More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ddes_1685 on replicon NC_011883
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011883  Ddes_1685  dihydrodipicolinate synthetase  100 
 
 		 295 aa  607  1e-173  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.805786  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2258  dihydrodipicolinate synthase  36.08 
 
 		 294 aa  199  3e-50  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.269277  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5604  dihydrodipicolinate synthase  34.47 
 
 		 298 aa  196  3e-49  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0722  dihydrodipicolinate synthase  34.13 
 
 		 298 aa  196  5.000000000000001e-49  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.862949  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1531  dihydrodipicolinate synthetase family protein  34.38 
 
 		 304 aa  194  2e-48  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00114549  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2861  dihydrodipicolinate synthase  34.25 
 
 		 298 aa  188  1e-46  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.224352  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2883  dihydrodipicolinate synthase  34.25 
 
 		 298 aa  186  4e-46  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.399498  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2822  dihydrodipicolinate synthetase  33.33 
 
 		 304 aa  186  4e-46  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0197523  normal  0.589984 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2635  dihydrodipicolinate synthase  34.93 
 
 		 298 aa  186  4e-46  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1762  dihydrodipicolinate synthase  32.29 
 
 		 304 aa  185  7e-46  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000163874  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2838  dihydrodipicolinate synthase  33.56 
 
 		 298 aa  184  1.0000000000000001e-45  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000864796 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2641  dihydrodipicolinate synthase  33.56 
 
 		 298 aa  184  1.0000000000000001e-45  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.267093  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2362  dihydrodipicolinate synthase  31.94 
 
 		 304 aa  184  1.0000000000000001e-45  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000117821  normal  0.484255 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2449  dihydrodipicolinate synthase  34.14 
 
 		 298 aa  184  1.0000000000000001e-45  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2832  dihydrodipicolinate synthase  33.56 
 
 		 298 aa  184  1.0000000000000001e-45  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.152609  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2592  dihydrodipicolinate synthase  33.9 
 
 		 298 aa  184  2.0000000000000003e-45  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2557  dihydrodipicolinate synthase  33.9 
 
 		 298 aa  183  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.191613  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4753  dihydrodipicolinate synthetase  35.89 
 
 		 305 aa  184  2.0000000000000003e-45  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.102033  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2844  dihydrodipicolinate synthase  33.45 
 
 		 298 aa  182  7e-45  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0557185  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0297  dihydrodipicolinate synthetase  34.71 
 
 		 306 aa  181  9.000000000000001e-45  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.168579 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_4002  dihydrodipicolinate synthetase  34.36 
 
 		 301 aa  179  4e-44  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0921  dihydrodipicolinate synthase  34.98 
 
 		 295 aa  177  2e-43  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003669  1-pyrroline-4-hydroxy-2-carboxylate deaminase  33.91 
 
 		 304 aa  176  4e-43  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6523  dihydrodipicolinate synthetase  32.64 
 
 		 303 aa  173  1.9999999999999998e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.107378 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4666  dihydrodipicolinate synthetase  33.33 
 
 		 301 aa  172  3.9999999999999995e-42  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0656669  normal  0.616699 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0873  putative dihydrodipicolinate synthase  34.26 
 
 		 301 aa  169  4e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.414654 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0309  putative dihydrodipicolinate synthetase  34.88 
 
 		 293 aa  169  5e-41  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.922253  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4559  dihydrodipicolinate synthetase  33.91 
 
 		 301 aa  169  5e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02730  putative dihydrodipicolinate synthetase  35.11 
 
 		 293 aa  169  6e-41  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0690835 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2714  dihydrodipicolinate synthetase  33.68 
 
 		 304 aa  168  1e-40  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0494  dihydrodipicolinate synthetase  33.33 
 
 		 305 aa  166  4e-40  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.78772  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1449  dihydrodipicolinate synthetase family protein  31.6 
 
 		 304 aa  164  1.0000000000000001e-39  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.365355  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0056  dihydrodipicolinate synthase  33.22 
 
 		 291 aa  163  3e-39  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.821032  normal  0.798921 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2579  dihydrodipicolinate synthase  32.3 
 
 		 303 aa  162  5.0000000000000005e-39  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1307  dihydrodipicolinate synthetase  34.25 
 
 		 293 aa  161  1e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5222  dihydrodipicolinate synthetase  32.29 
 
 		 304 aa  161  1e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0559955  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4110  dihydrodipicolinate synthetase  31.49 
 
 		 297 aa  161  1e-38  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4304  putative dihydrodipicolinate synthetase  36.55 
 
 		 297 aa  160  2e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.172011  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1271  dihydrodipicolinate synthase  33.67 
 
 		 294 aa  160  2e-38  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000148368  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_09012  dihydrodipicolinate synthetase family protein (AFU_orthologue; AFUA_8G02270)  31.62 
 
 		 298 aa  159  7e-38  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5278  dihydrodipicolinate synthetase  31.47 
 
 		 303 aa  159  7e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.995462 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1415  dihydrodipicolinate synthase  33.67 
 
 		 294 aa  158  1e-37  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2036  dihydrodipicolinate synthetase  32.73 
 
 		 295 aa  158  1e-37  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1568  dihydrodipicolinate synthetase  32.73 
 
 		 295 aa  158  1e-37  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5586  dihydrodipicolinate synthetase  30.56 
 
 		 304 aa  157  2e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.285938  normal  0.789314 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4271  dihydrodipicolinate synthetase  31.36 
 
 		 310 aa  157  3e-37  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.443076 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09730  putative dihydrodipicolinate synthase  31.25 
 
 		 303 aa  156  3e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000547803  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4834  dihydrodipicolinate synthetase  31.12 
 
 		 303 aa  156  4e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.561914  normal  0.105367 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3706  dihydrodipicolinate synthetase  32.73 
 
