165 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcDH1_2501 on replicon CP001637
Organism: Escherichia coli DH1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001637  EcDH1_2501  peptidase S24 and S26 domain protein  100 
 
 		 224 aa  469  1.0000000000000001e-131  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.241026  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2927  XRE family transcriptional regulator  37.44 
 
 		 204 aa  144  8.000000000000001e-34  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.035933  normal  0.395861 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0617  peptidase S24, S26A and S26B  39.07 
 
 		 225 aa  144  2e-33  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3421  repressor protein c2  48.48 
 
 		 243 aa  105  5e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.000122682  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3033  transcriptional repressor pyocin R2_PP  40.52 
 
 		 243 aa  95.1  7e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.593643  normal  0.0855736 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01954  hypothetical protein  41.56 
 
 		 221 aa  95.1  7e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1929  peptidase S24/S26 domain-containing protein  39.68 
 
 		 215 aa  95.1  7e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0221761  hitchhiker  0.0000000154774 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1970  XRE family transcriptional regulator  38.26 
 
 		 229 aa  92  6e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.118852  normal  0.0462481 
 
 
-
 
CP001509  ECD_10021  Repressor protein C2  41.13 
 
 		 216 aa  86.3  3e-16  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0289  P22 repressor protein c2  41.13 
 
 		 216 aa  86.3  3e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0382  P22 repressor protein c2  40.32 
 
 		 216 aa  86.3  4e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.103014  hitchhiker  0.000000000000607321 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1456  phage repressor protein  38.85 
 
 		 240 aa  82.4  0.000000000000005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.817013  normal  0.84573 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2750  phage repressor protein  38.85 
 
 		 240 aa  82.4  0.000000000000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2829  XRE family transcriptional regulator  38.85 
 
 		 240 aa  82.4  0.000000000000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1750  putative prophage repressor  32.28 
 
 		 230 aa  81.6  0.000000000000008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.141014  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1853  putative prophage repressor  39.52 
 
 		 221 aa  79  0.00000000000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0159907  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3399  XRE family transcriptional regulator  39.52 
 
 		 221 aa  79  0.00000000000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000795549 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1815  phage lambda repressor protein. Serine peptidase. MEROPS family S24  39.52 
 
 		 207 aa  77  0.0000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.50082  hitchhiker  0.00327746 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1733  XRE family transcriptional regulator  38.71 
 
 		 222 aa  74.3  0.000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000886349 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0989  S24 family peptidase  35.56 
 
 		 239 aa  73.6  0.000000000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000125637 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2812  peptidase  33.54 
 
 		 216 aa  72.8  0.000000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.354301 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1308  XRE family transcriptional regulator  36.3 
 
 		 229 aa  72.4  0.000000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3869  peptidase  35.98 
 
 		 218 aa  72  0.000000000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4132  repressor protein c2, putative  39.23 
 
 		 217 aa  71.2  0.00000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1500  phage lambda repressor protein. Serine peptidase. MEROPS family S24  35.48 
 
 		 220 aa  69.3  0.00000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000043506  normal  0.0115826 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1607  putative prophage repressor  26.13 
 
 		 221 aa  68.6  0.00000000008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.385994  normal  0.460632 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2471  putative prophage repressor  27.81 
 
 		 216 aa  68.2  0.00000000009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.894795  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3443  XRE family transcriptional regulator  34.35 
 
 		 228 aa  67.4  0.0000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.00400113  unclonable  9.66468e-17 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1249  repressor protein C2  35.2 
 
 		 218 aa  65.9  0.0000000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000393675  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0571  repressor protein c2  33.85 
 
 		 215 aa  63.9  0.000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.72773  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4603  peptidase  33.85 
 
 		 229 aa  63.9  0.000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3660  putative prophage repressor  40.91 
 
 		 232 aa  63.9  0.000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000108036  normal  0.0641656 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3550  phage lambda repressor protein. Serine peptidase. MEROPS family S24  34.29 
 
 		 235 aa  64.3  0.000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000497465  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1083  peptidase, S24 family  36.84 
 
 		 133 aa  63.5  0.000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.501278  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2248  repressor protein C2  32.58 
 
 		 236 aa  62.4  0.000000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000124176  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2805  transcriptional repressor, LexA family  33.08 
 
 		 208 aa  61.6  0.000000009  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000318976  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3102  XRE family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 240 aa  60.8  0.00000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0669048  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1210  XRE family transcriptional regulator  36.23 
 
 		 209 aa  58.9  0.00000006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2924  repressor protein  34.53 
 
 		 231 aa  56.6  0.0000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  4.38721e-16 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09241  putative SOS mutagenesis protein UmuD  41.38 
 
 		 138 aa  55.5  0.0000007  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2713  transcriptional regulator, XRE family  31.01 
 
 		 222 aa  55.5  0.0000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0293  prophage repressor  34.53 
 
 		 237 aa  55.1  0.0000008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.830345 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1142  SOS-response transcriptional repressor, LexA  32.56 
 
 		 201 aa  55.1  0.0000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00201645  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0863  SOS mutagenesis protein UmuD  41.38 
 
 		 138 aa  55.1  0.000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0265877  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_10191  putative SOS mutagenesis protein UmuD  40.23 
 
 		 143 aa  54.7  0.000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09221  putative SOS mutagenesis protein UmuD  40.23 
 
 		 138 aa  55.1  0.000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  decreased coverage  0.00588824  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3211  putative phage repressor  37.5 
 
 		 248 aa  53.9  0.000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.02032 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2490  SOS-response transcriptional repressor, LexA  29.94 
 
