More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_1159 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009441  Fjoh_1159  peptidase M50  100 
 
 
447 aa  895    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2050  peptidase M50  52.01 
 
 
444 aa  456  1e-127  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0906941  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0482  peptidase M50  47.69 
 
 
442 aa  395  1e-109  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0205055  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03975  membrane-associated zinc metalloprotease  49.22 
 
 
440 aa  383  1e-105  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.419536  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0383  membrane-associated zinc metalloprotease, putative  40.77 
 
 
439 aa  356  3.9999999999999996e-97  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2995  peptidase RseP  42.44 
 
 
430 aa  339  5.9999999999999996e-92  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.207005  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3176  membrane-associated zinc metalloprotease  42.73 
 
 
444 aa  338  1.9999999999999998e-91  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.836726 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4131  membrane-associated zinc metalloprotease  42.38 
 
 
438 aa  315  9.999999999999999e-85  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.158582 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5920  membrane-associated zinc metalloprotease  40.09 
 
 
438 aa  314  1.9999999999999998e-84  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.928218  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0469  hypothetical protein  40 
 
 
438 aa  305  1.0000000000000001e-81  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1961  membrane-associated zinc metalloprotease  31.39 
 
 
469 aa  241  1e-62  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0120  membrane-associated zinc metalloprotease  33.98 
 
 
453 aa  231  1e-59  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0009  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  33.77 
 
 
453 aa  230  3e-59  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.000631419  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0084  membrane-associated zinc metalloprotease  32.98 
 
 
453 aa  229  6e-59  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.47842  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2681  peptidase RseP  33.83 
 
 
446 aa  226  5.0000000000000005e-58  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0079  membrane-associated zinc metalloprotease  32.83 
 
 
453 aa  221  1.9999999999999999e-56  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.736118  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0097  membrane-associated zinc metalloprotease  34.91 
 
 
453 aa  220  3e-56  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  unclonable  0.000000512767  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0076  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  30.72 
 
 
454 aa  210  5e-53  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2798  membrane-associated zinc metalloprotease  27.92 
 
 
494 aa  157  4e-37  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.000647763  normal  0.117018 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1914  putative membrane-associated Zn-dependent protease  29.74 
 
 
446 aa  155  1e-36  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0382298  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3998  putative membrane-associated zinc metalloprotease  24.57 
 
 
441 aa  149  1.0000000000000001e-34  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.434108 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0892  membrane-associated zinc metalloprotease  29.98 
 
 
439 aa  149  1.0000000000000001e-34  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000122441  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2171  membrane-associated zinc metalloprotease  28.12 
 
 
454 aa  145  2e-33  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.661507  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0664  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  29.44 
 
 
455 aa  141  1.9999999999999998e-32  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.399038  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1001  membrane-associated zinc metalloprotease  30.77 
 
 
438 aa  137  4e-31  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1561  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  27.08 
 
 
456 aa  136  9.999999999999999e-31  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.00000461405  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1749  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  27.87 
 
 
455 aa  135  1.9999999999999998e-30  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.853109  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1459  putative membrane-associated zinc metalloprotease  26.61 
 
 
455 aa  134  3.9999999999999996e-30  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01122  membrane-associated Zn-dependent protease  25.32 
 
 
448 aa  133  6.999999999999999e-30  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.496446  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2808  peptidase RseP  27.8 
 
 
456 aa  132  1.0000000000000001e-29  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000246609  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1636  membrane-associated zinc metalloprotease, putative  26.93 
 
 
456 aa  131  3e-29  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01380  membrane-associated zinc metalloprotease, putative  28.21 
 
 
450 aa  131  3e-29  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1447  membrane-associated zinc metalloprotease  26.56 
 
 
469 aa  130  4.0000000000000003e-29  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.843225  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2590  peptidase RseP  26.78 
 
 
466 aa  129  1.0000000000000001e-28  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0359861  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1523  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  27.13 
 
