More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_2075 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009483  Gura_2075  ROK family protein  100 
 
 		 328 aa  651    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000214155  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1639  glucokinase  56.29 
 
 		 324 aa  308  8e-83  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00474414  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1702  ROK family protein  56.27 
 
 		 318 aa  306  5.0000000000000004e-82  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.38694  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2957  ROK family protein  50.63 
 
 		 306 aa  276  5e-73  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1326  ROK family protein  48.42 
 
 		 306 aa  275  9e-73  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0533007  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1263  ROK family protein  49.51 
 
 		 303 aa  236  5.0000000000000005e-61  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.0000116273  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1507  ROK (repressor, ORF, kinase) family protein  48.06 
 
 		 319 aa  235  7e-61  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000453151  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0649  ROK family protein  47.35 
 
 		 325 aa  235  7e-61  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3865  glucokinase  41.93 
 
 		 347 aa  224  2e-57  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16050  glucokinase  36.54 
 
 		 322 aa  197  2.0000000000000003e-49  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1116  ROK family protein  39.56 
 
 		 320 aa  196  3e-49  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0146441  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6562  ROK family protein  40.69 
 
 		 321 aa  186  3e-46  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0832  glucokinase  38.26 
 
 		 315 aa  186  5e-46  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.618047 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0992  ROK family glucokinase  37.18 
 
 		 312 aa  185  1.0000000000000001e-45  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0076  putative glucokinase  35.78 
 
 		 315 aa  177  3e-43  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0098  glucose kinase  35.78 
 
 		 315 aa  177  3e-43  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3188  ROK family protein  36.68 
 
 		 318 aa  174  2.9999999999999996e-42  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00496766  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2512  ROK family protein  37.03 
 
 		 340 aa  171  1e-41  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.615457  normal  0.876353 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1061  ROK family glucokinase  37.38 
 
 		 312 aa  171  1e-41  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.204957  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2754  ROK family protein  36.5 
 
 		 332 aa  170  3e-41  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3092  glucokinase  37.42 
 
 		 352 aa  169  6e-41  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0049  ROK family glucokinase  32.91 
 
 		 315 aa  169  7e-41  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00642511  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0037  ROK family protein  32.48 
 
 		 317 aa  166  5.9999999999999996e-40  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2897  ROK family protein  38.02 
 
 		 312 aa  165  1.0000000000000001e-39  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1690  ROK family protein  34.22 
 
 		 332 aa  163  4.0000000000000004e-39  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0088  ROK family protein  36.16 
 
 		 313 aa  163  5.0000000000000005e-39  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2714  ROK family protein  34.69 
 
 		 318 aa  162  9e-39  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0018  ROK family protein  33.95 
 
 		 321 aa  160  2e-38  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0049  ROK family protein  36.83 
 
 		 336 aa  160  3e-38  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.331576  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_49  transcriptional regulator/sugar kinase  36.51 
 
 		 334 aa  159  7e-38  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0340377  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2629  ROK family protein  33.98 
 
 		 409 aa  159  9e-38  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1217  ROK family protein  32.81 
 
 		 316 aa  158  1e-37  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0046  glucokinase  35 
 
 		 335 aa  158  1e-37  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00210983  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1441  glucokinase, ROK family  34.98 
 
 		 314 aa  157  3e-37  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.255203  normal  0.184628 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4056  ROK family protein  33.33 
 
 		 302 aa  156  5.0000000000000005e-37  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1821  ROK family protein  37.78 
 
 		 318 aa  156  5.0000000000000005e-37  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5161  glucokinase, ROK family  35.74 
 
 		 342 aa  155  9e-37  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.515306 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2309  glucokinase  32.81 
 
 		 323 aa  154  2e-36  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00114411  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0086  glucokinase, ROK family  37.3 
 
 		 313 aa  154  2e-36  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4343  glucokinase  36.36 
 
 		 327 aa  153  2.9999999999999998e-36  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4165  glucokinase  36.36 
 
 		 327 aa  153  2.9999999999999998e-36  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.131693  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4004  glucokinase  36.36 
 
 		 327 aa  153  2.9999999999999998e-36  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4014  glucokinase  36.36 
 
 		 327 aa  153  2.9999999999999998e-36  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0552724  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4487  glucokinase  36.36 
 
 		 327 aa  153  2.9999999999999998e-36  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.693624  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4283  glucokinase  36.36 
 
 		 327 aa  153  2.9999999999999998e-36  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4396  glucokinase  36.36 
 
 		 327 aa  153  2.9999999999999998e-36  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1908  glucokinase, putative  28.89 
 
 		 313 aa  153  4e-36  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5352  ROK family protein  33.33 
 
 		 298 aa  153  5e-36  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4116  ROK family glucokinase  36.36 
 
 		 327 aa  152  5.9999999999999996e-36  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0799  glucokinase, ROK family  29.17 
 
 		 317 aa  152  8e-36  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0857  glucokinase  35.42 
 
