97 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ent638_2893 on replicon NC_009436
Organism: Enterobacter sp. 638



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009436  Ent638_2893  radical SAM domain-containing protein  100 
 
 
370 aa  766  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.00746158  normal  0.722126 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1715  Radical SAM domain protein  72.16 
 
 
370 aa  581  1e-165  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.707887  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1616  Radical SAM domain protein  71.35 
 
 
370 aa  575  1e-163  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.230625  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2250  radical SAM domain-containing protein  51.21 
 
 
367 aa  388  1e-107  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.621052 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3365  radical SAM domain-containing protein  36.91 
 
 
393 aa  226  6e-58  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.803151  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0740  radical SAM domain-containing protein  37.13 
 
 
400 aa  219  8e-56  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2723  Radical SAM domain protein  34.33 
 
 
384 aa  199  4e-50  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2638  Radical SAM domain protein  26.92 
 
 
378 aa  74.3  3e-12  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.44859  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1099  radical SAM domain-containing protein  29.03 
 
 
501 aa  72.8  8e-12  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0051  radical SAM domain-containing protein  27.8 
 
 
389 aa  70.1  5e-11  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.865506 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1347  radical SAM domain-containing protein  28.22 
 
 
384 aa  67.8  3e-10  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1375  Fe-S oxidoreductase-like  24.78 
 
 
377 aa  66.6  7e-10  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.771753  normal  0.531566 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1706  radical SAM domain-containing protein  25.34 
 
 
380 aa  66.6  7e-10  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0248528 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0969  radical SAM domain-containing protein  27.31 
 
 
377 aa  65.9  1e-09  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  hitchhiker  0.00591663 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1047  radical SAM domain-containing protein  23.92 
 
 
468 aa  65.1  2e-09  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1669  putative molybdenum cofactor biosynthesis protein A  21.99 
 
 
321 aa  64.7  3e-09  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.195157 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2244  radical SAM domain-containing protein  25.47 
 
 
380 aa  60.8  3e-08  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.720848  normal  0.403535 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1002  Radical SAM domain protein  24.89 
 
 
365 aa  60.8  4e-08  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.808631  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0690  Radical SAM domain protein  28.05 
 
 
496 aa  59.7  8e-08  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0876  radical SAM domain-containing protein  28.92 
 
 
398 aa  59.7  9e-08  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0451643  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0597  putative molybdenum cofactor biosynthesis protein A  24.03 
 
 
348 aa  58.9  1e-07  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1814  radical SAM domain-containing protein  25.33 
 
 
369 aa  57.4  4e-07  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1198  radical SAM domain-containing protein  23.75 
 
 
306 aa  56.6  6e-07  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00512944  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2664  radical SAM family protein  29.3 
 
 
383 aa  57  6e-07  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.293501 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0879  radical SAM domain-containing protein  28.05 
 
 
349 aa  55.8  1e-06  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.11149  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1091  MoaA/NifB/PqqE family protein  27.65 
 
 
379 aa  53.9  4e-06  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1154  radical SAM domain-containing protein  19.69 
 
 
377 aa  53.9  4e-06  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.812273  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1913  Radical SAM domain protein  28.57 
 
 
364 aa  53.9  4e-06  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2629  Radical SAM domain protein  25.29 
 
 
399 aa  53.5  5e-06  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.514294  hitchhiker  0.00258896 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0055  radical SAM domain-containing protein  25.14 
 
 
429 aa  52.8  1e-05  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0938  radical SAM family Fe-S protein  22.31 
 
 
381 aa  52  2e-05  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000426541  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0511  radical SAM domain-containing protein  28.77 
 
 
366 aa  52  2e-05  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00485755  decreased coverage  0.00020138 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0791  Radical SAM domain protein  29.83 
 
 
415 aa  51.2  3e-05  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1987  radical SAM family protein  30.51 
 
 
373 aa  51.2  3e-05  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0568355  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2101  radical SAM family protein  30.53 
 
 
417 aa  50.8  4e-05  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2925  Radical SAM domain protein  26.95 
 
 
440 aa  50.8  4e-05  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  2.58536e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0393  metallo cofactor biosynthesis protein  22.67 
 
 
393 aa  50.4  4e-05  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0350  radical SAM domain-containing protein  21.72 
 
 
359 aa  50.4  5e-05  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.156548  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2660  Fe-S oxidoreductase, putative coenzyme synthesis protein  24.43 
 
 
344 aa  50.1  6e-05  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1180  radical SAM domain-containing protein  26.47 
 
 
418 aa  50.1  7e-05  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.832103  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1690  radical SAM family protein  28.04 
 
 
330 aa  49.7  8e-05  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000452598  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1793  metallo cofactor biosynthesis protein  27.69 
 
 
399 aa  49.3  0.0001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.91522  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12350  predicted Fe-S oxidoreductase  25.45 
 
 
422 aa  49.3  0.0001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1953  Radical SAM domain protein  26.67 
 
 
394 aa  48.1  0.0002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.66123 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1128  Radical SAM domain protein  24.72 
 
