More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU1809 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010730  SYO3AOP1_0091  ATP-dependent metalloprotease FtsH  53.21 
 
 
625 aa  640  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00172576  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4335  ATP-dependent metalloprotease FtsH  60.03 
 
 
640 aa  758  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0962233 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0714  ATP-dependent metalloprotease FtsH  58.4 
 
 
634 aa  726  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.87442  normal  0.0617842 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3474  ATP-dependent metalloprotease  58.24 
 
 
647 aa  734  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  8.79508e-08  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0356  ATP-dependent metalloprotease FtsH  52.93 
 
 
610 aa  652  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0522  ATP-dependent metalloprotease  59.39 
 
 
644 aa  732  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  1.77959e-06  hitchhiker  0.00179189 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3736  ATP-dependent metalloprotease  59.06 
 
 
647 aa  729  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  4.70783e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0087  ATP-dependent metalloprotease FtsH  56.77 
 
 
620 aa  696  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4423  ATP-dependent metalloprotease FtsH  60.43 
 
 
626 aa  707  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.765362 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4719  ATP-dependent metalloprotease FtsH  60.5 
 
 
634 aa  724  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0793  ATP-dependent metalloprotease FtsH  57.82 
 
 
611 aa  707  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  1.70708e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0060  ATP-dependent metalloprotease FtsH  54.41 
 
 
633 aa  650  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4840  ATP-dependent metalloprotease FtsH  60.37 
 
 
642 aa  763  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.199013  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3985  ATP-dependent metalloprotease  58.89 
 
 
647 aa  728  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  6.9949e-10  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1506  ATP-dependent metallopeptidase HflB  61.31 
 
 
647 aa  726  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3568  ATP-dependent metalloprotease FtsH  58.93 
 
 
657 aa  716  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  5.20805e-05  hitchhiker  6.81699e-06 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1268  ATP-dependent metalloprotease FtsH  56.57 
 
 
631 aa  693  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.972429  normal  0.432924 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5386  ATP-dependent metalloprotease FtsH  60.54 
 
 
642 aa  766  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.853585  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0081  FtsH-2 peptidase. Metallo peptidase. MEROPS family M41, membrane protease FtsH catalytic subunit  56.4 
 
 
693 aa  673  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.00746794  normal  0.780653 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00158  cell division protease FtsH  58.55 
 
 
646 aa  689  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2029  ATP-dependent metalloprotease FtsH  57.77 
 
 
628 aa  697  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2862  ATP-dependent metalloprotease FtsH  57.17 
 
 
629 aa  700  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.198246  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3592  ATP-dependent metalloprotease  58.72 
 
 
647 aa  730  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  1.14537e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0879  ATP-dependent metalloprotease FtsH  57.24 
 
 
629 aa  701  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.200568  normal  0.0679699 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3638  ATP-dependent metalloprotease FtsH  61.49 
 
 
640 aa  783  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.229892 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0062  ATP-dependent metalloprotease FtsH  58.91 
 
 
645 aa  705  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.107147  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1186  ATP-dependent metalloprotease FtsH  56.9 
 
 
631 aa  695  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.21079 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0854  ATP-dependent metalloprotease FtsH  55.76 
 
 
621 aa  679  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.946153  normal  0.500418 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2817  ATP-dependent metalloprotease FtsH  59.87 
 
 
634 aa  748  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0074  cell division protein  58.91 
 
 
645 aa  705  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0283  ATP-dependent metalloprotease FtsH  60.71 
 
 
640 aa  768  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0191984 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2023  ATP-dependent metalloprotease FtsH  56.73 
 
 
631 aa  693  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4925  ATP-dependent metalloprotease FtsH  57.36 
 
 
640 aa  727  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.147921  normal  0.185615 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3424  ATP-dependent metalloprotease FtsH  59.1 
 
 
657 aa  714  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  8.53792e-06  decreased coverage  0.000155742 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5471  cell division protein FtsH  60.83 
 
 
642 aa  716  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.809054  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1020  ATP-dependent metalloprotease FtsH  55.87 
 
 
659 aa  664  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  unclonable  2.08375e-06  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2623  ATP-dependent metalloprotease FtsH  60.5 
 
 
645 aa  749  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4361  ATP-dependent metalloprotease FtsH  53.9 
 
 
640 aa  635  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.193811 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4584  ATP-dependent metalloprotease FtsH  58.24 
 
 
634 aa  723  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.794949  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4509  membrane protease FtsH catalytic subunit  58.73 
 
 
652 aa  739  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.112611 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1635  cell division protein FtsH  61.63 
 
 
649 aa  752  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.771629  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0338  ATP-dependent metalloprotease FtsH  53.27 
 
 
610 aa  654  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6874  cell division protein FtsH  60.68 
 
 
638 aa  734  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0972491 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0366  ATP-dependent metalloprotease FtsH  63.36 
 
 
641 aa  771  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.444728  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2734  ATP-dependent metalloprotease FtsH  84.12 
 
 
617 aa  1049  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  9.9937e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0166  cell division protein FtsH  58.63 
 
 
651 aa  729  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  7.21667e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3615  membrane protease FtsH catalytic subunit  59.83 
 
 
640 aa  725  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0280177  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2841  ATP-dependent metalloprotease FtsH  59.03 
 
 
657 aa  713  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  3.56985e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3288  ATP-dependent metalloprotease FtsH  59.1 
 
