More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_4323 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009338  Mflv_2483  hypothetical protein  60.18 
 
 		 548 aa  653    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.207424 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3705  hypothetical protein  60.77 
 
 		 550 aa  649    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.724372  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4323  hypothetical protein  100 
 
 		 541 aa  1101    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.51495 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4171  hypothetical protein  60.11 
 
 		 548 aa  647    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3692  hypothetical protein  60.66 
 
 		 550 aa  649    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3765  hypothetical protein  60.66 
 
 		 550 aa  649    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.981168 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4108  diterpenoid dioxygenase  47.44 
 
 		 397 aa  341  2e-92  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.742638  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6832  DitF protein  46.02 
 
 		 396 aa  309  5.9999999999999995e-83  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0906  hypothetical protein  43.69 
 
 		 394 aa  307  3e-82  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  hitchhiker  0.00747371  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0581  hypothetical protein  42.82 
 
 		 395 aa  303  4.0000000000000003e-81  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0835832  normal  0.505436 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1902  hypothetical protein  42.09 
 
 		 396 aa  303  4.0000000000000003e-81  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.986081  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4716  DitF protein  44.68 
 
 		 453 aa  303  5.000000000000001e-81  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.300284 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3310  hypothetical protein  44.59 
 
 		 393 aa  297  3e-79  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.408434 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0900  hypothetical protein  42.38 
 
 		 389 aa  281  2e-74  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.049177  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4492  hypothetical protein  37.15 
 
 		 385 aa  222  1.9999999999999999e-56  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3651  Acetyl-CoA acetyltransferase-like protein  35.73 
 
 		 387 aa  206  6e-52  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.48348  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4021  putative nonspecific lipid-transfer protein  35.08 
 
 		 378 aa  205  2e-51  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8194  lipid-transfer protein  35.46 
 
 		 390 aa  199  7.999999999999999e-50  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3479  lipid-transfer protein  34.59 
 
 		 391 aa  187  4e-46  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0063  lipid-transfer protein  33.16 
 
 		 390 aa  185  2.0000000000000003e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0887  lipid-transfer protein  33.58 
 
 		 390 aa  185  2.0000000000000003e-45  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2141  lipid-transfer protein  31.11 
 
 		 392 aa  182  2e-44  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.219592  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4632  acetyl-CoA acetyltransferase  33.76 
 
 		 402 aa  181  2e-44  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3858  hypothetical protein  34.61 
 
 		 390 aa  179  9e-44  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.198117  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2093  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  34.68 
 
 		 385 aa  178  2e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.773617  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0511  lipid-transfer protein  35.12 
 
 		 389 aa  176  7e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3512  thiolase  32.9 
 
 		 390 aa  174  3.9999999999999995e-42  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8761  lipid-transfer protein  32.76 
 
 		 385 aa  174  3.9999999999999995e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.134204 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2786  lipid-transfer protein  33.51 
 
 		 394 aa  173  5.999999999999999e-42  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.143685  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4266  hypothetical protein  32.81 
 
 		 381 aa  173  6.999999999999999e-42  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.804759  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2361  lipid-transfer protein  34.27 
 
 		 394 aa  171  3e-41  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0692288 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0177  thiolase  34.55 
 
 		 403 aa  171  5e-41  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.96187  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3321  lipid-transfer protein  33.68 
 
 		 389 aa  169  1e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0828492  hitchhiker  0.000989049 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13573  lipid-transfer protein  31.88 
 
 		 386 aa  168  2e-40  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000077821 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51190  thiolase  33.94 
 
 		 383 aa  168  2e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000113364 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0129  thiolase  33.67 
 
 		 402 aa  166  1.0000000000000001e-39  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0147  thiolase  33.67 
 
 		 402 aa  166  1.0000000000000001e-39  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2016  lipid-transfer protein  32.07 
 
 		 388 aa  162  2e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.314529  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0233  putative thiolase  34.87 
 
 		 388 aa  161  2e-38  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4368  thiolase  33.5 
 
 		 383 aa  160  4e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.739547  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2621  lipid-transfer protein  32.57 
 
 		 395 aa  160  5e-38  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  decreased coverage  0.000528338  normal  0.352624 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2819  lipid-transfer protein  32.82 
 
 		 389 aa  160  7e-38  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00992918 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0860  putative thiolase  34.03 
 
 		 384 aa  159  1e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.016172  normal  0.461503 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5253  lipid-transfer protein  31.74 
 
 		 385 aa  157  5.0000000000000005e-37  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.509405 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0617  DitF protein  33.7 
 
 		 400 aa  157  6e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.206422  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1513  lipid-transfer protein  31.49 
 
 		 385 aa  156  1e-36  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5279  thiolase  32.69 
 
 		 385 aa  155  2e-36  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4625  thiolase  32.98 
 
 		 390 aa  155  2e-36  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5057  lipid-transfer protein  30.4 
 
 		 385 aa  154  5e-36  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4758  lipid-transfer protein  30.9 
 
 		 385 aa  152  1e-35  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.5694  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4672  lipid-transfer protein  30.9 
 
 		 385 aa  152  1e-35  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.495157  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0554  putative nonspecific lipid-transfer protein  36.51 
 