 
327 aa  48.5  0.0002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.823251 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1337  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  24.65 
 
 
308 aa  48.9  0.0002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0490637  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2068  Radical SAM domain protein  25.15 
 
 
399 aa  48.5  0.0002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.184452  hitchhiker  0.00128487 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0614  radical SAM domain-containing protein  25.16 
 
 
308 aa  48.1  0.0002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0923  Methyltransferase type 11  26.95 
 
 
1039 aa  48.1  0.0002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.804895  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0734  Radical SAM domain protein  25.31 
 
 
401 aa  48.5  0.0002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0289  Radical SAM domain protein  26.79 
 
 
394 aa  47.8  0.0003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.815066  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1970  Radical SAM domain protein  21.57 
 
 
346 aa  48.1  0.0003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0587  radical SAM family protein  25.7 
 
 
376 aa  47.8  0.0003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0071  Radical SAM domain protein  24.66 
 
 
428 aa  47.4  0.0004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0857  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqE  23.31 
 
 
378 aa  47.4  0.0004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0024  GTP cyclohydrolase subunit MoaA  24.34 
 
 
309 aa  47.4  0.0004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0058  putative molybdenum cofactor biosynthesis protein A  21.13 
 
 
310 aa  47  0.0005  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1935  radical SAM domain-containing protein  32.12 
 
 
404 aa  47  0.0005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.100874 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1782  Radical SAM domain protein  28.14 
 
 
404 aa  47.4  0.0005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1498  GTP cyclohydrolase subunit MoaA  22.76 
 
 
326 aa  46.6  0.0006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.286832  normal  0.0117341 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2369  Radical SAM domain protein  20.66 
 
 
435 aa  47  0.0006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0697954  normal  0.318858 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12330  predicted Fe-S oxidoreductase  20 
 
 
561 aa  46.6  0.0006  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1385  Radical SAM domain protein  26.73 
 
 
417 aa  46.6  0.0007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0362532  unclonable  1.06904e-05 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3352  Radical SAM domain protein  28.05 
 
 
391 aa  46.6  0.0008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1275  Radical SAM domain protein  24.44 
 
 
244 aa  46.2  0.001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1123  radical SAM domain-containing protein  30.25 
 
 
342 aa  45.8  0.001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2372  radical SAM domain-containing protein  26.7 
 
 
377 aa  45.4  0.001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.223606  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11630  predicted Fe-S oxidoreductase  24.07 
 
 
397 aa  46.2  0.001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.790216 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1236  radical SAM family Fe-S protein  22.61 
 
 
397 aa  45.8  0.001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0349  radical SAM domain-containing protein  30.73 
 
 
427 aa  45.8  0.001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0505  radical SAM domain-containing protein  26.76 
 
 
367 aa  45.1  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1915  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  22.4 
 
 
321 aa  45.4  0.002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0862  radical SAM domain-containing protein  23.39 
 
 
317 aa  45.4  0.002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  1.092e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1148  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  22.92 
 
 
298 aa  45.1  0.002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2710  radical SAM family Fe-S protein  26.29 
 
 
413 aa  45.1  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4323  radical SAM family protein  25.99 
 
 
373 aa  45.1  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.564384  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0763  radical SAM family protein  24.86 
 
 
354 aa  44.7  0.002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.959991  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1126  Radical SAM domain protein  25.97 
 
 
393 aa  45.4  0.002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.597913 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2903  Radical SAM domain protein  26.19 
 
 
393 aa  44.7  0.003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0608543 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1985  Methyltransferase type 11  27.27 
 
 
1000 aa  44.3  0.003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0095  radical SAM domain-containing protein  25.75 
 
 
316 aa  44.7  0.003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0204398  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1426  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  25 
 
 
322 aa  43.9  0.004  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2249  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqE  21.58 
 
 
371 aa  44.3  0.004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0357225  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4899  radical SAM family protein  24.27 
 
 
386 aa  44.3  0.004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.152748  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2391  Radical SAM domain protein  25 
 
 
397 aa  43.9  0.005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2859  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  33 
 
 
330 aa  43.9  0.005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00116324  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1156  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  25.32 
 
 
322 aa  43.9  0.005  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1425  radical SAM family Fe-S protein  22.16 
 
 
403 aa  43.5  0.006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0157  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  24.87 
 
 
320 aa  43.1  0.007  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0176  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  24.87 
 
 
320 aa  43.1  0.007  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04320  Radical SAM domain protein  24.88 
 
 
459 aa  43.1  0.007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0197  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  24.87 
 
 
320 aa  43.1  0.007  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2393  Radical SAM domain protein  22.47 
 
 
399 aa  43.1  0.008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1741  Radical SAM domain protein  22.52 
 
 
728 aa  43.1  0.008  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0185422  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1225  radical SAM domain-containing protein  26.97 
 
 
395 aa  43.1  0.008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1837  Radical SAM domain protein  25.64 
 
 
518 aa  43.1  0.008  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.654863  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1984  Radical SAM domain protein  27.22 
 
 
407 aa  42.7  0.009  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.519712 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>