 
657 aa  714  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  7.87677e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1223  ATP-dependent metalloprotease FtsH  61.46 
 
 
651 aa  751  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.514183  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1115  ATP-dependent metalloprotease FtsH  56.93 
 
 
638 aa  677  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.48117  normal  0.272437 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3044  ATP-dependent metalloprotease FtsH  64.48 
 
 
646 aa  798  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  8.97526e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3067  ATP-dependent metalloprotease FtsH  58.75 
 
 
650 aa  703  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  7.74852e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0483  ATP-dependent metalloprotease  59.73 
 
 
643 aa  732  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  4.99281e-05  normal  0.35106 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3396  microtubule-severing ATPase  59.36 
 
 
659 aa  720  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  5.36506e-06  decreased coverage  4.2164e-05 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3663  ATP-dependent metalloprotease  58.89 
 
 
647 aa  732  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  7.24409e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3370  ATP-dependent metalloprotease  58.89 
 
 
647 aa  732  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  1.23805e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03404  hypothetical protein  59.19 
 
 
658 aa  730  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1440  cell division protein  61.14 
 
 
650 aa  723  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3083  ATP-dependent metalloprotease FtsH  63.13 
 
 
640 aa  758  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.169453  normal  0.477403 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2126  ATP-dependent metalloprotease FtsH  64.2 
 
 
641 aa  773  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.450794 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3602  ATP-dependent metalloprotease  59.56 
 
 
644 aa  729  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  6.83259e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2338  ATP-dependent metalloprotease FtsH  65.82 
 
 
634 aa  783  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0060  ATP-dependent metalloprotease FtsH  53.72 
 
 
639 aa  662  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3612  ATP-dependent metalloprotease  58.71 
 
 
644 aa  726  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.000242003  normal  0.275176 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1076  ATP-dependent metalloprotease FtsH  57.21 
 
 
701 aa  668  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3471  ATP-dependent metalloprotease FtsH  58.13 
 
 
650 aa  730  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00121984  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02994  hypothetical protein  59.39 
 
 
644 aa  732  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  5.35271e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3352  ATP-dependent metalloprotease FtsH  58.89 
 
 
654 aa  733  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  unclonable  8.88182e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1721  ATP-dependent metalloprotease FtsH  57.6 
 
 
628 aa  694  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.54064  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3491  ATP-dependent metalloprotease FtsH  59.75 
 
 
648 aa  743  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.202032  normal  0.0464003 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0064  ATP-dependent metalloprotease FtsH  54.19 
 
 
635 aa  658  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  3.23168e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2624  ATP-dependent metalloprotease FtsH  56.19 
 
 
638 aa  711  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.642505  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42890  ATP-dependent metalloprotease FtsH  60 
 
 
637 aa  721  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0642  ATP-dependent metalloprotease FtsH  57 
 
 
616 aa  658  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1475  ATP-dependent metalloprotease FtsH  57.36 
 
 
639 aa  725  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3627  metalloprotease  60.26 
 
 
681 aa  769  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.840583  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0981  ATP-dependent metalloprotease FtsH  61.47 
 
 
637 aa  768  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.38316  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00580  ATP-dependent metalloprotease FtsH  56.03 
 
 
630 aa  689  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  1.19838e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5491  ATP-dependent metalloprotease FtsH  61.05 
 
 
640 aa  755  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.610912  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0566  ATP-dependent metalloprotease  58.72 
 
 
649 aa  729  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000344177  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1595  ATP-dependent metalloprotease FtsH  83.33 
 
 
612 aa  1058  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0703  ATP-dependent metalloprotease FtsH  61.17 
 
 
650 aa  727  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0142787  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1052  ATP-dependent metalloprotease FtsH  56.47 
 
 
643 aa  686  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0848  ATP-dependent metalloprotease FtsH  60.99 
 
 
630 aa  692  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.810549  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002603  cell division protein FtsH  58.86 
 
 
660 aa  734  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  1.82706e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3548  ATP-dependent metalloprotease FtsH  58.53 
 
 
682 aa  728  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0555196  normal  0.0513542 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1970  ATP-dependent metalloprotease FtsH  61.04 
 
 
656 aa  718  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  7.29584e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0801  ATP-dependent metalloprotease FtsH  58.89 
 
 
651 aa  738  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  unclonable  2.53513e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0062  ATP-dependent metalloprotease FtsH  54.46 
 
 
632 aa  658  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2059  ATP-dependent metalloprotease FtsH  59.93 
 
 
639 aa  694  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1727  ATP-dependent metalloprotease FtsH  68.8 
 
 
636 aa  856  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0229617  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0229  ATP-dependent metalloprotease FtsH  56.17 
 
 
608 aa  664  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0200  ATP-dependent metalloprotease FtsH  55.59 
 
 
602 aa  674  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0400462  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0253  ATP-dependent metalloprotease FtsH  68.39 
 
 
637 aa  871  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0503698  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1916  ATP-dependent metalloprotease FtsH  55.79 
 
 
598 aa  663  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2460  ATP-dependent metalloprotease FtsH  65.32 
 
 
635 aa  786  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1717  ATP-dependent metalloprotease FtsH  65.1 
 
 
676 aa  856  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0145  ATP-dependent metalloprotease FtsH  57.46 
 
 
657 aa  665  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  2.85756e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3654  ATP-dependent metalloprotease  58.56 
 
 
647 aa  732  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.000517371  normal  0.935097 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>