More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_4909 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011830  Dhaf_4909  choline/carnitine/betaine transporter  100 
 
 		 527 aa  1062    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00106  putative choline-glycine betaine transporter  40.08 
 
 		 586 aa  383  1e-105  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2179  choline/carnitine/betaine transporter  39.62 
 
 		 540 aa  377  1e-103  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03056  hypothetical protein  37.19 
 
 		 632 aa  365  2e-99  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4104  choline/carnitine/betaine transporter  37.43 
 
 		 650 aa  363  4e-99  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2637  choline transporter  37.57 
 
 		 540 aa  362  8e-99  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2691  choline transporter  37.57 
 
 		 540 aa  362  8e-99  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000396  choline-glycine betaine transporter  40.33 
 
 		 593 aa  362  8e-99  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1338  choline/carnitine/betaine transporter  37.6 
 
 		 542 aa  360  5e-98  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4071  choline/carnitine/betaine transporter  37.43 
 
 		 650 aa  358  9.999999999999999e-98  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0014  choline/carnitine/betaine transporter  35.5 
 
 		 584 aa  345  1e-93  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0977143 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1731  L-carnitine/gamma-butyrobetaine antiporter  35.78 
 
 		 508 aa  316  8e-85  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0569  L-carnitine/gamma-butyrobetaine antiporter  33.47 
 
 		 507 aa  315  9.999999999999999e-85  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3247  BCCT transporter  32.34 
 
 		 532 aa  309  5.9999999999999995e-83  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2342  BCCT transporter  32.34 
 
 		 525 aa  298  2e-79  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2027  putative transporter  34.13 
 
 		 536 aa  287  2.9999999999999996e-76  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.12575  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1889  putative transporter  33.91 
 
 		 536 aa  287  2.9999999999999996e-76  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01771  predicted transporter  33.91 
 
 		 481 aa  286  7e-76  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01759  hypothetical protein  33.91 
 
 		 481 aa  286  7e-76  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1832  putative transporter  33.91 
 
 		 481 aa  286  7e-76  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.301874 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1219  choline/carnitine/betaine transporter  33.7 
 
 		 503 aa  285  1.0000000000000001e-75  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1387  putative transporter  33.91 
 
 		 536 aa  285  2.0000000000000002e-75  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.216138  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2527  putative transporter  33.91 
 
 		 536 aa  285  2.0000000000000002e-75  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.951849  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4403  choline/carnitine/betaine transporter  32.93 
 
 		 659 aa  283  4.0000000000000003e-75  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1842  choline/carnitine/betaine transporter  33.77 
 
 		 476 aa  283  7.000000000000001e-75  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.220871  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4866  choline/carnitine/betaine transporter  32.72 
 
 		 659 aa  282  1e-74  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0140106 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4042  choline/carnitine/betaine transporter  30.71 
 
 		 526 aa  278  2e-73  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0608  choline/carnitine/betaine transporter  31.5 
 
 		 490 aa  276  6e-73  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1515  putative transporter  30.79 
 
 		 548 aa  276  7e-73  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1754  putative transporter  30.57 
 
 		 548 aa  275  1.0000000000000001e-72  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000362629 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1618  putative transporter  30.57 
 
 		 548 aa  275  2.0000000000000002e-72  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4862  putative carnitine transporter CglC  31.79 
 
 		 513 aa  271  2e-71  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.905862 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2215  choline/carnitine/betaine transporter  33.26 
 
 		 523 aa  270  5.9999999999999995e-71  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2195  putative transporter  32.05 
 
 		 532 aa  267  2.9999999999999995e-70  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.528619  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0845  choline/carnitine/betaine transport  30.82 
 
 		 551 aa  266  5e-70  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.626779  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3532  choline/carnitine/betaine transporter  30.21 
 
 		 556 aa  266  5.999999999999999e-70  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.825969 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5112  choline/carnitine/betaine transporter  33.52 
 
 		 667 aa  266  7e-70  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.181568  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2098  choline/carnitine/betaine transporter  33.04 
 
 		 498 aa  265  1e-69  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3957  choline/carnitine/betaine transporter family protein  31.42 
 
 		 657 aa  264  3e-69  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0148602  normal  0.612846 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1109  choline/carnitine/betaine transporter  32.69 
 
 		 676 aa  264  3e-69  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.507446  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0293  choline/carnitine/betaine transporter  33.48 
 
 		 637 aa  264  3e-69  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0308209  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0404  choline/carnitine/betaine transporter  33.46 
 
 		 667 aa  264  3e-69  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.766464 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5061  choline/carnitine/betaine transporter  33.33 
 
 		 667 aa  263  4e-69  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.536897  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2376  choline/carnitine/betaine transporter  32.39 
 
 		 508 aa  263  4.999999999999999e-69  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0157817  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1261  choline/carnitine/betaine transporter family protein  32.39 
 
 		 522 aa  263  6.999999999999999e-69  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0177229  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4934  choline/carnitine/betaine transporter  33.33 
 
 		 667 aa  263  6.999999999999999e-69  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.205263  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2475  choline/carnitine/betaine transporter  30.68 
 
 		 538 aa  262  1e-68  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.172611  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3496  choline/carnitine/betaine transporter  33.2 
 
 		 724 aa  261  2e-68  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.81429 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4319  choline/carnitine/betaine transporter  33.95 
 
 		 534 aa  260  5.0000000000000005e-68  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18950  choline/carnitine/betaine transport  33.67 
 
 		 606 aa  259  6e-68  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.318822  normal  0.131435 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2851  choline/carnitine/betaine transporter  31.82 
 
