More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_0094 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011769  DvMF_0094  50S ribosomal protein L6  100 
 
 
178 aa  350  5e-96  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0429315 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1750  50S ribosomal protein L6  75.84 
 
 
179 aa  279  1e-74  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.406175  normal  0.64108 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0675  50S ribosomal protein L6  73.03 
 
 
179 aa  267  6e-71  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2242  50S ribosomal protein L6  72.47 
 
 
179 aa  263  7e-70  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0343464  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2759  ribosomal protein L6  64.04 
 
 
179 aa  233  9e-61  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00102826  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2050  ribosomal protein L6  60.11 
 
 
178 aa  225  2e-58  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00433386  normal  0.0184636 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29590  LSU ribosomal protein L6P  55.31 
 
 
179 aa  196  1e-49  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.775265  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17020  LSU ribosomal protein L6P  52.27 
 
 
177 aa  196  2e-49  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  decreased coverage  3.13624e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0642  ribosomal protein L6  53.11 
 
 
178 aa  193  1e-48  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0688878  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3128  ribosomal protein L6  52.25 
 
 
179 aa  191  4e-48  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0602  ribosomal protein L6  53.07 
 
 
179 aa  188  3e-47  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.273648  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3691  ribosomal protein L6  51.98 
 
 
178 aa  188  4e-47  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  unclonable  2.82439e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2673  50S ribosomal protein L6  51.98 
 
 
178 aa  188  4e-47  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2961  50S ribosomal protein L6  53.11 
 
 
178 aa  188  4e-47  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0239512  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2384  50S ribosomal protein L6  55.06 
 
 
179 aa  187  7e-47  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2699  50S ribosomal protein L6  55.06 
 
 
179 aa  187  7e-47  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2318  ribosomal protein L6  51.96 
 
 
179 aa  186  1e-46  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000220779  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10733  50S ribosomal protein L6  50 
 
 
179 aa  185  3e-46  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0858871  normal  0.777005 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0230  50S ribosomal protein L6  52.05 
 
 
182 aa  184  4e-46  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  7.64662e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5032  50S ribosomal protein L6  51.38 
 
 
179 aa  185  4e-46  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  decreased coverage  3.33726e-06  normal  0.564685 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3990  ribosomal protein L6  49.15 
 
 
177 aa  184  6e-46  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.101136  normal  0.864616 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0703  ribosomal protein L6  50.56 
 
 
179 aa  184  7e-46  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.128941 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0782  50S ribosomal protein L6  50.28 
 
 
179 aa  184  8e-46  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0731321  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1337  50S ribosomal protein L6  51.69 
 
 
179 aa  183  9e-46  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  hitchhiker  5.14634e-05  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1047  50S ribosomal protein L6  50.56 
 
 
179 aa  183  1e-45  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  hitchhiker  0.000313329  normal  0.196922 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1030  50S ribosomal protein L6  50.56 
 
 
179 aa  183  1e-45  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  decreased coverage  3.75476e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1059  50S ribosomal protein L6  50.56 
 
 
179 aa  183  1e-45  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  decreased coverage  5.26273e-07  normal  0.385866 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2696  ribosomal protein L6  50.84 
 
 
179 aa  182  2e-45  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0437  50S ribosomal protein L6  53.8 
 
 
184 aa  181  4e-45  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.140454  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3652  50S ribosomal protein L6  53.89 
 
 
180 aa  181  5e-45  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000101089  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2644  ribosomal protein L6  49.44 
 
 
179 aa  181  6e-45  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1101  50S ribosomal protein L6  52.51 
 
 
180 aa  181  7e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0569151 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1138  ribosomal protein L6  50.28 
 
 
178 aa  180  8e-45  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.891595  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20720  LSU ribosomal protein L6P  48.88 
 
 
179 aa  180  9e-45  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0597  50S ribosomal protein L6  48.59 
 
 
178 aa  179  1e-44  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0209  LSU ribosomal protein L6P  50.85 
 
 
178 aa  179  1e-44  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.077075  normal  0.533407 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2631  50S ribosomal protein L6P  49.72 
 
 
178 aa  180  1e-44  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.242825  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3402  ribosomal protein L6  49.44 
 
 
179 aa  179  2e-44  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.587157  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6599  ribosomal protein L6  49.44 
 
 
179 aa  179  2e-44  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2163  ribosomal protein L6  49.15 
 
 
179 aa  178  3e-44  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0225942  normal  0.802348 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1926  50S ribosomal protein L6  51.12 
 
 
180 aa  178  4e-44  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.459918 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0126  50S ribosomal protein L6  52.54 
 
 
178 aa  177  1e-43  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0577  50S ribosomal protein L6  49.72 
 
 
180 aa  176  1e-43  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0948  50S ribosomal protein L6  53.07 
 
 
179 aa  176  2e-43  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00150811  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0946  50S ribosomal protein L6  49.73 
 
 
180 aa  176  2e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.183711  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0301  ribosomal protein L6  49.72 
 
 
180 aa  176  2e-43  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  1.79167e-09  normal  0.16006 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5139  ribosomal protein L6  48.59 
 
 
178 aa  176  2e-43  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.65449 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0321  50S ribosomal protein L6P  49.17 
 
 
179 aa  175  3e-43  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00365002 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6034  50S ribosomal protein L6  46.89 
 
