More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_0654 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011769  DvMF_0654  Amidohydrolase 3  100 
 
 		 540 aa  1082    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.214598 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1904  Amidohydrolase 3  38.39 
 
 		 520 aa  336  5.999999999999999e-91  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1072  Amidohydrolase 3  31.34 
 
 		 505 aa  266  1e-69  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.185661  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2366  Amidohydrolase 3  34.05 
 
 		 553 aa  216  9.999999999999999e-55  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.662277  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3171  amidohydrolase 3  28.14 
 
 		 539 aa  202  1.9999999999999998e-50  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.180837  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1441  amidohydrolase 3  29.33 
 
 		 583 aa  188  3e-46  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.822576  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4035  Amidohydrolase 3  33.15 
 
 		 556 aa  185  2.0000000000000003e-45  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.787006  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0426  Amidohydrolase 3  28.97 
 
 		 539 aa  182  2e-44  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2609  amidohydrolase 3  33.91 
 
 		 548 aa  181  4e-44  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.506547 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1214  Amidohydrolase 3  30.35 
 
 		 527 aa  180  5.999999999999999e-44  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1859  amidohydrolase 3  31.81 
 
 		 549 aa  177  5e-43  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.909827 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2770  Amidohydrolase 3  32.31 
 
 		 553 aa  174  2.9999999999999996e-42  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0730355  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1574  Amidohydrolase 3  31.1 
 
 		 540 aa  174  3.9999999999999995e-42  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0535  Amidohydrolase 3  33.57 
 
 		 539 aa  173  9e-42  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1013  Amidohydrolase 3  31.15 
 
 		 548 aa  172  1e-41  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.668342  normal  0.733638 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0505  amidohydrolase  29.66 
 
 		 543 aa  172  2e-41  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.122193  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4036  amidohydrolase 3  28.57 
 
 		 601 aa  171  2e-41  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3258  amidohydrolase 3  29.88 
 
 		 548 aa  171  4e-41  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.826014  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3052  amidohydrolase 3  30.65 
 
 		 546 aa  171  4e-41  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.35545  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2586  amidohydrolase 3  32.87 
 
 		 537 aa  170  5e-41  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0687512  normal  0.83708 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4761  hypothetical protein  27.72 
 
 		 522 aa  170  6e-41  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4778  hypothetical protein  27.45 
 
 		 522 aa  170  6e-41  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3333  amidohydrolase 3  30.98 
 
 		 538 aa  169  8e-41  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.827227 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4387  metal-dependent hydrolase  27.06 
 
 		 522 aa  169  1e-40  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.864199  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0803  Amidohydrolase 3  27.62 
 
 		 564 aa  169  1e-40  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.379476 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2765  amidohydrolase  32.32 
 
 		 543 aa  169  1e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.270794  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0483  hypothetical protein  26.45 
 
 		 522 aa  169  2e-40  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00687609 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4377  metal-dependent hydrolase  27.39 
 
 		 522 aa  169  2e-40  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4752  hypothetical protein  26.73 
 
 		 522 aa  167  4e-40  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4541  hypothetical protein  27.34 
 
 		 522 aa  167  5e-40  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.136084  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4894  hypothetical protein  27.34 
 
 		 522 aa  167  5e-40  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.723774  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4653  putative metal-dependent amidohydrolase with the TIM-barrel fold  29.59 
 
 		 560 aa  167  5e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.707824  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3788  amidohydrolase 3  29.03 
 
 		 543 aa  167  5.9999999999999996e-40  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3316  amidohydrolase 3  26.35 
 
 		 520 aa  166  1.0000000000000001e-39  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2637  Amidohydrolase 3  27.38 
 
 		 533 aa  165  2.0000000000000002e-39  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4779  hypothetical protein  26.3 
 
 		 522 aa  164  4.0000000000000004e-39  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0100  hypothetical protein  27.56 
 
 		 604 aa  163  8.000000000000001e-39  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3024  amidohydrolase 3  29.88 
 
 		 556 aa  163  9e-39  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3406  amidohydrolase 3  27.39 
 
 		 550 aa  162  2e-38  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.155233  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1362  Amidohydrolase 3  29.31 
 
 		 569 aa  161  3e-38  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1124  amidohydrolase 3  30.43 
 
 		 625 aa  161  3e-38  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.70056  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2426  amidohydrolase 3  30.31 
 
 		 549 aa  160  6e-38  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0987019 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0160  Amidohydrolase 3  31.41 
 
 		 512 aa  160  7e-38  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10562  hypothetical protein  29.89 
 
 		 537 aa  159  1e-37  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.036236 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0005  twin-arginine translocation pathway signal  30.15 
 
 		 584 aa  159  2e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2408  Amidohydrolase 3  29.38 
 
 		 520 aa  159  2e-37  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4474  amidohydrolase 3  26.33 
 
 		 522 aa  157  4e-37  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5168  amidohydrolase 3  29.16 
 
 		 541 aa  157  4e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.54245 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3417  Amidohydrolase 3  29.98 
 
 		 545 aa  156  1e-36  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.151731 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3397  Amidohydrolase 3  31.58 
 
 		 518 aa  153  8.999999999999999e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.00503125  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2795  amidohydrolase family protein  27.09 
 
 		 557 aa  152  1e-35  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1096  Amidohydrolase 3  30.65 
 
