More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Glov_0982 on replicon NC_010814
Organism: Geobacter lovleyi SZ



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010814  Glov_0982  lipoprotein signal peptidase  100 
 
 		 162 aa  327  6e-89  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000103329  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3597  lipoprotein signal peptidase  73.42 
 
 		 161 aa  251  2.0000000000000002e-66  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000941199  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0352  lipoprotein signal peptidase  68.39 
 
 		 162 aa  234  5.0000000000000005e-61  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.947194  normal  0.0144306 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3135  lipoprotein signal peptidase  70.13 
 
 		 160 aa  216  1e-55  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.269423  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3756  lipoprotein signal peptidase  63.7 
 
 		 164 aa  199  9.999999999999999e-51  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4314  lipoprotein signal peptidase  58.75 
 
 		 163 aa  192  2e-48  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00081258  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3649  lipoprotein signal peptidase  62.14 
 
 		 164 aa  179  2e-44  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0184315  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3687  lipoprotein signal peptidase  51.39 
 
 		 164 aa  163  1.0000000000000001e-39  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2454  lipoprotein signal peptidase  48.7 
 
 		 161 aa  157  7e-38  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.996956  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0386  lipoprotein signal peptidase  45.06 
 
 		 178 aa  137  6e-32  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  decreased coverage  0.000832352  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2254  signal peptidase II  43.92 
 
 		 158 aa  127  5.0000000000000004e-29  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0126401  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03029  lipoprotein signal peptidase  45.68 
 
 		 182 aa  127  7.000000000000001e-29  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.810128  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1239  lipoprotein signal peptidase  39.35 
 
 		 165 aa  126  1.0000000000000001e-28  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.261124  normal  0.0513456 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1190  lipoprotein signal peptidase  42.21 
 
 		 160 aa  125  3e-28  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1893  lipoprotein signal peptidase  43.4 
 
 		 202 aa  124  5e-28  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4558  lipoprotein signal peptidase  46.26 
 
 		 171 aa  122  2e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.21418  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0487  lipoprotein signal peptidase  40.38 
 
 		 178 aa  121  5e-27  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11790  lipoprotein signal peptidase  40.65 
 
 		 167 aa  120  9e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2459  lipoprotein signal peptidase  44.9 
 
 		 173 aa  119  9.999999999999999e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.417163  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0711  lipoprotein signal peptidase  46.15 
 
 		 168 aa  120  9.999999999999999e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.395122  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4851  lipoprotein signal peptidase  43.24 
 
 		 170 aa  120  9.999999999999999e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.589527 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5199  lipoprotein signal peptidase  39.47 
 
 		 169 aa  119  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.864833  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2727  lipoprotein signal peptidase  46.26 
 
 		 174 aa  119  1.9999999999999998e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.149763  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0185  lipoprotein signal peptidase  38.96 
 
 		 165 aa  119  1.9999999999999998e-26  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0604  lipoprotein signal peptidase  44.59 
 
 		 176 aa  118  3e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.975545  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1183  signal peptidase II  40 
 
 		 180 aa  118  3e-26  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0645  lipoprotein signal peptidase  44.59 
 
 		 171 aa  118  3e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.11552 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60360  lipoprotein signal peptidase  40.13 
 
 		 169 aa  118  3e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000409977 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2338  lipoprotein signal peptidase  45.58 
 
 		 174 aa  117  3.9999999999999996e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.18883 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0265  lipoprotein signal peptidase  44.74 
 
 		 166 aa  118  3.9999999999999996e-26  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0465894 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0650  lipoprotein signal peptidase  44.9 
 
 		 171 aa  117  6e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.177868 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3217  lipoprotein signal peptidase  41.61 
 
 		 163 aa  117  7.999999999999999e-26  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0969  lipoprotein signal peptidase  38.16 
 
 		 154 aa  116  9.999999999999999e-26  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1352  lipoprotein signal peptidase  41.67 
 
 		 235 aa  116  9.999999999999999e-26  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.136242  normal  0.167028 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1000  lipoprotein signal peptidase  38.16 
 
 		 154 aa  115  1.9999999999999998e-25  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1292  lipoprotein signal peptidase  40.14 
 
 		 176 aa  115  1.9999999999999998e-25  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.107992 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1858  signal peptidase II  41.89 
 
 		 157 aa  115  3e-25  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0954  lipoprotein signal peptidase  41.29 
 
 		 169 aa  114  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.30324 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0807  lipoprotein signal peptidase  46.98 
 
 		 173 aa  113  8.999999999999998e-25  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0581  lipoprotein signal peptidase  40.79 
 
 		 171 aa  113  8.999999999999998e-25  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0620136  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1195  lipoprotein signal peptidase  36.94 
 
 		 176 aa  112  1.0000000000000001e-24  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0349853  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1100  lipoprotein signal peptidase  40.13 
 
 		 170 aa  113  1.0000000000000001e-24  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.955311  normal  0.240164 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0123  lipoprotein signal peptidase  38 
 
 		 153 aa  113  1.0000000000000001e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0839092  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2146  signal peptidase II  37.75 
 
 		 159 aa  113  1.0000000000000001e-24  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.137647  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3587  lipoprotein signal peptidase  41.72 
 
 		 169 aa  112  2.0000000000000002e-24  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2276  lipoprotein signal peptidase  40.13 
 
 		 154 aa  112  2.0000000000000002e-24  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0789  lipoprotein signal peptidase  41.72 
 
 		 169 aa  112  2.0000000000000002e-24  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.56712 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2746  lipoprotein signal peptidase  41.29 
 