 		 295 aa  155  6e-37  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4439  dihydrodipicolinate synthetase  32.99 
 
 		 290 aa  155  6e-37  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.609265 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3568  dihydrodipicolinate synthase  30.24 
 
 		 292 aa  155  8e-37  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000801902  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1031  dihydrodipicolinate synthase  29.76 
 
 		 289 aa  155  1e-36  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.432132  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0317  dihydrodipicolinate synthase  30 
 
 		 289 aa  154  1e-36  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1484  dihydrodipicolinate synthase  29.66 
 
 		 300 aa  154  2e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.853225  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0234  dihydrodipicolinate synthase  30.58 
 
 		 290 aa  154  2e-36  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0452  dihydrodipicolinate synthetase  33.68 
 
 		 296 aa  153  4e-36  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3897  dihydrodipicolinate synthase  29.9 
 
 		 292 aa  152  5e-36  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0082714  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3650  dihydrodipicolinate synthase  29.9 
 
 		 292 aa  152  5e-36  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.109215  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3540  dihydrodipicolinate synthase  29.9 
 
 		 292 aa  152  5e-36  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00322291  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3558  dihydrodipicolinate synthase  29.9 
 
 		 292 aa  152  5e-36  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.238358  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3810  dihydrodipicolinate synthase  29.9 
 
 		 292 aa  152  5e-36  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.27976e-50 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3935  dihydrodipicolinate synthase  29.9 
 
 		 292 aa  152  5e-36  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000721965  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3846  dihydrodipicolinate synthase  29.9 
 
 		 292 aa  152  5e-36  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000642983  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1402  dihydrodipicolinate synthase  29.9 
 
 		 292 aa  152  5e-36  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000702013  hitchhiker  4.69848e-20 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01439  dihydrodipicolinate synthetase  30.8 
 
 		 302 aa  152  5e-36  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0826  dihydrodipicolinate synthase  29.59 
 
 		 295 aa  152  5.9999999999999996e-36  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.545696  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2517  dihydrodipicolinate synthetase  31.38 
 
 		 309 aa  152  7e-36  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.35455  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0883  dihydrodipicolinate synthetase  33.22 
 
 		 294 aa  152  8.999999999999999e-36  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1479  dihydrodipicolinate synthetase  31.82 
 
 		 304 aa  152  8.999999999999999e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.319674  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3086  dihydrodipicolinate synthase  33.68 
 
 		 326 aa  151  1e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.167482  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3380  dihydrodipicolinate synthetase  33.1 
 
 		 306 aa  151  1e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.434141  normal  0.344387 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1929  dihydrodipicolinate synthase  31.88 
 
 		 296 aa  151  1e-35  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.712934 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1838  dihydrodipicolinate synthetase  31.38 
 
 		 306 aa  151  1e-35  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1895  dihydrodipicolinate synthetase  33.11 
 
 		 306 aa  151  1e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.305178 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1865  dihydrodipicolinate synthase  32.76 
 
 		 293 aa  151  1e-35  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4227  dihydrodipicolinate synthetase  33.1 
 
 		 306 aa  151  1e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0531975  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2987  dihydrodipicolinate synthase  32.09 
 
 		 294 aa  151  1e-35  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00573153  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4139  dihydrodipicolinate synthetase  33.1 
 
 		 306 aa  151  1e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.405813  normal  0.104892 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0464  dihydrodipicolinate synthase  29.45 
 
 		 294 aa  151  2e-35  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.145976  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3957  dihydrodipicolinate synthetase  31.72 
 
 		 299 aa  150  2e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1170  dihydrodipicolinate synthase  30.42 
 
 		 290 aa  150  2e-35  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000026647  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0964  2,4-dihydroxyhept-2-ene-1,7-dioic acid aldolase  31.38 
 
 		 308 aa  150  2e-35  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2503  dihydrodipicolinate synthetase  32.66 
 
 		 304 aa  150  3e-35  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.143344  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1492  dihydrodipicolinate synthase  31.06 
 
 		 291 aa  150  3e-35  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.944504  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6866  dihydrodipicolinate synthetase  32.64 
 
 		 295 aa  149  4e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.131306  normal  0.920472 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1597  dihydrodipicolinate synthase  29.31 
 
 		 289 aa  149  4e-35  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0078  dihydrodipicolinate synthase  33.8 
 
 		 298 aa  149  6e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00671629  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3063  dihydrodipicolinate synthase  31.12 
 
 		 290 aa  149  6e-35  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0542018  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5246  dihydrodipicolinate synthase  33.8 
 
 		 298 aa  148  9e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7258  dihydrodipicolinate synthase  31.47 
 
 		 303 aa  148  9e-35  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5613  dihydrodipicolinate synthase  33.8 
 
 		 298 aa  148  9e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.292937  normal  0.171207 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0803  dihydrodipicolinate synthase, putative  33.56 
 
 		 298 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5442  dihydrodipicolinate synthase  34.49 
 
 		 298 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0285099  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0097  dihydrodipicolinate synthase  31.63 
 
 		 297 aa  148  1.0000000000000001e-34  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3063  dihydrodipicolinate synthase, putative  30.28 
 
 		 303 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0586841  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0085  dihydrodipicolinate synthetase  33.11 
 
 		 310 aa  147  2.0000000000000003e-34  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2068  dihydrodipicolinate synthetase family protein  32.76 
 
 		 390 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.790569  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1420  dihydrodipicolinate synthetase family protein  32.4 
 
 		 306 aa  147  3e-34  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0587759  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1372  dihydrodipicolinate synthetase  30.56 
 
 		 302 aa  147  3e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.0366991 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2194  dihydrodipicolinate synthetase family protein  32.4 
 
 		 306 aa  147  3e-34  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.872577  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>