82 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_0696 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009441  Fjoh_0696  hypothetical protein  100 
 
 
919 aa  1851    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03200  hypothetical protein  42.02 
 
 
911 aa  699    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.358674  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1837  hypothetical protein  37.7 
 
 
909 aa  616  1e-175  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.57891  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2374  hypothetical protein  29.87 
 
 
968 aa  368  1e-100  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1658  hypothetical protein  27.47 
 
 
1039 aa  357  7.999999999999999e-97  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.450453  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0460  hypothetical protein  26.29 
 
 
969 aa  291  5.0000000000000004e-77  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0454  hypothetical protein  26.29 
 
 
969 aa  291  5.0000000000000004e-77  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4179  ATP-dependent nuclease subunit B  26.74 
 
 
951 aa  283  8.000000000000001e-75  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.0186449 
 
 
-
 
NC_002950  PG0517  hypothetical protein  26.33 
 
 
960 aa  268  2.9999999999999995e-70  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0137071 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1165  hypothetical protein  22.1 
 
 
984 aa  182  2e-44  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.5757 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1587  hypothetical protein  21.96 
 
 
997 aa  169  2e-40  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0978  hypothetical protein  24.05 
 
 
1000 aa  159  2e-37  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.263512  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0765  hypothetical protein  21.47 
 
 
1100 aa  124  7e-27  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.166845 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1911  hypothetical protein  22.87 
 
 
780 aa  84  0.00000000000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0088  hypothetical protein  20.31 
 
 
781 aa  77.8  0.0000000000008  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.217564  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0385  hypothetical protein  22.36 
 
 
786 aa  77.8  0.0000000000009  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.412498  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0735  hypothetical protein  23.52 
 
 
781 aa  76.3  0.000000000002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1562  ATP-dependent nuclease subunit B-like protein  23.6 
 
 
957 aa  74.7  0.000000000008  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1189  hypothetical protein  21.65 
 
 
962 aa  69.7  0.0000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0909  hypothetical protein  23.96 
 
 
783 aa  70.1  0.0000000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0381  hypothetical protein  23.99 
 
 
794 aa  68.2  0.0000000007  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0210586  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1125  hypothetical protein  23.03 
 
 
947 aa  68.2  0.0000000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.290097 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1392  hypothetical protein  22.69 
 
 
803 aa  67.4  0.000000001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1829  hypothetical protein  23.98 
 
 
788 aa  65.9  0.000000003  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.423033  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2680  double-strand break repair protein AddB  24.29 
 
 
991 aa  63.9  0.00000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0158  helicase  21.29 
 
 
991 aa  64.3  0.00000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.233932  normal  0.795485 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4287  double-strand break repair protein AddB  24.27 
 
 
1064 aa  63.5  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.235496  normal  0.271483 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1655  hypothetical protein  23.9 
 
 
788 aa  63.2  0.00000003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1804  ATP-dependent nuclease subunit B-like protein  24.68 
 
 
986 aa  62.8  0.00000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1709  hypothetical protein  24.32 
 
 
896 aa  62.8  0.00000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000066453  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0089  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, subunit B  21.34 
 
 
1048 aa  62.8  0.00000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.476876 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1475  hypothetical protein  23.71 
 
 
788 aa  62.4  0.00000004  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0853402  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1033  hypothetical protein  22.3 
 
 
951 aa  62  0.00000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.187389  normal  0.358259 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0057  hypothetical protein  23.08 
 
 
1049 aa  59.7  0.0000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0203  hypothetical protein  26.07 
 
 
1049 aa  60.1  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.587798  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0628  hypothetical protein  25.79 
 
 
1048 aa  60.1  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.397412  normal  0.357504 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0818  double-strand break repair protein AddB  20.5 
 
 
1052 aa  59.7  0.0000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1525  putative helicase/exonuclease  23.96 
 
 
997 aa  59.7  0.0000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.873687  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0645  ATP-dependent nuclease subunit B-like protein  23.86 
 
 
989 aa  59.7  0.0000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0137  double-strand break repair protein AddB  23.84 
 
 
1001 aa  58.9  0.0000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3960  double-strand break repair protein AddB  24.6 
 
