More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dret_2376 on replicon NC_013223
Organism: Desulfohalobium retbaense DSM 5692



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013223  Dret_2376  choline/carnitine/betaine transporter  100 
 
 		 508 aa  1013    Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0157817  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0608  choline/carnitine/betaine transporter  62.17 
 
 		 490 aa  629  1e-179  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0160  choline/carnitine/betaine transporter  57.86 
 
 		 497 aa  587  1e-166  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1219  choline/carnitine/betaine transporter  50.2 
 
 		 503 aa  487  1e-136  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2098  choline/carnitine/betaine transporter  51.52 
 
 		 498 aa  479  1e-134  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2215  choline/carnitine/betaine transporter  50.51 
 
 		 523 aa  479  1e-134  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4866  choline/carnitine/betaine transporter  46.5 
 
 		 659 aa  459  9.999999999999999e-129  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0140106 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4403  choline/carnitine/betaine transporter  46.5 
 
 		 659 aa  459  9.999999999999999e-129  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3772  choline/carnitine/betaine transporter  47.06 
 
 		 505 aa  459  9.999999999999999e-129  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5089  glycine betaine transporter  47.57 
 
 		 505 aa  457  1e-127  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5479  glycine betaine transporter  47.57 
 
 		 505 aa  457  1e-127  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.231091  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5358  glycine betaine transporter  46.96 
 
 		 505 aa  452  1.0000000000000001e-126  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4919  glycine betaine transporter  47.37 
 
 		 505 aa  454  1.0000000000000001e-126  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4934  glycine betaine transporter  47.37 
 
 		 505 aa  454  1.0000000000000001e-126  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5411  glycine betaine transporter  46.86 
 
 		 505 aa  453  1.0000000000000001e-126  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5032  choline/carnitine/betaine transporter  46.95 
 
 		 504 aa  452  1.0000000000000001e-126  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5329  glycine betaine transporter  47.37 
 
 		 505 aa  454  1.0000000000000001e-126  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.52581e-23 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1736  choline/carnitine/betaine transporter  46 
 
 		 506 aa  451  1e-125  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00814809  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5363  glycine betaine transporter  46.54 
 
 		 504 aa  445  1.0000000000000001e-124  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5593  glycine betaine transporter  46.54 
 
 		 504 aa  445  1.0000000000000001e-124  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000183656 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0757  choline/carnitine/betaine transport  48.94 
 
 		 525 aa  444  1e-123  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.26622  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3426  choline/carnitine/betaine transporter  46.81 
 
 		 531 aa  442  1e-123  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0758867  normal  0.343027 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3803  choline/carnitine/betaine transporter  47.34 
 
 		 531 aa  438  1e-121  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.19587 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0046  glycine betaine transporter  45.94 
 
 		 532 aa  433  1e-120  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.275522  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2364  choline/carnitine/betaine transporter  46.3 
 
 		 685 aa  434  1e-120  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0485  choline/carnitine/betaine transporter  44.55 
 
 		 516 aa  424  1e-117  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.000000502789  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2906  choline/carnitine/betaine transporter  43.09 
 
 		 577 aa  422  1e-117  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0465  glycine betaine transporter  45.91 
 
 		 516 aa  420  1e-116  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00194055  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0465  glycine betaine transporter  45.91 
 
 		 516 aa  420  1e-116  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000010169  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2851  choline/carnitine/betaine transporter  42.62 
 
 		 600 aa  420  1e-116  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.152332  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2472  choline/carnitine/betaine transporter  43.25 
 
 		 667 aa  421  1e-116  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0610  glycine betaine transporter  45.91 
 
 		 516 aa  420  1e-116  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4749  glycine betaine transporter  44.49 
 
 		 516 aa  421  1e-116  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0790865 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0683  glycine betaine transporter  45.91 
 
 		 516 aa  418  1e-116  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000113352  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0614  glycine betaine transporter  45.91 
 
 		 516 aa  417  9.999999999999999e-116  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.00000015754  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0522  glycine betaine transporter  45.89 
 
 		 516 aa  418  9.999999999999999e-116  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0154  choline/carnitine/betaine transporter  46.25 
 
 		 682 aa  417  9.999999999999999e-116  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1888  choline/carnitine/betaine transporter  44.2 
 
 		 606 aa  417  9.999999999999999e-116  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.541906  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0554  glycine betaine transporter  45.89 
 
 		 516 aa  418  9.999999999999999e-116  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3957  choline/carnitine/betaine transporter family protein  44.96 
 
 		 657 aa  415  1e-114  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0148602  normal  0.612846 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0590  glycine betaine transporter  43.7 
 
 		 516 aa  414  1e-114  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000851893  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4324  choline/carnitine/betaine transporter  43.5 
 
 		 494 aa  414  1e-114  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0826  BCCT family choline/carnitine/betaine transporter  44.4 
 
 		 550 aa  414  1e-114  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0130314 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0845  choline/carnitine/betaine transport  42.68 
 
 		 551 aa  412  1e-114  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.626779  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0293  choline/carnitine/betaine transporter  43.07 
 
 		 637 aa  412  1e-114  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0308209  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0044  choline/carnitine/betaine transporter  43.93 
 
 		 610 aa  410  1e-113  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1765  choline/carnitine/betaine transporter  44.62 
 
 		 573 aa  411  1e-113  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.582743 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0421  choline/carnitine/betaine transporter  43.98 
 
 		 661 aa  406  1.0000000000000001e-112  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.45567  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5310  choline/carnitine/betaine transporter  43.1 
 
 		 698 aa  407  1.0000000000000001e-112  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.910175  normal  0.618905 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0920  choline/carnitine/betaine transporter  44 
 