 
455 aa  129  1.0000000000000001e-28  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.24636  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1451  membrane-associated zinc metalloprotease, putative  26.38 
 
 
452 aa  128  2.0000000000000002e-28  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0815  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  27.44 
 
 
454 aa  128  2.0000000000000002e-28  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.225956  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1167  membrane-associated zinc metalloprotease  26.38 
 
 
452 aa  128  2.0000000000000002e-28  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1387  putative membrane-associated zinc metalloprotease  26.46 
 
 
480 aa  126  7e-28  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.204632  normal  0.0100882 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2420  protease EcfE  28.39 
 
 
452 aa  126  7e-28  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0697135  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2878  putative membrane-associated zinc metalloprotease  28.54 
 
 
456 aa  126  8.000000000000001e-28  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000126252  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1530  peptidase RseP  28.78 
 
 
457 aa  125  1e-27  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00980857 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1420  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  30.7 
 
 
446 aa  125  1e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.130402 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2701  peptidase RseP  26.76 
 
 
456 aa  125  1e-27  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000971838  hitchhiker  0.00353487 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1146  membrane-associated zinc metalloprotease, putative  26.4 
 
 
456 aa  125  2e-27  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0106908  normal  0.442954 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2341  membrane-associated zinc metalloprotease, putative  27.35 
 
 
450 aa  124  3e-27  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.00281256  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2634  peptidase RseP  26.76 
 
 
456 aa  124  3e-27  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000113842  normal  0.0898661 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1709  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  28.57 
 
 
457 aa  124  4e-27  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.550772  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0607  RIP metalloprotease RseP  28.57 
 
 
370 aa  123  5e-27  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1331  membrane-associated zinc metalloprotease  26.36 
 
 
462 aa  124  5e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1355  putative membrane-associated zinc metalloprotease  26.32 
 
 
456 aa  123  7e-27  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000225455  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1279  putative membrane-associated zinc metalloprotease  27.45 
 
 
448 aa  122  9e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.196606  normal  0.702874 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03230  protease  26.81 
 
 
452 aa  122  9e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1856  peptidase RseP  24.5 
 
 
454 aa  122  9e-27  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0450  membrane-associated zinc metalloprotease  28.44 
 
 
428 aa  122  9.999999999999999e-27  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.0000000160258  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0948  zinc metallopeptidase RseP  26.29 
 
 
451 aa  120  3e-26  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000214354  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0570  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  26.83 
 
 
451 aa  121  3e-26  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0114456  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1488  putative membrane-associated zinc metalloprotease  26.57 
 
 
456 aa  120  4.9999999999999996e-26  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000665578  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3274  membrane-associated zinc metalloprotease  27.29 
 
 
461 aa  120  4.9999999999999996e-26  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000455239  hitchhiker  0.000441416 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3353  zinc metallopeptidase RseP  25.86 
 
 
451 aa  120  4.9999999999999996e-26  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0274947  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1121  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  26.42 
 
 
351 aa  120  4.9999999999999996e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0347872  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1638  membrane-associated zinc metalloprotease  26.46 
 
 
454 aa  120  4.9999999999999996e-26  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1874  peptidase RseP  26.3 
 
 
463 aa  120  6e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2448  membrane-associated zinc metalloprotease  26.05 
 
 
461 aa  120  6e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.699947  hitchhiker  0.00215564 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1689  peptidase RseP  26.26 
 
 
461 aa  119  7.999999999999999e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.439361  normal  0.213094 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0792  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  26.55 
 
 
454 aa  119  9.999999999999999e-26  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.534623  normal  0.220664 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1452  putative membrane-associated zinc metalloprotease  25.84 
 
 
456 aa  119  9.999999999999999e-26  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00139274  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2895  membrane-associated zinc metalloprotease  26.36 
 
 
456 aa  119  9.999999999999999e-26  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000920242  normal  0.27342 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4075  membrane-associated zinc metalloprotease  27.58 
 
