		 434 aa  84  0.000000000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.118976 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0973  geranylgeranyl reductase  28.96 
 
 		 430 aa  82.8  0.00000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4066  geranylgeranyl reductase  31.12 
 
 		 423 aa  82.4  0.00000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.449431  normal  0.299227 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0172  bacteriochlorophyll synthase  26.69 
 
 		 396 aa  82  0.00000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.935683 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0506  geranylgeranyl reductase  25.4 
 
 		 398 aa  81.3  0.00000000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0631  geranylgeranyl reductase  25.06 
 
 		 402 aa  80.5  0.00000000000006  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0431  PUA domain-containing protein  27.33 
 
 		 397 aa  79  0.0000000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5052  geranylgeranyl reductase  30.08 
 
 		 434 aa  79  0.0000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4464  geranylgeranyl reductase  29.74 
 
 		 423 aa  76.3  0.000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.152921  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0643  geranylgeranyl reductase  27.07 
 
 		 360 aa  75.5  0.000000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.770726  normal  0.124546 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0962  geranylgeranyl reductase  27.62 
 
 		 399 aa  74.7  0.000000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.493163  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0583  geranylgeranyl reductase  29.11 
 
 		 425 aa  74.7  0.000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8053  geranylgeranyl reductase  29.76 
 
 		 423 aa  75.1  0.000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.661392 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1123  geranylgeranyl reductase  28.57 
 
 		 402 aa  74.3  0.000000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0444  geranylgeranyl reductase  27.33 
 
 		 341 aa  73.9  0.000000000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0279  geranylgeranyl reductase  29.7 
 
 		 424 aa  73.6  0.000000000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.615542  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1711  geranylgeranyl reductase  29.68 
 
 		 365 aa  73.2  0.000000000008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1879  FAD dependent oxidoreductase  23.16 
 
 		 331 aa  73.2  0.000000000009  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0023  geranylgeranyl reductase  28.01 
 
 		 379 aa  72.8  0.00000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0136897  hitchhiker  0.00371909 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1945  geranylgeranyl reductase  26.65 
 
 		 398 aa  72  0.00000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3043  geranylgeranyl reductase  24.72 
 
 		 376 aa  72  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.483009 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0266  geranylgeranyl reductase  30.25 
 
 		 445 aa  72  0.00000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.224418  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3528  geranylgeranyl reductase  27.51 
 
 		 394 aa  71.6  0.00000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.673829 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1273  geranylgeranyl reductase  27.49 
 
 		 457 aa  70.9  0.00000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0513601 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3265  geranylgeranyl reductase  27.32 
 
 		 406 aa  70.5  0.00000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0200135 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2279  geranylgeranyl reductase  28.07 
 
 		 413 aa  70.5  0.00000000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4420  geranylgeranyl reductase  27.23 
 
 		 418 aa  70.1  0.00000000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0807  geranylgeranyl reductase  25.86 
 
 		 348 aa  69.3  0.0000000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00458422  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3230  geranylgeranyl reductase  27.51 
 
 		 431 aa  69.7  0.0000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00716202 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1774  FAD dependent oxidoreductase  26.51 
 
 		 369 aa  69.7  0.0000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.496071 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2205  geranylgeranyl reductase  26.74 
 
 		 363 aa  68.6  0.0000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0864  geranylgeranyl reductase  20.99 
 
 		 396 aa  67.8  0.0000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000799674  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2055  geranylgeranyl reductase  25.75 
 
 		 393 aa  68.6  0.0000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05761  NAD binding site  24.21 
 
 		 377 aa  68.2  0.0000000003  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.680324  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4291  geranylgeranyl reductase  26 
 
 		 393 aa  67  0.0000000006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.464527 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1920  geranylgeranyl reductase  26.69 
 
 		 394 aa  66.6  0.0000000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.571775 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0277  geranylgeranyl hydrogenase  26.69 
 
 		 394 aa  66.6  0.0000000008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3751  geranylgeranyl reductase  27.04 
 
 		 406 aa  66.2  0.000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0101048  hitchhiker  0.000524672 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3081  FAD dependent oxidoreductase  26.1 
 
 		 413 aa  65.9  0.000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6683  geranylgeranyl reductase  28.95 
 
 		 426 aa  65.9  0.000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00871957  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0044  geranylgeranyl reductase  28.22 
 
 		 380 aa  65.5  0.000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03150  geranylgeranyl reductase family protein  29.37 
 
 		 424 aa  64.7  0.000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.992088  normal  0.897834 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0671  geranylgeranyl reductase  25.14 
 
 		 381 aa  65.1  0.000000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.421353  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0387  geranylgeranyl reductase  27.19 
 
 		 403 aa  64.3  0.000000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0035  geranylgeranyl reductase  26.78 
 
 		 380 aa  63.5  0.000000007  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.916237  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3745  geranylgeranyl reductase  26.16 
 
 		 400 aa  63.5  0.000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000410516 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0697  FAD dependent oxidoreductase  23.6 
 
 		 393 aa  62.8  0.00000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17730  geranylgeranyl reductase family protein  28.78 
 
 		 466 aa  63.2  0.00000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0390  monooxygenase FAD-binding  25.39 
 
 		 425 aa  62.8  0.00000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0398453 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2507  FAD dependent oxidoreductase  25.65 
 
 		 414 aa  62.4  0.00000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.206191  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1007  FAD dependent oxidoreductase  23.69 
 
 		 409 aa  62.8  0.00000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0023  geranylgeranyl reductase  26.83 
 
 		 379 aa  62.4  0.00000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.086385  normal  0.74185 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1376  dehydrogenase, flavoprotein containing  26.24 
 
 		 384 aa  62.4  0.00000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000125722  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05461  NAD binding site  24.21 
 
 		 377 aa  62  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0714  geranylgeranyl reductase  27.36 
 
 		 386 aa  62  0.00000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2717  geranylgeranyl reductase  28.76 
 
 		 443 aa  62.4  0.00000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.593407 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1602  geranylgeranyl reductase  27.27 
 
 		 405 aa  62  0.00000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.157827  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2774  Electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  24.59 
 
 		 430 aa  61.6  0.00000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.372841  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1553  Electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  25.88 
 
 		 436 aa  61.6  0.00000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.457963  normal  0.229666 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0315  tryptophan halogenase  22.69 
 
 		 420 aa  60.8  0.00000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000735026 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2465  tryptophan halogenase  26.84 
 
 		 495 aa  60.8  0.00000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.842716  normal  0.17253 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1343  geranylgeranyl reductase  24.23 
 
 		 411 aa  60.5  0.00000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.263408 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1407  geranylgeranyl reductase  24.48 
 
 		 398 aa  60.1  0.00000008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.426262  normal  0.248213 
 
 
-
 
NC_002936  DET0771  hypothetical protein  24.15 
 
 		 379 aa  59.7  0.0000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0830  geranylgeranyl reductase  32.85 
 
 		 415 aa  59.3  0.0000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6095  geranylgeranyl reductase  28.69 
 
 		 440 aa  59.3  0.0000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0614228 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1863  tryptophan halogenase  23.18 
 
 		 415 aa  59.3  0.0000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1134  geranylgeranyl reductase  27.16 
 
 		 389 aa  58.9  0.0000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.719323  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0311  hypothetical protein  24.87 
 
 		 409 aa  59.3  0.0000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.172492  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1077  geranylgeranyl reductase  23.65 
 
 		 399 aa  58.9  0.0000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0240225  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>