More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_3933 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_3933  GntR family transcriptional regulator  100 
 
 		 282 aa  562  1.0000000000000001e-159  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.903638  decreased coverage  0.00636181 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2517  transcriptional regulator, GntR family  52.78 
 
 		 235 aa  206  5e-52  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0375758  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2514  transcriptional regulator, GntR family  46.15 
 
 		 273 aa  191  9e-48  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00436634  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4183  regulatory protein GntR HTH  40.79 
 
 		 222 aa  102  7e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10042  GntR family transcriptional regulator  30.33 
 
 		 244 aa  95.5  8e-19  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4638  transcriptional regulator, GntR family  33.33 
 
 		 258 aa  95.1  1e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0859  regulatory protein GntR, HTH  31 
 
 		 217 aa  94.4  2e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.774142  decreased coverage  0.0091053 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3493  GntR family transcriptional regulator  37.22 
 
 		 270 aa  90.9  2e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.671641 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6046  regulatory protein GntR, HTH  33.72 
 
 		 221 aa  87.8  2e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.122122  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3752  GntR family transcriptional regulator  39.26 
 
 		 211 aa  85.1  0.000000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.10635  normal  0.669748 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4602  GntR family transcriptional regulator  33.15 
 
 		 229 aa  84  0.000000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.933486 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5382  GntR family transcriptional regulator  31.17 
 
 		 220 aa  81.6  0.00000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.180969  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5471  GntR family transcriptional regulator  31.17 
 
 		 220 aa  81.6  0.00000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.969771  normal  0.33272 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5758  GntR family transcriptional regulator  31.17 
 
 		 220 aa  80.9  0.00000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.470153  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2509  GntR family transcriptional regulator  31.71 
 
 		 211 aa  80.9  0.00000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0825913 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2970  GntR family transcriptional regulator  35 
 
 		 229 aa  80.1  0.00000000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3370  GntR family transcriptional regulator  34.62 
 
 		 235 aa  79.3  0.00000000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1538  transcriptional regulator, GntR family  36.31 
 
 		 242 aa  78.2  0.0000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0494418 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0341  transcriptional regulator, GntR family  35.38 
 
 		 217 aa  77  0.0000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.220517  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3548  transcriptional regulator  32.28 
 
 		 221 aa  77  0.0000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3717  transcriptional regulator  32.28 
 
 		 221 aa  77  0.0000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.531066  normal  0.297823 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4582  GntR family transcriptional regulator  37.06 
 
 		 213 aa  76.6  0.0000000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.971723  hitchhiker  0.000691576 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3620  transcriptional regulator  32.28 
 
 		 221 aa  76.6  0.0000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0556349  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3549  transcriptional regulator  32.28 
 
 		 221 aa  76.6  0.0000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3655  transcriptional regulator  32.28 
 
 		 221 aa  76.6  0.0000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1495  regulatory protein GntR HTH  33.7 
 
 		 231 aa  75.9  0.0000000000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.635233  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7582  GntR family transcriptional regulator  34.31 
 
 		 234 aa  75.9  0.0000000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5212  GntR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 219 aa  75.5  0.0000000000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0902392  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5647  GntR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 219 aa  75.5  0.0000000000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0508113  normal  0.188641 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2099  transcriptional regulator, GntR family  31.41 
 
 		 245 aa  75.5  0.000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.386507  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4755  transcriptional regulator, GntR family  37.25 
 
 		 227 aa  73.9  0.000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0037  GntR family transcriptional regulator  35.04 
 
 		 213 aa  73.9  0.000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8557  transcriptional regulator, GntR family  35.37 
 
 		 217 aa  73.6  0.000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0013  GntR domain protein  34.46 
 
 		 218 aa  73.9  0.000000000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.913161  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5651  transcriptional regulator, GntR family  30.77 
 
 		 219 aa  72.8  0.000000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0870438  normal  0.299655 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2789  GntR family transcriptional regulator  32.93 
 
 		 219 aa  72.8  0.000000000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000064922  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0062  GntR family transcriptional regulator  31.54 
 
 		 234 aa  72.4  0.000000000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3671  GntR family transcriptional regulator  29.21 
 
 		 247 aa  72.4  0.000000000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.483393  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4297  transcriptional regulator, GntR family  36.03 
 
 		 232 aa  72.4  0.000000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.535178  normal  0.743699 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0526  transcriptional regulator, GntR family  28.34 
 
 		 231 aa  72  0.000000000009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000481506  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4161  GntR family transcriptional regulator  31.78 
 
 		 235 aa  72  0.000000000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3523  GntR family transcriptional regulator  46.99 
 
 		 239 aa  71.6  0.00000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0140617  normal  0.356265 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5088  GntR family transcriptional regulator  34.27 
 
 		 260 aa  72  0.00000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.104666  normal  0.0604229 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1517  transcriptional regulator, GntR family  36.62 
 
 		 225 aa  70.9  0.00000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.156852  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1522  GntR family transcriptional regulator  29.01 
 
 		 267 aa  71.2  0.00000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.383522 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4799  transcriptional regulator, GntR family  39.31 
 
 		 233 aa  71.2  0.00000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.197176 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2090  GntR family transcriptional regulator  39 
 
 		 222 aa  70.9  0.00000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.047228  normal  0.700914 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2707  GntR family transcriptional regulator  29.13 
 
 		 223 aa  70.9  0.00000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.755904  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5092  GntR family transcriptional regulator  32.47 
 
 		 217 aa  70.9  0.00000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00344916 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1565  GntR family transcriptional regulator  37.38 
 
