47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_4789 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009441  Fjoh_4789  hypothetical protein  100 
 
 		 587 aa  1176    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0838792  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1930  hypothetical protein  42.71 
 
 		 595 aa  444  1e-123  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.171186  normal  0.0291599 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3939  hypothetical protein  33.73 
 
 		 649 aa  355  2e-96  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.462657  normal  0.150476 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5660  hypothetical protein  34.98 
 
 		 588 aa  344  2e-93  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2373  hypothetical protein  27.74 
 
 		 619 aa  204  5e-51  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.651768  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2831  hypothetical protein  25.98 
 
 		 605 aa  175  2.9999999999999996e-42  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3567  hypothetical protein  25.62 
 
 		 575 aa  149  2.0000000000000003e-34  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.336155  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1608  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  28.41 
 
 		 735 aa  146  9e-34  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.435255  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3564  hypothetical protein  31.21 
 
 		 572 aa  134  3e-30  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5664  hypothetical protein  30.88 
 
 		 382 aa  132  2.0000000000000002e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1935  hypothetical protein  30.25 
 
 		 386 aa  107  6e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0240984 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0874  ICE-like protease  26.27 
 
 		 360 aa  104  3e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  decreased coverage  0.00749471  normal  0.127131 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0877  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  29.5 
 
 		 708 aa  99.8  1e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.111073  normal  0.182276 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0979  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  24.78 
 
 		 704 aa  88.6  3e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0982  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  23.6 
 
 		 704 aa  79.7  0.0000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.819515  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2207  TonB-dependent receptor plug  27.37 
 
 		 1161 aa  66.2  0.000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.582294 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1702  TonB-dependent receptor plug  30.06 
 
 		 1176 aa  64.7  0.000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.456283  normal  0.767755 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1623  TonB-dependent receptor plug  26.75 
 
 		 1120 aa  60.8  0.00000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.21051 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1565  TonB-dependent receptor plug  25.95 
 
 		 1142 aa  60.1  0.0000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0679  TonB-dependent receptor plug  27.44 
 
 		 1148 aa  58.5  0.0000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0517707  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4708  TonB-dependent receptor plug  23.53 
 
 		 1097 aa  56.6  0.000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3704  TonB-dependent receptor plug  26.35 
 
 		 1128 aa  55.8  0.000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1421  TonB-dependent receptor  25.13 
 
 		 1144 aa  53.5  0.00001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0101171 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4979  TonB-dependent receptor plug  22.08 
 
 		 1188 aa  52.4  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000632908 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6567  TonB-dependent receptor plug  25.75 
 
 		 1155 aa  52  0.00003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7234  TonB-dependent receptor plug  21.56 
 
 		 1119 aa  50.8  0.00006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.507309  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5419  TonB-dependent receptor plug  21.88 
 
 		 1102 aa  50.4  0.00008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08731  putative TonB-dependent outer membrane receptor protein  26.07 
 
 		 917 aa  50.4  0.0001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.954861  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1657  TonB-dependent receptor plug  21.11 
 
 		 1122 aa  50.1  0.0001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.653698 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2302  TonB-dependent receptor plug  23.56 
 
 		 1096 aa  49.3  0.0002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1413  TonB-dependent receptor plug  25.61 
 
 		 1165 aa  48.9  0.0003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.177661  normal  0.496706 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7043  TonB-dependent receptor plug  23.86 
 
 		 1189 aa  48.9  0.0003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0868  TonB-dependent receptor plug  23.63 
 
 		 1117 aa  47.8  0.0005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.503541  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2402  TonB-dependent receptor plug  27.61 
 
 		 1217 aa  47  0.0009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3123  TonB-dependent receptor plug  22.4 
 
 		 1139 aa  46.6  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0154313  normal  0.66529 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1791  TonB-dependent receptor plug  23.87 
 
 		 1177 aa  46.6  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.132082  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2082  hypothetical protein  33.56 
 
 		 1703 aa  46.6  0.001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.112234 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0043  TonB-dependent receptor plug  26.88 
 
 		 1089 aa  45.8  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3337  TonB-dependent receptor, plug  23.3 
 
 		 1119 aa  45.8  0.002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.661419  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0074  hypothetical protein  35.05 
 
 		 165 aa  45.8  0.002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000360926  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2219  TonB-dependent receptor plug  22.56 
 
 		 1106 aa  45.4  0.003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.136302 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1460  TonB-dependent receptor  20.67 
 
 		 1189 aa  45.4  0.003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.198313 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4695  TonB-dependent receptor plug  22.67 
 
 		 1148 aa  45.4  0.003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.0000484676  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2894  TonB-dependent receptor, plug  21.37 
 
 		 1237 aa  45.1  0.003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.403551  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1103  TonB-dependent receptor plug  25.29 
 
 		 1138 aa  45.1  0.004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.240572  normal  0.101301 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2764  TonB-dependent receptor plug  22.84 
 
 		 1103 aa  44.7  0.004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.533832  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2227  TonB-dependent receptor plug  24.83 
 
 		 1179 aa  44.7  0.005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.376454  normal  0.140411 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>