 		 600 aa  258  3e-67  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.152332  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4027  BCCT family transporter  33.26 
 
 		 530 aa  257  4e-67  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2676  L-carnitine/gamma-butyrobetaine antiporter  29.78 
 
 		 514 aa  256  5e-67  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01010  choline/carnitine/betaine transport  33.27 
 
 		 573 aa  256  5e-67  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.883034  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13950  choline/carnitine/betaine transport  29.22 
 
 		 568 aa  256  7e-67  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.626795  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0826  BCCT family choline/carnitine/betaine transporter  32.02 
 
 		 550 aa  256  8e-67  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0130314 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6160  choline transporter BetT  31.32 
 
 		 534 aa  256  9e-67  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3229  L-carnitine/gamma-butyrobetaine antiporter  29.45 
 
 		 514 aa  255  1.0000000000000001e-66  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0877  choline/carnitine/betaine transporter  30.97 
 
 		 542 aa  255  1.0000000000000001e-66  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.359976  hitchhiker  0.00000108541 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69850  putative choline transporter  31.79 
 
 		 661 aa  255  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.545233 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0160  choline/carnitine/betaine transporter  30.93 
 
 		 497 aa  255  2.0000000000000002e-66  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3745  choline/carnitine/betaine transporter  32.68 
 
 		 724 aa  254  4.0000000000000004e-66  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1859  BCCT family transporter  32.69 
 
 		 676 aa  253  6e-66  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0971  choline/carnitine/betaine transporter  32.69 
 
 		 676 aa  253  6e-66  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.745252  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0328  choline/carnitine/betaine transporter  32.69 
 
 		 676 aa  253  6e-66  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.140196  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1774  BCCT family transporter  32.69 
 
 		 676 aa  253  6e-66  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0841224  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0407  BCCT family transporter  32.69 
 
 		 716 aa  253  6e-66  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1364  BCCT family transporter  32.69 
 
 		 676 aa  253  6e-66  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0234  BCCT family transporter  32.69 
 
 		 716 aa  253  6e-66  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00044  L-carnitine/gamma-butyrobetaine antiporter  30.73 
 
 		 504 aa  252  1e-65  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.757112  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00043  hypothetical protein  30.73 
 
 		 504 aa  252  1e-65  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.721093  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0022  choline/carnitine/betaine transporter  32.57 
 
 		 580 aa  252  1e-65  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.499144 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1512  choline transport protein BetT  30.77 
 
 		 679 aa  251  2e-65  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0971262  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5241  BCCT transporter  33.14 
 
 		 665 aa  251  2e-65  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.151008  normal  0.0666066 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0079  choline/carnitine/betaine transporter  30.74 
 
 		 558 aa  251  2e-65  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4038  L-carnitine/gamma-butyrobetaine antiporter  29.9 
 
 		 519 aa  251  3e-65  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0875  choline/carnitine/betaine transport  30.54 
 
 		 681 aa  251  3e-65  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0082  L-carnitine/gamma-butyrobetaine antiporter  31.32 
 
 		 505 aa  250  4e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.508572 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0080  L-carnitine/gamma-butyrobetaine antiporter  31.32 
 
 		 505 aa  250  4e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.682648  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0078  L-carnitine/gamma-butyrobetaine antiporter  31.32 
 
 		 505 aa  250  4e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0081  L-carnitine/gamma-butyrobetaine antiporter  31.32 
 
 		 505 aa  250  4e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0078  L-carnitine/gamma-butyrobetaine antiporter  31.32 
 
 		 505 aa  250  4e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.901874  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3615  L-carnitine/gamma-butyrobetaine antiporter  30.5 
 
 		 504 aa  250  5e-65  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0720919 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0041  L-carnitine/gamma-butyrobetaine antiporter  30.5 
 
 		 504 aa  250  5e-65  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.206145  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3360  choline/carnitine/betaine transporter  32.3 
 
 		 676 aa  249  6e-65  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0225578  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4430  choline/carnitine/betaine transporter  33.08 
 
 		 691 aa  250  6e-65  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1909  choline/carnitine/betaine transport  30.65 
 
 		 660 aa  250  6e-65  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.30039  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3559  choline/carnitine/betaine transporter  30.5 
 
 		 504 aa  249  7e-65  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0044  L-carnitine/gamma-butyrobetaine antiporter  30.5 
 
 		 504 aa  249  7e-65  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0042  L-carnitine/gamma-butyrobetaine antiporter  30.5 
 
 		 504 aa  249  7e-65  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2320  choline/carnitine/betaine transporter  32.11 
 
 		 530 aa  249  1e-64  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.439021  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6064  putative choline transporter  32.34 
 
 		 661 aa  249  1e-64  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4324  choline/carnitine/betaine transporter  31.69 
 
 		 494 aa  248  2e-64  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1874  BCCT transporter  32.04 
 
 		 676 aa  248  2e-64  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0838618  normal  0.235512 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2216  choline/carnitine/betaine transporter  31.29 
 
 		 520 aa  247  3e-64  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2255  choline/carnitine/betaine transporter  31.29 
 
 		 520 aa  247  3e-64  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0654  choline/carnitine/betaine transport  32.79 
 
 		 544 aa  247  4e-64  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5310  choline/carnitine/betaine transporter  32.33 
 
 		 698 aa  247  4e-64  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.910175  normal  0.618905 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2609  choline/carnitine/betaine transporter  34.57 
 
 		 573 aa  247  4e-64  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0501554  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3436  choline/carnitine/betaine transporter  32.45 
 
 		 526 aa  246  4.9999999999999997e-64  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.97143  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>