 		 215 aa  70.5  0.00000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.440624 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4456  GntR family transcriptional regulator  37.1 
 
 		 213 aa  70.9  0.00000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0602  GntR family transcriptional regulator  29.67 
 
 		 220 aa  70.1  0.00000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0180782  normal  0.364212 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4345  GntR family transcriptional regulator  27.81 
 
 		 230 aa  70.1  0.00000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.49969 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5139  GntR family transcriptional regulator  28.29 
 
 		 242 aa  69.7  0.00000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.911419  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2126  transcriptional regulator, GntR family  37.84 
 
 		 215 aa  69.3  0.00000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.199216  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4252  GntR family transcriptional regulator  29.27 
 
 		 241 aa  69.3  0.00000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3487  transcriptional regulator, GntR family  36.29 
 
 		 223 aa  69.3  0.00000000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1843  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 257 aa  68.9  0.00000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0747919 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4050  GntR family transcriptional regulator  35.56 
 
 		 230 aa  68.9  0.00000000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6960  transcriptional regulator, GntR family  28.7 
 
 		 241 aa  68.2  0.0000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1619  transcriptional regulator, GntR family  41.75 
 
 		 221 aa  68.6  0.0000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00167189  hitchhiker  0.000000109727 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3397  GntR family transcriptional regulator  43.68 
 
 		 211 aa  68.6  0.0000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.00851285  normal  0.427162 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0874  transcriptional regulator, GntR family  28.75 
 
 		 226 aa  67.8  0.0000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.917982  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4366  GntR family transcriptional regulator  28.99 
 
 		 222 aa  67.8  0.0000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0992  transcriptional regulator, GntR family  41.84 
 
 		 223 aa  68.2  0.0000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2160  GntR family transcriptional regulator  29.73 
 
 		 211 aa  67.8  0.0000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0507248  normal  0.384122 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4449  GntR family transcriptional regulator  27.7 
 
 		 241 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00199071  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003675  predicted regulator PutR for proline utilization GntR family  37.5 
 
 		 224 aa  68.2  0.0000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3134  regulatory protein GntR HTH  33.15 
 
 		 238 aa  68.2  0.0000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.998254  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0606  GntR family transcriptional regulator  33.64 
 
 		 223 aa  68.2  0.0000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1848  transcriptional regulator, GntR family  41.67 
 
 		 211 aa  67.8  0.0000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2384  GntR family transcriptional regulator  31.39 
 
 		 211 aa  67.8  0.0000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1076  GntR family transcriptional regulator  41.84 
 
 		 223 aa  68.2  0.0000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2039  GntR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 211 aa  67.8  0.0000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1015  GntR family transcriptional regulator  29.79 
 
 		 228 aa  67.4  0.0000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.354271  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1887  GntR family transcriptional regulator  31.72 
 
 		 219 aa  67  0.0000000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.000514659  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4119  GntR family transcriptional regulator  29.55 
 
 		 258 aa  67  0.0000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.260522  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2365  GntR family transcriptional regulator  36.67 
 
 		 223 aa  67.4  0.0000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.0000000273195  normal  0.0972309 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0957  GntR family transcriptional regulator  29.79 
 
 		 228 aa  67.4  0.0000000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4086  transcriptional regulator, GntR family  34.38 
 
 		 231 aa  67  0.0000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.129918 
 
 
-
 
NC_004310  BR1961  GntR family transcriptional regulator  31.72 
 
 		 227 aa  67  0.0000000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0634218  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6398  transcriptional regulator, GntR family  37.78 
 
 		 215 aa  66.6  0.0000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3323  transcriptional regulator  34.26 
 
 		 226 aa  67  0.0000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0988  transcriptional regulator, GntR family  32.42 
 
 		 227 aa  66.2  0.0000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4353  GntR family transcriptional regulator  29.24 
 
 		 290 aa  66.6  0.0000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4931  GntR family transcriptional regulator  44.32 
 
 		 231 aa  66.2  0.0000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.558054  hitchhiker  0.000443766 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2579  GntR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 346 aa  66.2  0.0000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.252259  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B3002  GntR family transcriptional regulator  28.29 
 
 		 241 aa  66.2  0.0000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  2.78265e-16  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4142  GntR family transcriptional regulator  43.75 
 
 		 222 aa  65.9  0.0000000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.209682  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3021  GntR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 234 aa  65.9  0.0000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.222763 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3784  GntR family transcriptional regulator  29.15 
 
 		 222 aa  65.9  0.0000000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.142846  normal  0.227758 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4822  transcriptional regulator, GntR family  32.65 
 
 		 257 aa  65.9  0.0000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00147753  normal  0.0149979 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4650  regulatory protein GntR HTH  30.77 
 
 		 230 aa  65.1  0.000000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.272173  normal  0.380465 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1421  GntR family transcriptional regulator  37.72 
 
 		 217 aa  65.1  0.000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00674258  normal  0.128717 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4083  GntR domain protein  31.25 
 
 		 222 aa  64.7  0.000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2175  transcriptional regulator, GntR family  29.57 
 
 		 223 aa  65.5  0.000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000546644  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5113  transcriptional regulator, GntR family  26.76 
 
 		 230 aa  64.3  0.000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0844169  normal  0.823532 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0104  GntR family transcriptional regulator  36.51 
 
 		 251 aa  64.3  0.000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.99437  normal  0.215217 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4842  transcriptional regulator, GntR family  34.57 
 
 		 230 aa  64.3  0.000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.283505  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1978  GntR family transcriptional regulator  27.67 
 
 		 222 aa  64.7  0.000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>