154 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_3074 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012918  GM21_3074  putative signal transduction protein with Nacht domain  100 
 
 		 851 aa  1748    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  4.39797e-24 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0799  putative signal transduction protein with Nacht domain  48.46 
 
 		 549 aa  490  1e-137  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3153  metallophosphoesterase  23.97 
 
 		 1831 aa  85.9  0.000000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.479673  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0552  signal transduction protein  24.46 
 
 		 1004 aa  84  0.00000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2430  putative signal transduction protein with Nacht domain  23.58 
 
 		 911 aa  81.6  0.00000000000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3275  pentapeptide repeat-containing protein  22.35 
 
 		 1474 aa  80.5  0.0000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.918383  normal  0.348051 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0798  pentapeptide repeat protein  25.87 
 
 		 285 aa  78.6  0.0000000000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3846  pentapeptide repeat protein  22.6 
 
 		 1443 aa  75.1  0.000000000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6431  WD-40 repeat protein  25.05 
 
 		 1766 aa  73.2  0.00000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.903065  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0840  ribosome assembly protein 4 (RSA4)  21.39 
 
 		 1868 aa  72  0.00000000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2183  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  24.57 
 
 		 1557 aa  67  0.000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.150849  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2975  WD40 repeatdomain-containing protein-like protein  21.82 
 
 		 1901 aa  66.2  0.000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2000  hypothetical protein  22.8 
 
 		 768 aa  63.5  0.00000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.993463 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3157  pentapeptide repeat protein  36.25 
 
 		 145 aa  61.2  0.00000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.400577  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6261  pentapeptide repeat-containing protein  38.89 
 
 		 433 aa  61.2  0.00000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.559875 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2939  pentapeptide repeat protein  36.25 
 
 		 145 aa  61.2  0.00000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6430  pentapeptide repeat protein  23.25 
 
 		 998 aa  57.4  0.000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0686  pentapeptide repeat-containing protein  33.33 
 
 		 152 aa  56.6  0.000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0322373  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1480  pentapeptide repeat-containing protein  22.64 
 
 		 1807 aa  56.6  0.000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.811465  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_08061  hypothetical protein  29.93 
 
 		 170 aa  56.2  0.000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3427  pentapeptide repeat-containing protein  42.65 
 
 		 367 aa  55.5  0.000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3556  pentapeptide repeat-containing protein  42.65 
 
 		 367 aa  55.5  0.000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2584  pentapeptide repeat protein  36.78 
 
 		 171 aa  55.1  0.000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.14087  normal  0.252585 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3032  putative signal transduction protein with Nacht domain  29.08 
 
 		 1004 aa  55.1  0.000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.00461923  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0318  pentapeptide repeat-containing protein  32.76 
 
 		 452 aa  54.3  0.000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3923  pentapeptide repeat protein  38.16 
 
 		 167 aa  53.9  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0131528  normal  0.35091 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0785  hypothetical protein  30.66 
 
 		 170 aa  53.5  0.00001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.859693  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08391  hypothetical protein  31.39 
 
 		 170 aa  53.9  0.00001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0677  pentapeptide repeat-containing protein  38.89 
 
 		 214 aa  54.3  0.00001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.606696  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3874  pentapeptide repeat protein  38.16 
 
 		 152 aa  53.9  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3994  RDD domain containing protein  38.03 
 
 		 734 aa  53.5  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00412081 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4644  pentapeptide repeat-containing protein  36.56 
 
 		 416 aa  53.1  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1479  pentapeptide repeat protein  33.64 
 
 		 295 aa  53.5  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000330683 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_08371  hypothetical protein  31.39 
 
 		 170 aa  52.8  0.00003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4278  pentapeptide repeat-containing protein  34.48 
 
 		 411 aa  52.8  0.00003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0535647  normal  0.226875 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1212  pentapeptide repeat-containing protein  31.94 
 
 		 420 aa  52.8  0.00003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.643735 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3088  putative signal transduction protein with Nacht domain  28.57 
 
 		 798 aa  52.4  0.00003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2291  hypothetical protein  42.86 
 
 		 365 aa  52  0.00004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0775084 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3044  pentapeptide repeat protein  34.83 
 
 		 253 aa  52.4  0.00004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.157086  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4733  pentapeptide repeat protein  32.99 
 
 		 452 aa  52  0.00004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.832203  decreased coverage  0.00416272 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1222  pentapeptide repeat protein  28.93 
 
 		 331 aa  52.4  0.00004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.154284  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4586  pentapeptide repeat protein  33.71 
 
 		 453 aa  51.6  0.00005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.20747  normal  0.0812819 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4216  pentapeptide repeat-containing protein  33.71 
 
 		 485 aa  51.6  0.00006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0428969  normal  0.525681 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2529  putative signal transduction protein with Nacht domain  28.81 
 
 		 1174 aa  51.6  0.00006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.250967  normal  0.208659 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2179  putative outer membrane adhesin like proteiin  41.03 
 
 		 14916 aa  51.2  0.00008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0195  hypothetical protein  35.06 
 
 		 142 aa  50.8  0.00009  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.673966 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2706  pentapeptide repeat-containing protein  33.33 
 
 		 225 aa  51.2  0.00009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.122087 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6262  pentapeptide repeat-containing protein  37.8 
 
 		 408 aa  51.2  0.00009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.104366  normal  0.857591 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1254  pentapeptide repeat-containing protein  37.5 
 