 		 546 aa  402  1e-111  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0705081  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1301  BCCT family betaine/choline/carnitine/glycine transporter  42.66 
 
 		 682 aa  402  1e-111  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3305  choline/carnitine/betaine transport  42.17 
 
 		 545 aa  401  9.999999999999999e-111  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0654  choline/carnitine/betaine transport  40.33 
 
 		 544 aa  399  9.999999999999999e-111  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69850  putative choline transporter  41.99 
 
 		 661 aa  401  9.999999999999999e-111  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.545233 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01010  choline/carnitine/betaine transport  43.06 
 
 		 573 aa  401  9.999999999999999e-111  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.883034  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01813  Choline-glycine betaine transporter  42.89 
 
 		 656 aa  396  1e-109  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.000594064  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2320  choline/carnitine/betaine transporter  40.04 
 
 		 530 aa  397  1e-109  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.439021  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1610  hypothetical protein  41.85 
 
 		 646 aa  396  1e-109  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  unclonable  0.00096761  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6064  putative choline transporter  41.99 
 
 		 661 aa  396  1e-109  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4430  choline/carnitine/betaine transporter  43.69 
 
 		 691 aa  395  1e-109  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1909  choline/carnitine/betaine transport  42.34 
 
 		 660 aa  397  1e-109  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.30039  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1485  choline/carnitine/betaine transporter  43.15 
 
 		 580 aa  398  1e-109  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  hitchhiker  0.00724238  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2475  choline/carnitine/betaine transporter  39.09 
 
 		 538 aa  395  1e-109  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.172611  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2255  choline/carnitine/betaine transporter  43.57 
 
 		 520 aa  397  1e-109  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2216  choline/carnitine/betaine transporter  43.57 
 
 		 520 aa  397  1e-109  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2025  choline/carnitine/betaine transporter  45.71 
 
 		 533 aa  396  1e-109  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1384  choline/carnitine/betaine transporter  43.47 
 
 		 524 aa  398  1e-109  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.095402  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2105  choline/carnitine/betaine transporter  43.75 
 
 		 581 aa  392  1e-108  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3628  choline/carnitine/betaine transporter  43.75 
 
 		 581 aa  392  1e-108  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1390  choline/carnitine/betaine transporter  42.86 
 
 		 582 aa  394  1e-108  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.211195 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4702  choline/carnitine/betaine transporter  43.61 
 
 		 583 aa  393  1e-108  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.911193  decreased coverage  0.0031512 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0174  choline/carnitine/betaine transporter  43.41 
 
 		 541 aa  392  1e-108  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.525828  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1356  choline/carnitine/betaine transport  42.86 
 
 		 582 aa  394  1e-108  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.379286  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1374  choline/carnitine/betaine transporter  42.86 
 
 		 582 aa  394  1e-108  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.796407  normal  0.760016 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25390  choline/carnitine/betaine transport  42.69 
 
 		 514 aa  394  1e-108  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.229483  normal  0.345378 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2288  choline/carnitine/betaine transporter  43.53 
 
 		 582 aa  392  1e-108  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.529795 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0077  choline/carnitine/betaine transporter  43.82 
 
 		 546 aa  394  1e-108  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0066  choline/carnitine/betaine transporter  46.04 
 
 		 583 aa  393  1e-108  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.432279  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2914  choline/carnitine/betaine transporter  42.23 
 
 		 611 aa  389  1e-107  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.34631  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4027  BCCT family transporter  41.24 
 
 		 530 aa  390  1e-107  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1109  choline/carnitine/betaine transporter  40.91 
 
 		 676 aa  390  1e-107  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.507446  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0098  transporter, BCCT family  42.41 
 
 		 526 aa  390  1e-107  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3326  choline/carnitine/betaine transporter  46.37 
 
 		 525 aa  390  1e-107  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.188195  normal  0.774831 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3360  choline/carnitine/betaine transporter  42.95 
 
 		 676 aa  390  1e-107  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0225578  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0877  choline/carnitine/betaine transporter  41.94 
 
 		 542 aa  389  1e-107  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.359976  hitchhiker  0.00000108541 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04148  secondary glycine betaine transporter BetU  42.69 
 
 		 667 aa  387  1e-106  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18950  choline/carnitine/betaine transport  41.75 
 
 		 606 aa  388  1e-106  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.318822  normal  0.131435 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3164  choline/carnitine/betaine transporter  45.43 
 
 		 660 aa  387  1e-106  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04111  hypothetical protein  42.69 
 
 		 667 aa  387  1e-106  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1437  choline/carnitine/betaine transporter  42.28 
 
 		 548 aa  388  1e-106  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000110122  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1874  BCCT transporter  42.32 
 
 		 676 aa  386  1e-106  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0838618  normal  0.235512 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1337  choline/carnitine/betaine transport  43.74 
 
 		 687 aa  386  1e-106  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4042  choline/carnitine/betaine transporter  39.39 
 
 		 526 aa  385  1e-106  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1362  choline/carnitine/betaine transport  46 
 
 		 673 aa  386  1e-106  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000623924  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1132  choline/carnitine/betaine transporter  42.18 
 
 		 574 aa  387  1e-106  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0319453 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1809  choline/carnitine/betaine transporter  42.91 
 
 		 526 aa  386  1e-106  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4850  BCCT family transporter  42.48 
 
 		 667 aa  386  1e-106  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01511  putative high-affinity choline transport protein  41.25 
 
 		 676 aa  387  1e-106  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0764  transporter, BCCT family  42.48 
 
 		 667 aa  386  1e-106  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.846408  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1505  choline/carnitine/betaine transporter  42.92 
 
 		 668 aa  385  1e-106  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>