 		 327 aa  152  8.999999999999999e-36  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4377  glucokinase  35.42 
 
 		 327 aa  152  8.999999999999999e-36  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2991  ROK family glucokinase  35.11 
 
 		 327 aa  151  1e-35  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.922063  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2069  glucokinase, ROK family  34.81 
 
 		 315 aa  150  2e-35  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.222452  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1913  ROK family protein  40.58 
 
 		 326 aa  150  3e-35  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.435171  unclonable  0.00000844821 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0887  N-acylmannosamine kinase  31.76 
 
 		 317 aa  148  1.0000000000000001e-34  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2875  ROK domain-containing protein  32.18 
 
 		 303 aa  148  1.0000000000000001e-34  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0985025 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003012  Mlc transcriptional repressor of MalT (the transcriptional activator of maltose regulon) and manXYZ operon  30.87 
 
 		 405 aa  147  2.0000000000000003e-34  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0676  glucokinase  34.49 
 
 		 321 aa  147  2.0000000000000003e-34  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1206  glucokinase  35.2 
 
 		 323 aa  147  2.0000000000000003e-34  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000192168  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0195  glucokinase, ROK family  36.59 
 
 		 317 aa  147  2.0000000000000003e-34  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4339  glucokinase  32.42 
 
 		 316 aa  147  3e-34  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1363  ROK family protein  35.81 
 
 		 314 aa  147  3e-34  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0520337  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1323  ROK family protein  35.81 
 
 		 314 aa  147  3e-34  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000170604  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02870  hypothetical protein  30.87 
 
 		 434 aa  147  3e-34  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2265  ROK  33.12 
 
 		 311 aa  146  4.0000000000000006e-34  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1308  ROK family glucokinase  36.62 
 
 		 313 aa  146  5e-34  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.301963  normal  0.189583 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3430  ROK family protein  30.03 
 
 		 399 aa  145  8.000000000000001e-34  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0920  glucokinase  33.75 
 
 		 323 aa  145  1e-33  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.635044  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2938  glucokinase  33.23 
 
 		 317 aa  145  1e-33  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2378  glucokinase, ROK family  35.31 
 
 		 318 aa  145  1e-33  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1103  ROK family protein  35.11 
 
 		 316 aa  144  2e-33  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.251323  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1141  ROK family protein  33.87 
 
 		 308 aa  144  2e-33  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0752  ROK family protein  30.38 
 
 		 408 aa  144  2e-33  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000087715  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3047  glucokinase, ROK family  35.08 
 
 		 315 aa  143  3e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00154361  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5226  ROK family protein  30.5 
 
 		 321 aa  143  3e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.515111  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15770  glucokinase  37.07 
 
 		 314 aa  143  4e-33  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.137107  normal  0.317496 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1953  ROK family protein  33.85 
 
 		 321 aa  143  4e-33  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.109027  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3275  ROK family protein  32.48 
 
 		 372 aa  143  4e-33  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.545553  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1593  ROK family transcriptional regulator  30.55 
 
 		 405 aa  143  4e-33  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0097  ROK family protein  33.01 
 
 		 319 aa  142  6e-33  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3170  ROK family protein  36.74 
 
 		 314 aa  142  6e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3573  ROK family protein  30.74 
 
 		 299 aa  142  9.999999999999999e-33  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.406671  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2675  ROK family protein  31.77 
 
 		 314 aa  141  9.999999999999999e-33  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.233527  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24860  glucokinase  38.24 
 
 		 313 aa  142  9.999999999999999e-33  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.227158  normal  0.765013 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4867  ROK family protein  29.39 
 
 		 389 aa  142  9.999999999999999e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19960  transcriptional regulator/sugar kinase  35.87 
 
 		 325 aa  140  1.9999999999999998e-32  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.606323  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0894  ROK family protein  30.35 
 
 		 300 aa  140  3e-32  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0259  transcriptional regulator  32.36 
 
 		 336 aa  140  3.9999999999999997e-32  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0273  glucokinase  35.4 
 
 		 361 aa  139  6e-32  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.878639  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0889  glucokinase  37.86 
 
 		 319 aa  139  6e-32  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0217  ROK family protein  30.43 
 
 		 395 aa  139  6e-32  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2459  ROK family protein  33.78 
 
 		 313 aa  139  7e-32  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.0122294  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1089  ROK family protein  34.82 
 
 		 396 aa  139  7.999999999999999e-32  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3649  ROK family protein  33.33 
 
 		 297 aa  138  1e-31  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6210  ROK family protein  32.49 
 
 		 302 aa  138  1e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.115608  normal  0.43177 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1684  ROK family protein  33.22 
 
 		 400 aa  138  1e-31  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3703  ROK family protein  33.33 
 
 		 297 aa  138  1e-31  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.428812  normal  0.261316 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1825  ROK family glucokinase  36.39 
 
 		 323 aa  137  2e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.064318  normal  0.188614 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1566  ROK family protein  33.99 
 
 		 322 aa  137  2e-31  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>