More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dde_0731 on replicon NC_007519
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007519  Dde_0731  ATPase  100 
 
 
249 aa  503  1e-141  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.79044  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0354  ABC transporter related  79.24 
 
 
249 aa  388  1e-107  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.774428  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0252  ABC transporter related  75.21 
 
 
244 aa  374  1e-103  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.229432  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0568  ABC transporter related  51.54 
 
 
234 aa  249  3e-65  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0583  ABC transporter related  51.54 
 
 
234 aa  249  3e-65  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.540435  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2605  ABC transporter related  49.78 
 
 
239 aa  246  3e-64  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0199755  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4191  ABC transporter related  49.77 
 
 
252 aa  235  5e-61  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.31684 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1763  ABC transporter related protein  51.13 
 
 
246 aa  234  8e-61  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.261961  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0814  ABC transporter related  47.32 
 
 
231 aa  234  1e-60  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4940  ABC transporter related  50.44 
 
 
249 aa  234  1e-60  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.208609  normal  0.863425 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1917  ABC transporter, ATPase subunit  46.93 
 
 
286 aa  233  2e-60  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1720  ABC transporter related  48.66 
 
 
242 aa  233  3e-60  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0068  ABC transporter related protein  48.52 
 
 
248 aa  231  8e-60  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3760  ABC transporter related  49.77 
 
 
236 aa  231  1e-59  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.676355  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003050  ABC-type antimicrobial peptide transport system ATPase component  48.88 
 
 
232 aa  229  2e-59  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0103  ABC transporter related  47.51 
 
 
234 aa  230  2e-59  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0694  ABC transporter related  48.47 
 
 
230 aa  229  4e-59  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00813244  hitchhiker  0.000136942 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1603  ABC transporter related  48.86 
 
 
225 aa  229  5e-59  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2384  ABC transporter ATP-binding protein  50.44 
 
 
228 aa  228  6e-59  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0127106  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0199  ABC transporter related  48.86 
 
 
230 aa  228  7e-59  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02834  hypothetical protein  49.77 
 
 
239 aa  228  7e-59  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1574  ABC transporter related  48.4 
 
 
225 aa  228  7e-59  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0590821  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1638  ABC transporter related  51.13 
 
 
244 aa  227  1e-58  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5001  ABC transporter related  49.33 
 
 
230 aa  227  1e-58  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1484  ABC transporter related  48.65 
 
 
236 aa  227  1e-58  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.789382 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02550  ABC transporter related  48.64 
 
 
266 aa  226  2e-58  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00397831  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5121  ABC transporter related protein  48.42 
 
 
240 aa  226  3e-58  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2740  putative macrolide efflux ABC transporter, ATP-binding protein  48.46 
 
 
228 aa  226  4e-58  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0466  ABC transporter related  49.31 
 
 
242 aa  225  5e-58  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.492802  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3012  ABC transporter, ATP-binding protein  46.67 
 
 
319 aa  224  8e-58  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.331598  normal  0.0181609 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2927  ABC transporter related  46.54 
 
 
237 aa  224  9e-58  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0132114  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12888  ABC transporter, ATP-binding protein  48.65 
 
 
228 aa  224  1e-57  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.567138  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0175  ABC transporter related  47.75 
 
 
226 aa  223  2e-57  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0570775  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0696  ABC transporter related protein  44.39 
 
 
229 aa  223  3e-57  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6888  ABC transporter related  45.92 
 
 
238 aa  221  9e-57  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.228229 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4127  ABC transporter related  46.12 
 
 
241 aa  221  9e-57  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.330151  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2216  ABC transporter related  48.02 
 
 
228 aa  220  1e-56  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.126053  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1533  ABC transporter related  48.89 
 
 
228 aa  221  1e-56  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1899  ABC transporter related  48 
 
 
228 aa  221  1e-56  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.676555  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1943  ABC transporter related protein  48.26 
 
 
288 aa  220  2e-56  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.728996  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2391  ABC transporter related  48.42 
 
 
253 aa  220  2e-56  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.692969 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2216  ABC transporter-related protein  46.12 
 
 
233 aa  219  3e-56  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.22614 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3555  ABC transporter, ATP-binding protein  49.55 
 
 
224 aa  219  4e-56  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.287436  normal  0.628784 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2852  ABC transporter-like  46.12 
 
 
252 aa  219  4e-56  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1000  ABC transporter-related protein  47.98 
 
 
227 aa  219  5e-56  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00286652 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2810  ABC transporter related  45.05 
 
 
715 aa  218  6e-56  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.780778  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3324  ABC transporter, ATPase subunit  48.7 
 
 
255 aa  218  6e-56  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23250  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  44.4 
 
 
234 aa  218  7e-56  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0411  ABC transporter related  47.87 
 
 
287 aa  218  7e-56  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00299545 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1979  ABC transporter related  45.66 
 