 		 525 aa  149  1.0000000000000001e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1934  Amidohydrolase 3  25.6 
 
 		 557 aa  149  1.0000000000000001e-34  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1321  Amidohydrolase 3  30.54 
 
 		 532 aa  149  1.0000000000000001e-34  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000608926 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09378  Predicted metal-dependent amidohydrolase with the TIM-barrel fold  26.6 
 
 		 540 aa  147  4.0000000000000006e-34  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4594  putative secreted protein  30.1 
 
 		 522 aa  147  4.0000000000000006e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.693564  normal  0.0479417 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0948  amidohydrolase 3  28.4 
 
 		 619 aa  147  4.0000000000000006e-34  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.497988  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3132  metal-dependent amidohydrolase with the TIM-barrel fold  30.58 
 
 		 565 aa  147  5e-34  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1097  amidohydrolase  30.42 
 
 		 568 aa  147  7.0000000000000006e-34  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21800  predicted TIM-barrel fold metal-dependent hydrolase  31.16 
 
 		 552 aa  146  8.000000000000001e-34  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.389207 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1491  Amidohydrolase 3  31.35 
 
 		 537 aa  145  1e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0764832 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2075  putative lipoprotein  25.93 
 
 		 585 aa  145  2e-33  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.860152  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1290  Amidohydrolase 3  28.17 
 
 		 603 aa  145  2e-33  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0346185  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3234  Amidohydrolase 3  27.1 
 
 		 543 aa  144  4e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.926046 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1950  amidohydrolase 3  30.23 
 
 		 530 aa  144  5e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3957  amidohydrolase 3  26.79 
 
 		 553 aa  144  6e-33  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0420  amidohydrolase-like  26.67 
 
 		 581 aa  143  8e-33  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0834  amidohydrolase 3  27.41 
 
 		 555 aa  143  8e-33  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.644909 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0333  Amidohydrolase 3  21.98 
 
 		 526 aa  143  8e-33  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00778  predicted metal-dependent amidohydrolase with the TIM-barrel fold protein  28.89 
 
 		 546 aa  143  9.999999999999999e-33  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2289  amidohydrolase 3  27.95 
 
 		 579 aa  142  9.999999999999999e-33  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2702  Amidohydrolase 3  30.3 
 
 		 513 aa  142  1.9999999999999998e-32  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.149949  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3353  amidohydrolase 3  28.54 
 
 		 583 aa  142  1.9999999999999998e-32  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.742336  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3951  Amidohydrolase 3  28.4 
 
 		 512 aa  141  3e-32  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2427  amidohydrolase 3  26.5 
 
 		 543 aa  140  6e-32  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0799616  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1793  hypothetical protein  31.08 
 
 		 539 aa  140  7e-32  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3458  hypothetical protein  29.86 
 
 		 601 aa  140  7e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.55725  normal  0.0698709 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7493  amidohydrolase family  29.48 
 
 		 564 aa  140  7.999999999999999e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0605616  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1551  amidohydrolase 3  29.62 
 
 		 542 aa  139  1e-31  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.56072  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1873  Amidohydrolase 3  30.51 
 
 		 542 aa  139  1e-31  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0350767 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0736  amidohydrolase 3  27.7 
 
 		 536 aa  138  2e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0656369  normal  0.367651 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0742  amidohydrolase 3  27.7 
 
 		 536 aa  138  2e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.838024  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1040  amidohydrolase 3  28.97 
 
 		 590 aa  138  2e-31  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.80433  normal  0.260287 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0480  Amidohydrolase 3  24.43 
 
 		 544 aa  138  2e-31  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.0000298357  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0756  amidohydrolase 3  27.7 
 
 		 536 aa  138  2e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.398429  normal  0.248868 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0032  Amidohydrolase 3  27.94 
 
 		 527 aa  138  3.0000000000000003e-31  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2396  amidohydrolase 3  29.62 
 
 		 565 aa  138  3.0000000000000003e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.660482 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3832  amidohydrolase 3  29.2 
 
 		 556 aa  138  3.0000000000000003e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.988411 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3443  amidohydrolase 3  27.88 
 
 		 556 aa  137  4e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.6586 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4125  amidohydrolase 3  30.92 
 
 		 544 aa  137  4e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.101406  normal  0.239825 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0501  Amidohydrolase 3  29.22 
 
 		 537 aa  137  4e-31  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00372928  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14070  predicted TIM-barrel fold metal-dependent hydrolase  30.24 
 
 		 522 aa  136  9.999999999999999e-31  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  decreased coverage  0.00157439  normal  0.408471 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1844  amidohydrolase 3  28.63 
 
 		 554 aa  133  9e-30  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.371248 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2329  Amidohydrolase 3  29.32 
 
 		 530 aa  132  1.0000000000000001e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.108595 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4051  amidohydrolase 3  28.27 
 
 		 620 aa  132  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2186  amidohydrolase 3  28.52 
 
 		 558 aa  130  4.0000000000000003e-29  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0899437  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004324  metal-dependent hydrolase  26.06 
 
 		 581 aa  130  5.0000000000000004e-29  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6181  putative amidohydrolase  27.95 
 
 		 542 aa  130  7.000000000000001e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0743865  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1068  Amidohydrolase 3  26.37 
 
 		 563 aa  130  9.000000000000001e-29  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.185986 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2059  amidohydrolase 3  28.33 
 
 		 569 aa  129  2.0000000000000002e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>