 		 213 aa  50.8  0.0001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2086  hypothetical protein  36.11 
 
 		 156 aa  50.4  0.0001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2185  pentapeptide repeat-containing protein  31.06 
 
 		 361 aa  50.4  0.0001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.225539 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6284  pentapeptide repeat-containing protein  33.05 
 
 		 381 aa  50.8  0.0001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0810  pentapeptide repeat protein  34.92 
 
 		 149 aa  50.4  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0869  pentapeptide repeat protein  33.71 
 
 		 290 aa  50.8  0.0001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.236368  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0783  pentapeptide repeat protein  34.92 
 
 		 149 aa  50.4  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0019  pentapeptide repeat-containing protein  29.31 
 
 		 292 aa  49.7  0.0002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.400102  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4850  pentapeptide repeat-containing protein  34.72 
 
 		 576 aa  50.1  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00626433 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4963  pentapeptide repeat-containing protein  32 
 
 		 489 aa  49.7  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2563  putative signal transduction protein with Nacht domain  27.34 
 
 		 997 aa  50.1  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.238788  normal  0.0710109 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0271  pentapeptide repeat-containing protein  40 
 
 		 1033 aa  49.7  0.0002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.977531  normal  0.0705059 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1451  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  37.68 
 
 		 525 aa  49.7  0.0002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.137512  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3400  serine/threonine protein kinase  28.37 
 
 		 567 aa  49.7  0.0002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.110331 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2382  pentapeptide repeat protein  36.76 
 
 		 216 aa  50.1  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2987  pentapeptide repeat protein  33.72 
 
 		 130 aa  49.7  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2972  pentapeptide repeat protein  30.49 
 
 		 145 aa  49.7  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0229  pentapeptide repeat protein  34.78 
 
 		 162 aa  50.1  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.584528 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2144  pentapeptide repeat protein  35.16 
 
 		 245 aa  50.1  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.433776 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2558  pentapeptide repeat-containing protein  33.65 
 
 		 312 aa  49.7  0.0002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2836  pentapeptide repeat protein  33.78 
 
 		 368 aa  50.1  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3807  pentapeptide repeat protein  35.71 
 
 		 259 aa  49.3  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1100  pentapeptide repeat-containing protein  32.67 
 
 		 493 aa  49.3  0.0003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.257041  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4082  pentapeptide repeat-containing protein  31.43 
 
 		 189 aa  48.9  0.0004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.492464 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2588  pentapeptide repeat-containing protein  28.46 
 
 		 162 aa  48.9  0.0004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0522  pentapeptide repeat-containing protein  33.33 
 
 		 177 aa  48.9  0.0004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.667231  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4837  pentapeptide repeat-containing protein  29.67 
 
 		 151 aa  48.9  0.0004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  hitchhiker  0.000291889  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3404  pentapeptide repeat protein  32.5 
 
 		 401 aa  48.9  0.0004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.559073  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2699  pentapeptide repeat protein  32.5 
 
 		 401 aa  48.9  0.0004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3090  hypothetical protein  31.43 
 
 		 362 aa  48.5  0.0005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0391882  normal  0.0374194 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0521  pentapeptide repeat-containing protein  28.21 
 
 		 418 aa  48.5  0.0005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0577  hypothetical protein  32.94 
 
 		 961 aa  48.1  0.0006  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_09851  hypothetical protein  29.91 
 
 		 169 aa  48.1  0.0006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.176778 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4879  pentapeptide repeat-containing protein  25.19 
 
 		 657 aa  48.5  0.0006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.511853 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3570  signal transduction protein  27.27 
 
 		 783 aa  48.1  0.0007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1748  hypothetical protein  37.68 
 
 		 310 aa  48.1  0.0007  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26580  Pentapeptide repeat protein  35.56 
 
 		 872 aa  48.1  0.0007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1012  pentapeptide repeat protein  29 
 
 		 309 aa  48.1  0.0008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0736311 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5846  hypothetical protein  28.68 
 
 		 727 aa  47.8  0.0008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.909355 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1826  hypothetical protein  27.01 
 
 		 1094 aa  47.8  0.001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2678  pentapeptide repeat-containing protein  30.85 
 
 		 168 aa  47  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2751  putative signal transduction protein with Nacht domain protein  28.15 
 
 		 942 aa  47.8  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0360  pentapeptide repeat protein  30.77 
 
 		 191 aa  47.4  0.001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1239  pentapeptide repeat-containing protein  31.62 
 
 		 493 aa  47  0.001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.101838  normal  0.0181716 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0563  pentapeptide repeat-containing protein  35.71 
 
 		 386 aa  47.4  0.001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.643792 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2015  pentapeptide repeat-containing protein  34.04 
 
 		 447 aa  47  0.002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.869172  normal  0.493444 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6493  pentapeptide repeat protein  29.2 
 
 		 204 aa  46.6  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.364584  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2937  hypothetical protein  33.33 
 
 		 393 aa  46.6  0.002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.807989  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2498  signal transduction protein  23.95 
 
 		 1349 aa  46.2  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1259  pentapeptide repeat-containing protein  40.85 
 
 		 452 aa  46.2  0.002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.563551  hitchhiker  0.00447434 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0198  pentapeptide repeat-containing protein  30.43 
 
 		 862 aa  46.6  0.002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.726788  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4536  pentapeptide repeat protein  32.99 
 
 		 184 aa  46.6  0.002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.339065 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>