 		 201 aa  51.2  0.00001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1901  SOS-response transcriptional repressor, LexA  32.37 
 
 		 200 aa  50.4  0.00002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1339  putative prophage repressor  25.17 
 
 		 219 aa  50.1  0.00003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00520189 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1232  transcriptional repressor, LexA family  30.73 
 
 		 209 aa  49.7  0.00004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2427  SOS-response transcriptional repressor LexA  31.17 
 
 		 238 aa  49.3  0.00004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.639374 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2344  LexA repressor  30.37 
 
 		 206 aa  49.3  0.00005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.53254  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4010  repressor protein cI  32.85 
 
 		 234 aa  48.9  0.00006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.895282  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0666  hypothetical protein  39.44 
 
 		 147 aa  48.9  0.00006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0895819  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5225  LexA repressor  34.55 
 
 		 240 aa  48.9  0.00007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.630242  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1549  SOS mutagenesis protein UmuD  39.29 
 
 		 186 aa  48.5  0.00007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.093809 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2719  SOS-response transcriptional repressor, LexA  32.31 
 
 		 204 aa  48.5  0.00009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000100121  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1758  transcriptional repressor, LexA family  28.66 
 
 		 201 aa  48.1  0.0001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000113097  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1810  hypothetical protein  32.18 
 
 		 150 aa  47.8  0.0001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.529582  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1662  SOS-response transcriptional repressor, LexA  30.3 
 
 		 197 aa  48.1  0.0001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1469  putative phage repressor  29.41 
 
 		 225 aa  48.1  0.0001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.416764  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0041  LexA repressor  37.36 
 
 		 201 aa  47.4  0.0002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0466  peptidase S24  30.95 
 
 		 210 aa  47.8  0.0002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0757  putative phage repressor  30.4 
 
 		 208 aa  47  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.418938  normal  0.361734 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5148  LexA repressor  33.33 
 
 		 240 aa  47  0.0002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.160291  normal  0.0920185 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0048  DNA polymerase V  34.83 
 
 		 137 aa  47.4  0.0002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00109264 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4683  LexA repressor  33.33 
 
 		 240 aa  47  0.0002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.20121  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2104  SOS-response transcriptional repressor, LexA  29.92 
 
 		 231 aa  47  0.0002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.788745  normal  0.0179142 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0885  Peptidase S24/S26A/S26B, conserved region  39.08 
 
 		 243 aa  47  0.0002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3727  LexA repressor  31.3 
 
 		 206 aa  46.6  0.0003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3750  LexA repressor  31.54 
 
 		 223 aa  47  0.0003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.596492  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3444  LexA repressor  31.3 
 
 		 206 aa  46.6  0.0003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3708  LexA repressor  31.3 
 
 		 206 aa  46.6  0.0003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000011007 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3754  LexA repressor  31.3 
 
 		 206 aa  46.6  0.0003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1516  LexA repressor  31.54 
 
 		 223 aa  46.6  0.0003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.142022 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1236  LexA repressor  31.88 
 
 		 207 aa  46.6  0.0003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000635507  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3799  LexA repressor  31.54 
 
 		 223 aa  47  0.0003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0472  Cro/CI family transcriptional regulator  28.69 
 
 		 224 aa  46.2  0.0004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.404493 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2380  peptidase S24, S26A and S26B  28.72 
 
 		 421 aa  46.2  0.0004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00000103067  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1735  LexA family transcriptional regulator  30.3 
 
 		 197 aa  46.2  0.0004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0970  XRE family transcriptional regulator  31.78 
 
 		 212 aa  46.2  0.0004  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0257991  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0927  SOS-response transcriptional repressor, LexA  29.01 
 
 		 206 aa  46.2  0.0004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5031  putative prophage repressor  36.05 
 
 		 142 aa  46.2  0.0004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.916136  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0020  SOS-response transcriptional repressor, LexA  27.18 
 
 		 199 aa  46.2  0.0004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000000309012  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2108  peptidase S24/S26 domain-containing protein  31.19 
 
 		 210 aa  46.2  0.0005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.261828  normal  0.0258179 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0557  putative phage repressor  30.65 
 
 		 210 aa  45.8  0.0005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2384  putative phage repressor  31.19 
 
 		 210 aa  45.8  0.0005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0580  repressor protein C2  27.59 
 
 		 238 aa  45.8  0.0005  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3395  LexA repressor  31.54 
 
 		 269 aa  45.4  0.0006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1874  LexA repressor  36.54 
 
 		 228 aa  45.4  0.0006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.879574  normal  0.093957 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1577  peptidase S24-like domain-containing protein  26.09 
 
 		 216 aa  45.8  0.0006  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000555461  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3377  LexA repressor  31.3 
 
 		 204 aa  45.8  0.0006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.32678  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3479  LexA repressor  31.54 
 
 		 269 aa  45.4  0.0007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2238  SOS-response transcriptional repressor, LexA  29.84 
 
 		 228 aa  45.4  0.0007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.778697  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1701  SOS-response transcriptional repressor, LexA  29.84 
 
 		 229 aa  45.4  0.0007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2148  transcriptional repressor, LexA family  29.84 
 
 		 230 aa  45.4  0.0007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0192  SOS-response transcriptional repressor, LexA  29.13 
 
 		 200 aa  45.4  0.0007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2060  putative phage repressor  31.19 
 
 		 210 aa  45.4  0.0008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0018  putative phage repressor  36.11 
 
 		 214 aa  45.1  0.0008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>