More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_3518 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_3518  Peptidase M23  100 
 
 		 406 aa  800    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.829131  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4752  Peptidase M23  41.22 
 
 		 458 aa  217  2e-55  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.817263  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33100  metalloendopeptidase-like membrane protein  48.26 
 
 		 326 aa  168  2e-40  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.718817 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1283  Peptidase M23  57.48 
 
 		 251 aa  162  1e-38  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1343  Peptidase M23  58.2 
 
 		 320 aa  160  5e-38  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.243109  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4428  Peptidase M23  41.71 
 
 		 272 aa  157  3e-37  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.914132  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4708  peptidase M23B  50.69 
 
 		 360 aa  152  7e-36  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4328  peptidase M23B  50.69 
 
 		 360 aa  152  8.999999999999999e-36  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4414  peptidase M23B  50.69 
 
 		 360 aa  152  8.999999999999999e-36  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.307323  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10968  hypothetical protein  55.12 
 
 		 332 aa  149  9e-35  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.292549 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4510  peptidase M23B  51.39 
 
 		 334 aa  147  3e-34  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1864  peptidase M23B  53.12 
 
 		 351 aa  145  1e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.102724 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5378  peptidase M23B  51.18 
 
 		 339 aa  143  5e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4871  peptidase M23B  52.34 
 
 		 348 aa  140  3e-32  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.289392  normal  0.856578 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5120  Peptidase M23  54.4 
 
 		 288 aa  139  6e-32  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2817  peptidase M23B  46.98 
 
 		 339 aa  139  8.999999999999999e-32  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3705  peptidase M23B  51.61 
 
 		 340 aa  139  1e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6511  Peptidase M23  54.4 
 
 		 224 aa  138  2e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5342  peptidase M23B  50 
 
 		 340 aa  137  4e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.556656  normal  1 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5669  peptidase M23B  50 
 
 		 340 aa  137  4e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04900  metalloendopeptidase-like membrane protein  53.6 
 
 		 235 aa  135  1.9999999999999998e-30  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2895  Peptidase M23  48.95 
 
 		 199 aa  132  1.0000000000000001e-29  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.351071  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2660  Peptidase M23  45.83 
 
 		 245 aa  130  3e-29  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4206  peptidase M23B  50.4 
 
 		 270 aa  129  1.0000000000000001e-28  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00713418 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2270  Peptidase M23  54.31 
 
 		 727 aa  129  1.0000000000000001e-28  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.0000539525  unclonable  0.00000000807187 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2207  Peptidase M23  54.31 
 
 		 727 aa  129  1.0000000000000001e-28  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2089  Peptidase M23  53.78 
 
 		 751 aa  128  2.0000000000000002e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000000000016694 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2345  peptidase M23B  46.83 
 
 		 452 aa  127  3e-28  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000378681  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3326  Peptidase M23  47.24 
 
 		 340 aa  127  3e-28  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0633  Peptidase M23  50.42 
 
 		 198 aa  125  2e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2633  Peptidase M23  49.21 
 
 		 348 aa  124  3e-27  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0598  peptidoglycan-binding LysM  51.24 
 
 		 590 aa  123  5e-27  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  unclonable  0.0000000000165223  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0688  Peptidase M23  45.58 
 
 		 383 aa  123  5e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.50956  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0652  Peptidase M23  49.58 
 
 		 198 aa  122  8e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00716754  normal  0.0927 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1888  Peptidase M23  51.67 
 
 		 511 aa  120  3e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.00000847553  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1340  Peptidase M23  50.82 
 
 		 346 aa  120  3.9999999999999996e-26  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.363221  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14661  M23/M37 familypeptidase  47.86 
 
 		 333 aa  120  3.9999999999999996e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.122507 
 
 
-
 
NC_013167  Cyan8802_4631  Peptidase M23  52.1 
 
 		 195 aa  119  7.999999999999999e-26  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1148  peptidoglycan-binding LysM  33.33 
 
 		 358 aa  119  9.999999999999999e-26  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.766808  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3071  peptidase M23B  27.13 
 
 		 374 aa  119  9.999999999999999e-26  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000167566  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2606  Peptidase M23  53.45 
 
 		 238 aa  118  1.9999999999999998e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0756278  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3195  peptidoglycan-binding LysM  49.14 
 
 		 754 aa  118  1.9999999999999998e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  unclonable  0.000000000999045  decreased coverage  0.00000682898 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4473  peptidase M23B  46.72 
 
 		 491 aa  118  1.9999999999999998e-25  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2510  Peptidase M23  53.45 
 
 		 238 aa  117  3e-25  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.167772  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0246  peptidase M23B  32.79 
 
 		 377 aa  117  3e-25  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3816  peptidase M23B  46.4 
 
 		 283 aa  117  5e-25  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3964  Peptidase M23  38.57 
 
 		 376 aa  116  6e-25  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000173675  hitchhiker  0.00000000427958 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1326  peptidoglycan-binding LysM  38.85 
 
