80 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssol_1879 on replicon CP001800
Organism: Sulfolobus solfataricus 98/2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001800  Ssol_1879  FAD dependent oxidoreductase  100 
 
 		 331 aa  671    Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1682  dehydrogenase (flavoprotein)-like protein  58.26 
 
 		 325 aa  371  1e-102  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.426539  normal  0.21751 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0634  hypothetical protein  30.17 
 
 		 322 aa  141  1.9999999999999998e-32  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.621704  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0627  hypothetical protein  29.23 
 
 		 320 aa  130  3e-29  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1596  hypothetical protein  30.19 
 
 		 320 aa  127  4.0000000000000003e-28  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0875  hypothetical protein  32.01 
 
 		 320 aa  126  6e-28  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1036  hypothetical protein  29.06 
 
 		 297 aa  94.7  2e-18  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.16489  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0160  FAD dependent oxidoreductase  30.37 
 
 		 332 aa  88.6  2e-16  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.358314  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1085  dehydrogenase (flavoprotein)-like protein  25 
 
 		 289 aa  79  0.0000000000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0687  FAD dependent oxidoreductase  27.41 
 
 		 329 aa  79  0.0000000000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  decreased coverage  0.0000000330964  unclonable  0.000000300742 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0718  geranylgeranyl reductase  23.95 
 
 		 387 aa  61.2  0.00000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3127  geranylgeranyl reductase  22.17 
 
 		 458 aa  58.2  0.0000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.541663  normal  0.393865 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1073  geranylgeranyl reductase  24.1 
 
 		 452 aa  56.6  0.0000006  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0879  geranylgeranyl reductase  24.76 
 
 		 370 aa  55.1  0.000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.917387  normal  0.163245 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0508  geranylgeranyl reductase  26.15 
 
 		 376 aa  53.9  0.000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1347  geranylgeranyl reductase  23.99 
 
 		 453 aa  53.5  0.000005  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0129504  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0501  geranylgeranyl reductase  23.96 
 
 		 376 aa  53.1  0.000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0064  geranylgeranyl reductase  31.52 
 
 		 373 aa  52.4  0.00001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.535363  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1774  FAD dependent oxidoreductase  21.18 
 
 		 369 aa  52  0.00001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.496071 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6208  monooxygenase FAD-binding protein  23.56 
 
 		 403 aa  52  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00171157  normal  0.384261 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1087  electron transfer flavoprotein  23.25 
 
 		 384 aa  52  0.00001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.384904  normal  0.110599 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1066  geranylgeranyl reductase  33.65 
 
 		 382 aa  51.2  0.00002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000111291  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2954  geranylgeranyl reductase  34.11 
 
 		 457 aa  51.2  0.00002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1134  geranylgeranyl reductase  33.33 
 
 		 389 aa  50.4  0.00004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.719323  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0359  dehydrogenase (flavoprotein)-like protein  27.49 
 
 		 332 aa  50.4  0.00004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1193  geranylgeranyl reductase  26.04 
 
 		 362 aa  49.3  0.00009  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0917874  hitchhiker  0.0000705466 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1603  geranylgeranyl reductase  30.29 
 
 		 374 aa  48.9  0.0001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0982  geranylgeranyl reductase  36.9 
 
 		 384 aa  49.3  0.0001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0176875  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1377  geranylgeranyl reductase  27.59 
 
 		 467 aa  48.1  0.0002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1268  geranylgeranyl reductase  20 
 
 		 375 aa  48.5  0.0002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0830  geranylgeranyl reductase  27.81 
 
 		 415 aa  48.1  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0714  geranylgeranyl reductase  32.31 
 
 		 415 aa  47.8  0.0003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2279  geranylgeranyl reductase  22.59 
 
 		 413 aa  47.4  0.0003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1407  geranylgeranyl reductase  27.93 
 
 		 398 aa  47.4  0.0003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.426262  normal  0.248213 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05761  NAD binding site  26.43 
 
 		 377 aa  47.4  0.0003  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.680324  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05771  NAD binding site  23.56 
 
 		 376 aa  47.8  0.0003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.161819  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1376  dehydrogenase, flavoprotein containing  23.38 
 
 		 384 aa  47  0.0004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000125722  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0277  geranylgeranyl hydrogenase  21.43 
 
 		 394 aa  47  0.0005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1920  geranylgeranyl reductase  21.43 
 
 		 394 aa  47  0.0005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.571775 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0668  geranylgeranyl reductase  23.78 
 