 		 388 aa  152  2e-35  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5776  thiolase  33.14 
 
 		 393 aa  151  2e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.158542  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1670  putative nonspecific lipid-transfer protein  36.68 
 
 		 388 aa  152  2e-35  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1643  putative nonspecific lipid-transfer protein  36.68 
 
 		 388 aa  152  2e-35  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0636  putative nonspecific lipid-transfer protein  36.51 
 
 		 388 aa  152  2e-35  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.962067  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1694  putative nonspecific lipid-transfer protein  36.68 
 
 		 388 aa  152  2e-35  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4071  thiolase  33.79 
 
 		 382 aa  150  5e-35  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.197027  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2581  thiolase  30.35 
 
 		 385 aa  149  1.0000000000000001e-34  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0313462 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5643  putative nonspecific lipid-transfer protein  35.98 
 
 		 388 aa  149  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5454  putative nonspecific lipid-transfer protein  35.71 
 
 		 388 aa  147  3e-34  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.839799  normal  1 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5851  putative nonspecific lipid-transfer protein  35.71 
 
 		 388 aa  147  3e-34  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0314395  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5111  thiolase  32.37 
 
 		 390 aa  147  6e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0000299159  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6629  thiolase  33.61 
 
 		 381 aa  147  6e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.023971  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1803  putative nonspecific lipid-transfer protein  32.32 
 
 		 389 aa  145  2e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.851643 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4055  putative nonspecific lipid-transfer protein  31.56 
 
 		 397 aa  143  8e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0205444  normal  0.64672 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2103  Acetyl-CoA acetyltransferase-like protein  30.49 
 
 		 384 aa  143  8e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.655505  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4062  putative thiolase  32.9 
 
 		 383 aa  142  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5302  putative nonspecific lipid-transfer protein  32.25 
 
 		 388 aa  140  6e-32  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.739228 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1835  lipid-transfer protein  30.42 
 
 		 381 aa  139  1e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.722448  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2044  acetyl-CoA acetyltransferase-like protein  30.61 
 
 		 360 aa  139  1e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0529  putative nonspecific lipid-transfer protein  35.98 
 
 		 388 aa  139  2e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.384509  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2839  hypothetical protein  31.5 
 
 		 388 aa  139  2e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00983373  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2277  thiolase  31.11 
 
 		 383 aa  136  9.999999999999999e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.573629 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5255  thiolase  30.59 
 
 		 389 aa  135  1.9999999999999998e-30  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0342  thiolase  32.65 
 
 		 381 aa  134  3.9999999999999996e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.516645  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1903  hypothetical protein  50 
 
 		 132 aa  133  6.999999999999999e-30  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.539737  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0905  hypothetical protein  50.39 
 
 		 135 aa  133  7.999999999999999e-30  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  hitchhiker  0.00718711  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6845  thiolase  31.99 
 
 		 383 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0582  hypothetical protein  48.82 
 
 		 137 aa  132  2.0000000000000002e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00877368  normal  0.438267 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2336  Propanoyl-CoA C-acyltransferase  31.04 
 
 		 382 aa  129  1.0000000000000001e-28  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0899  lipid-transfer protein  31.23 
 
 		 389 aa  129  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1074  thiolase  31.04 
 
 		 384 aa  127  4.0000000000000003e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2009  hypothetical protein  29.44 
 
 		 380 aa  127  7e-28  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.992719  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0352  hypothetical protein  29.89 
 
 		 386 aa  124  4e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000477716  decreased coverage  0.0000013738 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5499  acetyl-CoA acetyltransferase  29 
 
 		 391 aa  124  5e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3254  putative thiolase/acetyl-CoA acetyltransferase  30.9 
 
 		 394 aa  123  7e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.146846  normal  0.511595 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5553  hypothetical protein  28.38 
 
 		 383 aa  122  1.9999999999999998e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1496  hypothetical protein  30.29 
 
 		 390 aa  120  3.9999999999999996e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.770654  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2931  hypothetical protein  28.96 
 
 		 379 aa  121  3.9999999999999996e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0844  thiolase  32.76 
 
 		 384 aa  120  3.9999999999999996e-26  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4017  hypothetical protein  42.86 
 
 		 155 aa  120  7e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.188869  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1335  hypothetical protein  28.88 
 
 		 391 aa  120  7.999999999999999e-26  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0339  acetyl-CoA acetyltransferase  29.12 
 
 		 388 aa  119  9e-26  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00626565  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0899  hypothetical protein  44.62 
 
 		 131 aa  120  9e-26  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.312493  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4180  putative acetyl-CoA C-acetyltransferase  29.23 
 
 		 394 aa  119  9.999999999999999e-26  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.785914  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3311  hypothetical protein  44.53 
 
 		 135 aa  118  1.9999999999999998e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.367067 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3401  Acetyl-CoA acetyltransferase-like protein  32.38 
 
 		 380 aa  119  1.9999999999999998e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0771846 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4152  acetyl-CoA acetyltransferase  30.25 
 
 		 389 aa  118  3e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.500938  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3540  hypothetical protein  28.66 
 
 		 392 aa  118  3e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.101585 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>