More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_1028 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008751  Dvul_1792  type II secretion system protein E  82.49 
 
 
573 aa  974  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.608065 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1028  type II secretion system protein E  100 
 
 
568 aa  1158  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.328232 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1996  type II secretion system protein E  62.61 
 
 
567 aa  748  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1408  type II secretion system protein E  57.64 
 
 
577 aa  674  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.22381  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0873  general secretory pathway protein E  46.98 
 
 
871 aa  483  1e-135  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1725  general secretory pathway protein E  46.61 
 
 
553 aa  479  1e-134  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1504  type II secretion system protein E  44.77 
 
 
558 aa  476  1e-133  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1554  type II secretion system protein E  47.34 
 
 
553 aa  469  1e-131  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.185461 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1392  type II secretion system protein E  42.58 
 
 
571 aa  469  1e-131  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.025124 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05970  Tfp pilus assembly protein PilB  44.31 
 
 
558 aa  465  1e-130  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1107  type II secretion system protein E  42.18 
 
 
787 aa  462  1e-129  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1322  type II secretion system protein E  43.91 
 
 
553 aa  460  1e-128  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.0787535 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4828  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  43.37 
 
 
563 aa  457  1e-127  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.436741 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1055  type II secretion system protein E  44.83 
 
 
559 aa  458  1e-127  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0268645  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0117  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  43.14 
 
 
571 aa  449  1e-125  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00247138  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2414  type II secretion system protein E  41.96 
 
 
564 aa  449  1e-125  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1491  type IV pilus biogenesis protein PilB  42.27 
 
 
568 aa  449  1e-125  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.10563  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0956  type II secretion system protein E  45.44 
 
 
561 aa  448  1e-124  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3555  type II secretion system protein E  43.16 
 
 
573 aa  446  1e-124  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.422315  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0968  type II secretion system protein E  43.49 
 
 
561 aa  448  1e-124  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.197479  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1653  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  42.76 
 
 
568 aa  446  1e-124  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17740  type II secretion system protein E (GspE)  43.11 
 
 
557 aa  448  1e-124  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.898246 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1393  type II secretion system protein E  42.63 
 
 
568 aa  447  1e-124  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.733111 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0991  type II secretion system protein E  42.91 
 
 
564 aa  445  1e-124  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1168  type II secretion system protein E  42.17 
 
 
561 aa  443  1e-123  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2562  type II secretion system protein E  42.98 
 
 
555 aa  445  1e-123  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0888  type II secretion system protein E  43.56 
 
 
553 aa  440  1e-122  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0301  type II secretion system protein E  44.39 
 
 
554 aa  440  1e-122  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1884  type II secretion system protein E  41.95 
 
 
570 aa  439  1e-122  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  6.26903e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1347  type II secretion system protein E  42.22 
 
 
556 aa  440  1e-122  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2103  type II secretion system protein E  41.96 
 
 
571 aa  441  1e-122  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1822  type II secretion system protein E  43.37 
 
 
557 aa  439  1e-122  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0186286  normal  0.89431 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0667  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  42.32 
 
 
568 aa  438  1e-121  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0453527  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2595  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  42.35 
 
 
568 aa  438  1e-121  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2149  type II secretory pathway, ATPase PulE/Tfp pilus assembly pathway, ATPase PilB  41.04 
 
 
566 aa  436  1e-121  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.365322  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0729  general secretory pathway protein E  42.31 
 
 
603 aa  434  1e-120  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.26973  normal  0.525639 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2682  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  41.64 
 
 
568 aa  435  1e-120  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0685  type II secretion system protein E  42.31 
 
 
599 aa  434  1e-120  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3257  type II secretion system protein E  42.63 
 
 
561 aa  433  1e-120  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0719  general secretory pathway protein E  42.13 
 
 
599 aa  432  1e-120  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1166  type II secretion system protein E  43.28 
 
 
572 aa  434  1e-120  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0042  type II secretion system protein E  41.24 
 
 
568 aa  435  1e-120  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0622  type II secretion system protein E  41.89 
 
 
568 aa  431  1e-119  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2514  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  41.03 
 
 
568 aa  431  1e-119  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.066963  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0656  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  41.89 
 
 
568 aa  429  1e-119  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0720  general secretory pathway protein E  41.96 
 
 
599 aa  431  1e-119  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1034  type II secretion system protein E  42.33 
 
 
558 aa  431  1e-119  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0656  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  41.89 
 
 
568 aa  430  1e-119  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1631  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  41.99 
 
 
568 aa  432  1e-119  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1743  type II secretion system protein E  40.55 
 
 
577 aa  427  1e-118  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0263  type II secretion system protein E  41.73 
 
 
891 aa  424  1e-117  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.198237  normal  0.68743 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1128  type II secretion system protein E  43.17 
 