 		 176 aa  111  5e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2722  lipoprotein signal peptidase  37.66 
 
 		 182 aa  110  5e-24  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.214135  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3047  signal peptidase II  44.9 
 
 		 164 aa  111  5e-24  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.242579  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3177  lipoprotein signal peptidase  39.74 
 
 		 164 aa  110  7.000000000000001e-24  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3160  lipoprotein signal peptidase  43.33 
 
 		 172 aa  110  7.000000000000001e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.366988  normal  0.0125166 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0699  lipoprotein signal peptidase  42.07 
 
 		 169 aa  110  8.000000000000001e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.390058  normal  0.0603607 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1084  lipoprotein signal peptidase  38.67 
 
 		 170 aa  110  9e-24  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0806  lipoprotein signal peptidase  43.33 
 
 		 172 aa  109  1.0000000000000001e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.699045 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0588  lipoprotein signal peptidase  41.18 
 
 		 168 aa  108  3e-23  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.510976  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0573  lipoprotein signal peptidase  43.33 
 
 		 166 aa  108  3e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00741417 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1459  lipoprotein signal peptidase  41.18 
 
 		 163 aa  108  4.0000000000000004e-23  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.419525 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004418  lipoprotein signal peptidase  41.67 
 
 		 169 aa  107  5e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1688  lipoprotein signal peptidase  40.13 
 
 		 149 aa  107  5e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0549  lipoprotein signal peptidase  42.67 
 
 		 170 aa  107  6e-23  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.380101  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1040  lipoprotein signal peptidase  37.25 
 
 		 155 aa  107  6e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000244755  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3459  lipoprotein signal peptidase  40.4 
 
 		 169 aa  107  8.000000000000001e-23  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0475821  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2555  lipoprotein signal peptidase  36.77 
 
 		 169 aa  106  1e-22  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00974385 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2655  lipoprotein signal peptidase  38.96 
 
 		 160 aa  106  1e-22  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0215  lipoprotein signal peptidase  39.34 
 
 		 171 aa  106  1e-22  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0133386  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1157  lipoprotein signal peptidase  35.71 
 
 		 171 aa  106  1e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.355443 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1117  lipoprotein signal peptidase  42.98 
 
 		 165 aa  105  2e-22  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.149841  normal  0.0706096 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1122  lipoprotein signal peptidase  35.06 
 
 		 171 aa  105  3e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2143  signal peptidase II  40.26 
 
 		 156 aa  105  3e-22  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1814  lipoprotein signal peptidase  37.91 
 
 		 358 aa  105  3e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.344803 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3234  lipoprotein signal peptidase  35.06 
 
 		 171 aa  105  3e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1055  lipoprotein signal peptidase  35.06 
 
 		 171 aa  105  3e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00981  lipoprotein signal peptidase  38.51 
 
 		 168 aa  105  3e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3274  lipoprotein signal peptidase  41.26 
 
 		 171 aa  104  4e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00894133  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5385  lipoprotein signal peptidase  42.07 
 
 		 171 aa  105  4e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.37962 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0925  lipoprotein signal peptidase  36.49 
 
 		 168 aa  104  4e-22  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1060  lipoprotein signal peptidase  35.06 
 
 		 171 aa  104  4e-22  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.189146  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3938  lipoprotein signal peptidase  40.52 
 
 		 152 aa  104  5e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000501111  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3945  lipoprotein signal peptidase  40.52 
 
 		 152 aa  104  5e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000105724  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2542  lipoprotein signal peptidase  40.52 
 
 		 152 aa  104  5e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0674041  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0889  lipoprotein signal peptidase  39.38 
 
 		 170 aa  104  5e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2327  lipoprotein signal peptidase  39.38 
 
 		 170 aa  104  5e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1105  lipoprotein signal peptidase  39.38 
 
 		 170 aa  103  8e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2904  lipoprotein signal peptidase  39.38 
 
 		 170 aa  103  8e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.353036  normal  0.916389 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1606  lipoprotein signal peptidase  39.38 
 
 		 170 aa  103  8e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.322844  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2910  lipoprotein signal peptidase  39.38 
 
 		 170 aa  103  8e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0390  lipoprotein signal peptidase  39.38 
 
 		 170 aa  103  8e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.259079  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0884  lipoprotein signal peptidase  39.38 
 
 		 170 aa  103  8e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.978547 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0472  lipoprotein signal peptidase  39.38 
 
 		 170 aa  103  8e-22  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5353  lipoprotein signal peptidase  38.16 
 
 		 357 aa  103  9e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.00779044  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1431  lipoprotein signal peptidase  44 
 
 		 169 aa  103  1e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1741  lipoprotein signal peptidase  38.56 
 
 		 162 aa  103  1e-21  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3720  lipoprotein signal peptidase  39.22 
 
 		 152 aa  102  2e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00905453  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0769  lipoprotein signal peptidase  40.52 
 
 		 166 aa  102  2e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.63005  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3270  lipoprotein signal peptidase  39.01 
 
 		 173 aa  102  2e-21  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2956  lipoprotein signal peptidase  35.06 
 
 		 170 aa  102  2e-21  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0330316  normal  0.232232 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3038  lipoprotein signal peptidase  35.06 
 
 		 170 aa  102  2e-21  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0554582  normal  0.30778 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3135  lipoprotein signal peptidase  35.06 
 
 		 170 aa  102  2e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0031  lipoprotein signal peptidase  37.33 
 
 		 164 aa  101  3e-21  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.112205  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>