 
178 aa  175  3e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.136114 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3313  50S ribosomal protein L6  51.96 
 
 
179 aa  175  4e-43  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.24387e-10 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0413  ribosomal protein L6  51.69 
 
 
179 aa  174  5e-43  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0280  ribosomal protein L6  45.51 
 
 
181 aa  174  5e-43  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  6.25305e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1689  50S ribosomal protein L6  50.56 
 
 
178 aa  174  6e-43  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.267616  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04130  LSU ribosomal protein L6P  50 
 
 
179 aa  174  6e-43  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1860  50S ribosomal protein L6  50.56 
 
 
178 aa  174  6e-43  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23320  LSU ribosomal protein L6P  49.43 
 
 
181 aa  174  6e-43  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000190859  hitchhiker  1.13192e-06 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1948  50S ribosomal protein L6  48.88 
 
 
180 aa  174  8e-43  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0074  50S ribosomal protein L6  51.67 
 
 
178 aa  174  8e-43  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.54113  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1200  50S ribosomal protein L6  51.93 
 
 
179 aa  174  8e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.046217 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1931  50S ribosomal protein L6  48.88 
 
 
180 aa  174  8e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4492  ribosomal protein L6  48.07 
 
 
179 aa  173  9e-43  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0196  50S ribosomal protein L6  48.6 
 
 
179 aa  173  1e-42  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.474109  normal 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0504  50S ribosomal protein L6  48.6 
 
 
180 aa  173  1e-42  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01320  ribosomal protein L6  50.84 
 
 
179 aa  173  1e-42  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.299584  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2218  50S ribosomal protein L6  52.51 
 
 
179 aa  173  1e-42  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.545954  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0276  ribosomal protein L6  49.44 
 
 
181 aa  173  1e-42  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.017278  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2033  50S ribosomal protein L6  48.88 
 
 
180 aa  173  1e-42  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.693671  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4306  ribosomal protein L6  49.46 
 
 
185 aa  172  2e-42  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0235  50S ribosomal protein L6  50.28 
 
 
179 aa  172  2e-42  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.89178 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0641  50S ribosomal protein L6  48.6 
 
 
179 aa  172  2e-42  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  9.03619e-11  hitchhiker  3.81043e-08 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17261  50S ribosomal protein L6  49.72 
 
 
179 aa  172  2e-42  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1361  50S ribosomal protein L6  50.28 
 
 
179 aa  172  2e-42  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  7.76648e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3717  50S ribosomal protein L6  51.4 
 
 
179 aa  172  2e-42  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0238  50S ribosomal protein L6  50.28 
 
 
179 aa  172  2e-42  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1923  50S ribosomal protein L6  46.99 
 
 
183 aa  171  3e-42  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3890  50S ribosomal protein L6  49.44 
 
 
179 aa  171  4e-42  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4300  50S ribosomal protein L6  50.27 
 
 
180 aa  171  5e-42  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.118959  hitchhiker  0.00370364 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1338  50S ribosomal protein L6  49.14 
 
 
177 aa  171  5e-42  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.152453 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2066  50S ribosomal protein L6  50 
 
 
178 aa  171  5e-42  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0857  ribosomal protein L6  46.2 
 
 
184 aa  171  7e-42  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4929  ribosomal protein L6  51.4 
 
 
179 aa  171  7e-42  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00377374  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3908  50S ribosomal protein L6  50.54 
 
 
180 aa  171  7e-42  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.383455  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09850  LSU ribosomal protein L6P  47.16 
 
 
180 aa  171  7e-42  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.012035  hitchhiker  1.69605e-05 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2140  50S ribosomal protein L6P  47.46 
 
 
177 aa  171  7e-42  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.105025  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5772  ribosomal protein L6  46.74 
 
 
185 aa  169  1e-41  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.245176  normal  0.751673 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1629  50S ribosomal protein L6  48.57 
 
 
177 aa  169  1e-41  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.415246  normal  0.285193 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1509  ribosomal protein L6  50.84 
 
 
182 aa  170  1e-41  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.84211  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0695  50S ribosomal protein L6  48.6 
 
 
179 aa  170  1e-41  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.476782  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1018  50S ribosomal protein L6  48.31 
 
 
178 aa  169  3e-41  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.000674747  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1355  ribosomal protein L6  49.71 
 
 
177 aa  169  3e-41  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0122  50S ribosomal protein L6  49.72 
 
 
178 aa  169  3e-41  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1722  50S ribosomal protein L6  48.3 
 
 
179 aa  169  3e-41  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.0239785  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0049  50S ribosomal protein L6  47.75 
 
 
178 aa  169  3e-41  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.560841  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3980  ribosomal protein L6  51.41 
 
 
177 aa  168  4e-41  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1761  50S ribosomal protein L6  48.31 
 
 
178 aa  167  5e-41  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.00139046  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2214  50S ribosomal protein L6  44.69 
 
 
179 aa  167  6e-41  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  3.75197e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0362  50S ribosomal protein L6  48.62 
 
 
181 aa  167  7e-41  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.08503  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0723  50S ribosomal protein L6  44.57 
 
 
176 aa  166  1e-40  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0843452  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1081  50S ribosomal protein L6  45.81 
 
 
179 aa  166  2e-40  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.253024  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23650  LSU ribosomal protein L6P  49.72 
 
 
180 aa  166  2e-40  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.291924  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>