 		 349 aa  115  1.0000000000000001e-24  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.0931152 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4205  peptidase M23B  45.67 
 
 		 236 aa  115  1.0000000000000001e-24  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0068065 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0237  peptidase M23B  48.76 
 
 		 824 aa  115  1.0000000000000001e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.130715 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1347  peptidase M23B  51.26 
 
 		 243 aa  115  2.0000000000000002e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0523113  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1853  peptidase M23B  44.53 
 
 		 446 aa  114  3e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.764932  normal  0.516888 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2974  putative metalopeptidase  44.53 
 
 		 447 aa  114  4.0000000000000004e-24  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1620  peptidase M23B  44.53 
 
 		 447 aa  114  4.0000000000000004e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.629792  normal  0.149773 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4740  Peptidase M23  26.78 
 
 		 377 aa  113  5e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2623  Peptidase M23  43.88 
 
 		 311 aa  113  5e-24  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1858  peptidase M23B  33.64 
 
 		 375 aa  112  9e-24  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.00000000219165  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0539  Peptidase M23  39.33 
 
 		 308 aa  110  3e-23  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0030  Peptidase M23  36.67 
 
 		 445 aa  110  3e-23  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0376  peptidase M23B  44.8 
 
 		 271 aa  110  5e-23  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1176  peptidase M23B  47.11 
 
 		 442 aa  110  6e-23  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0217057  normal  0.4794 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0177  peptidase M23  49.6 
 
 		 298 aa  110  7.000000000000001e-23  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4610  peptidase M23  45.16 
 
 		 788 aa  109  7.000000000000001e-23  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  unclonable  0.0000163265  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6368  Peptidase M23  47.11 
 
 		 269 aa  108  1e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14641  LysM motif-containing protein  46.49 
 
 		 360 aa  108  1e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.318084 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0778  peptidase M23B  45.83 
 
 		 305 aa  108  2e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.484929  normal  0.385643 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2324  metalloendopeptidase-like membrane protein  45.99 
 
 		 321 aa  108  2e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  2.37146e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0734  peptidase M23B  45.83 
 
 		 305 aa  107  3e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.258531  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0190  Peptidase M23  42.06 
 
 		 582 aa  107  3e-22  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0771  Peptidase M23  46.67 
 
 		 305 aa  107  4e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0771  Peptidase M23  46.67 
 
 		 305 aa  107  4e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5984  peptidase M23B  43.09 
 
 		 284 aa  106  7e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0310033  normal  0.0715353 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10980  peptidase M23B  40.43 
 
 		 274 aa  105  1e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000310987  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2596  Peptidase M23  44.44 
 
 		 311 aa  104  2e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2553  Peptidase M23  40.27 
 
 		 323 aa  105  2e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1788  Peptidase M23  30.71 
 
 		 402 aa  105  2e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2905  Peptidase M23  44.07 
 
 		 468 aa  105  2e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04840  peptidase M23B  43.7 
 
 		 419 aa  104  3e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000479397  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4243  Peptidase M23  44.44 
 
 		 311 aa  104  3e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0043  Peptidase M23  40 
 
 		 305 aa  103  4e-21  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.0000000000681555  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2464  Peptidase M23  35.05 
 
 		 231 aa  103  4e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.126719  normal  0.891349 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2753  LysM/M23/M37 peptidase  43.2 
 
 		 363 aa  103  5e-21  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2197  Peptidase M23  44.53 
 
 		 300 aa  103  5e-21  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.927466  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4910  Peptidase M23  43.94 
 
 		 411 aa  103  5e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.401663 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2173  peptidase M23B  43.31 
 
 		 301 aa  103  6e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1867  peptidase, M23/M37 family protein  42.86 
 
 		 441 aa  102  9e-21  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0957526  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0489  Peptidase M23  26.63 
 
 		 404 aa  102  1e-20  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1089  peptidase M23B  45.45 
 
 		 443 aa  102  1e-20  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.156803  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2182  peptidase M23B  38.2 
 
 		 233 aa  102  1e-20  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2905  Peptidase M23  25.36 
 
 		 375 aa  102  1e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0202823  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0188  peptidase M23B  45.31 
 
 		 271 aa  102  1e-20  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.248105  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0888  M24/M37 family peptidase  41.73 
 
 		 427 aa  102  2e-20  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2752  Peptidase M23  34.86 
 
 		 482 aa  102  2e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.76088  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0183  peptidase M23B  40.3 
 
 		 400 aa  101  2e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.956572  normal  0.0114349 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0884  M24/M37 family peptidase  41.73 
 
 		 427 aa  102  2e-20  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1757  peptidase M23B  37.25 
 
 		 309 aa  101  2e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000249073  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2875  Peptidase M23  39.68 
 
 		 282 aa  101  3e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.571881  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2159  Peptidase M23  36.22 
 
 		 299 aa  100  3e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.409272  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0191  M24/M37 family peptidase  25.71 
 
 		 399 aa  101  3e-20  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2406  peptidase M23B  38.93 
 
 		 283 aa  100  3e-20  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000810221  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>