 
450 aa  119  9.999999999999999e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.274449 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2628  putative membrane-associated zinc metalloprotease  26.83 
 
 
453 aa  118  1.9999999999999998e-25  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000538528  normal  0.548541 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2034  membrane-associated zinc metalloprotease, putative  25.87 
 
 
463 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.931148  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1490  membrane-associated zinc metalloprotease  25.21 
 
 
453 aa  118  1.9999999999999998e-25  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1457  putative membrane-associated zinc metalloprotease  25.94 
 
 
456 aa  118  1.9999999999999998e-25  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000042456  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2148  putative membrane-associated zinc metalloprotease  23.9 
 
 
444 aa  117  3e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2969  putative membrane-associated zinc metalloprotease  25.05 
 
 
458 aa  117  3e-25  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.3628  normal  0.340979 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2541  putative membrane-associated zinc metalloprotease  27.14 
 
 
449 aa  117  3e-25  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1277  putative membrane-associated zinc metalloprotease  25.94 
 
 
456 aa  117  5e-25  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.358202  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1541  membrane-associated zinc metalloprotease, putative  25.16 
 
 
450 aa  117  6e-25  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.521262  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1534  protease ecfE  25.33 
 
 
454 aa  117  6e-25  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000633641  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1914  membrane-associated zinc metalloprotease  25 
 
 
462 aa  116  8.999999999999998e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.344578 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3158  zinc metallopeptidase RseP  25.95 
 
 
451 aa  116  8.999999999999998e-25  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00293978  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1153  membrane-associated zinc metalloprotease  27.25 
 
 
450 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.386407  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2045  putative membrane-associated zinc metalloprotease  24.79 
 
 
462 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1166  membrane-associated zinc metalloprotease  25.26 
 
 
454 aa  115  2.0000000000000002e-24  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.351032  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2429  membrane-associated zinc metalloprotease, putative  25.47 
 
 
463 aa  114  3e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0781389  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5322  peptidase RseP  25.1 
 
 
456 aa  114  3e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.430006  normal  0.522456 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002753  membrane-associated zinc metalloprotease  26.33 
 
 
452 aa  114  4.0000000000000004e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.422522  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2576  membrane-associated zinc metalloprotease, putative  25.47 
 
 
463 aa  113  6e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.222453  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2485  membrane-associated zinc metalloprotease, putative  25.47 
 
 
463 aa  113  6e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5120  peptidase M50  27.04 
 
 
428 aa  113  8.000000000000001e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.949013  normal  0.451136 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1548  membrane-associated zinc metalloprotease, putative  25.47 
 
 
463 aa  113  8.000000000000001e-24  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1350  peptidase M50, putative membrane-associated zinc metallopeptidase  26.05 
 
 
450 aa  113  8.000000000000001e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.512727  normal  0.377982 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3263  putative membrane-associated zinc metalloprotease  25.47 
 
 
463 aa  113  8.000000000000001e-24  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.388567  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1320  putative membrane-associated zinc metalloprotease  25.47 
 
 
463 aa  113  8.000000000000001e-24  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0767878  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2048  putative membrane-associated zinc metalloprotease  25.47 
 
 
463 aa  113  8.000000000000001e-24  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2710  putative membrane-associated zinc metalloprotease  23.64 
 
 
444 aa  112  1.0000000000000001e-23  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0608503  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38920  membrane-associated zinc metallopeptidase MucP  23.91 
 
 
450 aa  112  1.0000000000000001e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.241633  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17140  putative membrane-associated zinc metalloprotease  26.06 
 
 
450 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1349  membrane-associated zinc metalloprotease  25.47 
 
 
462 aa  112  2.0000000000000002e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  decreased coverage  0.00245183  normal  0.774325 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1558  peptidase M50  25.55 
 
 
481 aa  111  2.0000000000000002e-23  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>