 
240 aa  218  9e-56  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1667  ABC transporter related  47.51 
 
 
228 aa  217  1e-55  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3059  ABC transporter-related protein  47.49 
 
 
253 aa  218  1e-55  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.309908  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0477  ABC transporter, ATP-binding protein  45.66 
 
 
226 aa  217  1e-55  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3167  ABC transporter related  47.09 
 
 
253 aa  217  1e-55  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.310354  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0009  ABC transporter related  47.47 
 
 
241 aa  217  1e-55  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.788883  hitchhiker  0.00117724 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2587  ABC transporter related  45.21 
 
 
230 aa  216  2e-55  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  4.35089e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2628  ABC transporter related  46.26 
 
 
241 aa  217  2e-55  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1760  ABC transporter related  48.85 
 
 
250 aa  217  2e-55  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3786  ABC transporter-related protein  45.21 
 
 
226 aa  217  2e-55  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1173  ABC transporter, ATP-binding protein  48.86 
 
 
233 aa  217  2e-55  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2073  ABC transporter related protein  43.5 
 
 
228 aa  216  2e-55  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5379  ABC transporter, ATP-binding protein  45.66 
 
 
226 aa  216  2e-55  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1456  ABC transporter related  47.53 
 
 
256 aa  216  3e-55  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  hitchhiker  0.00934987  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5105  ABC transporter ATP-binding protein  45.21 
 
 
226 aa  216  3e-55  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1678  ABC transporter related  48.86 
 
 
235 aa  216  3e-55  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.184707  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5346  ABC transporter, ATP-binding protein  45.21 
 
 
226 aa  216  3e-55  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4936  ABC transporter, ATP-binding protein  45.21 
 
 
226 aa  216  3e-55  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5496  ABC transporter ATP-binding protein  45.21 
 
 
226 aa  216  3e-55  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5373  ABC transporter, ATP-binding protein  45.21 
 
 
226 aa  216  3e-55  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4951  ABC transporter, ATP-binding protein  45.21 
 
 
226 aa  216  3e-55  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3266  ABC transporter related  47.49 
 
 
259 aa  215  4e-55  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0211  ABC transporter related  46.15 
 
 
256 aa  215  4e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1335  ATPase  46.93 
 
 
247 aa  216  4e-55  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5577  ABC transporter, ATP-binding protein  45.66 
 
 
226 aa  216  4e-55  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.81829 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2827  ABC transporter-like protein protein  44.75 
 
 
254 aa  216  4e-55  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1998  ABC transporter related  45.21 
 
 
240 aa  216  4e-55  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.332962  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2044  ABC transporter related  45.21 
 
 
240 aa  216  4e-55  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3644  ABC transporter related  47.3 
 
 
253 aa  215  4e-55  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.248417  normal  0.501538 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0896  ABC transporter, ATPase subunit  45.91 
 
 
229 aa  215  5e-55  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.00595939  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1635  ABC transporter related  47.77 
 
 
229 aa  215  5e-55  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0267  ABC transporter related  46.58 
 
 
277 aa  215  5e-55  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.481305  normal  0.0672685 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0111  ABC transporter related  44 
 
 
237 aa  215  6e-55  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1984  ABC transporter related protein  46.64 
 
 
228 aa  215  6e-55  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5427  ABC transporter, ATP-binding protein  45.21 
 
 
226 aa  215  6e-55  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1518  ABC transporter-related protein  46.82 
 
 
228 aa  215  6e-55  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0478  ABC transporter related protein  46.12 
 
 
220 aa  215  6e-55  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2536  ABC transporter related protein  44.69 
 
 
230 aa  214  8e-55  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0287  ABC transporter related  41.15 
 
 
240 aa  214  8e-55  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1572  ABC transporter related  47.03 
 
 
239 aa  214  8e-55  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.633552  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1084  ABC transporter related  48.2 
 
 
234 aa  214  8e-55  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3629  ABC transporter related  46.12 
 
 
229 aa  214  8e-55  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  3.79324e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0521  ABC transporter related  46.64 
 
 
225 aa  214  8e-55  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0272537  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0988  ATPase  46.46 
 
 
233 aa  214  9e-55  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.663944  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3214  ABC transporter related  48.43 
 
 
233 aa  214  9e-55  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.418962  normal  0.11192 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1551  ABC transporter related  42.92 
 
 
244 aa  214  9e-55  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0380512  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3234  ABC transporter related  47.03 
 
 
227 aa  214  9e-55  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0162255  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1151  ABC transporter related  46.02 
 
 
228 aa  214  1e-54  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.023193  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2354  ABC transporter related  45.95 
 
 
247 aa  214  1e-54  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.266266  normal  0.0591431 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2577  ABC transporter related  45.05 
 
 
260 aa  214  1e-54  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.993808  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1061  ABC transporter related protein  43.04 
 
 
238 aa  214  1e-54  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>