More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_0731 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_0731  glycosyl transferase, group 1  100 
 
 		 397 aa  766    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.238036 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5882  glycosyl transferase group 1  68.54 
 
 		 405 aa  456  1e-127  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.72005 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4092  glycosyl transferase group 1  58.06 
 
 		 359 aa  394  1e-108  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0732  group 1 glycosyl transferase  58.57 
 
 		 358 aa  384  1e-105  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0243925 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2522  glycosyl transferase  56.67 
 
 		 364 aa  378  1e-103  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.810552  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3774  glycosyl transferase group 1  56.17 
 
 		 372 aa  372  1e-102  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.291858  normal  0.904998 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1369  Glycosyltransferase-like protein  55.19 
 
 		 357 aa  365  1e-100  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.473124  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3865  glycosyl transferase group 1  47.47 
 
 		 666 aa  245  9e-64  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00141274 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2571  glycosyl transferase group 1  38.92 
 
 		 386 aa  207  2e-52  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0582  glycosyl transferase group 1  26.87 
 
 		 374 aa  187  3e-46  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.838889  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0395  glycosyl transferase group 1  27.02 
 
 		 378 aa  185  2.0000000000000003e-45  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.988234  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3353  glycosyl transferase group 1  35.23 
 
 		 381 aa  183  4.0000000000000006e-45  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.207762  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2715  glycosyl transferase group 1  35.99 
 
 		 375 aa  162  7e-39  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3116  glycosyl transferase group 1  28.21 
 
 		 377 aa  155  2e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.304233 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3942  glycosyl transferase group 1  33.6 
 
 		 395 aa  153  5e-36  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.484579  normal  0.520896 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1104  glycosyl transferase, group 1  33.69 
 
 		 396 aa  150  5e-35  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0552505  hitchhiker  0.00694846 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2856  glycosyl transferase, group 1  28.43 
 
 		 388 aa  115  2.0000000000000002e-24  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.258995 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2306  glycosyl transferase group 1  28.07 
 
 		 379 aa  114  2.0000000000000002e-24  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.455622  normal  0.0637665 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2442  glycosyl transferase, group 1  29.61 
 
 		 382 aa  112  1.0000000000000001e-23  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0168  glycosyl transferase  33.33 
 
 		 374 aa  110  3e-23  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.627515 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1868  glycosyl transferase  29.44 
 
 		 375 aa  109  7.000000000000001e-23  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0255  glycosyl transferase group 1  31.34 
 
 		 358 aa  109  8.000000000000001e-23  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2282  glycosyl transferase group 1  30.73 
 
 		 381 aa  104  3e-21  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.823032  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0241  lipopolysaccharide transferase family protein  24.82 
 
 		 384 aa  95.9  1e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2075  glycosyl transferase group 1  27.85 
 
 		 381 aa  94.4  4e-18  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0723  glycosyltransferase-like protein  38.1 
 
 		 396 aa  91.7  2e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5248  glycosyl transferase, group 1  39.44 
 
 		 393 aa  88.6  2e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.663702 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6234  glycosyl transferase group 1  42.48 
 
 		 366 aa  88.2  2e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.130468  normal  0.465121 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1080  glycosyl transferase group 1  32.2 
 
 		 394 aa  86.7  7e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.184829  normal  0.928063 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1498  glycosyl transferase, group 1  40.29 
 
 		 392 aa  86.7  8e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6430  glycosyl transferase group 1  40.26 
 
 		 366 aa  84.3  0.000000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.706841  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1996  glycosyl transferase group 1  35.25 
 
 		 364 aa  80.1  0.00000000000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.55506 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3694  glycosyl transferase, group 1  40.43 
 
 		 401 aa  79.7  0.00000000000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.414804 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4841  glycosyl transferase, group 1  31.34 
 
 		 374 aa  78.6  0.0000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.000142373  normal  0.0561788 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2909  glycosyl transferase, group 1  36.92 
 
 		 362 aa  75.5  0.000000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0250  glycosyl transferase, group 1  38.24 
 
 		 374 aa  74.3  0.000000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.430935  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0847  glycosyl transferase, group 1  29.92 
 
 		 370 aa  72.4  0.00000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.531187 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2015  glycosyl transferase, group 1  28.4 
 
 		 382 aa  71.6  0.00000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2249  glycosyl transferase group 1  36.73 
 
 		 423 aa  71.6  0.00000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.143292  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3693  glycosyl transferase, group 1  42.45 
 
 		 371 aa  72  0.00000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.419352 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2797  glycosyl transferase group 1  37.07 
 
 		 396 aa  71.6  0.00000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00591651  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1891  glycosyl transferase group 1  42.86 
 
 		 382 aa  70.9  0.00000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0253  glycosyl transferase, group 1  31.84 
 
 		 358 aa  70.9  0.00000000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1751  glycosyl transferase group 1  38.36 
 
 		 453 aa  70.9  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2638  glycosyl transferase group 1  38.89 
 
 		 367 aa  70.1  0.00000000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0400002  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0833  glycosyl transferase group 1  40.56 
 
 		 415 aa  69.7  0.00000000007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0458  glycosyl transferase group 1  33.71 
 
 		 447 aa  69.7  0.00000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0095  glycosyl transferase group 1  33.33 
 
 		 378 aa  68.9  0.0000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.844499 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0080  glycosyl transferase group 1  34.71 
 
 		 404 aa  68.6  0.0000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0676  glycosyl transferase, group 1  37.68 
 
