81 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Elen_2369 on replicon NC_013204
Organism: Eggerthella lenta DSM 2243



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013204  Elen_2369  Radical SAM domain protein  100 
 
 		 435 aa  880    Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0697954  normal  0.318858 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00200  pyruvate formate-lyase activating-like enzyme  45.97 
 
 		 464 aa  360  2e-98  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.158297  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2925  Radical SAM domain protein  41.75 
 
 		 440 aa  332  8e-90  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000258536  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1387  radical SAM family protein  40.75 
 
 		 441 aa  322  6e-87  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05050  pyruvate formate-lyase activating-like enzyme  39.35 
 
 		 457 aa  297  3e-79  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2101  radical SAM family protein  36.28 
 
 		 417 aa  272  1e-71  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1369  hypothetical protein  26.79 
 
 		 471 aa  94  5e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1025  Radical SAM domain protein  27.92 
 
 		 409 aa  91.7  2e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1481  radical SAM domain-containing protein  28.77 
 
 		 371 aa  92  2e-17  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0924558  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0983  radical SAM domain-containing protein  28.24 
 
 		 380 aa  91.7  2e-17  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.156314  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2157  radical SAM domain-containing protein  28.52 
 
 		 343 aa  89.4  1e-16  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.350893  hitchhiker  0.000485535 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0398  radical SAM domain-containing protein  27.57 
 
 		 371 aa  85.9  0.000000000000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0698777  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0464  radical SAM domain-containing protein  26.55 
 
 		 353 aa  84.7  0.000000000000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0439  radical SAM domain-containing protein  27.57 
 
 		 371 aa  84  0.000000000000004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3410  Radical SAM domain protein  27.67 
 
 		 433 aa  84  0.000000000000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.736979  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1063  Radical SAM domain protein  25.19 
 
 		 350 aa  81.6  0.00000000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.540032  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0508  radical SAM domain-containing protein  25.77 
 
 		 373 aa  80.5  0.00000000000005  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0043  radical SAM family Fe-S protein  27.57 
 
 		 348 aa  72.8  0.00000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0117  hypothetical protein  29.11 
 
 		 334 aa  72.4  0.00000000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1327  Radical SAM domain protein  25.6 
 
 		 375 aa  70.1  0.00000000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000215386  hitchhiker  0.00000524996 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0016  radical SAM domain-containing protein  26.97 
 
 		 344 aa  62.8  0.00000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.238462  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0273  hypothetical protein  26.21 
 
 		 353 aa  62  0.00000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.888723  normal  0.245364 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1789  radical SAM domain-containing protein  31.37 
 
 		 341 aa  61.6  0.00000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0106  Radical SAM domain protein  28.65 
 
 		 343 aa  60.5  0.00000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0772  Radical SAM domain protein  24.61 
 
 		 353 aa  60.1  0.00000009  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00827536  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1246  Radical SAM domain protein  25.71 
 
 		 346 aa  57.4  0.0000005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2062  radical SAM domain-containing protein  27.83 
 
 		 341 aa  56.2  0.000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.539759 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0936  Radical SAM domain protein  25.59 
 
 		 343 aa  52  0.00002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.674566 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1235  radical SAM family protein  29.82 
 
 		 470 aa  49.7  0.0001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0312  Radical SAM domain protein  25.59 
 
 		 332 aa  49.7  0.0001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.139539 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2098  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqE  25 
 
 		 400 aa  48.1  0.0003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.456256  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1616  Radical SAM domain protein  24.45 
 
 		 370 aa  48.1  0.0003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.230625  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2556  radical SAM family protein  33.33 
 
 		 337 aa  48.1  0.0003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2492  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqE  25 
 
 		 400 aa  47.8  0.0004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.250234  normal  0.0827229 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1715  Radical SAM domain protein  24.45 
 
 		 370 aa  47.8  0.0004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.707887  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5901  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqE  32.11 
 
 		 374 aa  47.4  0.0005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.630073 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1734  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  31.58 
 
 		 329 aa  47.4  0.0006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2893  radical SAM domain-containing protein  20.66 
 
 		 370 aa  47  0.0007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.00746158  normal  0.722126 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6168  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqE  32.11 
 
