269 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_3095 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009253  Dred_3095  XRE family transcriptional regulator  100 
 
 
152 aa  315  2e-85  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2431  XRE family transcriptional regulator  38.76 
 
 
143 aa  78.2  4e-14  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1027  transcriptional regulator, XRE family  52.31 
 
 
321 aa  73.9  6e-13  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1715  XRE family transcriptional regulator  44.59 
 
 
152 aa  73.6  9e-13  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  1.19777e-11  normal  0.864438 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3317  transcriptional regulator, XRE family  56.9 
 
 
281 aa  71.2  4e-12  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  7.86405e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0465  transcriptional regulator, XRE family  40.2 
 
 
163 aa  70.5  9e-12  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00289124  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0364  XRE family transcriptional regulator  50.75 
 
 
231 aa  70.1  1e-11  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0416  prophage LambdaBa04, DNA-binding protein  48.53 
 
 
114 aa  69.7  1e-11  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0428  prophage lambdaba04, DNA-binding protein  48.53 
 
 
114 aa  69.7  1e-11  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.663163  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2433  transcriptional regulator, XRE family  48.53 
 
 
132 aa  68.9  3e-11  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000213647 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1604  DNA-binding protein  50 
 
 
114 aa  67.8  5e-11  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00115974  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0702  XRE family transcriptional regulator  50 
 
 
137 aa  67.4  7e-11  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000217339  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2790  transcriptional regulator, XRE family  41.43 
 
 
133 aa  66.2  1e-10  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  2.03467e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07480  helix-turn-helix domain protein  41.67 
 
 
301 aa  65.5  2e-10  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.961759  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0630  helix-turn-helix domain protein  53.03 
 
 
139 aa  65.1  3e-10  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2436  transcriptional regulator, XRE family  39.8 
 
 
104 aa  63.9  8e-10  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2460  XRE family transcriptional regulator  43.75 
 
 
142 aa  62.4  2e-09  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0113682  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0801  XRE family transcriptional regulator  36.67 
 
 
111 aa  62  3e-09  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  2.60527e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1349  immunity repressor protein  40 
 
 
144 aa  61.6  4e-09  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0958  transcriptional regulator, XRE family  38.03 
 
 
133 aa  61.2  5e-09  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2256  transcriptional regulator, XRE family  40 
 
 
117 aa  60.5  8e-09  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0278  XRE family transcriptional regulator  49.15 
 
 
128 aa  59.7  1e-08  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  6.72654e-05  normal  0.646275 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1292  transcriptional regulator, XRE family  37.04 
 
 
110 aa  58.9  2e-08  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.020008  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2431  transcriptional regulator, XRE family  32.76 
 
 
125 aa  58.5  3e-08  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000620136 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0656  transcriptional regulator, XRE family  44.44 
 
 
71 aa  58.5  3e-08  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3618  XRE family transcriptional regulator  47.37 
 
 
123 aa  57  8e-08  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2429  transcriptional regulator, XRE family  31.3 
 
 
127 aa  57  9e-08  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00159098 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1479  putative prophage repressor  43.1 
 
 
206 aa  56.2  1e-07  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.734418  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0916  XRE family transcriptional regulator  40.62 
 
 
115 aa  56.2  1e-07  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4130  prophage lambdaba02, repressor protein  39.06 
 
 
114 aa  55.8  2e-07  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.05101  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3459  transcriptional regulator  46.55 
 
 
145 aa  56.2  2e-07  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00424563  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2104  helix-turn-helix domain-containing protein  43.55 
 
 
95 aa  55.5  2e-07  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0694198  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3833  prophage LambdaBa02, repressor protein  39.06 
 
 
114 aa  55.8  2e-07  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3465  XRE family transcriptional regulator  46.55 
 
 
142 aa  55.8  2e-07  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0510  XRE family transcriptional regulator  32.35 
 
 
114 aa  55.1  3e-07  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  7.59518e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0281  XRE family transcriptional regulator  46.27 
 
 
78 aa  55.1  3e-07  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0335018  normal 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0234  transcriptional regulator  31.18 
 
 
108 aa  54.7  4e-07  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00111986  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2146  transcriptional regulator, XRE family  40.32 
 
 
206 aa  55.1  4e-07  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0483341  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1912  helix-turn-helix domain protein  28.07 
 
 
258 aa  54.7  4e-07  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.978099  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2730  putative DNA-binding protein  41.27 
 
 
117 aa  54.3  5e-07  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  1.0572e-06  hitchhiker  2.67972e-05 
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0188  DNA-binding protein  31.18 
 
 
108 aa  54.7  5e-07  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  9.78101e-08  hitchhiker  1.67724e-41 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0471  XRE family plasmid maintenance system antidote protein  37.88 
 
 
72 aa  54.3  6e-07  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  1.42015e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2624  XRE family transcriptional regulator  42.62 
 
 
112 aa  53.9  7e-07  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00551798  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26020  predicted transcriptional regulator  35 
 
 
200 aa  53.9  7e-07  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.676624  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20950  putative prophage repressor  42.42 
 
 
200 aa  53.9  8e-07  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  5.78065e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0797  transcriptional regulator, XRE family  31.53 
 
 
206 aa  53.9  8e-07  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.028007  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3288  transcriptional regulator, XRE family  43.86 
 
 
135 aa  53.5  9e-07  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0169  XRE family transcriptional regulator  33.66 
 
 
141 aa  53.1  1e-06  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0218  Cro/CI family transcriptional regulator  45.31 
 
 
158 aa  53.1  1e-06  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.631577  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2672  transcriptional regulator, XRE family  40.68 
 