 
563 aa  422  1e-117  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0756  type II secretion system protein E  40.85 
 
 
589 aa  425  1e-117  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2272  secretion system protein E  40.54 
 
 
563 aa  423  1e-117  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1042  general secretory pathway protein E  41.95 
 
 
570 aa  418  1e-115  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.90473  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2090  type II secretion system protein E  43.89 
 
 
573 aa  417  1e-115  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1156  type II secretion system protein E  41.8 
 
 
591 aa  418  1e-115  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0676561 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2570  secretion system protein E  39.71 
 
 
562 aa  416  1e-115  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1823  type II secretion system protein E  43.09 
 
 
571 aa  414  1e-114  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.158798 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0410  type II secretion system protein E  40.14 
 
 
565 aa  413  1e-114  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.430305  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0594  type II secretion system protein E  40.83 
 
 
888 aa  410  1e-113  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0229677 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3365  type II secretion system protein E  46.34 
 
 
520 aa  410  1e-113  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.219755  normal  0.0138681 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1585  type II secretion system protein E  39.1 
 
 
552 aa  411  1e-113  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.834386 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2609  general secretory pathway protein E  39.58 
 
 
610 aa  407  1e-112  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0938454  normal  0.754135 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0326  type II secretion system protein E  39.86 
 
 
612 aa  409  1e-112  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.038954  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1610  type II secretion system protein E  39.24 
 
 
673 aa  406  1e-112  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0608  general secretory pathway protein E  44.76 
 
 
520 aa  403  1e-111  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.11826e-14 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0949  type II secretion system protein E  40.83 
 
 
885 aa  403  1e-111  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.14742  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0682  general secretory pathway protein E  46.11 
 
 
520 aa  404  1e-111  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.980899  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0594  general secretory pathway protein E  44.76 
 
 
520 aa  402  1e-111  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1349  general secretory pathway protein E  53.87 
 
 
520 aa  403  1e-111  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1636  type II secretion system protein E  39.24 
 
 
673 aa  405  1e-111  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1280  general secretory pathway protein E  45.38 
 
 
521 aa  402  1e-111  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1103  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  39.61 
 
 
571 aa  399  1e-110  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.202418  decreased coverage  0.00743342 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4182  type II secretion system protein E  38.52 
 
 
676 aa  399  1e-110  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.231582 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23990  general secretion pathway protein E  51.68 
 
 
502 aa  399  1e-110  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2923  general secretion pathway protein E  50.9 
 
 
499 aa  399  1e-110  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0138  type II secretion system protein E  39.72 
 
 
569 aa  400  1e-110  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00254  putative Mannose-sensitive agglutinin (MSHA) biogenesis protein MshE (pilus type IV)  39.68 
 
 
570 aa  401  1e-110  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3579  glycoside hydrolase family protein  49.16 
 
 
503 aa  395  1e-109  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.666057 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2030  general secretion pathway protein E  48.15 
 
 
502 aa  398  1e-109  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3271  type II secretion system protein E  41.45 
 
 
574 aa  398  1e-109  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001891  general secretion pathway protein E  51.16 
 
 
500 aa  397  1e-109  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0408  type II secretion system protein E  39.54 
 
 
570 aa  397  1e-109  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0328  general secretion pathway protein E  46.32 
 
 
514 aa  398  1e-109  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1138  type II secretory pathway, ATPase  39.89 
 
 
582 aa  394  1e-108  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0879  type II secretion system protein E  39.08 
 
 
569 aa  394  1e-108  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.13472 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0122  type II secretion system protein E  44.42 
 
 
514 aa  392  1e-108  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.766789  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2895  type II secretion system protein E  40.57 
 
 
580 aa  393  1e-108  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.847539  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00602  general secretory pathway protein E  50.9 
 
 
501 aa  394  1e-108  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0173  type II secretion system protein E  39.75 
 
 
637 aa  393  1e-108  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1971  type II secretion system protein E  38.12 
 
 
670 aa  392  1e-108  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3765  type II secretion system protein E  39.83 
 
 
577 aa  395  1e-108  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.238087  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04882  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  39.89 
 
 
577 aa  391  1e-107  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.415694  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0246  type II secretion system protein E  38.1 
 
 
560 aa  389  1e-107  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00126346  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0388  MshA biogenesis protein MshE  39.58 
 
 
594 aa  391  1e-107  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000356112  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2364  response regulator receiver protein  38.79 
 
 
806 aa  391  1e-107  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2925  general secretory pathway protein E  48.94 
 
 
495 aa  391  1e-107  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.366791  normal  0.218914 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3083  type II secretion system protein E  45.72 
 
 
550 aa  392  1e-107  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0750364 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4414  type II secretion system protein E  40.56 
 
 
585 aa  390  1e-107  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0327101  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>