 		 374 aa  46.6  0.0008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0169631  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3366  radical SAM family protein  26.89 
 
 		 374 aa  46.6  0.0008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0273275 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0911  radical SAM domain-containing protein  21.13 
 
 		 287 aa  46.6  0.0008  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.833054 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2372  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  26.11 
 
 		 341 aa  46.6  0.0008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.760376  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04770  ribonucleoside-triphosphate reductase class III activase subunit  23.93 
 
 		 179 aa  46.2  0.001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0269333  normal  0.584897 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2030  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  30.71 
 
 		 334 aa  45.8  0.001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0183  lipoyl synthase  24.55 
 
 		 306 aa  45.8  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.604682  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1830  GTP cyclohydrolase subunit MoaA  29.53 
 
 		 334 aa  45.8  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2766  radical SAM family Fe-S protein  28.89 
 
 		 340 aa  45.1  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0341  anaerobic ribonucleoside-triphosphate reductase activating protein  30.19 
 
 		 231 aa  45.1  0.002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1133  Radical SAM domain protein  30.21 
 
 		 453 aa  45.4  0.002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.318737 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2100  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  29.53 
 
 		 334 aa  45.8  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2352  Radical SAM domain protein  24.16 
 
 		 565 aa  45.4  0.002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3491  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  34.85 
 
 		 328 aa  45.4  0.002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.552399 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0784  radical SAM family protein  28.57 
 
 		 337 aa  45.1  0.002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  0.00132902  normal  0.107419 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1279  Radical SAM domain protein  39.09 
 
 		 327 aa  45.8  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000563551 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3511  Radical SAM domain protein  24.83 
 
 		 475 aa  45.4  0.002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0000437292  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0729  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqE  31.48 
 
 		 380 aa  44.7  0.003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.701014  normal  0.10573 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0509  radical SAM domain-containing protein  31.93 
 
 		 359 aa  44.7  0.003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000294869  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2955  Radical SAM domain protein  31.41 
 
 		 475 aa  44.3  0.004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.807752  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1449  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqE  27.78 
 
 		 373 aa  44.3  0.004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0775464  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3249  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqE  25.45 
 
 		 379 aa  44.3  0.004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.384282  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5119  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqE  25.45 
 
 		 379 aa  44.3  0.004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.830153  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0322  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  29.27 
 
 		 298 aa  44.3  0.004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1590  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  28.46 
 
 		 298 aa  44.3  0.004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.370128  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6512  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqE  30.28 
 
 		 405 aa  44.3  0.005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.397453  normal  0.0847554 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5162  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqE  25.45 
 
 		 379 aa  44.3  0.005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.426022 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2249  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqE  26.43 
 
 		 371 aa  44.3  0.005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0357225  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0822  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  29.55 
 
 		 322 aa  44.3  0.005  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0225831  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3915  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqE  31.48 
 
 		 375 aa  43.9  0.005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2551  radical SAM family protein  29.91 
 
 		 344 aa  44.3  0.005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2588  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqE  28.34 
 
 		 414 aa  44.3  0.005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0973479  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4275  Radical SAM domain protein  29.45 
 
 		 474 aa  43.9  0.006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0262219  normal  0.0188195 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2430  radical SAM domain-containing protein  33.33 
 
 		 347 aa  43.9  0.006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.943222  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2921  radical SAM domain-containing protein  44.44 
 
 		 324 aa  43.9  0.006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.925202  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0159  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  23.9 
 
 		 322 aa  43.9  0.006  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  decreased coverage  0.000610838  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1448  radical SAM domain-containing protein  33.65 
 
 		 418 aa  43.9  0.006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1280  Radical SAM domain protein  27.54 
 
 		 346 aa  43.9  0.006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1151  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqE  31.82 
 
 		 373 aa  43.5  0.007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00861011 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1782  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqE  29.02 
 
 		 389 aa  43.5  0.007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.449437  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1036  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  27.69 
 
 		 298 aa  43.5  0.007  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.643895  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2341  Radical SAM domain protein  33.93 
 
 		 280 aa  43.1  0.01  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4536  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  34.38 
 
 		 337 aa  43.1  0.01  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.792195 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>