 
118 aa  52.4  2e-06  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  6.79525e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0697  transcriptional regulator, XRE family  32.79 
 
 
151 aa  52.8  2e-06  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011314  VSAL_p320_13  putative peptidase, S24-like  37.5 
 
 
205 aa  52  3e-06  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.568691  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2113  transcriptional regulator, putative  39.68 
 
 
143 aa  52  3e-06  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2209  putative DNA-binding protein  38.71 
 
 
117 aa  52  3e-06  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.706329  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0798  transcriptional regulator, XRE family  40.74 
 
 
73 aa  51.6  4e-06  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0286273  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23690  predicted transcriptional regulator  31.03 
 
 
338 aa  51.6  4e-06  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000476892  normal  0.626882 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3160  transcriptional regulator AnsR  44.07 
 
 
125 aa  51.2  5e-06  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.980504  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3138  transcriptional regulator AnsR  44.07 
 
 
125 aa  51.2  5e-06  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2847  ans operon repressor protein  44.07 
 
 
125 aa  51.2  5e-06  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2885  ans operon repressor protein  44.07 
 
 
125 aa  51.2  5e-06  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0484001  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2917  transcriptional regulator AnsR  44.07 
 
 
125 aa  51.2  5e-06  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.41229  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1102  transcriptional regulator, XRE family  33.33 
 
 
261 aa  51.2  5e-06  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  2.09596e-07  hitchhiker  2.9e-14 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3137  transcriptional regulator AnsR  44.07 
 
 
125 aa  51.2  5e-06  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0594  transcriptional regulator, XRE family  42.11 
 
 
117 aa  50.8  6e-06  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010183  BcerKBAB4_5811  helix-turn-helix domain-containing protein  43.75 
 
 
141 aa  50.4  8e-06  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1666  transcriptional regulator, XRE family  40 
 
 
205 aa  50.4  8e-06  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.130033  hitchhiker  0.00224482 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1530  XRE family transcriptional regulator  40.28 
 
 
137 aa  50.4  9e-06  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0575  XRE family transcriptional regulator  39.66 
 
 
115 aa  50.1  1e-05  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  1.42648e-12  normal  0.969931 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1028  XRE family transcriptional regulator  37.93 
 
 
464 aa  49.7  1e-05  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1587  transcriptional regulator, XRE family  43.86 
 
 
75 aa  50.1  1e-05  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1576  transcriptional regulator, XRE family  43.86 
 
 
75 aa  50.1  1e-05  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1565  transcriptional regulator, XRE family  43.86 
 
 
75 aa  50.1  1e-05  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0552  XRE family transcriptional regulator  41.94 
 
 
117 aa  50.1  1e-05  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.747826 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2457  transcriptional regulator, XRE family  34.25 
 
 
380 aa  50.1  1e-05  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0637  XRE family transcriptional regulator  39.66 
 
 
115 aa  50.1  1e-05  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  1.52617e-06  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1881  transcriptional regulator  27.19 
 
 
259 aa  50.1  1e-05  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0431466  hitchhiker  0.00212922 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2791  XRE family transcriptional regulator  32.84 
 
 
139 aa  50.1  1e-05  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2371  transcriptional regulator, XRE family  42.59 
 
 
165 aa  50.1  1e-05  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.111191  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0495  XRE family transcriptional regulator  40.38 
 
 
100 aa  49.7  1e-05  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00400235  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2792  XRE family transcriptional regulator  42.03 
 
 
124 aa  48.9  2e-05  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0468  transcriptional regulator, XRE family  36.76 
 
 
82 aa  49.3  2e-05  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  1.57698e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6868  transcriptional regulator, XRE family  39.68 
 
 
250 aa  49.3  2e-05  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.815043  normal  0.198687 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1926  XRE family transcriptional regulator  38.81 
 
 
170 aa  49.7  2e-05  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3117  transcriptional regulator AnsR  42.37 
 
 
125 aa  49.3  2e-05  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2120  transcriptional regulator AnsR  42.37 
 
 
125 aa  49.3  2e-05  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0513  transcriptional regulator, XRE family  38.1 
 
 
70 aa  48.9  3e-05  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.041665  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3135  transcriptional regulator, XRE family  38.98 
 
 
137 aa  48.5  3e-05  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.317529  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00980  predicted transcriptional regulator  36.21 
 
 
459 aa  48.9  3e-05  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.224409  normal  0.709118 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1714  XRE family transcriptional regulator  39.66 
 
 
67 aa  48.9  3e-05  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  2.53714e-11  normal 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6747  XRE family transcriptional regulator  37.1 
 
 
115 aa  48.9  3e-05  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2111  XRE family transcriptional regulator  40.74 
 
 
380 aa  48.9  3e-05  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4126  prophage LambdaBa02, repressor protein  37.18 
 
 
122 aa  48.1  4e-05  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.158818  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0065  XRE family transcriptional regulator  33.33 
 
 
273 aa  48.1  4e-05  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3831  prophage LambdaBa02, repressor protein  37.18 
 
 
122 aa  48.1  4e-05  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0071415  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1067  transcriptional regulator, XRE family  37.31 
 
 
82 aa  48.1  4e-05  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0145003  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1538  XRE family transcriptional regulator  38.89 
 
 
374 aa  47.8  5e-05  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2142  XRE family transcriptional regulator  40.32 
 
 
175 aa  47.4  6e-05  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2140  XRE family transcriptional regulator  39.66 
 
 
196 aa  47.4  7e-05  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1010  XRE family transcriptional regulator  40.68 
 
 
370 aa  47.4  7e-05  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4032  prophage LambdaBa02, repressor protein  32.81 
 
 
114 aa  47.4  8e-05  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00194689  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>