 
1064 aa  58.5  0.0000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0177  putative helicase/exonuclease  23.96 
 
 
997 aa  58.9  0.0000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.169187  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0386  hypothetical protein  22.87 
 
 
1042 aa  58.9  0.0000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0078  double-strand break repair protein AddB  21.65 
 
 
1049 aa  57.8  0.0000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.160312  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0085  hypothetical protein  20.72 
 
 
1016 aa  57  0.000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.604328 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1608  double-strand break repair protein AddB  22.19 
 
 
1037 aa  56.6  0.000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.62778  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3266  DNA-dependent ATPase I and helicase II  27.71 
 
 
1041 aa  56.2  0.000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.951374  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR2102  hypothetical protein  22.91 
 
 
1052 aa  53.9  0.00001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2019  double-strand break repair protein AddB  22.91 
 
 
1052 aa  53.5  0.00002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0055  double-strand break repair protein AddB  23.01 
 
 
1062 aa  53.9  0.00002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2952  exonuclease-like protein  22.29 
 
 
1000 aa  53.5  0.00002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.034558  normal  0.0831314 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0034  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, subunit B  23.22 
 
 
836 aa  53.1  0.00002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.0563603 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0820  hypothetical protein  23.28 
 
 
914 aa  53.5  0.00002  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.839231  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0049  hypothetical protein  23.03 
 
 
1053 aa  52.4  0.00003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.258638  normal  0.374652 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1306  hypothetical protein  22.07 
 
 
994 aa  52.4  0.00004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.791013  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1413  double-strand break repair protein AddB  20.12 
 
 
1043 aa  52.4  0.00004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3243  double-strand break repair protein AddB  22.22 
 
 
1059 aa  52  0.00005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1296  double-strand break repair protein AddB  19.57 
 
 
1014 aa  51.6  0.00007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.862539  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4852  double-strand break repair protein AddB  23.12 
 
 
999 aa  49.3  0.0003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.173842  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1356  double-strand break repair protein AddB  23.66 
 
 
1047 aa  48.9  0.0004  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5094  double-strand break repair protein AddB  20.4 
 
 
1054 aa  48.9  0.0005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.145083 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1499  ATP-dependent nuclease subunit B-like protein  24.38 
 
 
1049 aa  48.9  0.0005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0987  hypothetical protein  22.52 
 
 
911 aa  48.1  0.0007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000754464  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20930  RecB family exonuclease  27.75 
 
 
297 aa  48.1  0.0007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.466535  normal  0.903432 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1698  hypothetical protein  25.12 
 
 
922 aa  47.8  0.001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2414  RecB family exonuclease-like protein  25.96 
 
 
351 aa  47.8  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2223  hypothetical protein  28.99 
 
 
858 aa  46.6  0.002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1287  ATP-dependent nuclease subunit B-like protein  24.56 
 
 
994 aa  46.6  0.002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0491  double-strand break repair protein AddB  20.49 
 
 
1040 aa  46.6  0.002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00465819 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2195  hypothetical protein  28.99 
 
 
858 aa  46.6  0.002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3463  RecB family exonuclease  25.12 
 
 
304 aa  47  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0972  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, subunit B  24.39 
 
 
916 aa  46.6  0.002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00798755 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1243  ATP-dependent nuclease subunit B-like protein  25.6 
 
 
968 aa  45.8  0.003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0167838  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD0912  hypothetical protein  21.17 
 
 
890 aa  46.2  0.003  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.216262  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1156  hypothetical protein  23.67 
 
 
865 aa  46.2  0.003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0263  hypothetical protein  22.65 
 
 
911 aa  45.8  0.003  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.453707  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12151  hypothetical protein  25 
 
 
278 aa  45.4  0.004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2845  hypothetical protein  21.25 
 
 
977 aa  45.4  0.004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.786725 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1478  hypothetical protein  27.75 
 
 
273 aa  45.8  0.004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0682127  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1280  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, subunit B  20.49 
 
 
958 aa  45.4  0.005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2004  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, subunit B  22.49 
 
 
935 aa  44.7  0.008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0640  inactivated superfamily I helicase-like protein  21.62 
 
 
991 aa  44.7  0.009  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>