 		 458 aa  46.6  0.0005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.159483  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1852  NAD binding site  24.34 
 
 		 376 aa  47  0.0005  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05841  NAD binding site  34.71 
 
 		 377 aa  46.6  0.0006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.188024  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0583  geranylgeranyl reductase  25.29 
 
 		 425 aa  46.6  0.0006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5254  geranylgeranyl reductase  36.36 
 
 		 416 aa  46.6  0.0006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.609279 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0881  geranylgeranyl reductase  32.63 
 
 		 455 aa  46.2  0.0007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.170951  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3265  geranylgeranyl reductase  30.26 
 
 		 406 aa  46.2  0.0008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0200135 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1602  geranylgeranyl reductase  26.95 
 
 		 405 aa  45.4  0.001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.157827  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1355  geranylgeranyl reductase  25.18 
 
 		 358 aa  45.8  0.001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.0520333 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0630  geranylgeranyl reductase  30.72 
 
 		 373 aa  45.4  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.685888 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0938  geranylgeranyl reductase  29.79 
 
 		 453 aa  45.8  0.001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.129052 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1413  geranylgeranyl reductase  32.14 
 
 		 456 aa  45.4  0.001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.145276  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3751  geranylgeranyl reductase  28.95 
 
 		 406 aa  45.1  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0101048  hitchhiker  0.000524672 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0133  geranylgeranyl reductase  27.2 
 
 		 368 aa  45.1  0.002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3422  geranylgeranyl reductase  28.57 
 
 		 407 aa  44.7  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.351163 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0520  NAD binding site  33.91 
 
 		 377 aa  45.1  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0388  geranylgeranyl reductase  24.82 
 
 		 362 aa  45.1  0.002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.1431 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1308  geranylgeranyl reductase  28.97 
 
 		 406 aa  45.1  0.002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4420  geranylgeranyl reductase  25.29 
 
 		 418 aa  44.3  0.003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1386  geranylgeranyl reductase  26.2 
 
 		 390 aa  44.3  0.003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1375  geranylgeranyl reductase  22.86 
 
 		 390 aa  44.3  0.003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.545102  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1239  geranylgeranyl reductase  31.58 
 
 		 452 aa  44.3  0.003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.214331  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05461  NAD binding site  25.58 
 
 		 377 aa  44.3  0.003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1161  geranylgeranyl reductase  22.3 
 
 		 429 aa  43.9  0.003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0164  putative electron transfer oxidoreductase  24.47 
 
 		 420 aa  44.3  0.003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.762503  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0164  geranylgeranyl reductase  31.58 
 
 		 443 aa  43.5  0.004  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.620405  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1664  geranylgeranyl reductase  34.43 
 
 		 407 aa  43.9  0.004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07961  aromatic-ring hydroxylase (flavoprotein monooxygenase)  31.58 
 
 		 443 aa  43.5  0.004  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.253418  normal  0.790247 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1119  geranylgeranyl reductase  24.54 
 
 		 367 aa  43.9  0.004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.920793 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0807  geranylgeranyl reductase  21.47 
 
 		 348 aa  43.5  0.005  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00458422  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08221  aromatic-ring hydroxylase (flavoprotein monooxygenase)  29.82 
 
 		 446 aa  43.1  0.007  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_08231  aromatic-ring hydroxylase (flavoprotein monooxygenase)  31.58 
 
 		 445 aa  43.1  0.007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.891697  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0768  aromatic-ring hydroxylase (flavoprotein monooxygenase)  29.82 
 
 		 446 aa  43.1  0.007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0643  geranylgeranyl reductase  24.12 
 
 		 360 aa  43.1  0.007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.770726  normal  0.124546 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_08201  aromatic-ring hydroxylase (flavoprotein monooxygenase)  29.82 
 
 		 446 aa  43.1  0.007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0578  geranylgeranyl reductase  30.48 
 
 		 395 aa  43.1  0.007  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10031  aromatic-ring hydroxylase (flavoprotein monooxygenase)  31.58 
 
 		 449 aa  42.7  0.008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.245076  normal  0.232729 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0522  geranylgeranyl reductase  29.29 
 
 		 390 aa  42.7  0.008  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16731  aromatic-ring hydroxylase (flavoprotein monooxygenase)  29.82 
 
 		 468 aa  42.7  0.008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.652632 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3043  geranylgeranyl reductase  22.67 
 
 		 376 aa  42.7  0.009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.483009 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2299  geranylgeranyl reductase  28.32 
 
 		 374 aa  42.7  0.009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.650791  normal  0.524944 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>