 		 396 aa  68.6  0.0000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.063849  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3926  glucosyltransferase  36.31 
 
 		 411 aa  68.6  0.0000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0880  glycosyl transferase group 1  38.1 
 
 		 376 aa  67.8  0.0000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0960108 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0868  glycosyl transferase group 1  33.71 
 
 		 419 aa  67  0.0000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1839  glycosyl transferase group 1  29.97 
 
 		 362 aa  67  0.0000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3700  glycosyl transferase group 1  35.98 
 
 		 373 aa  67  0.0000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.24149 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2780  glycosyl transferase, group 1  30.16 
 
 		 425 aa  66.6  0.0000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.301884  normal  0.66542 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4448  glycosyl transferase, group 1  40.17 
 
 		 428 aa  66.2  0.0000000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1118  group 1 glycosyltransferase  30.16 
 
 		 425 aa  66.2  0.000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.48856  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0914  glycosyl transferase, group 1  29.79 
 
 		 370 aa  65.1  0.000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1753  glycosyl transferase group 1  26.71 
 
 		 359 aa  65.1  0.000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.908553  decreased coverage  0.00756127 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1843  glycosyl transferase group 1  41.1 
 
 		 396 aa  65.1  0.000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0516  glycosyl transferase group 1  36.96 
 
 		 360 aa  65.1  0.000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.192039  normal  0.814109 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3429  glycosyl transferase group 1  32.97 
 
 		 440 aa  65.1  0.000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2548  glycosyl transferase, group 1  29.08 
 
 		 367 aa  64.7  0.000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.742963  normal  0.196776 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7048  putative O-antigen export system permease protein  30.67 
 
 		 638 aa  64.7  0.000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3532  glycosyl transferase group 1  39.68 
 
 		 428 aa  64.7  0.000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00173558  normal  0.0189831 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2747  glycosyl transferase group 1  39.51 
 
 		 381 aa  63.9  0.000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000000175186  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1547  glycosyl transferase, group 1  27.88 
 
 		 397 aa  63.9  0.000000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.104847  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0675  glycosyl transferase, group 1  30.92 
 
 		 376 aa  63.5  0.000000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.102281  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1042  glycosyl transferase, group 1  36.16 
 
 		 378 aa  63.5  0.000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2749  glycosyl transferase group 1  43.84 
 
 		 344 aa  63.2  0.000000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.611394  hitchhiker  0.00344637 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8172  glycosyl transferase group 1  40.13 
 
 		 356 aa  63.2  0.000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3411  glycosyl transferase, group 1  33.55 
 
 		 425 aa  63.2  0.000000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00000000163553  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6091  glycosyl transferase group 1  39.42 
 
 		 384 aa  62.4  0.00000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.594629  decreased coverage  0.00114888 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0892  glycosyl transferase group 1  36.84 
 
 		 379 aa  62.8  0.00000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.71794  decreased coverage  0.00056914 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4332  glycosyl transferase group 1  32.41 
 
 		 390 aa  62.8  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.112045 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0797  glycosyl transferase group 1  30.97 
 
 		 441 aa  62.4  0.00000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.926616  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0407  glycosyl transferase group 1  42.86 
 
 		 750 aa  62.4  0.00000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1171  glycosyl transferase group 1  36.62 
 
 		 366 aa  62.8  0.00000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.059053 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3107  glycosyl transferase, group 1  34.42 
 
 		 452 aa  62.8  0.00000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02010  glycosyltransferase  37.3 
 
 		 389 aa  62.4  0.00000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.472903  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7902  glycosyltransferase  42.47 
 
 		 406 aa  62.4  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4272  glycosyl transferase group 1  32.41 
 
 		 390 aa  61.6  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5286  glycosyl transferase group 1  34.97 
 
 		 409 aa  61.6  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2938  glycosyl transferase, group 1  38.89 
 
 		 351 aa  61.6  0.00000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3891  glycosyl transferase group 1  37.69 
 
 		 377 aa  61.6  0.00000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.14972  normal  0.743624 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0898  hypothetical protein  36.84 
 
 		 407 aa  61.2  0.00000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1673  glycosyl transferase group 1  31.8 
 
 		 411 aa  61.2  0.00000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.272276 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0503  putative glycosyltransferase  34.97 
 
 		 363 aa  60.8  0.00000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2261  glycosyl transferase, group 1  34 
 
 		 410 aa  60.8  0.00000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1681  glycosyl transferase, group 1  36.18 
 
 		 303 aa  60.8  0.00000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.456944  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0890  glycosyl transferase, group 1  31.91 
 
 		 405 aa  60.8  0.00000004  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0223562  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5249  glycosyl transferase group 1  35.21 
 
 		 386 aa  60.1  0.00000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1935  glycosyl transferase group 1  30 
 
 		 424 aa  60.1  0.00000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0154  glycosyl transferase, group 1 family protein  39.29 
 
 		 360 aa  60.1  0.00000007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3432  glycosyl transferase group 1  30.81 
 
 		 419 aa  60.1  0.00000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2152  glycosyl transferase family protein  36.17 
 
 		 371 aa  60.1  0.00000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.540294  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2506  glycosyl transferase group 1  33.99 
 
 		 774 aa  60.1  0.00000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2562  glycosyl transferase, group 1  37.23 
 
 		 344 aa  60.1  0.00000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.118298 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4909  group 1 glycosyl transferase  24.24 
 
 		 364 aa  59.7  0.00000008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>